MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 16236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	ACA	3	9	136	144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602061
2	NC_008610	TTA	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
3	NC_008610	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602061
4	NC_008610	TAT	2	6	413	418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
5	NC_008610	CTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602061
6	NC_008610	TAT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
7	NC_008610	TGA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602061
8	NC_008610	AAG	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602061
9	NC_008610	ATT	2	6	699	704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602061
10	NC_008610	TGC	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602061
11	NC_008610	AGA	2	6	869	874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602061
12	NC_008610	CTT	2	6	933	938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602061
13	NC_008610	TTG	2	6	952	957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602061
14	NC_008610	ACA	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602061
15	NC_008610	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602061
16	NC_008610	AAC	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008610	TAA	2	6	1374	1379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008610	TAA	5	15	1507	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008610	ACT	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
20	NC_008610	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
21	NC_008610	AAG	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
22	NC_008610	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
23	NC_008610	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602062
24	NC_008610	ATC	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
25	NC_008610	ATT	2	6	1918	1923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
26	NC_008610	TTG	4	12	2039	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602062
27	NC_008610	ACT	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602062
28	NC_008610	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
29	NC_008610	TTA	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
30	NC_008610	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602062
31	NC_008610	TAT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
32	NC_008610	CAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602062
33	NC_008610	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
34	NC_008610	ACA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602062
35	NC_008610	GAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602062
36	NC_008610	TTA	2	6	2587	2592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602062
37	NC_008610	AGT	2	6	2593	2598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602062
38	NC_008610	TGT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602062
39	NC_008610	ATT	2	6	2718	2723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008610	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008610	ATA	2	6	2843	2848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008610	TAC	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008610	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008610	GAT	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
45	NC_008610	GTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
46	NC_008610	TGA	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
47	NC_008610	GCA	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602063
48	NC_008610	AGG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118602063
49	NC_008610	TGA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
50	NC_008610	TGT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
51	NC_008610	GGT	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602063
52	NC_008610	TAA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
53	NC_008610	TAT	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
54	NC_008610	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
55	NC_008610	GGT	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602063
56	NC_008610	TAA	2	6	3833	3838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
57	NC_008610	TAA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602063
58	NC_008610	ATT	2	6	3918	3923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
59	NC_008610	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602063
60	NC_008610	ATT	3	9	4062	4070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
61	NC_008610	CGT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602063
62	NC_008610	CTA	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602063
63	NC_008610	TAT	2	6	4336	4341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
64	NC_008610	AGA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
65	NC_008610	TAT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
66	NC_008610	ACC	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602063
67	NC_008610	ATT	2	6	4615	4620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
68	NC_008610	AAG	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
69	NC_008610	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
70	NC_008610	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602063
71	NC_008610	TGA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602063
72	NC_008610	GCA	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602063
73	NC_008610	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602063
74	NC_008610	AAC	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602063
75	NC_008610	TTG	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602063
76	NC_008610	AGA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602063
77	NC_008610	GTA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
78	NC_008610	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602064
79	NC_008610	AAC	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602064
80	NC_008610	TTA	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602064
81	NC_008610	AAG	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602064
82	NC_008610	TAA	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602064
83	NC_008610	CGT	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602064
84	NC_008610	TAT	2	6	5673	5678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602064
85	NC_008610	GAA	3	9	5688	5696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602064
86	NC_008610	GAT	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
87	NC_008610	TAT	2	6	5782	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602064
88	NC_008610	AGT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
89	NC_008610	GAT	2	6	5820	5825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
90	NC_008610	GTT	2	6	5862	5867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602064
91	NC_008610	AGA	3	9	5930	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602064
92	NC_008610	GTA	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602064
93	NC_008610	AAC	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602064
94	NC_008610	GTT	2	6	6192	6197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602064
95	NC_008610	ATT	2	6	6228	6233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602064
96	NC_008610	TTA	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008610	CAA	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008610	TAC	2	6	6663	6668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008610	ATG	2	6	6733	6738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008610	AAC	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602065
101	NC_008610	TTA	2	6	6929	6934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
102	NC_008610	ATT	2	6	7408	7413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
103	NC_008610	TTA	2	6	7475	7480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
104	NC_008610	TGG	2	6	7534	7539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602065
105	NC_008610	TAA	2	6	7695	7700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
106	NC_008610	TCA	2	6	7706	7711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602065
107	NC_008610	AAT	2	6	7715	7720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
108	NC_008610	TTA	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
109	NC_008610	CCA	2	6	7769	7774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602065
110	NC_008610	ACC	2	6	7789	7794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602065
111	NC_008610	AAT	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
112	NC_008610	TTA	2	6	7838	7843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
113	NC_008610	GAT	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602065
114	NC_008610	TTG	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602065
115	NC_008610	AGT	2	6	7939	7944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602065
116	NC_008610	TAA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
117	NC_008610	TAA	2	6	8277	8282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
118	NC_008610	CAT	2	6	8406	8411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602065
119	NC_008610	ATT	2	6	8533	8538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602065
120	NC_008610	GTG	2	6	8615	8620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602065
121	NC_008610	AAT	2	6	8924	8929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
122	NC_008610	ATA	2	6	8956	8961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602065
123	NC_008610	GCA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602065
124	NC_008610	CAT	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602066
125	NC_008610	TGC	2	6	9531	9536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602066
126	NC_008610	GAT	2	6	9543	9548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602066
127	NC_008610	ACC	2	6	9678	9683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602066
128	NC_008610	ATT	2	6	9687	9692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602066
129	NC_008610	CAA	2	6	9866	9871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602066
130	NC_008610	CGC	2	6	9908	9913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118602066
131	NC_008610	TAA	3	9	10022	10030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602066
132	NC_008610	CAC	2	6	10074	10079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602066
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259	NC_008610	CAT	2	6	19464	19469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602075
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