MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	AT	3	6	1334	1339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008610	TA	3	6	2711	2716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008610	AC	3	6	6418	6423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008610	TA	3	6	6442	6447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008610	TA	3	6	14776	14781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008610	TG	3	6	21894	21899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008610	AT	3	6	27382	27387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008610	AT	3	6	27762	27767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008610	AT	3	6	27777	27782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008610	TA	3	6	32720	32725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008610	AC	3	6	32919	32924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008610	AC	3	6	33247	33252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008610	TG	3	6	33879	33884	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008610	TA	3	6	34182	34187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008610	AT	3	6	34247	34252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008610	GA	3	6	39232	39237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008610	AT	3	6	48725	48730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008610	TG	3	6	49166	49171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008610	AC	3	6	53903	53908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008610	TG	3	6	58571	58576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008610	AT	3	6	58602	58607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008610	AG	3	6	68213	68218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008610	GT	3	6	68355	68360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008610	TG	3	6	71552	71557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008610	TA	3	6	74791	74796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008610	CT	3	6	75052	75057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008610	CT	3	6	85169	85174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008610	AG	4	8	85344	85351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008610	TA	3	6	85388	85393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008610	AG	3	6	89652	89657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008610	CA	3	6	98913	98918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008610	TA	3	6	101371	101376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008610	AT	3	6	101391	101396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008610	AT	4	8	101405	101412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008610	GT	3	6	101449	101454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008610	GA	3	6	102886	102891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008610	AG	3	6	103782	103787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008610	TG	3	6	109581	109586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008610	TG	3	6	112286	112291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008610	GA	3	6	112552	112557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008610	GT	3	6	116351	116356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008610	TA	3	6	117937	117942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008610	TA	3	6	117984	117989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008610	TA	3	6	120038	120043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008610	AT	3	6	122809	122814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008610	TA	4	8	123284	123291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008610	TG	3	6	134479	134484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008610	TA	3	6	138951	138956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008610	CT	3	6	139156	139161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008610	CT	3	6	139764	139769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008610	AT	4	8	139915	139922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008610	AT	3	6	139947	139952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008610	TG	3	6	147740	147745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008610	AT	3	6	147863	147868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008610	TA	3	6	149556	149561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008610	AC	3	6	152710	152715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008610	AG	3	6	152769	152774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008610	AT	3	6	153839	153844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008610	AG	3	6	153948	153953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008610	AG	3	6	154195	154200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008610	AT	3	6	158769	158774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008610	TA	3	6	163311	163316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008610	TG	3	6	165039	165044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008610	CA	3	6	169231	169236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008610	TC	3	6	170000	170005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008610	AC	3	6	172949	172954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008610	AC	3	6	175819	175824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008610	AT	3	6	176173	176178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008610	TA	3	6	176237	176242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008610	AT	3	6	178607	178612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008610	TA	3	6	180326	180331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008610	AT	4	8	180341	180348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008610	TA	3	6	182061	182066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008610	GT	4	8	184254	184261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008610	TA	3	6	184293	184298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008610	AT	3	6	184320	184325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008610	GT	3	6	184396	184401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008610	AG	3	6	196642	196647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008610	AC	3	6	202430	202435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008610	GT	3	6	205832	205837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008610	CT	3	6	205936	205941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008610	TA	3	6	206722	206727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008610	CA	3	6	207602	207607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008610	AT	3	6	208032	208037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008610	CT	3	6	208324	208329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008610	AT	3	6	208881	208886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008610	TG	4	8	209010	209017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008610	CA	3	6	211809	211814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008610	TA	3	6	211930	211935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008610	AT	3	6	212098	212103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008610	GA	3	6	215261	215266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008610	TC	3	6	223974	223979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008610	CT	3	6	223983	223988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008610	TC	3	6	224480	224485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008610	GT	3	6	228734	228739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008610	TA	3	6	228808	228813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008610	GT	3	6	229273	229278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008610	AT	3	6	232443	232448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008610	CT	3	6	233427	233432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008610	TG	3	6	233521	233526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008610	TA	3	6	233828	233833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008610	TA	3	6	235468	235473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008610	TA	3	6	238812	238817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008610	TA	3	6	239306	239311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008610	CG	3	6	240013	240018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008610	AT	3	6	240156	240161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008610	GT	3	6	241841	241846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008610	AT	3	6	243265	243270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008610	AT	3	6	244051	244056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008610	CA	3	6	247057	247062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008610	AT	3	6	247063	247068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008610	AT	3	6	247625	247630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008610	AT	3	6	266195	266200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008610	AC	3	6	275700	275705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008610	GT	3	6	278241	278246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008610	AT	3	6	278406	278411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008610	AT	3	6	278425	278430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008610	TA	3	6	293787	293792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008610	TC	3	6	295655	295660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008610	GA	3	6	301589	301594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008610	TA	3	6	303292	303297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008610	GC	3	6	308160	308165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008610	AT	3	6	308911	308916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008610	AC	3	6	312479	312484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008610	TC	3	6	314738	314743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008610	TA	3	6	315119	315124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008610	TA	3	6	315259	315264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008610	TG	3	6	322877	322882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008610	AG	3	6	324300	324305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008610	TG	3	6	325168	325173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008610	TA	3	6	325506	325511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008610	GT	3	6	333191	333196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008610	TC	3	6	338819	338824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008610	GA	3	6	340498	340503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008610	GA	3	6	340684	340689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008610	CT	3	6	353003	353008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008610	AC	3	6	353100	353105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008610	CA	3	6	356687	356692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008610	TA	3	6	357034	357039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008610	GA	3	6	358459	358464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008610	TA	3	6	378995	379000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008610	TA	3	6	383416	383421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008610	GT	3	6	387709	387714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008610	AT	3	6	388135	388140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008610	GT	4	8	388996	389003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008610	AT	3	6	404216	404221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008610	GT	3	6	405891	405896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008610	AT	3	6	407717	407722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008610	CT	3	6	407938	407943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008610	GT	3	6	408780	408785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008610	TC	3	6	413473	413478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008610	GA	3	6	413522	413527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008610	AT	3	6	413625	413630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008610	TG	4	8	413684	413691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.