MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	TTTTA	2	10	1793	1802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008639	CAATA	2	10	3141	3150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008639	ATCCA	2	10	4919	4928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008639	TAACT	2	10	9301	9310	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008639	TTATT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008639	AAGAC	2	10	14270	14279	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008639	ATAAA	2	10	15827	15836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008639	TTATT	2	10	16116	16125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008639	AAGAC	2	10	17743	17752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008639	ATGAT	2	10	19026	19035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008639	CAGAA	2	10	22773	22782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008639	AAAGG	2	10	29391	29400	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008639	TTTTA	2	10	30071	30080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008639	TTTTG	2	10	30412	30421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008639	TCTTA	2	10	40456	40465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008639	TTGTC	2	10	62307	62316	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008639	TTTTG	2	10	67302	67311	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008639	TGTTA	2	10	74479	74488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008639	CTTGA	2	10	74859	74868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008639	AAAGC	2	10	77444	77453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008639	GCGAT	2	10	83553	83562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008639	TCCTT	2	10	85606	85615	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008639	TCCTC	2	10	98868	98877	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_008639	AGTAT	2	10	100735	100744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008639	CGCTC	2	10	120249	120258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008639	AGTGC	2	10	137895	137904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008639	AGTGC	2	10	138003	138012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008639	AATAA	2	10	138878	138887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008639	AGTTG	2	10	148573	148582	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008639	TTTTC	2	10	163952	163961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008639	AAGGG	2	10	174265	174274	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008639	TTGCT	2	10	178623	178632	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008639	TTTTC	2	10	181866	181875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008639	ATGAC	2	10	184522	184531	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008639	CTGCG	2	10	188654	188663	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_008639	TATGG	2	10	188856	188865	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008639	CAAAA	2	10	213514	213523	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008639	TTTTC	2	10	218097	218106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008639	AAATT	2	10	223183	223192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008639	ATGCT	2	10	223199	223208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008639	TTTCA	2	10	224159	224168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008639	TTTTC	2	10	241760	241769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008639	TGATC	2	10	249625	249634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008639	TTATT	2	10	252067	252076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008639	ATATA	2	10	267753	267762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008639	CAGAT	2	10	278040	278049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008639	GTAGT	2	10	279817	279826	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008639	AATGA	2	10	285216	285225	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008639	GCTTT	2	10	290017	290026	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008639	TGTCT	2	10	290336	290345	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008639	AATAA	2	10	291964	291973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008639	GGTTA	2	10	295386	295395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008639	TGTCT	2	10	296260	296269	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008639	AATAA	2	10	297888	297897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008639	GATAT	2	10	299015	299024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008639	AGGCA	2	10	303665	303674	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008639	AGCAA	2	10	304242	304251	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008639	AATAA	2	10	311999	312008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008639	TCAGG	2	10	312518	312527	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008639	TTGAT	2	10	318149	318158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008639	ATAAA	2	10	319331	319340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008639	TGTTT	2	10	320367	320376	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008639	AAAAC	2	10	336708	336717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008639	TTATA	2	10	337752	337761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008639	AACGC	2	10	338043	338052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008639	CTCAA	2	10	342335	342344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_008639	AAAAT	2	10	348599	348608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008639	TTTTG	2	10	355218	355227	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008639	TTAAA	2	10	368167	368176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008639	TGTTT	2	10	384444	384453	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008639	AGAAA	2	10	390805	390814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008639	TGTCT	2	10	391077	391086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008639	AATAA	2	10	392705	392714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008639	ATTAT	2	10	394841	394850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008639	CTCTT	2	10	406496	406505	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008639	TAAAA	2	10	422378	422387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008639	TGAAA	2	10	471669	471678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008639	TTTTG	2	10	473417	473426	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008639	AGAGG	2	10	482115	482124	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008639	TTAAA	2	10	485852	485861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008639	GAAGA	2	10	502122	502131	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008639	TCCTG	2	10	502823	502832	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008639	GAAGA	2	10	511385	511394	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008639	CCGCT	2	