MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	TAGAAG	2	12	2466	2477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119355859
2	NC_008639	ATGCAA	2	12	5344	5355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119355862
3	NC_008639	TCCAGC	2	12	8617	8628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119355865
4	NC_008639	GCTGAT	2	12	10390	10401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119355867
5	NC_008639	AAAAAC	2	12	10856	10867	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	119355867
6	NC_008639	TTTTGT	2	12	28472	28483	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	119355878
7	NC_008639	GTTTGC	2	12	35080	35091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119355884
8	NC_008639	ACTTCG	2	12	38287	38298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119355886
9	NC_008639	GACGAT	2	12	40994	41005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119355890
10	NC_008639	GCGACG	2	12	41031	41042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119355890
11	NC_008639	CTTGAA	2	12	44933	44944	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119355892
12	NC_008639	TGTCGG	2	12	45449	45460	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119355893
13	NC_008639	GTTCCG	2	12	46315	46326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355894
14	NC_008639	GCCGGA	2	12	50830	50841	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119355899
15	NC_008639	TTACTC	2	12	54790	54801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119355902
16	NC_008639	GCAGCG	2	12	60193	60204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119355905
17	NC_008639	GTAATG	2	12	61939	61950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355906
18	NC_008639	GCCGCT	2	12	68269	68280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119355911
19	NC_008639	GCCGCT	2	12	68473	68484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119355911
20	NC_008639	CCTGCG	2	12	70734	70745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119355913
21	NC_008639	CAGGGT	2	12	71237	71248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119355913
22	NC_008639	ACCCCA	2	12	71314	71325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355913
23	NC_008639	CATTAT	2	12	77719	77730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119355918
24	NC_008639	TTTCTT	2	12	78262	78273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	119355918
25	NC_008639	ATTCGA	2	12	81468	81479	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119355919
26	NC_008639	TCCGAG	2	12	82740	82751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119355921
27	NC_008639	TCCAGC	2	12	88618	88629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119355927
28	NC_008639	TCGATG	2	12	101247	101258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119355935
29	NC_008639	CGGCAA	2	12	107821	107832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355943
30	NC_008639	AAGCAG	2	12	110312	110323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119355945
31	NC_008639	ACATAG	2	12	114774	114785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119355948
32	NC_008639	GAGGAA	2	12	118957	118968	50 %	0 %	50 %	0 %	119355952
33	NC_008639	ATCTTG	2	12	121804	121815	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119355956
34	NC_008639	ATGGCG	2	12	124451	124462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119355957
35	NC_008639	CTTCGC	2	12	128742	128753	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119355959
36	NC_008639	GGTCAG	2	12	128754	128765	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119355959
37	NC_008639	TGCGGC	2	12	131553	131564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119355961
38	NC_008639	TCGGTA	2	12	131708	131719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119355961
39	NC_008639	CTTGAC	2	12	132001	132012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119355961
40	NC_008639	CAATAT	2	12	132615	132626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	119355962
41	NC_008639	CCGTAT	2	12	133205	133216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119355963
42	NC_008639	CATGGA	2	12	145507	145518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119355973
43	NC_008639	CGGAGC	2	12	149985	149996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119355978
44	NC_008639	ATGGGA	2	12	153602	153613	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119355980
45	NC_008639	CTTCCG	2	12	164927	164938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119355994
46	NC_008639	TCGGCG	2	12	165854	165865	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119355995
47	NC_008639	CCCCGT	2	12	167818	167829	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119355997
48	NC_008639	CCGATT	2	12	169474	169485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119355999
49	NC_008639	CAAAAC	2	12	185298	185309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119356011
50	NC_008639	TTCCGC	2	12	198365	198376	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119356020
51	NC_008639	GCTCTT	2	12	198427	198438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119356020
52	NC_008639	CCATGA	2	12	198611	198622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119356020
53	NC_008639	GTTATC	2	12	198823	198834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119356020
54	NC_008639	ATACCT	2	12	210849	210860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119356031
55	NC_008639	GGAAAA	2	12	212195	212206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119356033
56	NC_008639	CTTGTC	2	12	219286	219297	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119356041
57	NC_008639	AGACCG	2	12	220324	220335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119356042
58	NC_008639	AACTGT	2	12	222476	222487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356043
59	NC_008639	AACACC	2	12	223586	223597	50 %	0 %	0 %	50 %	119356045
60	NC_008639	CGTTTC	2	12	232313	232324	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119356053
61	NC_008639	TAAAAA	2	12	236051	236062	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	119356059
62	NC_008639	TTGATT	2	12	244759	244770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	119356067
63	NC_008639	ATCAGG	2	12	246964	246975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356069
64	NC_008639	GGCAAG	2	12	247780	247791	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119356069
65	NC_008639	TTTAAT	2	12	249429	249440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119356070
66	NC_008639	AAACAG	2	12	255888	255899	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119356078
67	NC_008639	CTTACT	2	12	256005	256016	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119356079
68	NC_008639	CAACAC	2	12	256570	256581	50 %	0 %	0 %	50 %	119356080
69	NC_008639	AAGCTT	2	12	256857	256868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356080
70	NC_008639	TGAAGA	2	12	258338	258349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119356080
71	NC_008639	AACCAT	2	12	268107	268118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119356085
72	NC_008639	GCTGAA	2	12	275213	275224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356090
73	NC_008639	CGGCAA	2	12	279156	279167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119356095
74	NC_008639	CATGAT	2	12	284726	284737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356100
75	NC_008639	ATCGGC	2	12	286557	286568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356101
76	NC_008639	ATATCT	2	12	292453	292464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119356107
77	NC_008639	AACAGC	2	12	295681	295692	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119356112
78	NC_008639	GAAATT	2	12	300805	300816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119356116
79	NC_008639	TCCAGC	2	12	302996	303007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119356118
80	NC_008639	ATCCAA	2	12	305627	305638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	119356120
