MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	TCAAA	2	10	206	215	60 %	20 %	0 %	20 %	118602061
2	NC_008610	CACAA	2	10	226	235	60 %	0 %	0 %	40 %	118602061
3	NC_008610	AGGAA	2	10	632	641	60 %	0 %	40 %	0 %	118602061
4	NC_008610	GGCAT	2	10	4683	4692	20 %	20 %	40 %	20 %	118602063
5	NC_008610	GAAAA	2	10	5061	5070	80 %	0 %	20 %	0 %	118602063
6	NC_008610	AGAAA	2	10	5472	5481	80 %	0 %	20 %	0 %	118602064
7	NC_008610	TTTCT	2	10	5579	5588	0 %	80 %	0 %	20 %	118602064
8	NC_008610	AAACA	2	10	6116	6125	80 %	0 %	0 %	20 %	118602064
9	NC_008610	CCGTA	2	10	8361	8370	20 %	20 %	20 %	40 %	118602065
10	NC_008610	AATCG	2	10	8629	8638	40 %	20 %	20 %	20 %	118602065
11	NC_008610	CCAAT	2	10	8681	8690	40 %	20 %	0 %	40 %	118602065
12	NC_008610	CAATT	2	10	11496	11505	40 %	40 %	0 %	20 %	118602068
13	NC_008610	TTTGT	2	10	12195	12204	0 %	80 %	20 %	0 %	118602069
14	NC_008610	TTGAT	2	10	15010	15019	20 %	60 %	20 %	0 %	118602072
15	NC_008610	AGGCG	2	10	16986	16995	20 %	0 %	60 %	20 %	118602073
16	NC_008610	AATGG	2	10	17894	17903	40 %	20 %	40 %	0 %	118602074
17	NC_008610	GGATT	2	10	18410	18419	20 %	40 %	40 %	0 %	118602074
18	NC_008610	TCTGC	2	10	19056	19065	0 %	40 %	20 %	40 %	118602075
19	NC_008610	TTTTG	2	10	19418	19427	0 %	80 %	20 %	0 %	118602075
20	NC_008610	CCAAT	2	10	22257	22266	40 %	20 %	0 %	40 %	118602077
21	NC_008610	TTGTC	2	10	23858	23867	0 %	60 %	20 %	20 %	118602078
22	NC_008610	AGGTT	2	10	24510	24519	20 %	40 %	40 %	0 %	118602079
23	NC_008610	TTGGA	2	10	24744	24753	20 %	40 %	40 %	0 %	118602079
24	NC_008610	ATATG	2	10	25666	25675	40 %	40 %	20 %	0 %	118602081
25	NC_008610	GCAGT	2	10	26030	26039	20 %	20 %	40 %	20 %	118602081
26	NC_008610	CCAAA	2	10	26698	26707	60 %	0 %	0 %	40 %	118602082
27	NC_008610	TGTAA	2	10	27958	27967	40 %	40 %	20 %	0 %	118602083
28	NC_008610	ATGCT	2	10	28909	28918	20 %	40 %	20 %	20 %	118602083
29	NC_008610	TTGAT	2	10	29095	29104	20 %	60 %	20 %	0 %	118602084
30	NC_008610	AGTCA	2	10	29250	29259	40 %	20 %	20 %	20 %	118602084
31	NC_008610	AAGTC	2	10	30111	30120	40 %	20 %	20 %	20 %	118602085
32	NC_008610	GCTAT	2	10	36057	36066	20 %	40 %	20 %	20 %	118602089
33	NC_008610	GAAAA	2	10	38429	38438	80 %	0 %	20 %	0 %	118602092
34	NC_008610	TATTC	2	10	41815	41824	20 %	60 %	0 %	20 %	118602094
35	NC_008610	TCGTT	2	10	42859	42868	0 %	60 %	20 %	20 %	118602096
36	NC_008610	AAATG	2	10	46697	46706	60 %	20 %	20 %	0 %	118602099
37	NC_008610	TTGGT	2	10	47115	47124	0 %	60 %	40 %	0 %	118602100
38	NC_008610	TGGCT	2	10	50953	50962	0 %	40 %	40 %	20 %	118602102
39	NC_008610	CTTTC	2	10	51542	51551	0 %	60 %	0 %	40 %	118602102
40	NC_008610	AAATA	2	10	51766	51775	80 %	20 %	0 %	0 %	118602102
41	NC_008610	AATGC	2	10	53089	53098	40 %	20 %	20 %	20 %	118602103
42	NC_008610	TTGGG	2	10	54681	54690	0 %	40 %	60 %	0 %	118602104
43	NC_008610	ACACT	2	10	59035	59044	40 %	20 %	0 %	40 %	118602108
44	NC_008610	ATATC	2	10	59787	59796	40 %	40 %	0 %	20 %	118602109
45	NC_008610	GTACT	2	10	64023	64032	20 %	40 %	20 %	20 %	118602112
46	NC_008610	ACATT	2	10	64518	64527	40 %	40 %	0 %	20 %	118602112
47	NC_008610	CAACA	2	10	67785	67794	60 %	0 %	0 %	40 %	118602115
