MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 16617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TATT	2	8	339	346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008600	AAAG	2	8	515	522	75 %	0 %	25 %	0 %	118475779
3	NC_008600	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	118475779
4	NC_008600	ATGC	2	8	888	895	25 %	25 %	25 %	25 %	118475779
5	NC_008600	TTAA	2	8	1389	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	118475779
6	NC_008600	TAGA	2	8	1802	1809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008600	ATTA	2	8	1885	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008600	GAAA	2	8	2196	2203	75 %	0 %	25 %	0 %	118475780
9	NC_008600	AACT	2	8	2444	2451	50 %	25 %	0 %	25 %	118475780
10	NC_008600	GATG	2	8	2934	2941	25 %	25 %	50 %	0 %	118475780
11	NC_008600	AATT	2	8	3038	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	118475780
12	NC_008600	TACT	2	8	3057	3064	25 %	50 %	0 %	25 %	118475780
13	NC_008600	TTTA	2	8	3144	3151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008600	ACGA	2	8	4282	4289	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
15	NC_008600	AACG	2	8	4507	4514	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
16	NC_008600	ATAG	2	8	4532	4539	50 %	25 %	25 %	0 %	118475782
17	NC_008600	GTAT	2	8	4673	4680	25 %	50 %	25 %	0 %	118475783
18	NC_008600	ATGT	2	8	6557	6564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008600	ATGA	2	8	6755	6762	50 %	25 %	25 %	0 %	118475784
20	NC_008600	GATT	2	8	7413	7420	25 %	50 %	25 %	0 %	118475784
21	NC_008600	AAAC	2	8	9256	9263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008600	AACT	2	8	9301	9308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008600	ATGG	2	8	9540	9547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008600	GTGA	2	8	9720	9727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008600	AGCC	2	8	10774	10781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008600	AAAT	2	8	10971	10978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008600	GCCT	2	8	11103	11110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008600	GTAA	2	8	11322	11329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008600	AGAC	2	8	11412	11419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008600	CACG	2	8	12018	12025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008600	ATAA	2	8	14443	14450	75 %	25 %	0 %	0 %	118475785
32	NC_008600	AATA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	118475785
33	NC_008600	GTAA	2	8	14601	14608	50 %	25 %	25 %	0 %	118475785
34	NC_008600	AAGT	2	8	15558	15565	50 %	25 %	25 %	0 %	118475786
35	NC_008600	AACA	2	8	17565	17572	75 %	0 %	0 %	25 %	118475787
36	NC_008600	CAAA	2	8	18052	18059	75 %	0 %	0 %	25 %	118475787
37	NC_008600	TTCT	2	8	18303	18310	0 %	75 %	0 %	25 %	118475787
38	NC_008600	GGTT	2	8	18349	18356	0 %	50 %	50 %	0 %	118475787
39	NC_008600	TAGT	2	8	18440	18447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008600	TAAA	2	8	18870	18877	75 %	25 %	0 %	0 %	118475788
41	NC_008600	TATT	2	8	19821	19828	25 %	75 %	0 %	0 %	118475789
42	NC_008600	TCCA	2	8	19932	19939	25 %	25 %	0 %	50 %	118475789
43	NC_008600	TGGT	2	8	20125	20132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	ATCC	2	8	20158	20165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008600	AAAG	2	8	20539	20546	75 %	0 %	25 %	0 %	118475790
