MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 5428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008639	TGG	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008639	TTC	2	6	1605	1610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008639	AAT	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008639	CAA	3	9	1850	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008639	ACA	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008639	TAA	2	6	1876	1881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008639	TAT	2	6	3174	3179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008639	AAT	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008639	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008639	AGT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008639	AAG	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008639	TTC	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008639	GCT	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008639	TGC	2	6	9265	9270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008639	TCC	2	6	9944	9949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008639	GAA	2	6	9968	9973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008639	AAC	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008639	AGC	2	6	10089	10094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008639	ACC	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008639	ATA	2	6	11639	11644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008639	AAT	2	6	12594	12599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008639	ACA	2	6	12662	12667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008639	TCT	2	6	15505	15510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008639	ATT	2	6	15528	15533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008639	AAT	2	6	15649	15654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008639	TGA	2	6	15716	15721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008639	TCT	2	6	15725	15730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008639	TTG	2	6	15888	15893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008639	CAT	2	6	15918	15923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008639	AAT	2	6	16067	16072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008639	ACA	2	6	16135	16140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008639	CTT	2	6	18629	18634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008639	ACA	2	6	18689	18694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008639	TAA	2	6	18799	18804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008639	AAC	2	6	18826	18831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008639	ATG	2	6	18985	18990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008639	ATC	2	6	19081	19086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008639	CAT	2	6	19097	19102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008639	ATC	2	6	19347	19352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008639	TAT	2	6	19445	19450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008639	CGT	2	6	19540	19545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008639	GAA	2	6	19807	19812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008639	GCC	2	6	19916	19921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008639	AAC	2	6	19925	19930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008639	CTT	2	6	20061	20066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008639	AAT	2	6	20107	20112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008639	ATC	2	6	20402	20407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008639	TCC	3	9	20591	20599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008639	CAA	2	6	20656	20661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008639	ATA	2	6	20746	20751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008639	ATT	2	6	20772	20777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008639	TGT	2	6	20821	20826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008639	CCT	2	6	22214	22219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008639	ATA	2	6	22223	22228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008639	AGG	2	6	22236	22241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008639	ATC	2	6	22272	22277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008639	CAC	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008639	ACC	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008639	GCT	2	6	22359	22364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008639	TTG	2	6	22374	22379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008639	ACA	2	6	22418	22423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008639	TTA	2	6	22518	22523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008639	TCA	2	6	22693	22698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008639	TCA	2	6	22738	22743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008639	TGG	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008639	GCT	2	6	22827	22832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008639	CTC	2	6	22908	22913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008639	TGT	2	6	22914	22919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008639	TGA	2	6	22934	22939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008639	AAG	2	6	24271	24276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008639	CAG	2	6	24341	24346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008639	ACG	2	6	24378	24383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008639	ATA	2	6	24388	24393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008639	TTC	2	6	24395	24400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008639	GTT	2	6	26973	26978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008639	AGA	2	6	27125	27130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008639	CAT	2	6	27285	27290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008639	GTT	2	6	29213	29218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008639	TTG	2	6	29233	29238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008639	AAT	2	6	29272	29277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008639	AAG	2	6	29321	29326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008639	AAC	2	6	29370	29375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008639	TTG	2	6	29376	29381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008639	GCT	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008639	TGA	2	6	29605	29610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008639	AGG	2	6	30465	30470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008639	TCA	2	6	32389	32394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008639	TTG	2	6	35252	35257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008639	CAA	2	6	35263	35268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008639	TGT	2	6	35280	35285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008639	CCG	2	6	35324	35329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008639	GCT	2	6	35349	35354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008639	CTG	2	6	38769	38774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008639	GGA	2	6	38781	38786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008639	TGT	2	6	39823	39828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008639	GAC	2	6	40259	40264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008639	TGA	2	6	40327	40332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008639	GGA	2	6	40346	40351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008639	TGC	2	6	40369	40374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008639	TCT	2	6	40385	40390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008639	TTC	2	6	40474	40479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008639	TTC	2	6	40488	40493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008639	ATG	2	6	40551	40556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008639	GTT	2	6	40571	40576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008639	AGC	2	6	43329	43334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008639	GTT	3	9	45784	45792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008639	CGG	2	6	48567	48572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008639	ATG	2	6	51789	51794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008639	CTA	2	6	51921	51926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008639	ATA	2	6	54733	54738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008639	GGC	2	6	55545	55550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008639	AAC	2	6	55577	55582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008639	CCT	3	9	57453	57461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008639	CAG	2	6	57511	57516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008639	AAT	2	6	57579	57584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008639	TTG	2	6	57612	57617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008639	AAG	2	6	57670	57675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008639	CTC	2	6	57685	57690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_008639	AGT	2	6	57819	57824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008639	AGG	2	6	57836	57841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008639	GAA	3	9	57946	57954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008639	AGA	2	6	57993	57998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008639	AGA	2	6	58138	58143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008639	AGA	2	6	58221	58226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008639	TGT	2	6	58355	58360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008639	TCA	2	6	58562	58567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008639	AGA	2	6	58620	58625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008639	GTT	2	6	58692	58697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008639	TCA	2	6	58898	58903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008639	TTG	2	6	60723	60728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008639	TGA	2	6	60746	60751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008639	AAC	2	6	62266	62271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008639	CAG	2	6	62289	62294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008639	CTG	2	6	62352	62357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008639	TCG	2	6	62592	62597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008639	CTG	2	6	62640	62645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008639	ACG	2	6	67169	67174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008639	TTA	2	6	67198	67203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008639	TAT	2	6	69944	69949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008639	TCT	2	6	72969	72974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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