MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 5222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	GCTT	2	8	23	30	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008601	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008601	GCAA	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	118496616
4	NC_008601	TGAT	2	8	914	921	25 %	50 %	25 %	0 %	118496616
5	NC_008601	GTAC	2	8	1201	1208	25 %	25 %	25 %	25 %	118496616
6	NC_008601	GCTT	2	8	1297	1304	0 %	50 %	25 %	25 %	118496616
7	NC_008601	ATGC	2	8	1528	1535	25 %	25 %	25 %	25 %	118496616
8	NC_008601	TAAA	2	8	1618	1625	75 %	25 %	0 %	0 %	118496616
9	NC_008601	AGTT	2	8	1830	1837	25 %	50 %	25 %	0 %	118496617
10	NC_008601	TGAA	2	8	1898	1905	50 %	25 %	25 %	0 %	118496617
11	NC_008601	AGCA	2	8	2027	2034	50 %	0 %	25 %	25 %	118496617
12	NC_008601	TCTA	2	8	2671	2678	25 %	50 %	0 %	25 %	118496617
13	NC_008601	GTTT	2	8	2729	2736	0 %	75 %	25 %	0 %	118496617
14	NC_008601	GAAT	2	8	2805	2812	50 %	25 %	25 %	0 %	118496618
15	NC_008601	AGAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	25 %	0 %	118496618
16	NC_008601	GTAT	2	8	3886	3893	25 %	50 %	25 %	0 %	118496618
17	NC_008601	ACTT	2	8	4621	4628	25 %	50 %	0 %	25 %	118496619
18	NC_008601	TTCA	2	8	4782	4789	25 %	50 %	0 %	25 %	118496619
19	NC_008601	TTAG	2	8	4952	4959	25 %	50 %	25 %	0 %	118496619
20	NC_008601	TTAT	2	8	5160	5167	25 %	75 %	0 %	0 %	118496619
21	NC_008601	ATTG	2	8	5326	5333	25 %	50 %	25 %	0 %	118496619
22	NC_008601	TTTA	2	8	5686	5693	25 %	75 %	0 %	0 %	118496619
23	NC_008601	TAAA	2	8	5761	5768	75 %	25 %	0 %	0 %	118496619
24	NC_008601	GATA	2	8	6146	6153	50 %	25 %	25 %	0 %	118496620
25	NC_008601	AAAG	2	8	6207	6214	75 %	0 %	25 %	0 %	118496620
26	NC_008601	ATTT	3	12	6771	6782	25 %	75 %	0 %	0 %	118496620
27	NC_008601	AAAT	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008601	TTGC	2	8	7637	7644	0 %	50 %	25 %	25 %	118496622
29	NC_008601	ATTA	2	8	7852	7859	50 %	50 %	0 %	0 %	118496623
30	NC_008601	AATT	2	8	8298	8305	50 %	50 %	0 %	0 %	118496623
31	NC_008601	AATA	2	8	8439	8446	75 %	25 %	0 %	0 %	118496623
32	NC_008601	GGTT	2	8	8822	8829	0 %	50 %	50 %	0 %	118496624
33	NC_008601	AGTT	2	8	8961	8968	25 %	50 %	25 %	0 %	118496624
34	NC_008601	TTTA	2	8	9020	9027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008601	TTTA	2	8	9258	9265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008601	CTAT	2	8	9553	9560	25 %	50 %	0 %	25 %	118496625
37	NC_008601	GTAA	2	8	9755	9762	50 %	25 %	25 %	0 %	118496625
38	NC_008601	CAAC	2	8	9903	9910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008601	ATTA	2	8	10050	10057	50 %	50 %	0 %	0 %	118496626
40	NC_008601	ATTC	2	8	10145	10152	25 %	50 %	0 %	25 %	118496626
41	NC_008601	TGTA	2	8	10471	10478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008601	GTTA	2	8	10488	10495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008601	TTTA	2	8	10600	10607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008601	GTTG	2	8	10638	10645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008601	AATA	2	8	10875	10882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008601	AGTT	2	8	11403	11410	25 %	50 %	25 %	0 %	118496628
47	NC_008601	AATA	2	8	11572	11579	75 %	25 %	0 %	0 %	118496628
48	NC_008601	CTAA	2	8	11654	11661	50 %	25 %	0 %	25 %	118496628
49	NC_008601	TTAT	2	8	12343	12350	25 %	75 %	0 %	0 %	118496629
