MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Pelobacter propionicus DSM 2379 plasmid pPRO1

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008607	AAATT	2	10	7594	7603	60 %	40 %	0 %	0 %	118577239
2	NC_008607	GAAAT	2	10	15009	15018	60 %	20 %	20 %	0 %	118577245
3	NC_008607	TCTGG	2	10	17698	17707	0 %	40 %	40 %	20 %	118577248
4	NC_008607	TGCTC	2	10	19263	19272	0 %	40 %	20 %	40 %	118577251
5	NC_008607	CGGCA	2	10	23239	23248	20 %	0 %	40 %	40 %	118577254
6	NC_008607	CTGAT	2	10	23655	23664	20 %	40 %	20 %	20 %	118577254
7	NC_008607	TGCCG	2	10	26261	26270	0 %	20 %	40 %	40 %	118577255
8	NC_008607	GGCCG	2	10	26442	26451	0 %	0 %	60 %	40 %	118577255
9	NC_008607	GTGAA	2	10	29040	29049	40 %	20 %	40 %	0 %	118577257
10	NC_008607	AAAAC	2	10	29242	29251	80 %	0 %	0 %	20 %	118577258
11	NC_008607	CTTTC	2	10	29910	29919	0 %	60 %	0 %	40 %	118577259
12	NC_008607	CTTGA	2	10	30025	30034	20 %	40 %	20 %	20 %	118577259
13	NC_008607	AAGGA	2	10	30080	30089	60 %	0 %	40 %	0 %	118577259
14	NC_008607	AGCAG	2	10	31331	31340	40 %	0 %	40 %	20 %	118577261
15	NC_008607	CGAAG	2	10	35094	35103	40 %	0 %	40 %	20 %	118577266
16	NC_008607	TCCGG	2	10	35343	35352	0 %	20 %	40 %	40 %	118577266
17	NC_008607	CATCA	2	10	37140	37149	40 %	20 %	0 %	40 %	118577266
18	NC_008607	TGGTC	2	10	38570	38579	0 %	40 %	40 %	20 %	118577267
19	NC_008607	GATTT	2	10	44918	44927	20 %	60 %	20 %	0 %	118577271
20	NC_008607	ATTGC	2	10	50806	50815	20 %	40 %	20 %	20 %	118577274
21	NC_008607	CTTTT	2	10	53887	53896	0 %	80 %	0 %	20 %	118577276
22	NC_008607	ATCTT	2	10	59454	59463	20 %	60 %	0 %	20 %	118577283
23	NC_008607	TAACA	2	10	63375	63384	60 %	20 %	0 %	20 %	118577286
24	NC_008607	GATCA	2	10	64396	64405	40 %	20 %	20 %	20 %	118577287
25	NC_008607	GGTAT	2	10	65728	65737	20 %	40 %	40 %	0 %	118577287
26	NC_008607	ACCCC	2	10	68560	68569	20 %	0 %	0 %	80 %	118577293
27	NC_008607	AAGCC	2	10	70902	70911	40 %	0 %	20 %	40 %	118577296
28	NC_008607	GTGGA	2	10	72794	72803	20 %	20 %	60 %	0 %	118577299
29	NC_008607	GGATT	2	10	75888	75897	20 %	40 %	40 %	0 %	118577301
30	NC_008607	GCAGT	2	10	77704	77713	20 %	20 %	40 %	20 %	118577303
31	NC_008607	CATGA	2	10	85933	85942	40 %	20 %	20 %	20 %	118577311
32	NC_008607	CAAAG	2	10	87315	87324	60 %	0 %	20 %	20 %	118577312
33	NC_008607	AACTC	2	10	87369	87378	40 %	20 %	0 %	40 %	118577312
34	NC_008607	GAAAA	2	10	87533	87542	80 %	0 %	20 %	0 %	118577313
35	NC_008607	CTGCG	2	10	88026	88035	0 %	20 %	40 %	40 %	118577313
