MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	AGCTAT	2	12	57483	57494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008639	CTCTTC	2	12	58435	58446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008639	CTCTTC	2	12	58771	58782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008639	ATAAAA	2	12	62413	62424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008639	GAAGAG	2	12	73111	73122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008639	GAAGAG	2	12	73233	73244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008639	CTCTTC	2	12	138222	138233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008639	CGTGAA	2	12	154878	154889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008639	CGTAAG	2	12	181714	181725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008639	CGTCAA	2	12	215714	215725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008639	TGAAAA	2	12	308778	308789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008639	GATGAA	2	12	308905	308916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008639	ATCCGT	2	12	320343	320354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008639	TGAGGC	2	12	354081	354092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008639	CTAAAT	2	12	354123	354134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008639	CGTATA	2	12	390901	390912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008639	AGTTAC	2	12	445825	445836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008639	ACAAAA	2	12	446903	446914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008639	TTTTGA	2	12	453942	453953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008639	GGCGAG	2	12	516410	516421	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008639	CCCCTC	2	12	527054	527065	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_008639	AAAGAA	2	12	528505	528516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008639	CTTCCG	2	12	575849	575860	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008639	GCTTTT	2	12	629402	629413	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008639	GTAAAT	3	18	655374	655391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008639	AATTTC	2	12	669536	669547	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008639	GAACTG	2	12	742143	742154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008639	GATGCG	2	12	742952	742963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008639	CTTTTT	2	12	816692	816703	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008639	ATGTTC	2	12	834001	834012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008639	GATGTT	2	12	849546	849557	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008639	CGGTTT	2	12	854189	854200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008639	GAAGAG	2	12	939851	939862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008639	TTGATT	2	12	975185	975196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008639	CACAAA	2	12	999045	999056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008639	ATACTT	2	12	1004386	1004397	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008639	GTAAAA	2	12	1011844	1011855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008639	TGCTCA	2	12	1033340	1033351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008639	TGCAGT	2	12	1145398	1145409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008639	TTTTGT	2	12	1164154	1164165	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008639	TTTTGT	2	12	1165805	1165816	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008639	GTTTTT	2	12	1166194	1166205	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008639	TTTTTG	2	12	1166330	1166341	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008639	CTGGCA	2	12	1197068	1197079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008639	CCGTGC	2	12	1198422	1198433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008639	TCTTTT	2	12	1208881	1208892	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008639	CAATAA	2	12	1234818	1234829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008639	TTGATG	2	12	1270808	1270819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008639	TGAGCA	2	12	1271442	1271453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008639	ATCACA	2	12	1271538	1271549	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008639	GAAGAG	2	12	1323670	1323681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008639	GAAGAG	2	12	1323792	1323803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008639	TGCTCA	2	12	1324015	1324026	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008639	GAAGAG	2	12	1324182	1324193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008639	TGAGCA	2	12	1334332	1334343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008639	ATCACA	2	12	1334428	1334439	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008639	CTCTTC	2	12	1334550	1334561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008639	CTCTTC	2	12	1334732	1334743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008639	CTCTTC	2	12	1335225	1335236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008639	CTCTTC	2	12	1335473	1335484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008639	GAACCT	2	12	1372517	1372528	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008639	CATGAT	2	12	1372686	1372697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008639	ATGGAG	2	12	1415523	1415534	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008639	AGTATG	2	12	1450863	1450874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008639	TTCGCT	2	12	1468467	1468478	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008639	AAATAA	2	12	1492612	1492623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008639	TTTTCT	2	12	1540141	1540152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008639	ATCACA	2	12	1547785	1547796	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008639	CTCTTC	2	12	1556994	1557005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008639	ATCACA	2	12	1557257	1557268	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008639	CTCTTC	2	12	1560512	1560523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008639	AGCGGA	2	12	1605779	1605790	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008639	CTCTTC	2	12	1617813	1617824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008639	CTCTTC	2	12	1617978	1617989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618106	1618117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618278	1618289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618452	1618463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618580	1618591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618738	1618749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008639	CTCTTC	2	12	1618866	1618877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008639	TTGTTT	2	12	1622079	1622090	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008639	CGACGG	2	12	1625544	1625555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008639	TATGCG	2	12	1644370	1644381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008639	CTCCTG	2	12	1669058	1669069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008639	GAAGAG	2	12	1671489	1671500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008639	GCTCCT	2	12	1673875	1673886	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008639	GAACGT	2	12	1678472	1678483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008639	GACATC	2	12	1680049	1680060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008639	AAGAAA	2	12	1738393	1738404	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008639	ACAGTC	2	12	1771137	1771148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008639	ACTGCC	2	12	1797671	1797682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008639	TCGAGA	2	12	1803625	1803636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008639	ATCACA	2	12	1813646	1813657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008639	GATAAA	2	12	1817951	1817962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008639	CTCCGC	2	12	1839665	1839676	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008639	ATCCGA	2	12	1908987	1908998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008639	TGCGGA	2	12	1948634	1948645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008639	GGTTAT	2	12	1961050	1961061	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008639	CTGCTC	2	12	2063741	2063752	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008639	TTATCT	2	12	2070380	2070391	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008639	AAAAAC	2	12	2157273	2157284	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008639	TAACCA	2	12	2167447	2167458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008639	CTCTTC	2	12	2183909	2183920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008639	ATCACA	2	12	2184054	2184065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008639	CTCTTC	2	12	2184188	2184199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008639	CTCTTC	2	12	2184355	2184366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008639	CTCTTC	2	12	2184738	2184749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008639	CTCTTC	2	12	2194470	2194481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008639	CTCTTC	2	12	2194721	2194732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008639	AAAAGC	2	12	2222031	2222042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008639	GTTCTT	2	12	2230544	2230555	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008639	AAAACA	2	12	2231299	2231310	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008639	CTCTTC	2	12	2234175	2234186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008639	CTCTTC	2	12	2234965	2234976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008639	CTCTTC	2	12	2235164	2235175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008639	CCTCTT	2	12	2235560	2235571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008639	GGTTTT	2	12	2265023	2265034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008639	CTCTTC	2	12	2265916	2265927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008639	CTCTTC	2	12	2266242	2266253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008639	CTCTTC	2	12	2267905	2267916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008639	CCAATA	2	12	2279029	2279040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008639	CTCTTC	2	12	2291552	2291563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008639	CTTTTT	2	12	2297075	2297086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008639	GAAGAG	2	12	2377642	2377653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008639	GAAGAG	2	12	2382202	2382213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008639	GAAGAG	2	12	2382400	2382411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008639	GAAGAG	2	12	2382599	2382610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008639	GAAGAG	2	12	2382801	2382812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008639	AGAAAA	2	12	2383410	2383421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008639	CTCTTC	2	12	2389810	2389821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.