MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Paracoccus denitrificans PD1222 chromosome 1

Total Repeats: 48430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008686	GCC	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008686	CAA	2	6	105	110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008686	TGC	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382758
4	NC_008686	GAT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
5	NC_008686	GAT	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
6	NC_008686	ATG	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
7	NC_008686	AGA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382758
8	NC_008686	CCG	2	6	659	664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008686	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382759
10	NC_008686	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
11	NC_008686	GAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382759
12	NC_008686	GAT	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382759
13	NC_008686	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382759
14	NC_008686	CGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
15	NC_008686	CGC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382759
16	NC_008686	ATC	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382759
17	NC_008686	TGG	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382759
18	NC_008686	GCC	2	6	1290	1295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382759
19	NC_008686	TGC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
20	NC_008686	TGC	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
21	NC_008686	CGA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
22	NC_008686	CGA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
23	NC_008686	TGT	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119382759
24	NC_008686	TTC	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382759
25	NC_008686	GTG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382759
26	NC_008686	CGG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382759
27	NC_008686	CAT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382759
28	NC_008686	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382759
29	NC_008686	CTG	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
30	NC_008686	TTC	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382759
31	NC_008686	GGA	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008686	GGC	2	6	2155	2160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
33	NC_008686	CGA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
34	NC_008686	GCG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
35	NC_008686	CGA	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
36	NC_008686	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382760
37	NC_008686	CCG	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382760
38	NC_008686	GAA	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382760
39	NC_008686	GGC	2	6	3139	3144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
40	NC_008686	GAC	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
41	NC_008686	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382760
42	NC_008686	TGG	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382761
43	NC_008686	CGA	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
44	NC_008686	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
45	NC_008686	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
46	NC_008686	GAT	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
47	NC_008686	ATC	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
48	NC_008686	ACC	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382761
49	NC_008686	GCC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
50	NC_008686	CAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
51	NC_008686	TGA	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
52	NC_008686	AAT	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119382761
53	NC_008686	GTC	2	6	4135	4140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
54	NC_008686	ACG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
55	NC_008686	GGC	3	9	4422	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
56	NC_008686	TGA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
57	NC_008686	GAT	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
58	NC_008686	CAC	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382761
59	NC_008686	GCG	2	6	4695	4700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
60	NC_008686	GCG	2	6	4708	4713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
61	NC_008686	CTG	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
62	NC_008686	CAG	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
63	NC_008686	GAT	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
64	NC_008686	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
65	NC_008686	ATC	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
66	NC_008686	GCT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
67	NC_008686	ACG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
68	NC_008686	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
69	NC_008686	TGA	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
70	NC_008686	GCT	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382762
71	NC_008686	TGC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382762
72	NC_008686	GAA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382762
73	NC_008686	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382762
74	NC_008686	GCC	2	6	5514	5519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382762
75	NC_008686	TGA	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382762
76	NC_008686	CCA	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382762
77	NC_008686	CAT	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382763
78	NC_008686	GAA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382763
79	NC_008686	CTG	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
80	NC_008686	CGT	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
81	NC_008686	CGG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382763
82	NC_008686	CCG	2	6	6112	6117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382763
83	NC_008686	CTT	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382763
84	NC_008686	TGG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382763
85	NC_008686	TGA	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382763
86	NC_008686	TGC	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
87	NC_008686	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119382763
88	NC_008686	TGC	2	6	6419	6424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
89	NC_008686	GAG	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382763
90	NC_008686	CGC	2	6	6661	6666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382764
91	NC_008686	TGC	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
92	NC_008686	GAG	2	6	6919	6924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382764
93	NC_008686	CTT	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382764
94	NC_008686	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
95	NC_008686	GCT	2	6	7026	7031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
96	NC_008686	GAA	2	6	7146	7151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382764
97	NC_008686	GAA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382764
98	NC_008686	ATC	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008686	CCA	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008686	GGA	2	6	7476	7481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008686	TGC	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008686	GCA	2	6	7567	7572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
103	NC_008686	GCA	2	6	7582	7587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
104	NC_008686	GAT	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382765
105	NC_008686	TGC	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382765
106	NC_008686	TGA	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382765
107	NC_008686	GTT	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119382765
108	NC_008686	GCG	4	12	7773	7784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382765
109	NC_008686	GGC	2	6	7799	7804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382765
110	NC_008686	GCA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
111	NC_008686	GCC	2	6	7862	7867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382765
112	NC_008686	GAT	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382765
113	NC_008686	TCA	2	6	8070	8075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382766
114	NC_008686	CAA	2	6	8183	8188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119382766
115	NC_008686	ACG	2	6	8218	8223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382766
116	NC_008686	TCG	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382766
117	NC_008686	AGA	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382766
118	NC_008686	GCT	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382766
119	NC_008686	GCC	2	6	8470	8475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382766
120	NC_008686	CGC	2	6	8574	8579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382766
121	NC_008686	CCT	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119382766
122	NC_008686	GTC	2	6	8808	8813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382766
123	NC_008686	ATC	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382766
124	NC_008686	AGA	2	6	8941	8946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382766
125	NC_008686	TCG	2	6	8981	8986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382766
126	NC_008686	CGG	2	6	9070	9075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382766
127	NC_008686	AGC	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382766
128	NC_008686	CAT	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382767
129	NC_008686	GCG	2	6	9308	9313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382767
130	NC_008686	GAG	2	6	9343	9348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382767
131	NC_008686	GCC	2	6	9354	9359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382767
132	NC_008686	TGC	2	6	9407	9412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382767
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135	NC_008686	TCG	3	9	9548	9556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382767
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251	NC_008686	ACC	2	6	16590	16595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_008686	GGA	2	6	16603	16608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_008686	CAA	2	6	16773	16778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119382777
256	NC_008686	TGC	2	6	16826	16831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382777
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258	NC_008686	GCA	2	6	16953	16958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382777
259	NC_008686	TGC	2	6	16984	16989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382777
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261	NC_008686	GCG	2	6	17078	17083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382777
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288	NC_008686	GGC	2	6	18382	18387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382777
289	NC_008686	CAT	2	6	18485	18490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_008686	GGA	2	6	18508	18513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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