MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496616
2	NC_008601	TATTTC	2	12	2964	2975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496618
3	NC_008601	CAGGTA	2	12	5148	5159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496619
4	NC_008601	ATTTAT	2	12	6983	6994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496621
5	NC_008601	GCTACA	2	12	7584	7595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118496622
6	NC_008601	TTAGCA	2	12	12202	12213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496629
7	NC_008601	TTTATT	2	12	12609	12620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496629
8	NC_008601	CTTTTT	2	12	14772	14783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118496632
9	NC_008601	TCTAGT	2	12	17802	17813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118496634
10	NC_008601	CTAAAA	2	12	21362	21373	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496635
11	NC_008601	ACCAAT	2	12	23387	23398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496637
12	NC_008601	TATCAA	2	12	29914	29925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496644
13	NC_008601	TAAATT	2	12	31954	31965	50 %	50 %	0 %	0 %	118496646
14	NC_008601	TTGAGC	2	12	40422	40433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496653
15	NC_008601	GGTTTA	2	12	41448	41459	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496655
16	NC_008601	TTCAAA	2	12	45056	45067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496656
17	NC_008601	GATATG	2	12	47086	47097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496657
18	NC_008601	TGCAAA	2	12	47633	47644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496658
19	NC_008601	AAATAG	2	12	52544	52555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496661
20	NC_008601	ACAGTA	2	12	52919	52930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496661
21	NC_008601	AATAAA	2	12	63730	63741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496667
22	NC_008601	TAAAAA	2	12	64072	64083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496668
23	NC_008601	AGGTCA	2	12	64482	64493	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496669
24	NC_008601	CTTGAG	2	12	72517	72528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496676
25	NC_008601	ATCAAT	2	12	76068	76079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496679
26	NC_008601	TGTCAG	2	12	80618	80629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496681
27	NC_008601	AATACC	2	12	80862	80873	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496681
28	NC_008601	CTGATA	2	12	81128	81139	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496681
29	NC_008601	AGCTGG	2	12	85671	85682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118496688
30	NC_008601	AGCCAA	2	12	89015	89026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118496693
31	NC_008601	ATAATT	2	12	93263	93274	50 %	50 %	0 %	0 %	118496698
32	NC_008601	ATTGAT	2	12	93526	93537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496698
33	NC_008601	AAGTTT	2	12	99290	99301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496702
34	NC_008601	ATAATT	2	12	101332	101343	50 %	50 %	0 %	0 %	118496705
35	NC_008601	AATGGC	2	12	104430	104441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496707
36	NC_008601	TTAAGG	2	12	105096	105107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496708
37	NC_008601	TAAAAA	2	12	106408	106419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496710
38	NC_008601	TTATGT	2	12	108170	108181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496712
39	NC_008601	AAGGAT	2	12	108712	108723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496712
40	NC_008601	TAAATA	2	12	111645	111656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496716
41	NC_008601	GTTATT	2	12	113226	113237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496717
42	NC_008601	CTTGAG	2	12	114483	114494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496718
43	NC_008601	AGCACC	2	12	114529	114540	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118496718
44	NC_008601	TCAATT	2	12	121957	121968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118496725
45	NC_008601	TAAGAG	2	12	129593	129604	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496733
46	NC_008601	TGGTTT	2	12	130025	130036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496733
47	NC_008601	TAAAGG	2	12	131368	131379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496735
48	NC_008601	GTTGAT	2	12	132459	132470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496737
49	NC_008601	TTGAGA	2	12	146459	146470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496748
50	NC_008601	TTTTAG	2	12	146687	146698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496748
51	NC_008601	TTAGGC	2	12	147316	147327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118496748
52	NC_008601	TATTTT	2	12	150555	150566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496752
53	NC_008601	TAAGTA	2	12	151526	151537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118496753
54	NC_008601	GATCTA	2	12	155498	155509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496757
55	NC_008601	AAATAT	2	12	158374	158385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496758
56	NC_008601	ACAGGT	2	12	160551	160562	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496761
57	NC_008601	ACTTTT	2	12	160894	160905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496762
58	NC_008601	TACAAC	2	12	162361	162372	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118496763
59	NC_008601	TCCTTG	2	12	166207	166218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118496767
60	NC_008601	AGCTAT	2	12	167134	167145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496768
61	NC_008601	TAAAAG	2	12	170915	170926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496770
62	NC_008601	AAATAA	2	12	171504	171515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118496771
63	NC_008601	AACTTC	2	12	173448	173459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496773
64	NC_008601	TTATGA	2	12	175649	175660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496775
65	NC_008601	ATCAAA	2	12	178174	178185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496778
66	NC_008601	GTACAG	2	12	178347	178358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496778
67	NC_008601	CAAAGT	2	12	182678	182689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496781
68	NC_008601	AAATGC	2	12	186029	186040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496784
69	NC_008601	TTTCAT	2	12	193791	193802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118496790
70	NC_008601	CAGATA	2	12	195867	195878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118496791
71	NC_008601	ATCGTA	2	12	196089	196100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496792
72	NC_008601	AAGGTA	2	12	196120	196131	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496792
73	NC_008601	ATCGCT	2	12	198487	198498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118496794
74	NC_008601	TTGTGT	2	12	199835	199846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496796
75	NC_008601	GTTGCT	2	12	203503	203514	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118496800
76	NC_008601	TAGTAT	2	12	203583	203594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496800
