MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	ATAAGT	2	12	28010	28021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008601	TTAAGA	2	12	38669	38680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008601	CTTATA	2	12	38840	38851	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008601	AATTTT	2	12	38876	38887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008601	TTAATT	2	12	65695	65706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008601	TTTAAA	2	12	93051	93062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008601	ATATTT	2	12	102639	102650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008601	TTATAA	2	12	144976	144987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008601	ATAAAT	2	12	151940	151951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008601	ATTTCC	2	12	174444	174455	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008601	TAAAGA	2	12	185156	185167	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008601	TATAAA	2	12	198686	198697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008601	ATTTTT	2	12	241205	241216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008601	TAAAAG	2	12	245751	245762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008601	GCAAAA	2	12	289904	289915	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008601	TAAAAA	2	12	291673	291684	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008601	ATATTT	2	12	302598	302609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008601	TTATAA	2	12	320351	320362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008601	AGATAA	2	12	378852	378863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008601	TTAGAT	2	12	390752	390763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008601	AGAATA	2	12	477786	477797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008601	TGAAAT	2	12	480092	480103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008601	TAAAAT	2	12	485783	485794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008601	ATTTAT	2	12	503880	503891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008601	AAGTTA	2	12	505631	505642	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008601	TATTTT	2	12	510169	510180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008601	TTTAAT	2	12	560057	560068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008601	AAAATC	2	12	600445	600456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008601	CTTTTT	2	12	650595	650606	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008601	CATAAA	2	12	663288	663299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008601	TTTATA	2	12	687647	687658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008601	ACAAAA	2	12	690955	690966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008601	TAATCT	2	12	720447	720458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008601	TTTGAT	2	12	809896	809907	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008601	GTACTT	2	12	827943	827954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008601	ATATCA	2	12	843189	843200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008601	TCTAAA	2	12	851110	851121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008601	ATTGAG	2	12	852700	852711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008601	AGTAAT	2	12	866050	866061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008601	TAATTA	2	12	901587	901598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008601	ATATAA	2	12	921033	921044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008601	TAATCT	2	12	923108	923119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008601	AATCAA	2	12	987333	987344	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008601	ATTTAC	2	12	988011	988022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008601	TAAATT	2	12	988856	988867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008601	AATCAA	2	12	1000561	1000572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008601	AATTAT	2	12	1033261	1033272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008601	TTGCTA	2	12	1042227	1042238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008601	AACTAA	2	12	1059015	1059026	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008601	CAAAAG	2	12	1076401	1076412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008601	ATAAAA	2	12	1089479	1089490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008601	ATAAAT	2	12	1097544	1097555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008601	TATAAG	2	12	1150147	1150158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008601	TATTTA	2	12	1150167	1150178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008601	ATTATA	2	12	1155029	1155040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008601	GATAGT	2	12	1164097	1164108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008601	AAATTA	2	12	1183709	1183720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008601	AAATAT	2	12	1198791	1198802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008601	TAAAAA	2	12	1265664	1265675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008601	TATTTT	2	12	1268484	1268495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008601	TTAGCA	2	12	1281166	1281177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008601	TAATTG	2	12	1371882	1371893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008601	ATTTCA	2	12	1374067	1374078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008601	CTTATT	2	12	1376371	1376382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008601	GCTTTT	2	12	1404929	1404940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008601	TAACAT	2	12	1449191	1449202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008601	ATTTTT	2	12	1455657	1455668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008601	TATTAC	2	12	1473356	1473367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008601	CATTAA	2	12	1483865	1483876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008601	ATACAA	2	12	1489693	1489704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008601	AAAATA	2	12	1561299	1561310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008601	AATAGT	2	12	1608642	1608653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008601	AAAAAC	2	12	1644610	1644621	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008601	AATATA	2	12	1658412	1658423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008601	ATGTGG	2	12	1662125	1662136	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008601	GTTTTA	2	12	1721969	1721980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008601	TTATCA	2	12	1796047	1796058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008601	ATTATC	2	12	1801736	1801747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008601	ATTTCA	2	12	1848539	1848550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008601	CTTATT	2	12	1850843	1850854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008601	CTTTTT	2	12	1863111	1863122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008601	AGATTA	2	12	1866186	1866197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.