46	NC_008600	CTAT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	118475790
47	NC_008600	TAAA	2	8	21078	21085	75 %	25 %	0 %	0 %	118475790
48	NC_008600	ATTT	2	8	21716	21723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008600	CTGT	2	8	22096	22103	0 %	50 %	25 %	25 %	118475791
50	NC_008600	AAAG	2	8	22250	22257	75 %	0 %	25 %	0 %	118475791
51	NC_008600	GAAA	2	8	22307	22314	75 %	0 %	25 %	0 %	118475791
52	NC_008600	GTTT	2	8	22482	22489	0 %	75 %	25 %	0 %	118475792
53	NC_008600	ATAG	2	8	22850	22857	50 %	25 %	25 %	0 %	118475792
54	NC_008600	AGCT	2	8	23376	23383	25 %	25 %	25 %	25 %	118475793
55	NC_008600	TAAA	2	8	23386	23393	75 %	25 %	0 %	0 %	118475793
56	NC_008600	TTGT	2	8	23566	23573	0 %	75 %	25 %	0 %	118475793
57	NC_008600	AAAG	2	8	23583	23590	75 %	0 %	25 %	0 %	118475793
58	NC_008600	AGCG	2	8	23847	23854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008600	ATTA	2	8	23894	23901	50 %	50 %	0 %	0 %	118475794
60	NC_008600	TACA	2	8	24009	24016	50 %	25 %	0 %	25 %	118475794
61	NC_008600	ATGA	2	8	24198	24205	50 %	25 %	25 %	0 %	118475794
62	NC_008600	TAAT	2	8	24236	24243	50 %	50 %	0 %	0 %	118475794
63	NC_008600	ATTT	2	8	24560	24567	25 %	75 %	0 %	0 %	118475795
64	NC_008600	GCCT	2	8	25210	25217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008600	TAAG	2	8	25218	25225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008600	GGAA	2	8	25280	25287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008600	GAGG	2	8	25501	25508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008600	ATTT	2	8	25640	25647	25 %	75 %	0 %	0 %	118475796
69	NC_008600	AATG	2	8	25738	25745	50 %	25 %	25 %	0 %	118475796
70	NC_008600	TCAT	2	8	26504	26511	25 %	50 %	0 %	25 %	118475796
71	NC_008600	AATT	2	8	27222	27229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008600	ATCA	2	8	27806	27813	50 %	25 %	0 %	25 %	118475798
73	NC_008600	AAAT	2	8	28584	28591	75 %	25 %	0 %	0 %	118475800
74	NC_008600	TCAT	2	8	28601	28608	25 %	50 %	0 %	25 %	118475800
75	NC_008600	ATTT	2	8	28891	28898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008600	GAAA	2	8	28968	28975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008600	AAAC	2	8	29056	29063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008600	AACT	2	8	29101	29108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008600	ATGG	2	8	29340	29347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008600	GTGA	2	8	29520	29527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008600	AGCC	2	8	30574	30581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008600	AAAT	2	8	30771	30778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008600	GCCT	2	8	30903	30910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008600	GTAA	2	8	31121	31128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008600	AGAC	2	8	31211	31218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008600	CACG	2	8	31817	31824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008600	AGGG	2	8	34297	34304	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008600	TTGT	2	8	34336	34343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008600	AGAA	2	8	34349	34356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008600	AAAG	2	8	34608	34615	75 %	0 %	25 %	0 %	118475801
91	NC_008600	CTAT	2	8	34698	34705	25 %	50 %	0 %	25 %	118475801
92	NC_008600	GGAT	2	8	35083	35090	25 %	25 %	50 %	0 %	118475801