77	NC_008601	TCATTA	2	12	204339	204350	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118496801
78	NC_008601	GACAAG	2	12	207303	207314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496803
79	NC_008601	CAAATT	2	12	212520	212531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118496807
80	NC_008601	TTTTAT	2	12	213209	213220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118496808
81	NC_008601	TTAAGT	2	12	213950	213961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496808
82	NC_008601	ATTATA	2	12	220870	220881	50 %	50 %	0 %	0 %	118496813
83	NC_008601	CACCAA	2	12	222644	222655	50 %	0 %	0 %	50 %	118496815
84	NC_008601	ACTAGT	2	12	230167	230178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496824
85	NC_008601	TACTGC	2	12	236180	236191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118496828
86	NC_008601	TAGCTT	2	12	240952	240963	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118496832
87	NC_008601	CATCAC	2	12	244213	244224	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118496835
88	NC_008601	TTTTGA	2	12	244226	244237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118496835
89	NC_008601	TTATGG	2	12	247173	247184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496837
90	NC_008601	TGAAGC	2	12	250424	250435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118496840
91	NC_008601	AAAGAA	2	12	251529	251540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118496841
92	NC_008601	AAAAGA	2	12	253011	253022	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118496843
93	NC_008601	TGGTGT	2	12	254040	254051	0 %	50 %	50 %	0 %	118496845
94	NC_008601	GTTTTT	2	12	254740	254751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118496845
95	NC_008601	TGAAGT	2	12	256531	256542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496849
96	NC_008601	GCAAGA	2	12	257007	257018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496850
97	NC_008601	CTGTTG	2	12	258089	258100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118496850
98	NC_008601	AGGTTG	2	12	258698	258709	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118496850
99	NC_008601	TGGGTG	2	12	264962	264973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496864
100	NC_008601	TTGGTG	2	12	266091	266102	0 %	50 %	50 %	0 %	118496866
101	NC_008601	TAAAGA	2	12	274027	274038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118496879
102	NC_008601	GGTATG	2	12	274625	274636	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118496879
103	NC_008601	AAGAGC	2	12	281579	281590	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118496885
104	NC_008601	AAAGGT	2	12	282319	282330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496886
105	NC_008601	AGTTAC	2	12	287049	287060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496890
106	NC_008601	TACCAG	2	12	287580	287591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118496891
107	NC_008601	ATCAAA	2	12	289501	289512	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496894
108	NC_008601	ATATTT	2	12	293755	293766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496896
109	NC_008601	TTAGAA	2	12	294406	294417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118496897
110	NC_008601	AGTATG	2	12	295335	295346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496898
111	NC_008601	GTAAAG	2	12	297175	297186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118496900
112	NC_008601	TGAATC	2	12	301729	301740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118496904
113	NC_008601	TCATCC	2	12	305181	305192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118496907
114	NC_008601	GGTGAA	2	12	305909	305920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118496908
115	NC_008601	TAGGTT	2	12	310483	310494	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118496911
116	NC_008601	TATAGT	2	12	312058	312069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118496913
117	NC_008601	AATATA	2	12	314126	314137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496914
118	NC_008601	TACAAA	2	12	314716	314727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496915
119	NC_008601	TAACAA	2	12	314731	314742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118496915
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347	NC_008601	ACAGCT	3	18	762902	762919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497310
348	NC_008601	GACTAA	2	12	762976	762987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497310
349	NC_008601	ACAGCT	3	18	763208	763225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497310
350	NC_008601	GACTAA	2	12	763282	763293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497310
351	NC_008601	ACAGCT	3	18	763514	763531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497310
352	NC_008601	GACTAA	2	12	763588	763599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497310
353	NC_008601	AAAGTA	2	12	763943	763954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118497310
354	NC_008601	TTTACG	2	12	764189	764200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118497310
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356	NC_008601	TTTACG	2	12	764768	764779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118497310
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359	NC_008601	GACTAA	2	12	768412	768423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497311
360	NC_008601	ACAGCT	3	18	768644	768661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497311
361	NC_008601	GACTAA	2	12	768718	768729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497311
362	NC_008601	ACAGCT	3	18	768950	768967	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497311
363	NC_008601	GACTAA	2	12	769024	769035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497311
364	NC_008601	ACAGCT	3	18	769256	769273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497311
365	NC_008601	GACTAA	2	12	769330	769341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497311
366	NC_008601	ATCAGC	2	12	770158	770169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118497311
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374	NC_008601	TGGTAC	2	12	782241	782252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118497324
375	NC_008601	GATAAT	2	12	782359	782370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118497324
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459	NC_008601	TATTTA	2	12	934622	934633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118497471
460	NC_008601	ATATTT	2	12	937107	937118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118497474
461	NC_008601	ATCTAA	2	12	937247	937258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118497474
462	NC_008601	AAGTTT	2	12	942394	942405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118497477
463	NC_008601	TTATAT	2	12	944215	944226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118497478
464	NC_008601	TTAAGC	2	12	944964	944975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118497479
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485	NC_008601	AAATTC	2	12	1007059	1007070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118497541
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487	NC_008601	CTAAAG	2	12	1010102	1010113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118497546
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