MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans Agy99 chromosome

Total Repeats: 3442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008611	TGATC	2	10	1209	1218	20 %	40 %	20 %	20 %	118615920
2	NC_008611	ACCAC	2	10	1415	1424	40 %	0 %	0 %	60 %	118615920
3	NC_008611	GCTGA	2	10	2903	2912	20 %	20 %	40 %	20 %	118615921
4	NC_008611	CGGTT	2	10	3261	3270	0 %	40 %	40 %	20 %	118615921
5	NC_008611	CCGGC	2	10	4942	4951	0 %	0 %	40 %	60 %	118615923
6	NC_008611	GGCGC	2	10	5848	5857	0 %	0 %	60 %	40 %	118615924
7	NC_008611	GCAGC	2	10	7420	7429	20 %	0 %	40 %	40 %	118615925
8	NC_008611	GGGCC	2	10	9427	9436	0 %	0 %	60 %	40 %	118615925
9	NC_008611	GCGCG	2	10	10094	10103	0 %	0 %	60 %	40 %	118615926
10	NC_008611	CCGAT	2	10	10394	10403	20 %	20 %	20 %	40 %	118615926
11	NC_008611	CCGAC	2	10	11372	11381	20 %	0 %	20 %	60 %	118615927
12	NC_008611	TCATC	2	10	12707	12716	20 %	40 %	0 %	40 %	118615928
13	NC_008611	CACCG	2	10	13178	13187	20 %	0 %	20 %	60 %	118615929
14	NC_008611	GCCGG	2	10	14042	14051	0 %	0 %	60 %	40 %	118615930
15	NC_008611	ACCAG	2	10	14971	14980	40 %	0 %	20 %	40 %	118615932
16	NC_008611	CCAGC	2	10	16818	16827	20 %	0 %	20 %	60 %	118615935
17	NC_008611	GCAGC	2	10	17435	17444	20 %	0 %	40 %	40 %	118615935
18	NC_008611	CGGCG	2	10	18969	18978	0 %	0 %	60 %	40 %	118615936
19	NC_008611	TTAGC	2	10	20196	20205	20 %	40 %	20 %	20 %	118615937
20	NC_008611	TGGCG	2	10	24504	24513	0 %	20 %	60 %	20 %	118615940
21	NC_008611	GGGTC	2	10	25965	25974	0 %	20 %	60 %	20 %	118615941
22	NC_008611	CGCGG	2	10	36459	36468	0 %	0 %	60 %	40 %	118615950
23	NC_008611	CGGCG	2	10	36965	36974	0 %	0 %	60 %	40 %	118615951
24	NC_008611	GCTGG	2	10	37502	37511	0 %	20 %	60 %	20 %	118615951
25	NC_008611	TGGGC	2	10	37817	37826	0 %	20 %	60 %	20 %	118615951
26	NC_008611	TCGGT	2	10	38399	38408	0 %	40 %	40 %	20 %	118615953
27	NC_008611	GGGGC	2	10	38440	38449	0 %	0 %	80 %	20 %	118615953
28	NC_008611	CCACC	2	10	39510	39519	20 %	0 %	0 %	80 %	118615954
29	NC_008611	GCCTC	2	10	40291	40300	0 %	20 %	20 %	60 %	118615955
30	NC_008611	GTGCT	2	10	41970	41979	0 %	40 %	40 %	20 %	118615957
31	NC_008611	ATCGG	2	10	48066	48075	20 %	20 %	40 %	20 %	118615965
32	NC_008611	GAGTC	2	10	50283	50292	20 %	20 %	40 %	20 %	118615968
33	NC_008611	GTGGC	2	10	54797	54806	0 %	20 %	60 %	20 %	118615971
34	NC_008611	GCCAT	2	10	59113	59122	20 %	20 %	20 %	40 %	118615973
35	NC_008611	ACGCC	2	10	61904	61913	20 %	0 %	20 %	60 %	118615976
36	NC_008611	GGTCG	2	10	63273	63282	0 %	20 %	60 %	20 %	118615978
37	NC_008611	CCGCG	2	10	65257	65266	0 %	0 %	40 %	60 %	118615980
