MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Pelobacter propionicus DSM 2379 plasmid pPRO1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008607	GGAATA	2	12	4986	4997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118577236
2	NC_008607	TTTTGA	2	12	5635	5646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118577237
3	NC_008607	TCCTGG	2	12	9221	9232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118577239
4	NC_008607	CTGCGC	2	12	13988	13999	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118577244
5	NC_008607	ATGGAG	2	12	19334	19345	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118577251
6	NC_008607	GATGCT	2	12	21973	21984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118577253
7	NC_008607	TGAAAC	2	12	24141	24152	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118577254
8	NC_008607	AGATCC	2	12	24318	24329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577254
9	NC_008607	GTCAAG	2	12	25539	25550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118577255
10	NC_008607	CATCGC	2	12	25814	25825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118577255
11	NC_008607	ATCGAC	3	18	26784	26801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577255
12	NC_008607	GATCCG	2	12	26915	26926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118577255
13	NC_008607	CCGTGG	2	12	27565	27576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118577255
14	NC_008607	TCTCTG	2	12	40927	40938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118577268
15	NC_008607	TCAACG	2	12	46209	46220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577272
16	NC_008607	CCATCT	2	12	50968	50979	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118577274
17	NC_008607	AGATCG	2	12	51265	51276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118577274
18	NC_008607	GGGATT	2	12	53650	53661	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118577275
19	NC_008607	TGCTGG	2	12	54380	54391	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118577277
20	NC_008607	ATGGAT	2	12	56111	56122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118577278
21	NC_008607	CCAATA	2	12	57717	57728	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118577281
22	NC_008607	TTGGTA	2	12	59633	59644	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118577283
23	NC_008607	CCGAAC	2	12	65206	65217	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118577287
24	NC_008607	CCATGA	2	12	66942	66953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577290
25	NC_008607	TACCCA	2	12	68310	68321	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118577293
26	NC_008607	GCCGGT	2	12	68527	68538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118577293
27	NC_008607	AGCCCA	2	12	68850	68861	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118577294
28	NC_008607	GCCTGG	2	12	69198	69209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118577294
29	NC_008607	GTCCCG	2	12	69824	69835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118577294
30	NC_008607	CACGAG	2	12	71984	71995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118577298
31	NC_008607	GATGCC	2	12	82668	82679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118577308
32	NC_008607	CACAAT	2	12	89341	89352	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118577314
33	NC_008607	CTTACG	2	12	92791	92802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118577318
34	NC_008607	TTTAAA	2	12	93716	93727	50 %	50 %	0 %	0 %	118577319
35	NC_008607	TATCGT	2	12	100791	100802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118577325
36	NC_008607	ATTCAC	2	12	102236	102247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118577327
37	NC_008607	ATGAAT	2	12	107001	107012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118577330
38	NC_008607	ACCAGT	2	12	110551	110562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577334
39	NC_008607	ACCCCA	2	12	117382	117393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118577341
40	NC_008607	TTCCCA	2	12	121092	121103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118577346
41	NC_008607	GAGGCT	2	12	122235	122246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118577348
42	NC_008607	CCGATA	2	12	124314	124325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118577350
43	NC_008607	AAGCGA	2	12	137158	137169	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118577364
44	NC_008607	GCCAGC	2	12	137252	137263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118577364
45	NC_008607	GGCCTG	2	12	141177	141188	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118577369
46	NC_008607	CTCTAG	2	12	148045	148056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118577376
47	NC_008607	CAGTAG	2	12	148800	148811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118577377
48	NC_008607	TCGTTG	2	12	149601	149612	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118577377
49	NC_008607	TGTTGC	2	12	151412	151423	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118577378
50	NC_008607	CTCCCC	2	12	151684	151695	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	118577378
51	NC_008607	CCCGAT	2	12	153331	153342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118577379
52	NC_008607	CCCACC	2	12	159556	159567	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	118577386
53	NC_008607	AGACGA	2	12	166297	166308	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118577391
54	NC_008607	CGGATT	2	12	169297	169308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118577394
55	NC_008607	AAAAAT	2	12	171434	171445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118577395
56	NC_008607	GAAGAG	2	12	174800	174811	50 %	0 %	50 %	0 %	118577399
57	NC_008607	GACAAG	2	12	182229	182240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118577405
58	NC_008607	CACAAG	2	12	186688	186699	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118577409
59	NC_008607	CAGCTG	2	12	192307	192318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118577414
60	NC_008607	GTCCTG	2	12	195617	195628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118577418
61	NC_008607	TGACCC	2	12	199501	199512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118577423

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.