MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 1153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TTATC	2	10	184	193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008600	TTTTA	2	10	9280	9289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008600	TCGTG	2	10	10388	10397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008600	GATAT	2	10	10961	10970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008600	ATGGT	2	10	11374	11383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008600	CTGAA	2	10	13138	13147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008600	TGGAA	2	10	20166	20175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008600	TAAAA	2	10	20322	20331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008600	TCCTT	2	10	21703	21712	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008600	ATATT	2	10	21754	21763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008600	TTTTA	2	10	28433	28442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008600	TTTTA	2	10	29080	29089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008600	TCGTG	2	10	30188	30197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008600	GATAT	2	10	30761	30770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008600	ATGGT	2	10	31173	31182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008600	CTGAA	2	10	32937	32946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008600	ATTTA	2	10	64511	64520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008600	ATAAG	2	10	71720	71729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008600	TCGTG	2	10	83513	83522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008600	ATGGT	2	10	84271	84280	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008600	CTGAA	2	10	86036	86045	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008600	TCGTG	2	10	89228	89237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008600	ATGGT	2	10	89986	89995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008600	CTGAA	2	10	91750	91759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008600	AGATA	2	10	93632	93641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008600	AGTGA	2	10	97923	97932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008600	TATGA	2	10	100449	100458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008600	ATATA	2	10	102429	102438	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008600	TAAAA	2	10	122860	122869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008600	AATCC	2	10	122870	122879	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008600	CATGG	2	10	126615	126624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008600	AAAAG	2	10	145920	145929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008600	TTTTA	2	10	151186	151195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008600	TCGTG	2	10	152294	152303	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008600	ATGGT	2	10	153052	153061	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008600	CTGAA	2	10	154816	154825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008600	TACTT	2	10	165909	165918	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008600	TGAAA	2	10	170802	170811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008600	ATGAT	2	10	176198	176207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008600	TTAAA	2	10	178894	178903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008600	AAACT	2	10	180290	180299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008600	TGGAA	2	10	180412	180421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008600	AAAAG	2	10	188262	188271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	CTTTT	2	10	192278	192287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008600	TTAGT	2	10	199689	199698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008600	TAAAA	2	10	200508	200517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008600	AAAAG	2	10	207508	207517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008600	TTCTT	2	10	211076	211085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008600	AATGT	2	10	212339	212348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008600	GTTAT	2	10	217406	217415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008600	GTAAT	2	10	218648	218657	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008600	ATTAC	2	10	219351	219360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008600	GTAAT	2	10	219389	219398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008600	ACGTT	2	10	236179	236188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008600	TATTC	2	10	236961	236970	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008600	TGTTT	2	10	253053	253062	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008600	AAGAG	2	10	256066	256075	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008600	GATAA	2	10	257845	257854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008600	TTTTA	2	10	258175	258184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008600	TCGTG	2	10	259283	259292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008600	ATGGT	2	10	260040	260049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008600	CTGAA	2	10	261804	261813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008600	AAGAA	2	10	263165	263174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008600	ATCTT	2	10	283667	283676	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008600	TCGTG	2	10	288824	288833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008600	ATGGT	2	10	289583	289592	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008600	CTGAA	2	10	291348	291357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008600	TTTTA	2	10	294962	294971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008600	TCGTG	2	10	296070	296079	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008600	ATGGT	2	10	296826	296835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008600	CTGAA	2	10	298590	298599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008600	ATGGA	2	10	300742	300751	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008600	TAAAA	2	10	302064	302073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008600	TCGTG	2	10	303382	303391	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008600	ATGGT	2	10	304140	304149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008600	CTGAA	2	10	305904	305913	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008600	AGGGA	2	10	311919	311928	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008600	TCGTG	2	10	313386	313395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008600	ATGGT	2	10	314144	314153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008600	CTGAA	2	10	315908	315917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008600	TTTTA	2	10	319453	319462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008600	TCGTG	2	10	320561	320570	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008600	ATGGT	2	10	321318	321327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008600	CTGAA	2	10	323082	323091	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008600	TTTGC	2	10	337993	338002	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008600	CTTTT	2	10	338109	338118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008600	ATATC	2	10	353411	353420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008600	TTTTA	2	10	356805	356814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008600	AAAAC	2	10	360881	360890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_008600	TTTTA	2	10	362039	362048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008600	AGTGA	2	10	364439	364448	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008600	AAGAA	2	10	375840	375849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008600	TTTAT	2	10	375899	375908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008600	AGGTT	2	10	375962	375971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008600	ATGCA	2	10	403188	403197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008600	TATTT	2	10	406799	406808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008600	AATAA	2	10	437376	437385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008600	AATTT	2	10	437580	437589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008600	AGAAT	2	10	441256	441265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008600	ATTCA	2	10	445756	445765	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008600	ATATT	2	10	452750	452759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008600	TATAG	2	10	469994	470003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008600	ACAGT	2	10	471100	471109	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008600	TTCAA	2	10	477931	477940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008600	ATGAA	2	10	494702	494711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008600	TTTCG	2	10	495793	495802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008600	CACCC	2	10	511288	511297	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_008600	CGAAG	2	10	515214	515223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008600	AAAAG	2	10	532303	532312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008600	AAGTG	2	10	532852	532861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008600	TGAAG	2	10	533592	533601	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008600	TCGTG	2	10	535533	535542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_008600	ATGGT	2	10	536291	536300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008600	CTGAA	2	10	538057	538066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008600	TTTTA	2	10	540272	540281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008600	TTATG	2	10	540786	540795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008600	TATAA	2	10	540832	540841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008600	AAAAT	2	10	542717	542726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008600	ATTAA	2	10	543209	543218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008600	TTTCA	2	10	550093	550102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008600	GTTTC	2	10	552894	552903	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008600	ACAAT	2	10	562240	562249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008600	ACTTT	2	10	573043	573052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008600	TATAT	2	10	573066	573075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008600	AAAAT	2	10	581449	581458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008600	TTTTG	2	10	583805	583814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008600	AAGAG	2	10	601590	601599	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008600	TTTAT	2	10	605485	605494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008600	AGCTT	2	10	605518	605527	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008600	GTCAT	2	10	607993	608002	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008600	ACAAA	2	10	617429	617438	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008600	AATAA	2	10	622027	622036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008600	TTTCA	2	10	633162	633171	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008600	TTCTT	2	10	638482	638491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008600	GAAAA	2	10	639522	639531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008600	AAAAT	2	10	641338	641347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008600	TATAA	2	10	641417	641426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008600	GTTTT	2	10	653762	653771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008600	GAAAT	2	10	654610	654619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008600	GAAAA	2	10	658114	658123	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008600	ATTAG	2	10	666106	666115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008600	AAATG	2	10	673489	673498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008600	TAGAA	2	10	677807	677816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008600	TAAAA	2	10	692892	692901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008600	GGAAA	2	10	712096	712105	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008600	GGATT	2	10	715097	715106	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008600	TATGT	2	10	725631	725640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008600	AGTAA	2	10	736232	736241	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_008600	TTTTG	2	10	2165027	2165036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
477	NC_008600	AATGA	2	10	2169556	2169565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_008600	AAAAT	2	10	2226553	2226562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_008600	TAATA	2	10	2227297	2227306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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