38	NC_008611	TCGGC	2	10	65412	65421	0 %	20 %	40 %	40 %	118615980
39	NC_008611	CTGGC	2	10	67714	67723	0 %	20 %	40 %	40 %	118615981
40	NC_008611	TCCGG	2	10	67973	67982	0 %	20 %	40 %	40 %	118615981
41	NC_008611	CGGCG	2	10	68101	68110	0 %	0 %	60 %	40 %	118615981
42	NC_008611	CCGCG	2	10	68267	68276	0 %	0 %	40 %	60 %	118615981
43	NC_008611	GCTCG	2	10	70975	70984	0 %	20 %	40 %	40 %	118615986
44	NC_008611	TGCGT	2	10	74081	74090	0 %	40 %	40 %	20 %	118615988
45	NC_008611	CTGGA	2	10	74167	74176	20 %	20 %	40 %	20 %	118615988
46	NC_008611	CCAGG	2	10	74622	74631	20 %	0 %	40 %	40 %	118615989
47	NC_008611	CGACA	2	10	82975	82984	40 %	0 %	20 %	40 %	118615993
48	NC_008611	CCCGG	2	10	86418	86427	0 %	0 %	40 %	60 %	118615995
49	NC_008611	TCGAC	2	10	90488	90497	20 %	20 %	20 %	40 %	118616000
50	NC_008611	CATCG	2	10	90999	91008	20 %	20 %	20 %	40 %	118616000
51	NC_008611	GCGCC	2	10	91727	91736	0 %	0 %	40 %	60 %	118616000
52	NC_008611	CCGTG	2	10	92673	92682	0 %	20 %	40 %	40 %	118616001
53	NC_008611	CCTCG	2	10	93234	93243	0 %	20 %	20 %	60 %	118616001
54	NC_008611	CTGAC	2	10	93688	93697	20 %	20 %	20 %	40 %	118616002
55	NC_008611	TCCGG	2	10	95321	95330	0 %	20 %	40 %	40 %	118616003
56	NC_008611	TGGGC	2	10	96102	96111	0 %	20 %	60 %	20 %	118616003
57	NC_008611	GATGC	2	10	96846	96855	20 %	20 %	40 %	20 %	118616004
58	NC_008611	CAGCG	2	10	97125	97134	20 %	0 %	40 %	40 %	118616004
59	NC_008611	GATGC	2	10	99439	99448	20 %	20 %	40 %	20 %	118616005
60	NC_008611	CAGCG	2	10	99718	99727	20 %	0 %	40 %	40 %	118616005
61	NC_008611	GCACA	2	10	111781	111790	40 %	0 %	20 %	40 %	118616011
62	NC_008611	CGCGT	2	10	111881	111890	0 %	20 %	40 %	40 %	118616012
63	NC_008611	GGCCC	2	10	114231	114240	0 %	0 %	40 %	60 %	118616015
64	NC_008611	CTTTT	2	10	115239	115248	0 %	80 %	0 %	20 %	118616015
65	NC_008611	AGCGC	2	10	115640	115649	20 %	0 %	40 %	40 %	118616015
66	NC_008611	GATCT	2	10	119638	119647	20 %	40 %	20 %	20 %	118616017
67	NC_008611	CGGCC	2	10	119673	119682	0 %	0 %	40 %	60 %	118616017
68	NC_008611	GCGCC	2	10	120877	120886	0 %	0 %	40 %	60 %	118616019
69	NC_008611	CATCG	2	10	121781	121790	20 %	20 %	20 %	40 %	118616020
70	NC_008611	CCAGC	2	10	121958	121967	20 %	0 %	20 %	60 %	118616020
71	NC_008611	AGCCC	2	10	122097	122106	20 %	0 %	20 %	60 %	118616021
72	NC_008611	CATGC	2	10	122329	122338	20 %	20 %	20 %	40 %	118616021
73	NC_008611	CAACG	2	10	123374	123383	40 %	0 %	20 %	40 %	118616022
74	NC_008611	CGGCA	2	10	126468	126477	20 %	0 %	40 %	40 %	118616025
75	NC_008611	GCCGT	2	10	130084	130093	0 %	20 %	40 %	40 %	118616027
76	NC_008611	CGGCG	2	10	130429	130438	0 %	0 %	60 %	40 %	118616027
