MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 1221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	118496616
2	NC_008601	TAAAG	2	10	3871	3880	60 %	20 %	20 %	0 %	118496618
3	NC_008601	CATAC	2	10	3958	3967	40 %	20 %	0 %	40 %	118496618
4	NC_008601	AAATG	2	10	5191	5200	60 %	20 %	20 %	0 %	118496619
5	NC_008601	ATTTT	2	10	5841	5850	20 %	80 %	0 %	0 %	118496620
6	NC_008601	CATTT	2	10	7671	7680	20 %	60 %	0 %	20 %	118496622
7	NC_008601	CTTTT	2	10	9476	9485	0 %	80 %	0 %	20 %	118496625
8	NC_008601	ACCAA	2	10	10346	10355	60 %	0 %	0 %	40 %	118496627
9	NC_008601	TTCTT	2	10	11535	11544	0 %	80 %	0 %	20 %	118496628
10	NC_008601	ATTTT	2	10	15777	15786	20 %	80 %	0 %	0 %	118496633
11	NC_008601	ATATC	2	10	15849	15858	40 %	40 %	0 %	20 %	118496633
12	NC_008601	ATTTT	2	10	15944	15953	20 %	80 %	0 %	0 %	118496633
13	NC_008601	ATTTG	2	10	17105	17114	20 %	60 %	20 %	0 %	118496634
14	NC_008601	AAAGA	2	10	17823	17832	80 %	0 %	20 %	0 %	118496634
15	NC_008601	CATTT	2	10	19467	19476	20 %	60 %	0 %	20 %	118496635
16	NC_008601	ATATT	2	10	21941	21950	40 %	60 %	0 %	0 %	118496636
17	NC_008601	AAAAT	2	10	24041	24050	80 %	20 %	0 %	0 %	118496637
18	NC_008601	TCAGC	2	10	24202	24211	20 %	20 %	20 %	40 %	118496638
19	NC_008601	GTTTA	2	10	24629	24638	20 %	60 %	20 %	0 %	118496638
20	NC_008601	TCAAA	2	10	24883	24892	60 %	20 %	0 %	20 %	118496639
21	NC_008601	TTATC	2	10	27155	27164	20 %	60 %	0 %	20 %	118496641
22	NC_008601	TTGAT	2	10	28522	28531	20 %	60 %	20 %	0 %	118496642
23	NC_008601	GTAAA	2	10	28935	28944	60 %	20 %	20 %	0 %	118496643
24	NC_008601	TACAA	2	10	29362	29371	60 %	20 %	0 %	20 %	118496643
25	NC_008601	TCTAA	2	10	29835	29844	40 %	40 %	0 %	20 %	118496644
26	NC_008601	TTTCT	2	10	30354	30363	0 %	80 %	0 %	20 %	118496644
27	NC_008601	TTTTA	2	10	30410	30419	20 %	80 %	0 %	0 %	118496644
28	NC_008601	AATAT	2	10	31090	31099	60 %	40 %	0 %	0 %	118496645
29	NC_008601	AGTTT	2	10	35493	35502	20 %	60 %	20 %	0 %	118496649
30	NC_008601	ATTTC	2	10	40142	40151	20 %	60 %	0 %	20 %	118496652
31	NC_008601	AATAT	2	10	40731	40740	60 %	40 %	0 %	0 %	118496654
32	NC_008601	ATATT	2	10	41742	41751	40 %	60 %	0 %	0 %	118496655
33	NC_008601	AAGTA	2	10	41846	41855	60 %	20 %	20 %	0 %	118496655
34	NC_008601	ATGAG	2	10	42136	42145	40 %	20 %	40 %	0 %	118496655
35	NC_008601	CAAAT	2	10	42516	42525	60 %	20 %	0 %	20 %	118496655
36	NC_008601	ACTAT	2	10	42870	42879	40 %	40 %	0 %	20 %	118496655
37	NC_008601	GTTTT	2	10	43423	43432	0 %	80 %	20 %	0 %	118496655
38	NC_008601	TTATT	2	10	43945	43954	20 %	80 %	0 %	0 %	118496655
39	NC_008601	TCTTA	2	10	49500	49509	20 %	60 %	0 %	20 %	118496659
40	NC_008601	AGCAA	2	10	49668	49677	60 %	0 %	20 %	20 %	118496660
41	NC_008601	ATTCT	2	10	53953	53962	20 %	60 %	0 %	20 %	118496662
42	NC_008601	ATGAG	2	10	54832	54841	40 %	20 %	40 %	0 %	118496662
43	NC_008601	AATAA	2	10	54981	54990	80 %	20 %	0 %	0 %	118496662
44	NC_008601	GATAT	2	10	55669	55678	40 %	40 %	20 %	0 %	118496662
45	NC_008601	TAATA	2	10	56852	56861	60 %	40 %	0 %	0 %	118496662
46	NC_008601	ATTTA	2	10	58046	58055	40 %	60 %	0 %	0 %	118496663
