MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 39440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	AGC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
2	NC_008639	AGA	2	6	222	227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
3	NC_008639	ACT	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355858
4	NC_008639	CTT	2	6	236	241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355858
5	NC_008639	TTC	2	6	381	386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355858
6	NC_008639	AGG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355858
7	NC_008639	ATG	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355858
8	NC_008639	TCG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355858
9	NC_008639	AGG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355858
10	NC_008639	ATC	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355858
11	NC_008639	AGA	2	6	894	899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
12	NC_008639	ACC	2	6	945	950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355858
13	NC_008639	GCG	2	6	998	1003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
14	NC_008639	CGA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
15	NC_008639	GAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
16	NC_008639	GGC	2	6	1277	1282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
17	NC_008639	CGG	2	6	1347	1352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355858
18	NC_008639	CAG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
19	NC_008639	CGA	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355858
20	NC_008639	AGA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355858
21	NC_008639	TGG	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008639	TTC	2	6	1605	1610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008639	AAT	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008639	CAA	3	9	1850	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008639	ACA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008639	TAA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008639	TGA	2	6	1893	1898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355859
28	NC_008639	TTC	2	6	2130	2135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355859
29	NC_008639	ATG	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355859
30	NC_008639	AAT	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355859
31	NC_008639	TCG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355859
32	NC_008639	AGG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355859
33	NC_008639	CAG	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355859
34	NC_008639	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355859
35	NC_008639	ATA	2	6	3022	3027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355859
36	NC_008639	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008639	AAT	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008639	CTT	2	6	3381	3386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
39	NC_008639	ATT	2	6	3499	3504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
40	NC_008639	TAA	3	9	3596	3604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355860
41	NC_008639	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
42	NC_008639	TTC	3	9	3775	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
43	NC_008639	CTT	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
44	NC_008639	TCT	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
45	NC_008639	GAA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355860
46	NC_008639	TAT	2	6	4035	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
47	NC_008639	ATG	2	6	4048	4053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355860
48	NC_008639	GAT	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355860
49	NC_008639	ACG	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355860
50	NC_008639	TCT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355860
51	NC_008639	GAC	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355860
52	NC_008639	AGA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355860
53	NC_008639	ATT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355860
54	NC_008639	GTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355861
55	NC_008639	TGA	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355861
56	NC_008639	GTT	2	6	4525	4530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355861
57	NC_008639	GAG	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355861
58	NC_008639	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008639	AGT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008639	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008639	TTC	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008639	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008639	ACC	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355862
64	NC_008639	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355862
65	NC_008639	TCC	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355862
66	NC_008639	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355862
67	NC_008639	TGA	2	6	5506	5511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355862
68	NC_008639	TCG	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355862
69	NC_008639	GAC	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355862
70	NC_008639	AAG	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355862
71	NC_008639	AAC	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355862
72	NC_008639	GAA	2	6	6363	6368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355863
73	NC_008639	GGA	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355863
74	NC_008639	CAT	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355863
75	NC_008639	GCC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119355863
76	NC_008639	ACA	2	6	6812	6817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
77	NC_008639	TCC	2	6	6902	6907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355864
78	NC_008639	GCG	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355864
79	NC_008639	ATC	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
80	NC_008639	TGC	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355864
81	NC_008639	CCA	2	6	7406	7411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355864
82	NC_008639	ACA	2	6	7775	7780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
83	NC_008639	GTG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119355864
84	NC_008639	CAA	3	9	7947	7955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355864
85	NC_008639	CCT	2	6	7970	7975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355864
86	NC_008639	TGC	2	6	8006	8011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355864
87	NC_008639	CAG	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355864
88	NC_008639	ATC	3	9	8162	8170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
89	NC_008639	AGG	2	6	8219	8224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355864
90	NC_008639	TCA	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355864
91	NC_008639	CAG	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355864
92	NC_008639	ACC	2	6	8326	8331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355864
93	NC_008639	ACC	2	6	8373	8378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355865
94	NC_008639	GAA	2	6	8442	8447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355865
95	NC_008639	GCG	2	6	8808	8813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355865
96	NC_008639	GCA	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355865
97	NC_008639	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355865
98	NC_008639	CTG	2	6	8850	8855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355865
99	NC_008639	CGA	2	6	8861	8866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355865
100	NC_008639	CAT	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355865
101	NC_008639	CAT	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355865
102	NC_008639	TCA	2	6	8947	8952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355865
103	NC_008639	ACC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355865
104	NC_008639	CGA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355865
105	NC_008639	GCT	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355865
106	NC_008639	AAC	3	9	9103	9111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355865
107	NC_008639	AGG	2	6	9122	9127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355865
108	NC_008639	TGC	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008639	GGC	2	6	9421	9426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355866
110	NC_008639	CTT	2	6	9461	9466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355866
111	NC_008639	CTC	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355866
112	NC_008639	GTT	2	6	9575	9580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355866
113	NC_008639	GGA	2	6	9598	9603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355866
114	NC_008639	CCT	2	6	9659	9664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355866
115	NC_008639	CCT	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355866
116	NC_008639	AAG	2	6	9783	9788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355866
117	NC_008639	CTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355866
118	NC_008639	CTG	2	6	9920	9925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355866
119	NC_008639	TCC	2	6	9944	9949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008639	GAA	2	6	9968	9973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008639	AAC	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008639	AGC	2	6	10089	10094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008639	ACC	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008639	CCA	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355867
125	NC_008639	CAA	2	6	10497	10502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355867
126	NC_008639	TGT	2	6	10558	10563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355867
127	NC_008639	ATA	2	6	10651	10656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355867
128	NC_008639	TGA	2	6	10755	10760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355867
129	NC_008639	CCA	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355867
130	NC_008639	CAA	2	6	10821	10826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355867
131	NC_008639	CTG	2	6	11094	11099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355868
132	NC_008639	CTG	2	6	11177	11182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355868
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