MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 4848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TTATC	2	10	184	193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008600	CAAAT	2	10	1321	1330	60 %	20 %	0 %	20 %	118475779
3	NC_008600	TTCAA	2	10	1935	1944	40 %	40 %	0 %	20 %	118475780
4	NC_008600	AATTT	2	10	2261	2270	40 %	60 %	0 %	0 %	118475780
5	NC_008600	ATTGA	2	10	4316	4325	40 %	40 %	20 %	0 %	118475782
6	NC_008600	AGCAA	2	10	5895	5904	60 %	0 %	20 %	20 %	118475783
7	NC_008600	ATTCT	2	10	8267	8276	20 %	60 %	0 %	20 %	118475784
8	NC_008600	TTTTA	2	10	9280	9289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008600	TCGTG	2	10	10388	10397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008600	GATAT	2	10	10961	10970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008600	ATGGT	2	10	11374	11383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008600	CTGAA	2	10	13138	13147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008600	TTGAA	2	10	15151	15160	40 %	40 %	20 %	0 %	118475785
14	NC_008600	TGAAA	2	10	17961	17970	60 %	20 %	20 %	0 %	118475787
15	NC_008600	GTCAA	2	10	19017	19026	40 %	20 %	20 %	20 %	118475788
16	NC_008600	TGGAA	2	10	20166	20175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008600	TAAAA	2	10	20322	20331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008600	TCCTT	2	10	21703	21712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008600	ATATT	2	10	21754	21763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008600	TTTTA	2	10	21933	21942	20 %	80 %	0 %	0 %	118475791
21	NC_008600	AAGTA	2	10	22277	22286	60 %	20 %	20 %	0 %	118475791
22	NC_008600	AGATG	2	10	26322	26331	40 %	20 %	40 %	0 %	118475796
23	NC_008600	TTTTA	2	10	28433	28442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008600	TTTTA	2	10	29080	29089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008600	TCGTG	2	10	30188	30197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008600	GATAT	2	10	30761	30770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008600	ATGGT	2	10	31173	31182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008600	CTGAA	2	10	32937	32946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008600	AAAAG	2	10	35396	35405	80 %	0 %	20 %	0 %	118475801
30	NC_008600	AAGAC	2	10	35692	35701	60 %	0 %	20 %	20 %	118475801
31	NC_008600	GTGAA	2	10	36440	36449	40 %	20 %	40 %	0 %	118475802
32	NC_008600	GTATT	2	10	36530	36539	20 %	60 %	20 %	0 %	118475802
33	NC_008600	AATGA	2	10	42207	42216	60 %	20 %	20 %	0 %	118475810
34	NC_008600	ATCGT	2	10	45400	45409	20 %	40 %	20 %	20 %	118475813
35	NC_008600	ATTAG	2	10	46388	46397	40 %	40 %	20 %	0 %	118475814
36	NC_008600	AAGTG	2	10	46561	46570	40 %	20 %	40 %	0 %	118475814
37	NC_008600	AAGAC	2	10	48169	48178	60 %	0 %	20 %	20 %	118475816
38	NC_008600	CATCT	2	10	55490	55499	20 %	40 %	0 %	40 %	118475824
39	NC_008600	CAAAA	2	10	56262	56271	80 %	0 %	0 %	20 %	118475824
40	NC_008600	TGCGA	2	10	57438	57447	20 %	20 %	40 %	20 %	118475824
41	NC_008600	GATTT	2	10	57515	57524	20 %	60 %	20 %	0 %	118475824
42	NC_008600	TGCTA	2	10	59537	59546	20 %	40 %	20 %	20 %	118475826
43	NC_008600	AAGGT	2	10	59928	59937	40 %	20 %	40 %	0 %	118475826
44	NC_008600	TATTT	2	10	60068	60077	20 %	80 %	0 %	0 %	118475826
45	NC_008600	TTGGA	2	10	62749	62758	20 %	40 %	40 %	0 %	118475830
46	NC_008600	AAAGA	2	10	63583	63592	80 %	0 %	20 %	0 %	118475831
47	NC_008600	ATTTA	2	10	64511	64520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008600	TTATG	2	10	65069	65078	20 %	60 %	20 %	0 %	118475833
