MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 2019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TAGCCG	2	12	808	819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475779
2	NC_008600	AAAGGC	2	12	1268	1279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475779
3	NC_008600	TGGCGA	2	12	3555	3566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475782
4	NC_008600	TCTTTG	2	12	3656	3667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118475782
5	NC_008600	TGAAGA	2	12	8083	8094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475784
6	NC_008600	ATTCTT	2	12	8431	8442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118475784
7	NC_008600	AACTGG	2	12	17752	17763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475787
8	NC_008600	AAAGAT	2	12	18031	18042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475787
9	NC_008600	GACAGG	2	12	20959	20970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118475790
10	NC_008600	AAATGA	2	12	37837	37848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475804
11	NC_008600	TGTAGA	2	12	37942	37953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475804
12	NC_008600	GAAAAT	2	12	38608	38619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475805
13	NC_008600	TTGAAA	2	12	40105	40116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475808
14	NC_008600	GCACGT	2	12	52464	52475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475820
15	NC_008600	ATTAAC	2	12	56856	56867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475824
16	NC_008600	TTTTAA	2	12	60475	60486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475826
17	NC_008600	TATTGA	2	12	66455	66466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475833
18	NC_008600	CAGGTA	2	12	70224	70235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475836
19	NC_008600	AGCGTT	2	12	72555	72566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475838
20	NC_008600	GTTGGT	2	12	73006	73017	0 %	50 %	50 %	0 %	118475838
21	NC_008600	CTGGTG	2	12	74062	74073	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118475839
22	NC_008600	AAAAAG	2	12	75083	75094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475840
23	NC_008600	GTATCT	2	12	79264	79275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118475846
24	NC_008600	CAGTTA	2	12	79813	79824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475847
25	NC_008600	AGAAGC	2	12	100015	100026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475854
26	NC_008600	TTTAAT	2	12	100847	100858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118475855
27	NC_008600	GCAGTA	2	12	103641	103652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475858
28	NC_008600	GAACAA	2	12	104115	104126	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475858
29	NC_008600	CTAGCG	2	12	107502	107513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118475862
30	NC_008600	GTAGAA	2	12	110119	110130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475865
31	NC_008600	TTCTGG	2	12	110262	110273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118475865
32	NC_008600	TCTGGT	2	12	110949	110960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118475866
33	NC_008600	GAAGCT	2	12	111549	111560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475867
34	NC_008600	ATGCGA	2	12	120985	120996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475872
35	NC_008600	GCAAGA	2	12	123066	123077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475876
36	NC_008600	AGTAGA	2	12	123171	123182	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475876
37	NC_008600	GCAGTA	2	12	123208	123219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475876
38	NC_008600	AGCGTG	2	12	123944	123955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475876
39	NC_008600	ATTCGA	2	12	124464	124475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475876
40	NC_008600	AAGTTG	2	12	124718	124729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475876
41	NC_008600	GCTAAA	2	12	125104	125115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475877
42	NC_008600	GAAACT	2	12	125311	125322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475877
43	NC_008600	CAAGCT	2	12	125905	125916	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475877
44	NC_008600	AACTGA	2	12	127149	127160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475879
45	NC_008600	TAAAGG	2	12	127371	127382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475879
46	NC_008600	GAAATC	2	12	128575	128586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475881
47	NC_008600	ACAAGC	2	12	130924	130935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118475886
48	NC_008600	TTGAAG	2	12	134103	134114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475894
49	NC_008600	AAAGGT	2	12	134213	134224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475894
50	NC_008600	TAGTTG	2	12	134800	134811	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118475896
51	NC_008600	CTGAAA	2	12	137343	137354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475900
52	NC_008600	TTAGGT	2	12	140951	140962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118475905
53	NC_008600	ATTTTT	2	12	143303	143314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118475909
54	NC_008600	ATATCC	2	12	144370	144381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475910
55	NC_008600	TGCAAT	2	12	147407	147418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475914
56	NC_008600	TACAAG	2	12	148929	148940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475915
57	NC_008600	TTAGAT	2	12	158997	159008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475920
58	NC_008600	CCTGAA	2	12	161632	161643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475922
59	NC_008600	AGGAAC	2	12	161663	161674	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475922
60	NC_008600	AAGAAA	3	18	161687	161704	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475922
61	NC_008600	GGTGAC	2	12	162482	162493	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118475923
