MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	GAAATT	2	12	2482	2493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602062
2	NC_008610	TAGTGG	2	12	10382	10393	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602067
3	NC_008610	AATTAA	2	12	13113	13124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602070
4	NC_008610	AAAATT	2	12	13989	14000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602070
5	NC_008610	ATCAAC	2	12	14539	14550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118602071
6	NC_008610	TATTAG	2	12	17172	17183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602073
7	NC_008610	TATTGA	2	12	17325	17336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602073
8	NC_008610	ACCAGT	2	12	19919	19930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008610	TCAAAA	2	12	20729	20740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602076
10	NC_008610	TTTGGC	2	12	24776	24787	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118602079
11	NC_008610	CGATTA	2	12	30935	30946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118602086
12	NC_008610	AATTCA	2	12	30971	30982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602086
13	NC_008610	AGCAAT	2	12	38463	38474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602092
14	NC_008610	CATGGC	2	12	38760	38771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602092
15	NC_008610	AGCAAC	2	12	40387	40398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602094
16	NC_008610	AAATAA	2	12	41994	42005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008610	TAGGTT	2	12	43628	43639	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008610	ATTAGT	2	12	45949	45960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602098
19	NC_008610	CCCTAG	2	12	46785	46796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008610	ATCCAG	2	12	47540	47551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602100
21	NC_008610	TACGCG	2	12	54920	54931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602104
22	NC_008610	ATTTTT	2	12	56757	56768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602107
23	NC_008610	ATTTTT	2	12	60285	60296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602109
24	NC_008610	GCGCAA	2	12	63002	63013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602112
25	NC_008610	ATTGCT	2	12	63251	63262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602112
26	NC_008610	ATTGAT	2	12	63836	63847	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602112
27	NC_008610	AAAGTG	2	12	64472	64483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602112
28	NC_008610	AACACA	2	12	70186	70197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602117
29	NC_008610	ATAAAT	2	12	77774	77785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008610	TAATGT	2	12	78212	78223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602123
31	NC_008610	TTAGAT	2	12	78348	78359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602123
32	NC_008610	AATTAA	2	12	81897	81908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602126
33	NC_008610	AGCTTT	2	12	85362	85373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008610	TAAACT	2	12	86901	86912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602131
35	NC_008610	TAAAAT	2	12	89814	89825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008610	ATGTTT	2	12	90193	90204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602133
37	NC_008610	AAGCAC	2	12	101157	101168	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602139
38	NC_008610	TGAGCC	2	12	104142	104153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602142
39	NC_008610	ATCGTG	2	12	106081	106092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602143
40	NC_008610	TGAAAT	2	12	106371	106382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602144
41	NC_008610	CCATTG	2	12	108025	108036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118602147
42	NC_008610	ACTTGC	2	12	115285	115296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008610	TGTTAT	2	12	120331	120342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008610	AATTGG	2	12	121319	121330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008610	ACGTTA	2	12	121727	121738	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008610	GCATTG	2	12	126166	126177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602158
47	NC_008610	AATACA	2	12	127393	127404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602159
48	NC_008610	TTCAAA	2	12	133899	133910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602165
49	NC_008610	TTAGTA	2	12	135357	135368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602166
50	NC_008610	TAAAGC	2	12	138239	138250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602170
51	NC_008610	TTAATT	2	12	139779	139790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008610	GGTATG	2	12	142101	142112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602171
53	NC_008610	CAAGCT	2	12	148002	148013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602178
54	NC_008610	TATTGA	2	12	148838	148849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602178
55	NC_008610	TTTGAT	2	12	150195	150206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602179
56	NC_008610	TATCTT	2	12	150241	150252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118602179
57	NC_008610	TTAATA	2	12	150541	150552	50 %	50 %	0 %	0 %	118602179
58	NC_008610	TATTAA	2	12	153081	153092	50 %	50 %	0 %	0 %	118602181
59	NC_008610	TTGATT	2	12	158474	158485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602185
60	NC_008610	GAATTT	2	12	158721	158732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008610	GTGATT	2	12	159697	159708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602186
62	NC_008610	GGTAAA	2	12	159946	159957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602186
63	NC_008610	GCAAAA	2	12	161058	161069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118602187
64	NC_008610	GGTTTT	2	12	161325	161336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602187
65	NC_008610	TGATGG	2	12	162312	162323	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602188
66	NC_008610	TGTTAC	2	12	167000	167011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602191
67	NC_008610	CAAAAA	2	12	167580	167591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602191
68	NC_008610	GCTTTC	2	12	169020	169031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118602193
69	NC_008610	TGAAGA	2	12	175874	175885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008610	GATGAA	2	12	176123	176134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008610	TATATT	2	12	178709	178720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008610	CCAATG	2	12	187474	187485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602208
