MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 2097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	TTTTA	2	10	1793	1802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008639	CGATT	2	10	2764	2773	20 %	40 %	20 %	20 %	119355859
3	NC_008639	CAATA	2	10	3141	3150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008639	ATCCA	2	10	4919	4928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008639	TAACT	2	10	9301	9310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008639	TTTTG	2	10	9478	9487	0 %	80 %	20 %	0 %	119355866
7	NC_008639	GCCTT	2	10	10503	10512	0 %	40 %	20 %	40 %	119355867
8	NC_008639	TCGTT	2	10	11909	11918	0 %	60 %	20 %	20 %	119355869
9	NC_008639	AAATC	2	10	12263	12272	60 %	20 %	0 %	20 %	119355869
10	NC_008639	TTATT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008639	CCAAC	2	10	12718	12727	40 %	0 %	0 %	60 %	119355870
12	NC_008639	ATTGC	2	10	12888	12897	20 %	40 %	20 %	20 %	119355870
13	NC_008639	CCTGA	2	10	12935	12944	20 %	20 %	20 %	40 %	119355870
14	NC_008639	AAGAC	2	10	14270	14279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008639	ATAAA	2	10	15827	15836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008639	TTATT	2	10	16116	16125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008639	CCAAC	2	10	16191	16200	40 %	0 %	0 %	60 %	119355872
18	NC_008639	ATTGC	2	10	16361	16370	20 %	40 %	20 %	20 %	119355872
19	NC_008639	CCTGA	2	10	16408	16417	20 %	20 %	20 %	40 %	119355872
20	NC_008639	AAGAC	2	10	17743	17752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008639	ATGAT	2	10	19026	19035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008639	CCTTG	2	10	20935	20944	0 %	40 %	20 %	40 %	119355875
23	NC_008639	CAGAA	2	10	22773	22782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008639	TTATC	2	10	24068	24077	20 %	60 %	0 %	20 %	119355876
25	NC_008639	TGCCC	2	10	25371	25380	0 %	20 %	20 %	60 %	119355877
26	NC_008639	CCTGA	2	10	26642	26651	20 %	20 %	20 %	40 %	119355877
27	NC_008639	GCAAG	2	10	28240	28249	40 %	0 %	40 %	20 %	119355878
28	NC_008639	CCGCT	2	10	28816	28825	0 %	20 %	20 %	60 %	119355878
29	NC_008639	AAAGG	2	10	29391	29400	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008639	TTTTA	2	10	30071	30080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008639	AAGGG	2	10	30226	30235	40 %	0 %	60 %	0 %	119355880
32	NC_008639	TTTTG	2	10	30412	30421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008639	TTGCA	2	10	31851	31860	20 %	40 %	20 %	20 %	119355882
34	NC_008639	TTGAT	2	10	32738	32747	20 %	60 %	20 %	0 %	119355883
35	NC_008639	GCTTC	2	10	36516	36525	0 %	40 %	20 %	40 %	119355885
36	NC_008639	TTCTC	2	10	36819	36828	0 %	60 %	0 %	40 %	119355886
37	NC_008639	ATCTG	2	10	36862	36871	20 %	40 %	20 %	20 %	119355886
38	NC_008639	AACCG	2	10	38481	38490	40 %	0 %	20 %	40 %	119355886
39	NC_008639	TCTTA	2	10	40456	40465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008639	CGATT	2	10	41206	41215	20 %	40 %	20 %	20 %	119355890
41	NC_008639	TGACG	2	10	41587	41596	20 %	20 %	40 %	20 %	119355890
42	NC_008639	GCGCT	2	10	44028	44037	0 %	20 %	40 %	40 %	119355892
43	NC_008639	AGAGC	2	10	45496	45505	40 %	0 %	40 %	20 %	119355893
44	NC_008639	TGCAC	2	10	48846	48855	20 %	20 %	20 %	40 %	119355896
45	NC_008639	CACGA	2	10	48913	48922	40 %	0 %	20 %	40 %	119355896
46	NC_008639	CCCCT	2	10	49772	49781	0 %	20 %	0 %	80 %	119355897
47	NC_008639	GATCG	2	10	51474	51483	20 %	20 %	40 %	20 %	119355899
48	NC_008639	TCCGA	2	10	53048	53057	20 %	20 %	20 %	40 %	119355901
49	NC_008639	TGCGC	2	10	53521	53530	0 %	20 %	40 %	40 %	119355901
50	NC_008639	TGCAT	2	10	56361	56370	20 %	40 %	20 %	20 %	119355903