62	NC_008600	CGCATC	2	12	163843	163854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118475924
63	NC_008600	AAAAGA	2	12	165504	165515	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118475925
64	NC_008600	CAAAGA	2	12	185625	185636	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475944
65	NC_008600	CAAAAT	2	12	187040	187051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118475945
66	NC_008600	CGGTAT	2	12	190933	190944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475948
67	NC_008600	AGAGCA	2	12	191969	191980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118475949
68	NC_008600	ATTTTG	2	12	192998	193009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118475950
69	NC_008600	CAACGT	2	12	196145	196156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475953
70	NC_008600	CAAATT	2	12	196238	196249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475953
71	NC_008600	GTGGTT	2	12	202110	202121	0 %	50 %	50 %	0 %	118475959
72	NC_008600	GTGGTT	2	12	204138	204149	0 %	50 %	50 %	0 %	118475960
73	NC_008600	ATCTGG	2	12	205818	205829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475961
74	NC_008600	TGATTA	2	12	207596	207607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475963
75	NC_008600	TTCTTT	2	12	210761	210772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118475967
76	NC_008600	TATGAA	2	12	218898	218909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475974
77	NC_008600	GAAAGA	2	12	233217	233228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118475985
78	NC_008600	GAGAAT	2	12	234278	234289	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475986
79	NC_008600	CAACGT	2	12	234432	234443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475986
80	NC_008600	TGTAGC	2	12	241976	241987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475991
81	NC_008600	TGAAAA	2	12	247988	247999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475995
82	NC_008600	GTAATC	2	12	248194	248205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475995
83	NC_008600	CATCTC	2	12	248551	248562	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	118475996
84	NC_008600	ATAAAG	2	12	248980	248991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475996
85	NC_008600	CATAAT	2	12	249952	249963	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475997
86	NC_008600	AAAACA	2	12	251013	251024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118475999
87	NC_008600	AGCTGA	2	12	264434	264445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118476006
88	NC_008600	TAATTG	2	12	267897	267908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118476009
89	NC_008600	GGATAT	2	12	268663	268674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118476010
90	NC_008600	GCAACT	2	12	269415	269426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118476011
91	NC_008600	GGCATG	2	12	272400	272411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118476013
92	NC_008600	AGCAGA	2	12	273878	273889	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118476015
93	NC_008600	GTTTTT	2	12	279613	279624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118476020
94	NC_008600	CCATTT	2	12	286532	286543	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118476027
95	NC_008600	GTTTTA	2	12	309083	309094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118476033
96	NC_008600	TTTTGA	2	12	309818	309829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118476034
97	NC_008600	TAGAAA	2	12	310220	310231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118476035
98	NC_008600	TAGTTC	2	12	311332	311343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118476036
99	NC_008600	TGTACG	2	12	330964	330975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118476045
100	NC_008600	ACAAAT	2	12	331727	331738	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118476045
101	NC_008600	TTATGA	2	12	333201	333212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118476046
102	NC_008600	TTGTTA	2	12	335285	335296	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118476049
103	NC_008600	GATGCA	2	12	335752	335763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118476049
104	NC_008600	ATTGAT	2	12	336781	336792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118476050
105	NC_008600	ACAACT	2	12	342625	342636	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118476054
106	NC_008600	AGGTGA	2	12	342765	342776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118476054
107	NC_008600	CAAATC	2	12	343625	343636	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118476055
108	NC_008600	TTGCAA	2	12	348416	348427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118476058
109	NC_008600	CAGGGG	2	12	352038	352049	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118476062
110	NC_008600	AATTAA	2	12	352135	352146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118476062
111	NC_008600	AAAGAT	2	12	352673	352684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118476062
112	NC_008600	TTGCTG	2	12	356134	356145	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118476066
113	NC_008600	GCGAAA	2	12	357844	357855	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118476070
114	NC_008600	TGAGCA	2	12	359831	359842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118476071
115	NC_008600	ATTAAC	2	12	360107	360118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118476071
116	NC_008600	AATGAC	2	12	363473	363484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118476074
117	NC_008600	ATTTGG	2	12	363512	363523	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118476074
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343	NC_008600	TCACGT	2	12	843729	843740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118476467
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459	NC_008600	GTATCG	2	12	1198017	1198028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118476764
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