77	NC_008611	GATGC	2	10	131265	131274	20 %	20 %	40 %	20 %	118616028
78	NC_008611	CAGCG	2	10	131544	131553	20 %	0 %	40 %	40 %	118616028
79	NC_008611	CGCTG	2	10	134218	134227	0 %	20 %	40 %	40 %	118616030
80	NC_008611	GCATC	2	10	134497	134506	20 %	20 %	20 %	40 %	118616030
81	NC_008611	CTGGA	2	10	140696	140705	20 %	20 %	40 %	20 %	118616034
82	NC_008611	GTCGG	2	10	141268	141277	0 %	20 %	60 %	20 %	118616035
83	NC_008611	CCGCG	2	10	141388	141397	0 %	0 %	40 %	60 %	118616035
84	NC_008611	CCTCG	2	10	142551	142560	0 %	20 %	20 %	60 %	118616035
85	NC_008611	AACGA	2	10	142808	142817	60 %	0 %	20 %	20 %	118616035
86	NC_008611	CAGCC	2	10	145114	145123	20 %	0 %	20 %	60 %	118616036
87	NC_008611	CGTGC	2	10	145884	145893	0 %	20 %	40 %	40 %	118616037
88	NC_008611	GGCCT	2	10	147225	147234	0 %	20 %	40 %	40 %	118616038
89	NC_008611	AACGC	2	10	147933	147942	40 %	0 %	20 %	40 %	118616039
90	NC_008611	ACTCG	2	10	151482	151491	20 %	20 %	20 %	40 %	118616041
91	NC_008611	TCGGC	2	10	153690	153699	0 %	20 %	40 %	40 %	162138272
92	NC_008611	TCGGC	2	10	154508	154517	0 %	20 %	40 %	40 %	118616045
93	NC_008611	GATCT	2	10	155058	155067	20 %	40 %	20 %	20 %	118616045
94	NC_008611	GCACG	2	10	155075	155084	20 %	0 %	40 %	40 %	118616045
95	NC_008611	GAGTT	2	10	155092	155101	20 %	40 %	40 %	0 %	118616045
96	NC_008611	GGTTT	2	10	157826	157835	0 %	60 %	40 %	0 %	118616049
97	NC_008611	GCCGA	2	10	159043	159052	20 %	0 %	40 %	40 %	118616051
98	NC_008611	CGCTG	2	10	167515	167524	0 %	20 %	40 %	40 %	118616058
99	NC_008611	GCATC	2	10	167794	167803	20 %	20 %	20 %	40 %	118616058
100	NC_008611	GTTCA	2	10	169177	169186	20 %	40 %	20 %	20 %	118616059
101	NC_008611	GCACG	2	10	169317	169326	20 %	0 %	40 %	40 %	118616059
102	NC_008611	TCCGA	2	10	169568	169577	20 %	20 %	20 %	40 %	118616059
103	NC_008611	GCCGG	2	10	170852	170861	0 %	0 %	60 %	40 %	118616060
104	NC_008611	GCCCG	2	10	175167	175176	0 %	0 %	40 %	60 %	118616065
105	NC_008611	CGCTG	2	10	176685	176694	0 %	20 %	40 %	40 %	118616068
106	NC_008611	GCATC	2	10	176964	176973	20 %	20 %	20 %	40 %	118616068
107	NC_008611	CTGCG	2	10	180987	180996	0 %	20 %	40 %	40 %	118616070
108	NC_008611	TGGCG	2	10	183730	183739	0 %	20 %	60 %	20 %	118616073
109	NC_008611	CGGGC	2	10	185032	185041	0 %	0 %	60 %	40 %	118616074
110	NC_008611	GCAGG	2	10	189803	189812	20 %	0 %	60 %	20 %	118616076
111	NC_008611	TCGTC	2	10	190138	190147	0 %	40 %	20 %	40 %	118616077
112	NC_008611	TGTTC	2	10	190708	190717	0 %	60 %	20 %	20 %	118616077
113	NC_008611	CCGGC	2	10	191932	191941	0 %	0 %	40 %	60 %	118616078
114	NC_008611	CGAGC	2	10	192284	192293	20 %	0 %	40 %	40 %	118616079