47	NC_008601	GAACA	2	10	59104	59113	60 %	0 %	20 %	20 %	118496664
48	NC_008601	GATTT	2	10	59424	59433	20 %	60 %	20 %	0 %	118496664
49	NC_008601	ATAAA	2	10	59554	59563	80 %	20 %	0 %	0 %	118496664
50	NC_008601	AGGAG	2	10	59871	59880	40 %	0 %	60 %	0 %	118496665
51	NC_008601	AGTTT	2	10	60995	61004	20 %	60 %	20 %	0 %	118496665
52	NC_008601	TAAGT	2	10	61539	61548	40 %	40 %	20 %	0 %	118496666
53	NC_008601	TAAAT	2	10	62910	62919	60 %	40 %	0 %	0 %	118496667
54	NC_008601	AATTA	2	10	63899	63908	60 %	40 %	0 %	0 %	118496668
55	NC_008601	CTTGT	2	10	65297	65306	0 %	60 %	20 %	20 %	118496670
56	NC_008601	AGTTT	2	10	67230	67239	20 %	60 %	20 %	0 %	118496672
57	NC_008601	GATAA	2	10	68347	68356	60 %	20 %	20 %	0 %	118496673
58	NC_008601	TAAAC	2	10	69201	69210	60 %	20 %	0 %	20 %	118496673
59	NC_008601	TTTGC	2	10	69897	69906	0 %	60 %	20 %	20 %	118496674
60	NC_008601	AAACC	2	10	72064	72073	60 %	0 %	0 %	40 %	118496676
61	NC_008601	CGTAT	2	10	75124	75133	20 %	40 %	20 %	20 %	118496678
62	NC_008601	TTTTC	2	10	76835	76844	0 %	80 %	0 %	20 %	118496679
63	NC_008601	AGATT	2	10	82559	82568	40 %	40 %	20 %	0 %	118496683
64	NC_008601	CTTTT	2	10	84932	84941	0 %	80 %	0 %	20 %	118496687
65	NC_008601	CAACC	2	10	86363	86372	40 %	0 %	0 %	60 %	118496688
66	NC_008601	ATTTT	2	10	87870	87879	20 %	80 %	0 %	0 %	118496691
67	NC_008601	CTAGA	2	10	88310	88319	40 %	20 %	20 %	20 %	118496692
68	NC_008601	GCAAA	2	10	88378	88387	60 %	0 %	20 %	20 %	118496692
69	NC_008601	TACAG	2	10	94668	94677	40 %	20 %	20 %	20 %	118496699
70	NC_008601	TCAAG	2	10	95158	95167	40 %	20 %	20 %	20 %	118496699
71	NC_008601	TTATC	2	10	95675	95684	20 %	60 %	0 %	20 %	118496699
72	NC_008601	TAGTT	2	10	95883	95892	20 %	60 %	20 %	0 %	118496699
73	NC_008601	AAAAT	2	10	96560	96569	80 %	20 %	0 %	0 %	118496699
74	NC_008601	TGTGA	2	10	96946	96955	20 %	40 %	40 %	0 %	118496700
75	NC_008601	AGTTT	2	10	98255	98264	20 %	60 %	20 %	0 %	118496701
76	NC_008601	GCTTT	2	10	98637	98646	0 %	60 %	20 %	20 %	118496701
77	NC_008601	CAAGA	2	10	100568	100577	60 %	0 %	20 %	20 %	118496704
78	NC_008601	TACAA	2	10	100790	100799	60 %	20 %	0 %	20 %	118496704
79	NC_008601	TAGAG	2	10	103096	103105	40 %	20 %	40 %	0 %	118496706
80	NC_008601	ATATT	2	10	105086	105095	40 %	60 %	0 %	0 %	118496708
81	NC_008601	TATTT	2	10	105948	105957	20 %	80 %	0 %	0 %	118496709
82	NC_008601	TTATT	2	10	107236	107245	20 %	80 %	0 %	0 %	118496711
83	NC_008601	TACTT	2	10	107521	107530	20 %	60 %	0 %	20 %	118496711
84	NC_008601	AGGCT	2	10	109879	109888	20 %	20 %	40 %	20 %	118496714
85	NC_008601	TTCAA	2	10	110075	110084	40 %	40 %	0 %	20 %	118496714
86	NC_008601	AATTT	2	10	113121	113130	40 %	60 %	0 %	0 %	118496717
87	NC_008601	TTTGT	2	10	113400	113409	0 %	80 %	20 %	0 %	118496717
88	NC_008601	TATTT	2	10	114466	114475	20 %	80 %	0 %	0 %	118496718
89	NC_008601	TTGTT	2	10	115912	115921	0 %	80 %	20 %	0 %	118496718
90	NC_008601	GTTTA	2	10	116914	116923	20 %	60 %	20 %	0 %	118496720
91	NC_008601	TGAAA	2	10	117943	117952	60 %	20 %	20 %	0 %	118496722