51	NC_008639	TTCTC	2	10	59146	59155	0 %	60 %	0 %	40 %	119355904
52	NC_008639	CTGCT	2	10	59255	59264	0 %	40 %	20 %	40 %	119355904
53	NC_008639	TATGG	2	10	61653	61662	20 %	40 %	40 %	0 %	119355906
54	NC_008639	CTCTG	2	10	61865	61874	0 %	40 %	20 %	40 %	119355906
55	NC_008639	TTGTC	2	10	62307	62316	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008639	GCCGA	2	10	62851	62860	20 %	0 %	40 %	40 %	119355907
57	NC_008639	CACGA	2	10	63821	63830	40 %	0 %	20 %	40 %	119355907
58	NC_008639	CAGGG	2	10	65996	66005	20 %	0 %	60 %	20 %	119355908
59	NC_008639	TTTTG	2	10	67302	67311	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008639	TCGCA	2	10	70531	70540	20 %	20 %	20 %	40 %	119355913
61	NC_008639	TCCTG	2	10	70778	70787	0 %	40 %	20 %	40 %	119355913
62	NC_008639	TGTTA	2	10	74479	74488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008639	CTTGA	2	10	74859	74868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008639	GTATG	2	10	75231	75240	20 %	40 %	40 %	0 %	119355915
65	NC_008639	AAAGA	2	10	75833	75842	80 %	0 %	20 %	0 %	119355916
66	NC_008639	TTGAG	2	10	75846	75855	20 %	40 %	40 %	0 %	119355916
67	NC_008639	GATAA	2	10	76157	76166	60 %	20 %	20 %	0 %	119355916
68	NC_008639	GATCT	2	10	76478	76487	20 %	40 %	20 %	20 %	119355916
69	NC_008639	AAAGC	2	10	77444	77453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008639	TGTTT	2	10	78252	78261	0 %	80 %	20 %	0 %	119355918
71	NC_008639	CTGTC	2	10	80109	80118	0 %	40 %	20 %	40 %	119355918
72	NC_008639	AAGGA	2	10	81748	81757	60 %	0 %	40 %	0 %	119355920
73	NC_008639	GATAT	2	10	83034	83043	40 %	40 %	20 %	0 %	119355922
74	NC_008639	GCGAT	2	10	83553	83562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008639	TCCTT	2	10	85606	85615	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008639	TATGA	2	10	91639	91648	40 %	40 %	20 %	0 %	119355929
77	NC_008639	TTGTT	2	10	92639	92648	0 %	80 %	20 %	0 %	119355929
78	NC_008639	TGCGT	2	10	92970	92979	0 %	40 %	40 %	20 %	119355929
79	NC_008639	ACTTC	2	10	95255	95264	20 %	40 %	0 %	40 %	119355930
80	NC_008639	AGCCA	2	10	96460	96469	40 %	0 %	20 %	40 %	119355931
81	NC_008639	TGATC	2	10	96581	96590	20 %	40 %	20 %	20 %	119355931
82	NC_008639	TCCTC	2	10	98868	98877	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_008639	GCGGG	2	10	99321	99330	0 %	0 %	80 %	20 %	119355934
84	NC_008639	AGTAT	2	10	100735	100744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008639	TCGGG	2	10	102082	102091	0 %	20 %	60 %	20 %	119355936
86	NC_008639	TTTAT	2	10	103468	103477	20 %	80 %	0 %	0 %	119355937
87	NC_008639	TTTTC	2	10	104594	104603	0 %	80 %	0 %	20 %	119355937
88	NC_008639	GTACC	2	10	106516	106525	20 %	20 %	20 %	40 %	119355940
89	NC_008639	TCAGC	2	10	106958	106967	20 %	20 %	20 %	40 %	119355941
90	NC_008639	CTGCT	2	10	107588	107597	0 %	40 %	20 %	40 %	119355943
91	NC_008639	ACTTT	2	10	109149	109158	20 %	60 %	0 %	20 %	119355944
92	NC_008639	GTTTT	2	10	110596	110605	0 %	80 %	20 %	0 %	119355945
93	NC_008639	ATCGA	2	10	111349	111358	40 %	20 %	20 %	20 %	119355946
94	NC_008639	TCGTG	2	10	117616	117625	0 %	40 %	40 %	20 %	119355951
95	NC_008639	CTTGC	2	10	118140	118149	0 %	40 %	20 %	40 %	119355951
96	NC_008639	CGCTC	2	10	120249	120258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_008639	GCGCA	2	10	120351	120360	20 %	0 %	40 %	40 %	119355954
98	NC_008639	ATCCG	2	10	122417	122426	20 %	20 %	20 %	40 %	119355956
99	NC_008639	GGCCG	3	15	122477	122491	0 %	0 %	60 %	40 %	119355956
100	NC_008639	CAGGA	2	10	122496	122505	40 %	0 %	40 %	20 %	119355956
101	NC_008639	TTGTT	2	10	123415	123424	0 %	80 %	20 %	0 %	119355956
102	NC_008639	CCTGC	2	10	126015	126024	0 %	20 %	20 %	60 %	119355958