115	NC_008611	CCAGC	2	10	193921	193930	20 %	0 %	20 %	60 %	118616080
116	NC_008611	CCGCG	2	10	198274	198283	0 %	0 %	40 %	60 %	118616084
117	NC_008611	GCATG	2	10	199572	199581	20 %	20 %	40 %	20 %	118616086
118	NC_008611	GGCGC	2	10	199627	199636	0 %	0 %	60 %	40 %	118616086
119	NC_008611	CTCGA	2	10	201278	201287	20 %	20 %	20 %	40 %	118616088
120	NC_008611	TCCCG	2	10	202303	202312	0 %	20 %	20 %	60 %	118616089
121	NC_008611	CCTGA	2	10	203441	203450	20 %	20 %	20 %	40 %	118616090
122	NC_008611	GCCGC	2	10	203791	203800	0 %	0 %	40 %	60 %	118616091
123	NC_008611	TGCCT	2	10	205856	205865	0 %	40 %	20 %	40 %	118616093
124	NC_008611	CGTTT	2	10	206830	206839	0 %	60 %	20 %	20 %	118616093
125	NC_008611	CCGGC	2	10	212817	212826	0 %	0 %	40 %	60 %	118616098
126	NC_008611	GATGC	2	10	219948	219957	20 %	20 %	40 %	20 %	118616102
127	NC_008611	GCACC	2	10	221717	221726	20 %	0 %	20 %	60 %	118616103
128	NC_008611	TCGGC	2	10	221953	221962	0 %	20 %	40 %	40 %	118616104
129	NC_008611	CCCAG	2	10	221995	222004	20 %	0 %	20 %	60 %	118616104
130	NC_008611	ACGGC	2	10	222646	222655	20 %	0 %	40 %	40 %	118616105
131	NC_008611	CCCGT	2	10	225820	225829	0 %	20 %	20 %	60 %	118616107
132	NC_008611	GTCCC	2	10	225900	225909	0 %	20 %	20 %	60 %	118616107
133	NC_008611	GATGC	2	10	229118	229127	20 %	20 %	40 %	20 %	118616109
134	NC_008611	CAGCG	2	10	229397	229406	20 %	0 %	40 %	40 %	118616110
135	NC_008611	CGATC	2	10	232981	232990	20 %	20 %	20 %	40 %	118616113
136	NC_008611	CCGGA	2	10	236683	236692	20 %	0 %	40 %	40 %	118616115
137	NC_008611	CGCTG	2	10	238174	238183	0 %	20 %	40 %	40 %	118616116
138	NC_008611	GCATC	2	10	238453	238462	20 %	20 %	20 %	40 %	118616116
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153	NC_008611	GCCGA	2	10	261436	261445	20 %	0 %	40 %	40 %	118616131
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252	NC_008611	CCGGA	2	10	426988	426997	20 %	0 %	40 %	40 %	118616267
253	NC_008611	GGGGT	2	10	427433	427442	0 %	20 %	80 %	0 %	118616267
254	NC_008611	CATCC	2	10	427677	427686	20 %	20 %	0 %	60 %	118616267
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256	NC_008611	GTGCA	2	10	431202	431211	20 %	20 %	40 %	20 %	118616269
257	NC_008611	ACCCC	2	10	432289	432298	20 %	0 %	0 %	80 %	118616270
258	NC_008611	TCGCC	2	10	432718	432727	0 %	20 %	20 %	60 %	118616270
259	NC_008611	GCGCG	2	10	433067	433076	0 %	0 %	60 %	40 %	118616271
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263	NC_008611	GCTGC	2	10	440119	440128	0 %	20 %	40 %	40 %	118616277
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