73	NC_008610	TAGATG	2	12	189075	189086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602210
74	NC_008610	TCGTGC	2	12	192893	192904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602214
75	NC_008610	ATTTAT	2	12	193162	193173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602214
76	NC_008610	GTAAAG	2	12	196011	196022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602220
77	NC_008610	TATTGT	2	12	198520	198531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602227
78	NC_008610	TTACTA	2	12	198678	198689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118602228
79	NC_008610	AACAAA	2	12	202756	202767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602235
80	NC_008610	AATTAT	2	12	203845	203856	50 %	50 %	0 %	0 %	118602238
81	NC_008610	TATATG	2	12	205758	205769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008610	TATATT	2	12	211858	211869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008610	ATAAGG	2	12	216354	216365	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602247
84	NC_008610	TGATAT	2	12	218453	218464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602249
85	NC_008610	AAGTAA	2	12	221242	221253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602251
86	NC_008610	ATGAAA	2	12	221961	221972	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602252
87	NC_008610	TAAAGG	2	12	223075	223086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602252
88	NC_008610	GTGCAG	2	12	223257	223268	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602252
89	NC_008610	ATTAAC	3	18	223797	223814	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008610	TATTTT	2	12	224097	224108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008610	TAAAAT	2	12	230046	230057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008610	AAACCA	2	12	230979	230990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602259
93	NC_008610	CAAGTC	2	12	231025	231036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602259
94	NC_008610	TACGGT	2	12	231056	231067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602259
95	NC_008610	GGCAAT	2	12	231679	231690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118602260
96	NC_008610	TACAAC	2	12	242921	242932	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008610	CCATTT	2	12	245600	245611	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602271
98	NC_008610	AATTTG	2	12	249947	249958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602273
99	NC_008610	CGTGAA	2	12	253876	253887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118602278
100	NC_008610	GAAAAT	2	12	254838	254849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602279
101	NC_008610	CGTGGT	2	12	255356	255367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118602280
102	NC_008610	AGGTGC	2	12	255694	255705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602280
103	NC_008610	ATTGAA	2	12	256485	256496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602281
104	NC_008610	TGATCG	2	12	257252	257263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602281
105	NC_008610	CACTAT	2	12	266153	266164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602288
106	NC_008610	GTTATT	2	12	266578	266589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602289
107	NC_008610	GCAGGT	2	12	267016	267027	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602289
108	NC_008610	AGATAG	2	12	269298	269309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602289
109	NC_008610	TCACTA	2	12	272234	272245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602289
110	NC_008610	ACAATA	2	12	272855	272866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602289
111	NC_008610	TCTTAA	2	12	274740	274751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118602289
112	NC_008610	ATATTA	2	12	274874	274885	50 %	50 %	0 %	0 %	118602289
113	NC_008610	TCCTAA	2	12	278766	278777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602293
114	NC_008610	TTGGTA	2	12	280561	280572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602293
115	NC_008610	AAGAAC	2	12	282335	282346	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008610	TTTCCA	2	12	282620	282631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602295
117	NC_008610	AATACA	2	12	284494	284505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602297
118	NC_008610	TTTCTT	2	12	285672	285683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118602299
119	NC_008610	TACCTG	2	12	286428	286439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118602300
120	NC_008610	GTTTTA	2	12	289094	289105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602301
121	NC_008610	ATATCA	2	12	293201	293212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602306
122	NC_008610	TAAATT	2	12	293375	293386	50 %	50 %	0 %	0 %	118602307
123	NC_008610	TTAGGT	2	12	297683	297694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602310
124	NC_008610	TGAGAA	2	12	298195	298206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602310
125	NC_008610	AATGAT	2	12	298870	298881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602311
126	NC_008610	TGTGTT	2	12	299785	299796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602312
127	NC_008610	CATGAC	2	12	302576	302587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602315
128	NC_008610	AAAAAC	2	12	304462	304473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602317
129	NC_008610	ACAAAG	2	12	306381	306392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118602318
130	NC_008610	ATTTAA	2	12	307023	307034	50 %	50 %	0 %	0 %	118602318
131	NC_008610	AAATGA	2	12	307706	307717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602319
132	NC_008610	TTCGTA	2	12	308015	308026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602319
133	NC_008610	CAAAGC	2	12	313728	313739	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602327
134	NC_008610	ATTTTC	2	12	314728	314739	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_008610	TCAATA	2	12	315774	315785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602328
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139	NC_008610	AGCTTT	2	12	321496	321507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602333
140	NC_008610	TAAAAC	2	12	322285	322296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602334
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142	NC_008610	GATGTA	2	12	326523	326534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602336
143	NC_008610	TAAAGG	2	12	327602	327613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602336