92	NC_008601	AAATT	2	10	119947	119956	60 %	40 %	0 %	0 %	118496723
93	NC_008601	TTTTA	2	10	125008	125017	20 %	80 %	0 %	0 %	118496729
94	NC_008601	TATTT	2	10	125239	125248	20 %	80 %	0 %	0 %	118496729
95	NC_008601	CAACA	2	10	129548	129557	60 %	0 %	0 %	40 %	118496733
96	NC_008601	TGTTT	2	10	131256	131265	0 %	80 %	20 %	0 %	118496735
97	NC_008601	CAAGA	2	10	134242	134251	60 %	0 %	20 %	20 %	118496739
98	NC_008601	TTGAT	2	10	136570	136579	20 %	60 %	20 %	0 %	118496741
99	NC_008601	AGGGT	2	10	138087	138096	20 %	20 %	60 %	0 %	118496742
100	NC_008601	AATCA	2	10	138944	138953	60 %	20 %	0 %	20 %	118496742
101	NC_008601	ATGGT	2	10	138978	138987	20 %	40 %	40 %	0 %	118496742
102	NC_008601	TTTGC	2	10	139238	139247	0 %	60 %	20 %	20 %	118496743
103	NC_008601	CGTAC	2	10	139382	139391	20 %	20 %	20 %	40 %	118496743
104	NC_008601	TTCAA	2	10	139753	139762	40 %	40 %	0 %	20 %	118496743
105	NC_008601	ATGCA	2	10	141888	141897	40 %	20 %	20 %	20 %	118496744
106	NC_008601	ATAAA	2	10	144142	144151	80 %	20 %	0 %	0 %	118496746
107	NC_008601	AATAA	2	10	144295	144304	80 %	20 %	0 %	0 %	118496746
108	NC_008601	TGGGA	2	10	147825	147834	20 %	20 %	60 %	0 %	118496748
109	NC_008601	TTGAT	2	10	147878	147887	20 %	60 %	20 %	0 %	118496748
110	NC_008601	AAATT	2	10	149883	149892	60 %	40 %	0 %	0 %	118496750
111	NC_008601	TTATT	2	10	151655	151664	20 %	80 %	0 %	0 %	118496753
112	NC_008601	TATTT	2	10	153406	153415	20 %	80 %	0 %	0 %	118496755
113	NC_008601	AGATG	2	10	154672	154681	40 %	20 %	40 %	0 %	118496756
114	NC_008601	AATTC	2	10	165042	165051	40 %	40 %	0 %	20 %	118496766
115	NC_008601	ATTTT	2	10	167025	167034	20 %	80 %	0 %	0 %	118496768
116	NC_008601	TAAAT	2	10	169712	169721	60 %	40 %	0 %	0 %	118496769
117	NC_008601	TTTAC	2	10	170734	170743	20 %	60 %	0 %	20 %	118496770
118	NC_008601	CTTCT	2	10	172894	172903	0 %	60 %	0 %	40 %	118496773
119	NC_008601	TGATC	2	10	173319	173328	20 %	40 %	20 %	20 %	118496773
120	NC_008601	TTAAC	2	10	173549	173558	40 %	40 %	0 %	20 %	118496773
121	NC_008601	TAGCA	2	10	173880	173889	40 %	20 %	20 %	20 %	118496773
122	NC_008601	CAAAG	2	10	176342	176351	60 %	0 %	20 %	20 %	118496776
123	NC_008601	TAAGT	2	10	177982	177991	40 %	40 %	20 %	0 %	118496777
124	NC_008601	AAGAA	2	10	183357	183366	80 %	0 %	20 %	0 %	118496782
125	NC_008601	GTATG	2	10	184704	184713	20 %	40 %	40 %	0 %	118496782
126	NC_008601	AAATC	2	10	186186	186195	60 %	20 %	0 %	20 %	118496784
127	NC_008601	TAAAA	2	10	186227	186236	80 %	20 %	0 %	0 %	118496784
128	NC_008601	ATTCT	2	10	187013	187022	20 %	60 %	0 %	20 %	118496785
129	NC_008601	AAACT	2	10	187070	187079	60 %	20 %	0 %	20 %	118496785
130	NC_008601	CTTAG	2	10	189092	189101	20 %	40 %	20 %	20 %	118496786
131	NC_008601	TCCAG	2	10	189598	189607	20 %	20 %	20 %	40 %	118496787
132	NC_008601	TGCTT	2	10	189816	189825	0 %	60 %	20 %	20 %	118496787
133	NC_008601	TTTGT	2	10	189950	189959	0 %	80 %	20 %	0 %	118496787
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135	NC_008601	ATTTG	2	10	194653	194662	20 %	60 %	20 %	0 %	118496791
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