36	NC_008607	GCTGA	2	10	88920	88929	20 %	20 %	40 %	20 %	118577314
37	NC_008607	CAACA	2	10	89160	89169	60 %	0 %	0 %	40 %	118577314
38	NC_008607	CTGAA	2	10	94773	94782	40 %	20 %	20 %	20 %	118577319
39	NC_008607	TTGAG	2	10	95844	95853	20 %	40 %	40 %	0 %	118577320
40	NC_008607	TGGGA	2	10	98447	98456	20 %	20 %	60 %	0 %	118577322
41	NC_008607	CTGGG	2	10	99649	99658	0 %	20 %	60 %	20 %	118577323
42	NC_008607	AAGTC	2	10	103991	104000	40 %	20 %	20 %	20 %	118577327
43	NC_008607	AATGG	2	10	104170	104179	40 %	20 %	40 %	0 %	118577327
44	NC_008607	AGCAG	2	10	104985	104994	40 %	0 %	40 %	20 %	118577327
45	NC_008607	GAGAA	2	10	105124	105133	60 %	0 %	40 %	0 %	118577327
46	NC_008607	TCTAA	2	10	105804	105813	40 %	40 %	0 %	20 %	118577328
47	NC_008607	GGCTT	2	10	111800	111809	0 %	40 %	40 %	20 %	118577336
48	NC_008607	TTGCT	2	10	114896	114905	0 %	60 %	20 %	20 %	118577338
49	NC_008607	ATTCA	2	10	119514	119523	40 %	40 %	0 %	20 %	118577343
50	NC_008607	ATTCG	2	10	121671	121680	20 %	40 %	20 %	20 %	118577347
51	NC_008607	TGCCT	2	10	122247	122256	0 %	40 %	20 %	40 %	118577348
52	NC_008607	CAAGC	2	10	122260	122269	40 %	0 %	20 %	40 %	118577348
53	NC_008607	GAAGG	2	10	126370	126379	40 %	0 %	60 %	0 %	118577353
54	NC_008607	ATTTG	2	10	128720	128729	20 %	60 %	20 %	0 %	118577356
55	NC_008607	TTCCA	2	10	131456	131465	20 %	40 %	0 %	40 %	118577359
56	NC_008607	AACCA	2	10	132152	132161	60 %	0 %	0 %	40 %	118577360
57	NC_008607	AACTG	2	10	132675	132684	40 %	20 %	20 %	20 %	118577360
58	NC_008607	TGCCA	2	10	132790	132799	20 %	20 %	20 %	40 %	118577360
59	NC_008607	ACCAT	2	10	132885	132894	40 %	20 %	0 %	40 %	118577360
60	NC_008607	TTGTC	2	10	132916	132925	0 %	60 %	20 %	20 %	118577360
61	NC_008607	GCTCA	2	10	134031	134040	20 %	20 %	20 %	40 %	118577362
62	NC_008607	ATTGA	2	10	136720	136729	40 %	40 %	20 %	0 %	118577364
63	NC_008607	ATTCA	2	10	138232	138241	40 %	40 %	0 %	20 %	118577365
64	NC_008607	TTCAC	2	10	138421	138430	20 %	40 %	0 %	40 %	118577366
65	NC_008607	TGTGG	2	10	139068	139077	0 %	40 %	60 %	0 %	118577367
66	NC_008607	TGGTC	2	10	142497	142506	0 %	40 %	40 %	20 %	118577369
67	NC_008607	TGTTT	2	10	143007	143016	0 %	80 %	20 %	0 %	118577369
68	NC_008607	GGCCT	2	10	145975	145984	0 %	20 %	40 %	40 %	118577373
69	NC_008607	CACGC	2	10	147242	147251	20 %	0 %	20 %	60 %	118577375
70	NC_008607	GTGTT	2	10	147590	147599	0 %	60 %	40 %	0 %	118577375