93	NC_008600	TTAT	2	8	35607	35614	25 %	75 %	0 %	0 %	118475801
94	NC_008600	TATG	2	8	35861	35868	25 %	50 %	25 %	0 %	118475801
95	NC_008600	AAAT	2	8	36338	36345	75 %	25 %	0 %	0 %	118475802
96	NC_008600	ATGT	2	8	36841	36848	25 %	50 %	25 %	0 %	118475803
97	NC_008600	TACT	2	8	37084	37091	25 %	50 %	0 %	25 %	118475803
98	NC_008600	TTAT	2	8	37420	37427	25 %	75 %	0 %	0 %	118475803
99	NC_008600	AACA	2	8	37868	37875	75 %	0 %	0 %	25 %	118475804
100	NC_008600	GATT	2	8	38005	38012	25 %	50 %	25 %	0 %	118475804
101	NC_008600	GGTG	2	8	38468	38475	0 %	25 %	75 %	0 %	118475805
102	NC_008600	TAAA	2	8	38816	38823	75 %	25 %	0 %	0 %	118475805
103	NC_008600	ATGA	2	8	39352	39359	50 %	25 %	25 %	0 %	118475806
104	NC_008600	GAAA	2	8	40159	40166	75 %	0 %	25 %	0 %	118475808
105	NC_008600	CAAA	2	8	40341	40348	75 %	0 %	0 %	25 %	118475808
106	NC_008600	GAAA	2	8	40389	40396	75 %	0 %	25 %	0 %	118475808
107	NC_008600	GGGA	2	8	41505	41512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008600	TTCA	2	8	42183	42190	25 %	50 %	0 %	25 %	118475810
109	NC_008600	TCGT	2	8	42430	42437	0 %	50 %	25 %	25 %	118475810
110	NC_008600	ATCG	2	8	42579	42586	25 %	25 %	25 %	25 %	118475810
111	NC_008600	TGAT	2	8	42733	42740	25 %	50 %	25 %	0 %	118475810
112	NC_008600	AATA	2	8	42906	42913	75 %	25 %	0 %	0 %	118475810
113	NC_008600	TTTA	2	8	43917	43924	25 %	75 %	0 %	0 %	118475811
114	NC_008600	AGAA	2	8	44074	44081	75 %	0 %	25 %	0 %	118475811
115	NC_008600	AACG	2	8	44820	44827	50 %	0 %	25 %	25 %	118475812
116	NC_008600	GAAG	2	8	44979	44986	50 %	0 %	50 %	0 %	118475812
117	NC_008600	AGAA	2	8	45159	45166	75 %	0 %	25 %	0 %	118475812
118	NC_008600	TTTA	2	8	45695	45702	25 %	75 %	0 %	0 %	118475813
119	NC_008600	CTAT	2	8	46110	46117	25 %	50 %	0 %	25 %	118475813
120	NC_008600	GAAA	2	8	46468	46475	75 %	0 %	25 %	0 %	118475814
121	NC_008600	GTTT	2	8	46494	46501	0 %	75 %	25 %	0 %	118475814
122	NC_008600	TGGT	2	8	46992	46999	0 %	50 %	50 %	0 %	118475814
123	NC_008600	GATA	2	8	47323	47330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008600	AGAA	2	8	47813	47820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008600	ATCA	2	8	49131	49138	50 %	25 %	0 %	25 %	118475817
126	NC_008600	GTTT	2	8	49392	49399	0 %	75 %	25 %	0 %	118475817
127	NC_008600	TAAT	2	8	49758	49765	50 %	50 %	0 %	0 %	118475817
128	NC_008600	GAAA	2	8	49804	49811	75 %	0 %	25 %	0 %	118475817
129	NC_008600	ATAA	2	8	49981	49988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008600	CAAA	2	8	50017	50024	75 %	0 %	0 %	25 %	118475818
131	NC_008600	TGAC	2	8	50539	50546	25 %	25 %	25 %	25 %	162382789
132	NC_008600	AATT	2	8	50720	50727	50 %	50 %	0 %	0 %	162382789
133	NC_008600	GTTT	2	8	50898	50905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008600	TCGT	2	8	51574	51581	0 %	50 %	25 %	25 %	118475820
135	NC_008600	TATT	2	8	52351	52358	25 %	75 %	0 %	0 %	118475820
136	NC_008600	CTTG	2	8	52907	52914	0 %	50 %	25 %	25 %	118475821
137	NC_008600	TGCT	2	8	53294	53301	0 %	50 %	25 %	25 %	118475821
138	NC_008600	AGTT	2	8	53362	53369	25 %	50 %	25 %	0 %	118475821
139	NC_008600	AATT	2	8	53496	53503	50 %	50 %	0 %	0 %	118475821
140	NC_008600	GAAC	2	8	53684	53691	50 %	0 %	25 %	25 %	118475822
141	NC_008600	TAAA	2	8	54091	54098	75 %	25 %	0 %	0 %	118475822
142	NC_008600	TCGT	2	8	54645	54652	0 %	50 %	25 %	25 %	118475824
143	NC_008600	GATT	2	8	54975	54982	25 %	50 %	25 %	0 %	118475824
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