50	NC_008601	ACTT	2	8	12416	12423	25 %	50 %	0 %	25 %	118496629
51	NC_008601	ATTG	2	8	12506	12513	25 %	50 %	25 %	0 %	118496629
52	NC_008601	AACC	2	8	12784	12791	50 %	0 %	0 %	50 %	118496630
53	NC_008601	GTAT	2	8	13202	13209	25 %	50 %	25 %	0 %	118496631
54	NC_008601	CTTT	2	8	13348	13355	0 %	75 %	0 %	25 %	118496631
55	NC_008601	AGTA	2	8	13380	13387	50 %	25 %	25 %	0 %	118496631
56	NC_008601	CTTA	2	8	14107	14114	25 %	50 %	0 %	25 %	118496632
57	NC_008601	GCTT	2	8	14177	14184	0 %	50 %	25 %	25 %	118496632
58	NC_008601	ACTA	2	8	14296	14303	50 %	25 %	0 %	25 %	118496632
59	NC_008601	CTTG	2	8	15001	15008	0 %	50 %	25 %	25 %	118496632
60	NC_008601	AAGA	2	8	15414	15421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008601	TTTG	2	8	16239	16246	0 %	75 %	25 %	0 %	118496633
62	NC_008601	TAAA	2	8	16919	16926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008601	TAAT	2	8	16981	16988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008601	TCTA	2	8	17220	17227	25 %	50 %	0 %	25 %	118496634
65	NC_008601	AGTG	2	8	17461	17468	25 %	25 %	50 %	0 %	118496634
66	NC_008601	ATCA	2	8	17685	17692	50 %	25 %	0 %	25 %	118496634
67	NC_008601	TATT	2	8	17996	18003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008601	CATT	2	8	18872	18879	25 %	50 %	0 %	25 %	118496635
69	NC_008601	ATCA	2	8	19098	19105	50 %	25 %	0 %	25 %	118496635
70	NC_008601	CTTT	2	8	19685	19692	0 %	75 %	0 %	25 %	118496635
71	NC_008601	TCTT	2	8	19962	19969	0 %	75 %	0 %	25 %	118496635
72	NC_008601	ATCT	2	8	20010	20017	25 %	50 %	0 %	25 %	118496635
73	NC_008601	GTCT	2	8	21516	21523	0 %	50 %	25 %	25 %	118496636
74	NC_008601	TGGT	2	8	21664	21671	0 %	50 %	50 %	0 %	118496636
75	NC_008601	ATGT	2	8	22026	22033	25 %	50 %	25 %	0 %	118496636
76	NC_008601	TACG	2	8	22197	22204	25 %	25 %	25 %	25 %	118496636
77	NC_008601	CACG	2	8	22308	22315	25 %	0 %	25 %	50 %	118496636
78	NC_008601	ATTA	2	8	22962	22969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008601	ATCT	2	8	24703	24710	25 %	50 %	0 %	25 %	118496638
80	NC_008601	TTGT	2	8	24750	24757	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008601	ACTA	2	8	24773	24780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008601	TGAT	2	8	25049	25056	25 %	50 %	25 %	0 %	118496639
83	NC_008601	TCGC	2	8	25506	25513	0 %	25 %	25 %	50 %	118496639
84	NC_008601	ACTT	2	8	25846	25853	25 %	50 %	0 %	25 %	118496639
85	NC_008601	TCGT	2	8	26420	26427	0 %	50 %	25 %	25 %	118496640
86	NC_008601	TTGA	2	8	26597	26604	25 %	50 %	25 %	0 %	118496640
87	NC_008601	TAAA	2	8	26849	26856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008601	ATTT	2	8	26882	26889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008601	ATTT	2	8	26936	26943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008601	ATTG	2	8	26965	26972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008601	TATT	2	8	27335	27342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008601	GCTT	2	8	27925	27932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008601	TGAT	2	8	28324	28331	25 %	50 %	25 %	0 %	118496642
94	NC_008601	GCTA	2	8	28684	28691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008601	TAAA	2	8	28800	28807	75 %	25 %	0 %	0 %	118496643
96	NC_008601	AAAC	2	8	28874	28881	75 %	0 %	0 %	25 %	118496643
97	NC_008601	TTTA	2	8	29083	29090	25 %	75 %	0 %	0 %	118496643