48	NC_008610	TTCGC	2	10	68722	68731	0 %	40 %	20 %	40 %	118602116
49	NC_008610	TGGAT	2	10	68788	68797	20 %	40 %	40 %	0 %	118602116
50	NC_008610	GAACG	2	10	69600	69609	40 %	0 %	40 %	20 %	118602117
51	NC_008610	TTTGC	2	10	70145	70154	0 %	60 %	20 %	20 %	118602117
52	NC_008610	CTAAC	2	10	72804	72813	40 %	20 %	0 %	40 %	118602119
53	NC_008610	ATGGT	2	10	72909	72918	20 %	40 %	40 %	0 %	118602119
54	NC_008610	GATGC	2	10	73131	73140	20 %	20 %	40 %	20 %	118602119
55	NC_008610	TTCAA	2	10	78131	78140	40 %	40 %	0 %	20 %	118602123
56	NC_008610	AAGTA	2	10	78907	78916	60 %	20 %	20 %	0 %	118602123
57	NC_008610	TGATT	2	10	80231	80240	20 %	60 %	20 %	0 %	118602124
58	NC_008610	GTTTT	2	10	81773	81782	0 %	80 %	20 %	0 %	118602126
59	NC_008610	ATTTA	2	10	82164	82173	40 %	60 %	0 %	0 %	118602126
60	NC_008610	ACAAA	2	10	82218	82227	80 %	0 %	0 %	20 %	118602126
61	NC_008610	ATAGA	2	10	82298	82307	60 %	20 %	20 %	0 %	118602127
62	NC_008610	TTTTG	2	10	84097	84106	0 %	80 %	20 %	0 %	118602129
63	NC_008610	TATTT	2	10	84556	84565	20 %	80 %	0 %	0 %	118602129
64	NC_008610	TACTT	2	10	86611	86620	20 %	60 %	0 %	20 %	118602131
65	NC_008610	TGAAA	2	10	87393	87402	60 %	20 %	20 %	0 %	118602131
66	NC_008610	AGCAC	2	10	90365	90374	40 %	0 %	20 %	40 %	118602133
67	NC_008610	AGCCT	2	10	90678	90687	20 %	20 %	20 %	40 %	118602133
68	NC_008610	AAAAC	2	10	91064	91073	80 %	0 %	0 %	20 %	118602134
69	NC_008610	TTGCC	2	10	91735	91744	0 %	40 %	20 %	40 %	118602134
70	NC_008610	ACAAA	2	10	93261	93270	80 %	0 %	0 %	20 %	118602134
71	NC_008610	TGGGT	2	10	97678	97687	0 %	40 %	60 %	0 %	118602136
72	NC_008610	AAAGG	2	10	100063	100072	60 %	0 %	40 %	0 %	118602138
73	NC_008610	GTTTA	2	10	103439	103448	20 %	60 %	20 %	0 %	118602141
74	NC_008610	GTATG	2	10	104928	104937	20 %	40 %	40 %	0 %	118602143
75	NC_008610	TGTAT	2	10	106473	106482	20 %	60 %	20 %	0 %	118602144
76	NC_008610	AAGTT	2	10	106978	106987	40 %	40 %	20 %	0 %	118602145
77	NC_008610	TAGAA	2	10	107864	107873	60 %	20 %	20 %	0 %	118602147
78	NC_008610	ATAGC	2	10	108355	108364	40 %	20 %	20 %	20 %	118602147
79	NC_008610	ATAAA	2	10	108645	108654	80 %	20 %	0 %	0 %	118602147
80	NC_008610	TGGTT	2	10	110305	110314	0 %	60 %	40 %	0 %	118602148
81	NC_008610	GAATT	2	10	111532	111541	40 %	40 %	20 %	0 %	118602149
82	NC_008610	AATTA	2	10	118600	118609	60 %	40 %	0 %	0 %	118602152
83	NC_008610	ATTAA	2	10	124754	124763	60 %	40 %	0 %	0 %	118602155
84	NC_008610	GTGTT	2	10	125469	125478	0 %	60 %	40 %	0 %	118602157
85	NC_008610	AAACA	2	10	126222	126231	80 %	0 %	0 %	20 %	118602158
86	NC_008610	ATTTT	2	10	127608	127617	20 %	80 %	0 %	0 %	118602159
87	NC_008610	ATTGC	2	10	129900	129909	20 %	40 %	20 %	20 %	118602161
88	NC_008610	TCTTG	2	10	130380	130389	0 %	60 %	20 %	20 %	118602161
89	NC_008610	TGATT	2	10	134170	134179	20 %	60 %	20 %	0 %	118602165
90	NC_008610	ATTTA	2	10	135690	135699	40 %	60 %	0 %	0 %	118602167
91	NC_008610	TGATT	2	10	136712	136721	20 %	60 %	20 %	0 %	118602168
92	NC_008610	TAATA	2	10	136827	136836	60 %	40 %	0 %	0 %	118602168
93	NC_008610	TATTG	2	10	136956	136965	20 %	60 %	20 %	0 %	118602169