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145	NC_008610	TCAGAA	2	12	330773	330784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602340
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147	NC_008610	GAAGGC	2	12	331064	331075	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118602340
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149	NC_008610	TTTTAA	2	12	338725	338736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008610	CTAGTG	2	12	343613	343624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602349
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155	NC_008610	ACCAAC	2	12	357886	357897	50 %	0 %	0 %	50 %	118602365
156	NC_008610	TATTGG	2	12	358854	358865	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602366
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165	NC_008610	TTAGAT	2	12	388089	388100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008610	TTGATT	2	12	391433	391444	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602389
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179	NC_008610	AACTTA	2	12	407838	407849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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188	NC_008610	TGTTTT	2	12	423104	423115	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118602412
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199	NC_008610	ATGCTA	2	12	452928	452939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118602431
200	NC_008610	GCTTTG	2	12	454110	454121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118602433
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204	NC_008610	CCACAA	2	12	458207	458218	50 %	0 %	0 %	50 %	118602439
205	NC_008610	CATCAG	2	12	462385	462396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602441
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208	NC_008610	TTGTAG	2	12	475840	475851	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602451
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218	NC_008610	TGGTAA	2	12	500242	500253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602472
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221	NC_008610	ACTCTT	2	12	503078	503089	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_008610	TAATGA	2	12	503943	503954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602474
223	NC_008610	GTACTT	2	12	504962	504973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602474
224	NC_008610	TATTTT	2	12	506541	506552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_008610	CAATAA	2	12	507795	507806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602475
226	NC_008610	ATTTTT	2	12	508803	508814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602476
227	NC_008610	CATCTT	2	12	510586	510597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602477
228	NC_008610	ATACCA	2	12	514830	514841	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118602479
229	NC_008610	TCAATA	2	12	515510	515521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602480
230	NC_008610	TTTTGA	2	12	516898	516909	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602481
231	NC_008610	ATTACG	2	12	517570	517581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118602482
232	NC_008610	TTGCTA	2	12	517653	517664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602482
233	NC_008610	TTGAGA	2	12	519358	519369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602483
234	NC_008610	AATAAA	2	12	520067	520078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118602483
235	NC_008610	ATAACA	2	12	520139	520150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602483
236	NC_008610	GGCTTG	2	12	521215	521226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118602486
237	NC_008610	ATGGTT	2	12	525675	525686	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602489
238	NC_008610	CACCTA	2	12	525900	525911	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118602489
239	NC_008610	ATTAAT	2	12	526568	526579	50 %	50 %	0 %	0 %	118602489
240	NC_008610	TTGTTA	3	18	527330	527347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602490
241	NC_008610	TTTTTA	2	12	527348	527359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602490
242	NC_008610	AATAAA	2	12	527683	527694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118602490
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248	NC_008610	ATTTAT	2	12	534656	534667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_008610	ATGGTT	2	12	554469	554480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602518
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274	NC_008610	TTTGCT	2	12	572357	572368	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118602534
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342	NC_008610	TATTTT	2	12	749113	749124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_008610	CTGTAC	2	12	749316	749327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
344	NC_008610	ACCCAA	2	12	751806	751817	50 %	0 %	0 %	50 %	118602692
345	NC_008610	TTTTAT	2	12	756415	756426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
346	NC_008610	GTAAAA	2	12	759478	759489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602696
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349	NC_008610	CCACTA	2	12	761613	761624	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118602698
350	NC_008610	AATGAT	2	12	761740	761751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
351	NC_008610	CACTGC	2	12	766853	766864	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118602702
352	NC_008610	ATCTTG	2	12	767177	767188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602702
353	NC_008610	ATTACC	2	12	767712	767723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602702
354	NC_008610	CTTAAA	2	12	769331	769342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_008610	AGTGTT	2	12	770576	770587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602703
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470	NC_008610	ATTGTT	2	12	1007709	1007720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_008610	TTGGCA	2	12	1008646	1008657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602911
472	NC_008610	CTATTG	2	12	1008843	1008854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602911
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479	NC_008610	GCACTG	2	12	1016342	1016353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602918
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499	NC_008610	AAGAAA	2	12	1068005	1068016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008610	TATTAA	2	12	1071200	1071211	50 %	50 %	0 %	0 %	118602966

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