98	NC_008601	CCTT	2	8	29420	29427	0 %	50 %	0 %	50 %	118496643
99	NC_008601	TTTC	2	8	29856	29863	0 %	75 %	0 %	25 %	118496644
100	NC_008601	CTTT	2	8	30009	30016	0 %	75 %	0 %	25 %	118496644
101	NC_008601	TTAT	2	8	30733	30740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008601	GTAA	2	8	31018	31025	50 %	25 %	25 %	0 %	118496645
103	NC_008601	ATTG	2	8	31042	31049	25 %	50 %	25 %	0 %	118496645
104	NC_008601	TTAG	2	8	32046	32053	25 %	50 %	25 %	0 %	118496646
105	NC_008601	CAAA	2	8	32940	32947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008601	CTTG	2	8	33480	33487	0 %	50 %	25 %	25 %	118496648
107	NC_008601	CTTC	2	8	34676	34683	0 %	50 %	0 %	50 %	118496649
108	NC_008601	AAAT	2	8	35293	35300	75 %	25 %	0 %	0 %	118496649
109	NC_008601	AAAT	2	8	35395	35402	75 %	25 %	0 %	0 %	118496649
110	NC_008601	ATTT	2	8	35868	35875	25 %	75 %	0 %	0 %	118496649
111	NC_008601	CAAG	2	8	36170	36177	50 %	0 %	25 %	25 %	118496649
112	NC_008601	ATCC	2	8	36227	36234	25 %	25 %	0 %	50 %	118496649
113	NC_008601	TTCT	2	8	36738	36745	0 %	75 %	0 %	25 %	118496649
114	NC_008601	ACCT	2	8	36957	36964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008601	AGTT	2	8	37048	37055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008601	GTAG	2	8	37800	37807	25 %	25 %	50 %	0 %	118496650
117	NC_008601	AGTT	2	8	38567	38574	25 %	50 %	25 %	0 %	118496651
118	NC_008601	CTTT	2	8	38717	38724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008601	GTAT	2	8	38727	38734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008601	TTAT	2	8	38757	38764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008601	AATA	2	8	39034	39041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008601	AAGA	2	8	39667	39674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008601	ATTT	2	8	39803	39810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008601	TAGT	2	8	40155	40162	25 %	50 %	25 %	0 %	118496652
125	NC_008601	TTTG	2	8	40849	40856	0 %	75 %	25 %	0 %	118496654
126	NC_008601	ATTT	2	8	41091	41098	25 %	75 %	0 %	0 %	118496655
127	NC_008601	TATT	2	8	41245	41252	25 %	75 %	0 %	0 %	118496655
128	NC_008601	TTTA	2	8	41498	41505	25 %	75 %	0 %	0 %	118496655
129	NC_008601	ATTA	2	8	41999	42006	50 %	50 %	0 %	0 %	118496655
130	NC_008601	AAGA	2	8	43079	43086	75 %	0 %	25 %	0 %	118496655
131	NC_008601	GATA	2	8	43787	43794	50 %	25 %	25 %	0 %	118496655
132	NC_008601	TTAT	2	8	44357	44364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008601	ATAA	2	8	44740	44747	75 %	25 %	0 %	0 %	118496656
134	NC_008601	CATT	2	8	45222	45229	25 %	50 %	0 %	25 %	118496656
135	NC_008601	TAAA	2	8	45367	45374	75 %	25 %	0 %	0 %	118496656
136	NC_008601	ATTT	2	8	45499	45506	25 %	75 %	0 %	0 %	118496656
137	NC_008601	TAGA	2	8	45855	45862	50 %	25 %	25 %	0 %	118496656
138	NC_008601	GAAA	2	8	47038	47045	75 %	0 %	25 %	0 %	118496657
139	NC_008601	ATGG	2	8	47056	47063	25 %	25 %	50 %	0 %	118496657
140	NC_008601	TGGT	2	8	47378	47385	0 %	50 %	50 %	0 %	118496657
141	NC_008601	AAAT	2	8	49291	49298	75 %	25 %	0 %	0 %	118496659
142	NC_008601	AAAC	2	8	49371	49378	75 %	0 %	0 %	25 %	118496659
143	NC_008601	TTTG	2	8	49694	49701	0 %	75 %	25 %	0 %	118496660
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145	NC_008601	TTAA	2	8	50004	50011	50 %	50 %	0 %	0 %	118496660
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