49	NC_008600	TTCCA	2	10	65233	65242	20 %	40 %	0 %	40 %	118475833
50	NC_008600	AATGA	2	10	68980	68989	60 %	20 %	20 %	0 %	118475834
51	NC_008600	CGTTA	2	10	69360	69369	20 %	40 %	20 %	20 %	118475835
52	NC_008600	GATTA	2	10	69455	69464	40 %	40 %	20 %	0 %	118475835
53	NC_008600	GAAAA	2	10	70076	70085	80 %	0 %	20 %	0 %	118475836
54	NC_008600	ATAAG	2	10	71720	71729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008600	GAACA	2	10	72830	72839	60 %	0 %	20 %	20 %	118475838
56	NC_008600	GAAAA	2	10	75214	75223	80 %	0 %	20 %	0 %	118475840
57	NC_008600	GACAA	2	10	75321	75330	60 %	0 %	20 %	20 %	118475840
58	NC_008600	AGAGC	2	10	75574	75583	40 %	0 %	40 %	20 %	118475840
59	NC_008600	ATTTA	2	10	76097	76106	40 %	60 %	0 %	0 %	118475841
60	NC_008600	AAAAC	2	10	79117	79126	80 %	0 %	0 %	20 %	118475845
61	NC_008600	AAATA	2	10	79763	79772	80 %	20 %	0 %	0 %	118475847
62	NC_008600	GTATG	2	10	81938	81947	20 %	40 %	40 %	0 %	118475848
63	NC_008600	TGTTA	2	10	81986	81995	20 %	60 %	20 %	0 %	118475848
64	NC_008600	TCGTG	2	10	83513	83522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008600	ATGGT	2	10	84271	84280	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008600	CTGAA	2	10	86036	86045	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008600	TCGTG	2	10	89228	89237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008600	ATGGT	2	10	89986	89995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008600	CTGAA	2	10	91750	91759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008600	AGATA	2	10	93632	93641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008600	GAACA	2	10	95502	95511	60 %	0 %	20 %	20 %	118475852
72	NC_008600	GAACA	2	10	95724	95733	60 %	0 %	20 %	20 %	118475852
73	NC_008600	TGAAG	2	10	96664	96673	40 %	20 %	40 %	0 %	118475852
74	NC_008600	AGAAA	2	10	96686	96695	80 %	0 %	20 %	0 %	118475852
75	NC_008600	GAAAA	2	10	96810	96819	80 %	0 %	20 %	0 %	118475852
76	NC_008600	AATTG	2	10	97630	97639	40 %	40 %	20 %	0 %	118475852
77	NC_008600	AGTGA	2	10	97923	97932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008600	TGAAA	2	10	98746	98755	60 %	20 %	20 %	0 %	118475853
79	NC_008600	CGTAA	2	10	99710	99719	40 %	20 %	20 %	20 %	118475854
80	NC_008600	TATGA	2	10	100449	100458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008600	TACGT	2	10	101787	101796	20 %	40 %	20 %	20 %	118475856
82	NC_008600	ATATA	2	10	102429	102438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008600	CATTC	2	10	103573	103582	20 %	40 %	0 %	40 %	118475858
84	NC_008600	GAAAA	2	10	104461	104470	80 %	0 %	20 %	0 %	118475858
85	NC_008600	AAAAG	2	10	108560	108569	80 %	0 %	20 %	0 %	118475863
86	NC_008600	GATTG	2	10	108909	108918	20 %	40 %	40 %	0 %	118475864
87	NC_008600	GAAAA	2	10	110157	110166	80 %	0 %	20 %	0 %	118475865
88	NC_008600	AAAGA	2	10	113204	113213	80 %	0 %	20 %	0 %	118475870
89	NC_008600	AGAAA	2	10	113777	113786	80 %	0 %	20 %	0 %	118475870
90	NC_008600	AATCA	2	10	119972	119981	60 %	20 %	0 %	20 %	118475872
91	NC_008600	AACAT	2	10	121563	121572	60 %	20 %	0 %	20 %	118475873
92	NC_008600	ACGTG	2	10	122253	122262	20 %	20 %	40 %	20 %	118475875
93	NC_008600	TAAAA	2	10	122860	122869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008600	AATCC	2	10	122870	122879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_008600	TCGTA	2	10	123291	123300	20 %	40 %	20 %	20 %	118475876
96	NC_008600	CATGG	2	10	126615	126624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008600	TGGTA	2	10	130377	130386	20 %	40 %	40 %	0 %	118475885
