MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	CAAC	2	8	1341	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008610	CTAA	2	8	1353	1360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008610	TTAA	2	8	2728	2735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008610	ATCT	2	8	2899	2906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008610	TTAT	2	8	2927	2934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008610	ACAA	2	8	6292	6299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008610	ATTT	2	8	6360	6367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008610	AATT	2	8	6382	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008610	CTAT	2	8	6497	6504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008610	AATA	2	8	6721	6728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008610	AGAA	2	8	6787	6794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008610	AAGT	2	8	6868	6875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008610	AATT	2	8	15138	15145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008610	TAAT	2	8	20027	20034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008610	ATTT	2	8	20207	20214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008610	TAGA	2	8	21429	21436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008610	TATT	2	8	21511	21518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008610	AGGT	2	8	22110	22117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008610	TTAG	2	8	25295	25302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008610	TTTG	2	8	27583	27590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008610	TTGT	2	8	27706	27713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008610	TACT	2	8	31837	31844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008610	TTAA	2	8	32023	32030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008610	AGAT	2	8	32108	32115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008610	GATT	2	8	32687	32694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008610	AATG	2	8	32746	32753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008610	GTTT	2	8	33517	33524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008610	TTGG	2	8	33943	33950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008610	CTGT	2	8	34156	34163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008610	GATT	2	8	36841	36848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008610	TTGT	2	8	37085	37092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008610	CTAC	2	8	48121	48128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008610	TTTA	2	8	48471	48478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008610	ACTA	2	8	48588	48595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008610	GATT	2	8	48631	48638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008610	TGAA	2	8	48838	48845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008610	TAAA	2	8	54030	54037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008610	GCAA	2	8	54077	54084	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008610	GTCA	2	8	57899	57906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008610	AAAC	2	8	58000	58007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008610	GATT	2	8	58294	58301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008610	ATTT	2	8	62502	62509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008610	ACGA	2	8	66368	66375	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008610	ATTA	2	8	66788	66795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008610	ATTT	2	8	68145	68152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008610	AAGT	2	8	68362	68369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008610	GAAT	2	8	70542	70549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008610	AATC	2	8	70698	70705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008610	TTTG	2	8	71504	71511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008610	AAAC	2	8	74892	74899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008610	TGAA	2	8	84884	84891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008610	ATTG	2	8	85082	85089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008610	ATTT	2	8	88563	88570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008610	TAGT	2	8	88653	88660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008610	TTAT	2	8	88707	88714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008610	AATG	2	8	88971	88978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008610	AAGA	2	8	89254	89261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008610	AATT	2	8	89906	89913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008610	AACT	2	8	99074	99081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008610	ATTA	2	8	103767	103774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008610	AAAT	2	8	103790	103797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008610	TTAT	2	8	107491	107498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008610	AATC	2	8	107521	107528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008610	ATTG	2	8	107550	107557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008610	GATT	2	8	109601	109608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008610	TTTA	2	8	112258	112265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008610	TATC	2	8	112338	112345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008610	ATTA	2	8	112937	112944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008610	ATAA	2	8	112988	112995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008610	TAGA	2	8	113755	113762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008610	TTGG	2	8	114701	114708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008610	TAGT	2	8	115115	115122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008610	AATT	2	8	115687	115694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008610	TAAA	2	8	116150	116157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008610	AGTC	2	8	120211	120218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008610	ATGA	2	8	120766	120773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008610	TAAA	2	8	120855	120862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008610	GCCT	2	8	121090	121097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008610	CAAA	2	8	121617	121624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008610	TAAA	2	8	130699	130706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008610	AAGA	2	8	130728	130735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008610	TACG	2	8	134527	134534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008610	GATA	2	8	134939	134946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008610	TTAA	2	8	135799	135806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008610	TTGT	2	8	135839	135846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008610	TAAA	2	8	138838	138845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008610	TTAT	2	8	139046	139053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008610	ACAA	2	8	139502	139509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008610	TCTT	2	8	139683	139690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008610	TGAT	2	8	140001	140008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008610	GAAT	2	8	140133	140140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008610	AATA	2	8	142644	142651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008610	AGTT	2	8	144892	144899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008610	TTAT	2	8	144971	144978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008610	GGAA	2	8	145023	145030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008610	CAAT	2	8	147617	147624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008610	CATT	2	8	147662	147669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008610	TTTA	2	8	147901	147908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008610	TATT	2	8	149241	149248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008610	TAAT	2	8	149679	149686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008610	CTTT	2	8	149848	149855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008610	TTGA	2	8	152397	152404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008610	TTAA	2	8	152409	152416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008610	TACA	2	8	152619	152626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008610	TTCT	2	8	152716	152723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008610	CAAG	2	8	153779	153786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008610	CATT	2	8	154179	154186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008610	TTAG	2	8	154488	154495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008610	ATTA	2	8	158696	158703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008610	TAAC	2	8	163031	163038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008610	AATA	2	8	163071	163078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008610	AGTA	2	8	163385	163392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008610	TAAT	2	8	163448	163455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008610	ATTT	2	8	163680	163687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008610	TTTA	2	8	163816	163823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008610	TATT	2	8	163837	163844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008610	TGAA	2	8	164023	164030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008610	ATTG	2	8	164100	164107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008610	TAAG	2	8	164406	164413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008610	ATTT	2	8	164547	164554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008610	GGTA	2	8	164652	164659	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008610	ACTA	2	8	164687	164694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008610	ATTT	2	8	169476	169483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008610	TTTA	2	8	173576	173583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008610	TATT	2	8	176095	176102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008610	ATTA	2	8	176263	176270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008610	AGTA	2	8	180611	180618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008610	TGAT	2	8	184309	184316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008610	TTAT	2	8	184405	184412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008610	TTAA	2	8	191516	191523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008610	AGTA	2	8	191920	191927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008610	ATTT	2	8	196632	196639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008610	ATTA	2	8	199552	199559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008610	AAAC	2	8	202424	202431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008610	AGTG	2	8	205794	205801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008610	GGGA	2	8	206424	206431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008610	TATT	2	8	206485	206492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008610	CTAT	2	8	206906	206913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008610	TAAT	2	8	207280	207287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008610	TAAT	2	8	207459	207466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008610	TTAA	2	8	207652	207659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008610	ATAA	2	8	207967	207974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008610	AAAT	2	8	208163	208170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008610	GTTT	2	8	208180	208187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008610	TGAT	2	8	208235	208242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008610	TACA	2	8	208252	208259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008610	CATT	2	8	208426	208433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008610	TATT	2	8	208518	208525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008610	AATA	2	8	208604	208611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008610	ATGA	2	8	208843	208850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008610	AAAT	2	8	208985	208992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008610	ATTT	2	8	209094	209101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008610	AAGC	2	8	209114	209121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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