81	NC_008639	AGAGGA	2	12	309676	309687	50 %	0 %	50 %	0 %	119356123
82	NC_008639	CGATTT	2	12	313021	313032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119356126
83	NC_008639	AATGCG	2	12	315059	315070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356128
84	NC_008639	ACCAAG	2	12	324832	324843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119356139
85	NC_008639	AGTTTC	2	12	332337	332348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119356142
86	NC_008639	TGACGC	2	12	332407	332418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356142
87	NC_008639	TTTTCC	2	12	334996	335007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119356143
88	NC_008639	TATGGA	2	12	338628	338639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119356147
89	NC_008639	CAGAAA	2	12	340730	340741	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119356148
90	NC_008639	ATGCCG	2	12	342812	342823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356150
91	NC_008639	TCCAGC	2	12	359668	359679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119356169
92	NC_008639	AACCGA	2	12	364034	364045	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119356173
93	NC_008639	GGCTGG	2	12	365978	365989	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119356174
94	NC_008639	TTTCAG	2	12	369418	369429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119356177
95	NC_008639	GTATGC	2	12	370050	370061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356178
96	NC_008639	TCAGGA	2	12	370922	370933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356179
97	NC_008639	AGCGCC	2	12	372932	372943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119356180
98	NC_008639	GCAAGG	2	12	375493	375504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119356181
99	NC_008639	TGGCAA	2	12	377438	377449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356183
100	NC_008639	TTTCAC	2	12	389807	389818	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119356190
101	NC_008639	AGAATG	2	12	390586	390597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	119356190
102	NC_008639	ATAAAG	2	12	401900	401911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	119356198
103	NC_008639	GCTTCT	2	12	405626	405637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119356201
104	NC_008639	CGGGAG	2	12	407255	407266	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119356202
105	NC_008639	GTTGCT	2	12	407500	407511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119356202
106	NC_008639	CGATAC	2	12	409920	409931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119356206
107	NC_008639	TGATAT	2	12	411556	411567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	119356207
108	NC_008639	TGAACT	2	12	418848	418859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356214
109	NC_008639	CGAGTC	2	12	419141	419152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356215
110	NC_008639	GGTAAC	2	12	421250	421261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356219
111	NC_008639	TTCTTT	2	12	421762	421773	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	119356220
112	NC_008639	CGATGA	2	12	430982	430993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356227
113	NC_008639	CTTGCT	2	12	432094	432105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	119356229
114	NC_008639	GGATTG	2	12	436692	436703	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	119356233
115	NC_008639	GGTCTT	2	12	436965	436976	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119356233
116	NC_008639	TGCCAT	2	12	438460	438471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119356234
117	NC_008639	GTAACG	2	12	438948	438959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119356235
118	NC_008639	GGCATC	2	12	440728	440739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356236
119	NC_008639	TTTGGT	2	12	441025	441036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119356236
120	NC_008639	TACCAG	2	12	442183	442194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119356236
121	NC_008639	TGCCAT	2	12	442940	442951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119356237
122	NC_008639	ATCGTT	2	12	450155	450166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	119356244
123	NC_008639	TCTTTT	2	12	460126	460137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	119356254
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128	NC_008639	GTAGTT	2	12	469208	469219	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	119356262
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132	NC_008639	TGTCCG	2	12	478659	478670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119356269
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141	NC_008639	ATGTCG	2	12	498189	498200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356289
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214	NC_008639	TGTAGC	2	12	732993	733004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356475
215	NC_008639	TCCAGC	2	12	736734	736745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119356478
216	NC_008639	GAAGCA	2	12	737715	737726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119356479
217	NC_008639	GAGCCA	2	12	740594	740605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119356481
218	NC_008639	GCACGG	2	12	745498	745509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119356487
219	NC_008639	ATATCG	2	12	749358	749369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356492
220	NC_008639	AGGTGC	2	12	751760	751771	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119356494
221	NC_008639	GTTACA	2	12	752296	752307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356494
222	NC_008639	CAGGTT	2	12	756151	756162	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356497
223	NC_008639	ACCAGC	2	12	756525	756536	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119356498
224	NC_008639	CCTCAA	2	12	759779	759790	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	119356501
225	NC_008639	TACAAA	2	12	761791	761802	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	119356503
226	NC_008639	CTTGAA	2	12	761959	761970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119356503
227	NC_008639	GTTTTT	2	12	763904	763915	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	119356504
228	NC_008639	CCTTTT	2	12	765903	765914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119356506
229	NC_008639	ATGTGC	2	12	767154	767165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356507
230	NC_008639	ACAAGA	2	12	772537	772548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	119356511
231	NC_008639	CGGATC	2	12	772670	772681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119356511
232	NC_008639	TCTGGA	2	12	774934	774945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119356513
233	NC_008639	AACTTT	2	12	782856	782867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	119356520
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324	NC_008639	CGGTGG	2	12	1069574	1069585	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119356761
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337	NC_008639	TATTCT	2	12	1103011	1103022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119356789
338	NC_008639	TATTCT	2	12	1108971	1108982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	119356797
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340	NC_008639	TTTTTC	2	12	1119519	1119530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	119356805
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444	NC_008639	GATAAT	2	12	1483658	1483669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	119357112
445	NC_008639	CCTGAT	2	12	1488894	1488905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119357114
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447	NC_008639	AAGCAT	2	12	1501255	1501266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119357120
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