103	NC_008639	TTTTC	2	10	128822	128831	0 %	80 %	0 %	20 %	119355959
104	NC_008639	ATCGC	2	10	131599	131608	20 %	20 %	20 %	40 %	119355961
105	NC_008639	GGGGA	2	10	131984	131993	20 %	0 %	80 %	0 %	119355961
106	NC_008639	AGCGG	2	10	133192	133201	20 %	0 %	60 %	20 %	119355963
107	NC_008639	GATCA	2	10	134806	134815	40 %	20 %	20 %	20 %	119355964
108	NC_008639	CGTTT	2	10	135241	135250	0 %	60 %	20 %	20 %	119355965
109	NC_008639	TTGCA	2	10	136213	136222	20 %	40 %	20 %	20 %	119355966
110	NC_008639	AGTGC	2	10	137895	137904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008639	AGTGC	2	10	138003	138012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008639	AATAA	2	10	138878	138887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008639	CGCTG	2	10	139529	139538	0 %	20 %	40 %	40 %	119355969
114	NC_008639	GTTCG	2	10	140189	140198	0 %	40 %	40 %	20 %	119355969
115	NC_008639	TCAGG	2	10	140437	140446	20 %	20 %	40 %	20 %	119355969
116	NC_008639	ATCCG	2	10	140522	140531	20 %	20 %	20 %	40 %	119355969
117	NC_008639	GCGCA	2	10	141780	141789	20 %	0 %	40 %	40 %	119355970
118	NC_008639	CGATC	2	10	143283	143292	20 %	20 %	20 %	40 %	119355970
119	NC_008639	ATTTT	2	10	143723	143732	20 %	80 %	0 %	0 %	119355971
120	NC_008639	CGCGG	2	10	143924	143933	0 %	0 %	60 %	40 %	119355971
121	NC_008639	ATCTC	2	10	147151	147160	20 %	40 %	0 %	40 %	119355976
122	NC_008639	CGGAA	2	10	147314	147323	40 %	0 %	40 %	20 %	119355976
123	NC_008639	AGTTG	2	10	148573	148582	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008639	TGAAG	2	10	150237	150246	40 %	20 %	40 %	0 %	119355978
125	NC_008639	AATCC	2	10	151899	151908	40 %	20 %	0 %	40 %	119355980
126	NC_008639	GCCTT	2	10	152760	152769	0 %	40 %	20 %	40 %	119355980
127	NC_008639	TCTGC	2	10	152926	152935	0 %	40 %	20 %	40 %	119355980
128	NC_008639	GGCTC	2	10	153848	153857	0 %	20 %	40 %	40 %	119355981
129	NC_008639	GATGC	2	10	155563	155572	20 %	20 %	40 %	20 %	119355985
130	NC_008639	CTGAT	2	10	157848	157857	20 %	40 %	20 %	20 %	119355987
131	NC_008639	CAATG	2	10	162182	162191	40 %	20 %	20 %	20 %	119355992
132	NC_008639	TTTTC	2	10	163952	163961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008639	CAAAA	2	10	165461	165470	80 %	0 %	0 %	20 %	119355995
134	NC_008639	GATCA	2	10	166623	166632	40 %	20 %	20 %	20 %	119355996
135	NC_008639	TCGGC	2	10	168006	168015	0 %	20 %	40 %	40 %	119355998
136	NC_008639	AAGCG	2	10	171880	171889	40 %	0 %	40 %	20 %	119356001
137	NC_008639	ACCGC	2	10	173304	173313	20 %	0 %	20 %	60 %	119356003
138	NC_008639	AAGGG	2	10	174265	174274	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008639	TTGCT	2	10	178623	178632	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008639	TGCAT	2	10	179901	179910	20 %	40 %	20 %	20 %	119356007
141	NC_008639	TTTTC	2	10	181866	181875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008639	ATGAC	2	10	184522	184531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_008639	AACTG	2	10	218337	218346	40 %	20 %	20 %	20 %	119356040
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166	NC_008639	GCGCT	2	10	221440	221449	0 %	20 %	40 %	40 %	119356042
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168	NC_008639	ATGCT	2	10	223199	223208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_008639	CGCTT	2	10	273821	273830	0 %	40 %	20 %	40 %	119356090
198	NC_008639	TACCG	2	10	275301	275310	20 %	20 %	20 %	40 %	119356090
199	NC_008639	TTCGC	2	10	275408	275417	0 %	40 %	20 %	40 %	119356090
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403	NC_008639	GCGCA	2	10	590619	590628	20 %	0 %	40 %	40 %	119356373
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