MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 28388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008601	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008601	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496616
3	NC_008601	ATT	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
4	NC_008601	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496616
5	NC_008601	CAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496616
6	NC_008601	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
7	NC_008601	AGT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496616
8	NC_008601	AAG	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
9	NC_008601	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
10	NC_008601	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
11	NC_008601	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496616
12	NC_008601	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496616
13	NC_008601	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496616
14	NC_008601	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
15	NC_008601	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496616
16	NC_008601	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
17	NC_008601	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496616
18	NC_008601	TAC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
19	NC_008601	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496616
20	NC_008601	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496616
21	NC_008601	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496616
22	NC_008601	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496616
23	NC_008601	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496616
24	NC_008601	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496616
25	NC_008601	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
26	NC_008601	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
27	NC_008601	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
28	NC_008601	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496617
29	NC_008601	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
30	NC_008601	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
31	NC_008601	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496617
32	NC_008601	CTA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
33	NC_008601	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496617
34	NC_008601	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
35	NC_008601	ATT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
36	NC_008601	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
37	NC_008601	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496617
38	NC_008601	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496617
39	NC_008601	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496617
40	NC_008601	ATT	2	6	2737	2742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496617
41	NC_008601	TAA	2	6	2762	2767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008601	AGT	3	9	2878	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
43	NC_008601	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
44	NC_008601	CAC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
45	NC_008601	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
46	NC_008601	ATA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
47	NC_008601	ACC	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
48	NC_008601	GAA	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
49	NC_008601	TAT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
50	NC_008601	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
51	NC_008601	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
52	NC_008601	TAA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
53	NC_008601	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
54	NC_008601	TGA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496618
55	NC_008601	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
56	NC_008601	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
57	NC_008601	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
58	NC_008601	GAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
59	NC_008601	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496618
60	NC_008601	GCT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496618
61	NC_008601	CCA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
62	NC_008601	CCA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496618
63	NC_008601	TAA	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
64	NC_008601	AAT	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
65	NC_008601	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496618
66	NC_008601	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496618
67	NC_008601	TTG	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496618
68	NC_008601	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496618
69	NC_008601	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008601	TTA	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008601	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008601	ATT	2	6	4183	4188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008601	ATA	2	6	4205	4210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008601	TTA	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
75	NC_008601	AGC	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
76	NC_008601	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
77	NC_008601	TAT	2	6	4413	4418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
78	NC_008601	CAA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496619
79	NC_008601	ATT	2	6	4450	4455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496619
80	NC_008601	TAA	2	6	4674	4679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496619
81	NC_008601	ATA	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496619
82	NC_008601	AGC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
83	NC_008601	TGG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496619
84	NC_008601	CAG	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496619
85	NC_008601	TAC	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496619
86	NC_008601	TGG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118496619
87	NC_008601	CTA	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496619
88	NC_008601	CTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496619
89	NC_008601	ACA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496619
90	NC_008601	AGA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496619
91	NC_008601	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496619
92	NC_008601	TAG	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496619
93	NC_008601	AGA	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496619
94	NC_008601	TCA	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496619
95	NC_008601	TAT	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008601	TAT	2	6	5822	5827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008601	TTA	2	6	5883	5888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496620
98	NC_008601	TGA	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
99	NC_008601	AGA	2	6	6032	6037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496620
100	NC_008601	GAT	2	6	6063	6068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
101	NC_008601	TAA	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496620
102	NC_008601	GAT	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
103	NC_008601	AAT	2	6	6161	6166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496620
104	NC_008601	TGA	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
105	NC_008601	CTG	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496620
106	NC_008601	AAC	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496620
107	NC_008601	AGA	2	6	6332	6337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496620
108	NC_008601	TAA	2	6	6349	6354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496620
109	NC_008601	AAT	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496620
110	NC_008601	AGA	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496620
111	NC_008601	AGT	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
112	NC_008601	TAG	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496620
113	NC_008601	GAA	2	6	6543	6548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496620
114	NC_008601	TAA	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496620
115	NC_008601	TAT	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496620
116	NC_008601	ATT	2	6	6746	6751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496620
117	NC_008601	AAT	2	6	6875	6880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496621
118	NC_008601	TGC	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496621
119	NC_008601	TAA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496621
120	NC_008601	ACA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496621
121	NC_008601	CAT	2	6	7193	7198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496621
122	NC_008601	GTT	3	9	7218	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496621
123	NC_008601	TTC	2	6	7230	7235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496621
124	NC_008601	ATT	2	6	7314	7319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008601	ATT	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496622
126	NC_008601	TTG	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496622
127	NC_008601	GCA	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496622
128	NC_008601	TTA	2	6	7425	7430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496622
129	NC_008601	AGC	2	6	7484	7489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496622
130	NC_008601	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496622
131	NC_008601	ACT	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496622
132	NC_008601	TAA	2	6	7570	7575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496622
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257	NC_008601	AGA	2	6	17005	17010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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