10	516737	516746	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_008639	TCTGT	2	10	517007	517016	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008639	TGTGC	2	10	530710	530719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008639	GCACC	2	10	545752	545761	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_008639	TGACG	2	10	545825	545834	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008639	CTTTT	2	10	546084	546093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008639	GTTTT	2	10	577861	577870	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008639	GATTT	2	10	592932	592941	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008639	CTGCC	2	10	595353	595362	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_008639	GCTTT	2	10	596889	596898	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008639	ATAAA	2	10	612646	612655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008639	ATTTT	2	10	615164	615173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008639	CTTAT	2	10	628651	628660	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008639	CCAAA	2	10	649530	649539	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_008639	ACATT	2	10	672294	672303	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008639	AGAGA	2	10	677233	677242	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008639	GGCGG	2	10	692685	692694	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008639	GTGCA	2	10	695083	695092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_008639	TGGTA	2	10	695111	695120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008639	GTTTT	2	10	713345	713354	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008639	TTTCC	2	10	713504	713513	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008639	CGGTT	2	10	714046	714055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008639	TTTGC	2	10	730307	730316	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008639	CTCTA	2	10	730595	730604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008639	ACGCC	2	10	733496	733505	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_008639	ACCAC	2	10	734374	734383	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_008639	TCAGA	2	10	738562	738571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008639	TTGAA	2	10	741025	741034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008639	GAAAA	2	10	741035	741044	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008639	TGCAT	2	10	757294	757303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008639	GAAAA	2	10	758341	758350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008639	CGTTC	2	10	775189	775198	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008639	CCAAT	2	10	776328	776337	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008639	TTGCA	2	10	780312	780321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008639	CCCCT	2	10	780592	780601	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_008639	AAGAT	2	10	781235	781244	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008639	CAATG	2	10	792684	792693	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008639	GTTTT	2	10	792914	792923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008639	CGAAT	2	10	811617	811626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008639	ATTTT	2	10	818572	818581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008639	CAATG	2	10	819281	819290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008639	TGGTT	2	10	820547	820556	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008639	CTTTT	2	10	841265	841274	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008639	AGGGA	2	10	846157	846166	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008639	CGATC	2	10	851367	851376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_008639	CCGCC	2	10	855840	855849	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
130	NC_008639	TTCTG	2	10	870071	870080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008639	TTTAT	2	10	870240	870249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008639	AATTG	2	10	870285	870294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008639	GGAAC	2	10	872158	872167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008639	GGAAC	2	10	873246	873255	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008639	CCTGA	2	10	890789	890798	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_008639	GTAAG	2	10	895326	895335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008639	TAAAA	2	10	895394	895403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008639	CCTGA	2	10	896619	896628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_008639	TTCGT	2	10	897181	897190	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008639	GTGTC	2	10	905414	905423	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008639	GCAAC	2	10	909604	909613	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_008639	TCGTT	2	10	914902	914911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008639	TTTCC	2	10	915095	915104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_008639	GATCA	2	10	933900	933909	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008639	CTTCA	2	10	992325	992334	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008639	CCGGG	2	10	1010426	1010435	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008639	TTATA	2	10	1011383	1011392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_008639	CATTG	2	10	2210365	2210374	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_008639	CATTG	2	10	2210477	2210486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_008639	CATTG	2	10	2210589	2210598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
289	NC_008639	CATTG	2	10	2210701	2210710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_008639	CATTG	2	10	2210813	2210822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_008639	CATTG	2	10	2210925	2210934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_008639	CATTG	2	10	2211037	2211046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_008639	CATTG	2	10	2211149	2211158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
294	NC_008639	TAATA	2	10	2214582	2214591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_008639	AACTC	2	10	2725453	2725462	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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398	NC_008639	CATTG	2	10	2736921	2736930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
399	NC_008639	CATTG	2	10	2737130	2737139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
400	NC_008639	ACACA	2	10	2739463	2739472	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_008639	TCTGC	2	10	2749375	2749384	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
403	NC_008639	GTAAC	2	10	2773530	2773539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_008639	TAAAA	2	10	2920228	2920237	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_008639	AGCGA	2	10	2930355	2930364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.