94	NC_008610	CAATT	2	10	138158	138167	40 %	40 %	0 %	20 %	118602170
95	NC_008610	AGTTT	2	10	143349	143358	20 %	60 %	20 %	0 %	118602173
96	NC_008610	ATCTA	2	10	144476	144485	40 %	40 %	0 %	20 %	118602174
97	NC_008610	ATGTT	2	10	145858	145867	20 %	60 %	20 %	0 %	118602175
98	NC_008610	CATTG	2	10	146550	146559	20 %	40 %	20 %	20 %	118602176
99	NC_008610	TTTGG	2	10	146929	146938	0 %	60 %	40 %	0 %	118602176
100	NC_008610	TATTT	2	10	147204	147213	20 %	80 %	0 %	0 %	118602176
101	NC_008610	AGAAA	2	10	148709	148718	80 %	0 %	20 %	0 %	118602178
102	NC_008610	AAGCC	2	10	151614	151623	40 %	0 %	20 %	40 %	118602180
103	NC_008610	AAAAG	2	10	153229	153238	80 %	0 %	20 %	0 %	118602181
104	NC_008610	TGCCT	2	10	156727	156736	0 %	40 %	20 %	40 %	118602183
105	NC_008610	CAATC	2	10	157788	157797	40 %	20 %	0 %	40 %	118602184
106	NC_008610	ATAAA	2	10	158174	158183	80 %	20 %	0 %	0 %	118602184
107	NC_008610	AGGCC	2	10	159751	159760	20 %	0 %	40 %	40 %	118602186
108	NC_008610	TAAAT	2	10	160206	160215	60 %	40 %	0 %	0 %	118602186
109	NC_008610	ATTTT	2	10	160752	160761	20 %	80 %	0 %	0 %	118602186
110	NC_008610	ATAGA	2	10	162921	162930	60 %	20 %	20 %	0 %	118602188
111	NC_008610	ATCAT	2	10	166242	166251	40 %	40 %	0 %	20 %	118602191
112	NC_008610	TAAAT	2	10	170163	170172	60 %	40 %	0 %	0 %	118602194
113	NC_008610	TGATG	2	10	173163	173172	20 %	40 %	40 %	0 %	118602197
114	NC_008610	TTTAG	2	10	174719	174728	20 %	60 %	20 %	0 %	118602199
115	NC_008610	GCATT	2	10	174884	174893	20 %	40 %	20 %	20 %	118602199
116	NC_008610	TAAAT	2	10	175459	175468	60 %	40 %	0 %	0 %	118602199
117	NC_008610	AAAAT	2	10	178127	178136	80 %	20 %	0 %	0 %	118602201
118	NC_008610	CACTT	2	10	182714	182723	20 %	40 %	0 %	40 %	118602204
119	NC_008610	CAATA	2	10	184962	184971	60 %	20 %	0 %	20 %	118602205
120	NC_008610	TGGCA	2	10	185186	185195	20 %	20 %	40 %	20 %	118602205
121	NC_008610	TTATC	2	10	186901	186910	20 %	60 %	0 %	20 %	118602207
122	NC_008610	AAACT	2	10	187019	187028	60 %	20 %	0 %	20 %	118602207
123	NC_008610	AGCCA	2	10	191204	191213	40 %	0 %	20 %	40 %	118602211
124	NC_008610	AATTA	2	10	191621	191630	60 %	40 %	0 %	0 %	118602212
125	NC_008610	TAGAG	2	10	192217	192226	40 %	20 %	40 %	0 %	118602213
126	NC_008610	AAAAT	2	10	192594	192603	80 %	20 %	0 %	0 %	118602213
127	NC_008610	TAAGG	2	10	194760	194769	40 %	20 %	40 %	0 %	118602218
128	NC_008610	ATTAG	2	10	195080	195089	40 %	40 %	20 %	0 %	118602219
129	NC_008610	TAATG	2	10	196167	196176	40 %	40 %	20 %	0 %	118602220
130	NC_008610	ATTAA	2	10	197031	197040	60 %	40 %	0 %	0 %	118602224
131	NC_008610	TACCA	2	10	198655	198664	40 %	20 %	0 %	40 %	118602228
132	NC_008610	TTGTA	2	10	198745	198754	20 %	60 %	20 %	0 %	118602228
133	NC_008610	CCATT	2	10	200967	200976	20 %	40 %	0 %	40 %	118602233
134	NC_008610	ACTTT	2	10	201309	201318	20 %	60 %	0 %	20 %	118602233
135	NC_008610	AATGT	2	10	203307	203316	40 %	40 %	20 %	0 %	118602237
136	NC_008610	TCAAC	2	10	203714	203723	40 %	20 %	0 %	40 %	118602237
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263	NC_008610	TTTAA	2	10	411424	411433	40 %	60 %	0 %	0 %	118602400
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