71	NC_008607	CCCTG	2	10	149580	149589	0 %	20 %	20 %	60 %	118577377
72	NC_008607	AAATG	2	10	150126	150135	60 %	20 %	20 %	0 %	118577377
73	NC_008607	GTTTG	2	10	150630	150639	0 %	60 %	40 %	0 %	118577378
74	NC_008607	TTCTT	2	10	150778	150787	0 %	80 %	0 %	20 %	118577378
75	NC_008607	TGAGT	2	10	151071	151080	20 %	40 %	40 %	0 %	118577378
76	NC_008607	GAAGC	2	10	153557	153566	40 %	0 %	40 %	20 %	118577379
77	NC_008607	GCCCT	2	10	155570	155579	0 %	20 %	20 %	60 %	118577381
78	NC_008607	AGAGC	2	10	157535	157544	40 %	0 %	40 %	20 %	118577382
79	NC_008607	CTTTA	2	10	158259	158268	20 %	60 %	0 %	20 %	118577384
80	NC_008607	CGACG	2	10	159659	159668	20 %	0 %	40 %	40 %	118577387
81	NC_008607	GGGTG	2	10	161077	161086	0 %	20 %	80 %	0 %	118577388
82	NC_008607	CTCTT	2	10	162652	162661	0 %	60 %	0 %	40 %	118577390
83	NC_008607	AGGGG	2	10	162741	162750	20 %	0 %	80 %	0 %	118577390
84	NC_008607	CATAT	2	10	163377	163386	40 %	40 %	0 %	20 %	118577390
85	NC_008607	CAAAA	2	10	166385	166394	80 %	0 %	0 %	20 %	118577391
86	NC_008607	GACAG	2	10	170294	170303	40 %	0 %	40 %	20 %	118577395
87	NC_008607	CGAGA	2	10	171765	171774	40 %	0 %	40 %	20 %	118577396
88	NC_008607	TCTAC	2	10	172932	172941	20 %	40 %	0 %	40 %	118577398
89	NC_008607	AGAGG	2	10	174790	174799	40 %	0 %	60 %	0 %	118577399
90	NC_008607	AAGAT	2	10	175775	175784	60 %	20 %	20 %	0 %	118577400
91	NC_008607	CGAAT	2	10	178694	178703	40 %	20 %	20 %	20 %	118577402
92	NC_008607	GTTTC	2	10	179906	179915	0 %	60 %	20 %	20 %	118577404
93	NC_008607	ACCAG	2	10	183533	183542	40 %	0 %	20 %	40 %	118577406
94	NC_008607	GACCA	2	10	183793	183802	40 %	0 %	20 %	40 %	118577406
95	NC_008607	TGGCA	2	10	183975	183984	20 %	20 %	40 %	20 %	118577406
96	NC_008607	TGATA	2	10	188579	188588	40 %	40 %	20 %	0 %	118577411
97	NC_008607	CTCGT	2	10	190436	190445	0 %	40 %	20 %	40 %	118577413
98	NC_008607	CTCTT	2	10	192576	192585	0 %	60 %	0 %	40 %	118577414
99	NC_008607	TTTCC	2	10	193213	193222	0 %	60 %	0 %	40 %	118577415
100	NC_008607	GTTCT	2	10	193537	193546	0 %	60 %	20 %	20 %	118577416
101	NC_008607	TCAAC	2	10	194178	194187	40 %	20 %	0 %	40 %	118577416
102	NC_008607	TTCTA	2	10	199541	199550	20 %	60 %	0 %	20 %	118577423
103	NC_008607	GAAAG	2	10	199802	199811	60 %	0 %	40 %	0 %	118577424
104	NC_008607	TGGTG	2	10	201116	201125	0 %	40 %	60 %	0 %	118577425
105	NC_008607	CAGGT	2	10	202027	202036	20 %	20 %	40 %	20 %	118577426

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.