98	NC_008600	GTGCG	2	10	137617	137626	0 %	20 %	60 %	20 %	118475900
99	NC_008600	GAAAT	2	10	142242	142251	60 %	20 %	20 %	0 %	118475907
100	NC_008600	TTATT	2	10	144415	144424	20 %	80 %	0 %	0 %	118475910
101	NC_008600	GAGCA	2	10	145256	145265	40 %	0 %	40 %	20 %	118475911
102	NC_008600	AAAAG	2	10	145920	145929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008600	GGGCT	2	10	147227	147236	0 %	20 %	60 %	20 %	118475914
104	NC_008600	TTTTA	2	10	151186	151195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008600	TCGTG	2	10	152294	152303	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008600	ATGGT	2	10	153052	153061	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008600	CTGAA	2	10	154816	154825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008600	AAAAC	2	10	161254	161263	80 %	0 %	0 %	20 %	118475922
109	NC_008600	ATTAC	2	10	162762	162771	40 %	40 %	0 %	20 %	118475923
110	NC_008600	ATTGA	2	10	164202	164211	40 %	40 %	20 %	0 %	118475924
111	NC_008600	ACAGC	2	10	164799	164808	40 %	0 %	20 %	40 %	118475924
112	NC_008600	CGTAG	2	10	164994	165003	20 %	20 %	40 %	20 %	118475924
113	NC_008600	TACTT	2	10	165909	165918	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008600	CAACA	2	10	166509	166518	60 %	0 %	0 %	40 %	118475926
115	NC_008600	TTTCA	2	10	166571	166580	20 %	60 %	0 %	20 %	118475926
116	NC_008600	AAAAT	2	10	167038	167047	80 %	20 %	0 %	0 %	118475927
117	NC_008600	TAAAT	2	10	169343	169352	60 %	40 %	0 %	0 %	118475929
118	NC_008600	TGAAA	2	10	170802	170811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008600	AGCGC	2	10	172226	172235	20 %	0 %	40 %	40 %	118475930
120	NC_008600	GAAGC	2	10	174847	174856	40 %	0 %	40 %	20 %	118475932
121	NC_008600	ATGAT	2	10	176198	176207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008600	TTAAA	2	10	178894	178903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008600	TGTTT	2	10	180142	180151	0 %	80 %	20 %	0 %	118475938
124	NC_008600	AAACT	2	10	180290	180299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008600	TGGAA	2	10	180412	180421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008600	ATTTT	2	10	182024	182033	20 %	80 %	0 %	0 %	118475940
127	NC_008600	AGAAT	2	10	182667	182676	60 %	20 %	20 %	0 %	118475941
128	NC_008600	CCGCT	2	10	183994	184003	0 %	20 %	20 %	60 %	118475942
129	NC_008600	AAAAG	2	10	185476	185485	80 %	0 %	20 %	0 %	118475944
130	NC_008600	AGAGA	2	10	186782	186791	60 %	0 %	40 %	0 %	118475945
131	NC_008600	ACGTA	2	10	187324	187333	40 %	20 %	20 %	20 %	118475945
132	NC_008600	AAAAG	2	10	188262	188271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008600	GTGAA	2	10	189176	189185	40 %	20 %	40 %	0 %	118475947
134	NC_008600	AAAGG	2	10	189196	189205	60 %	0 %	40 %	0 %	118475947
135	NC_008600	TTACT	2	10	189387	189396	20 %	60 %	0 %	20 %	118475947
136	NC_008600	AAAAG	2	10	191846	191855	80 %	0 %	20 %	0 %	118475949
137	NC_008600	CTTTT	2	10	192278	192287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008600	TTTTA	2	10	193212	193221	20 %	80 %	0 %	0 %	118475950
139	NC_008600	TGGCA	2	10	194278	194287	20 %	20 %	40 %	20 %	118475951
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241	NC_008600	CTGAA	2	10	315908	315917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_008600	CTTTT	2	10	355717	355726	0 %	80 %	0 %	20 %	118476066
271	NC_008600	TGTTT	2	10	355831	355840	0 %	80 %	20 %	0 %	118476066
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