MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 3270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	TATT	2	8	339	346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008600	TAGA	2	8	1802	1809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008600	ATTA	2	8	1885	1892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008600	TTTA	2	8	3144	3151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008600	ATGT	2	8	6557	6564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008600	AAAC	2	8	9256	9263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008600	AACT	2	8	9301	9308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008600	ATGG	2	8	9540	9547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008600	GTGA	2	8	9720	9727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008600	AGCC	2	8	10774	10781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008600	AAAT	2	8	10971	10978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008600	GCCT	2	8	11103	11110	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008600	GTAA	2	8	11322	11329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008600	AGAC	2	8	11412	11419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008600	CACG	2	8	12018	12025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008600	TAGT	2	8	18440	18447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008600	TGGT	2	8	20125	20132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008600	ATCC	2	8	20158	20165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008600	ATTT	2	8	21716	21723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008600	AGCG	2	8	23847	23854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008600	GCCT	2	8	25210	25217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008600	TAAG	2	8	25218	25225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008600	GGAA	2	8	25280	25287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008600	GAGG	2	8	25501	25508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008600	AATT	2	8	27222	27229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008600	ATTT	2	8	28891	28898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008600	GAAA	2	8	28968	28975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008600	AAAC	2	8	29056	29063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008600	AACT	2	8	29101	29108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008600	ATGG	2	8	29340	29347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008600	GTGA	2	8	29520	29527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008600	AGCC	2	8	30574	30581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008600	AAAT	2	8	30771	30778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008600	GCCT	2	8	30903	30910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008600	GTAA	2	8	31121	31128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008600	AGAC	2	8	31211	31218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008600	CACG	2	8	31817	31824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008600	AGGG	2	8	34297	34304	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008600	TTGT	2	8	34336	34343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008600	AGAA	2	8	34349	34356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008600	GGGA	2	8	41505	41512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008600	GATA	2	8	47323	47330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008600	AGAA	2	8	47813	47820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008600	ATAA	2	8	49981	49988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008600	GTTT	2	8	50898	50905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008600	TGAA	2	8	58822	58829	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008600	CTTA	2	8	58886	58893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008600	TAAA	2	8	64634	64641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008600	ATAC	2	8	64713	64720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008600	TTTC	2	8	67355	67362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008600	TAAC	2	8	67515	67522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008600	TAAA	2	8	71583	71590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008600	ATTT	2	8	74554	74561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008600	GAAA	2	8	80453	80460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008600	AGTT	2	8	80472	80479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008600	AACA	2	8	82262	82269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008600	AAAC	2	8	82270	82277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008600	AAAC	2	8	82380	82387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008600	AACT	2	8	82426	82433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008600	ATGG	2	8	82665	82672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008600	GTGA	2	8	82845	82852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008600	AGCC	2	8	83899	83906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008600	ATGT	2	8	84074	84081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008600	GTAA	2	8	84219	84226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008600	AGAC	2	8	84309	84316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008600	CACG	2	8	84915	84922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008600	GGTG	2	8	87783	87790	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008600	TTTC	2	8	87905	87912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008600	GCCT	2	8	88020	88027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008600	AAAC	2	8	88095	88102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008600	AACT	2	8	88141	88148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008600	ATGG	2	8	88380	88387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008600	GTGA	2	8	88560	88567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008600	AGCC	2	8	89614	89621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008600	ATGT	2	8	89789	89796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008600	GTAA	2	8	89934	89941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008600	AGAC	2	8	90024	90031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008600	CACG	2	8	90630	90637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008600	TAAA	2	8	100467	100474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008600	AGTT	2	8	104889	104896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008600	GGGA	2	8	104921	104928	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008600	TAAA	2	8	108684	108691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008600	ATAA	2	8	109643	109650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008600	TTAT	2	8	109894	109901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008600	AGGG	2	8	109961	109968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008600	TAAA	2	8	111196	111203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008600	CCTA	2	8	112086	112093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008600	GCTC	2	8	113171	113178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008600	TATT	2	8	114047	114054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008600	AAAT	2	8	122709	122716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008600	TTTG	2	8	126333	126340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008600	CAAA	2	8	126509	126516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008600	CGAA	2	8	126667	126674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008600	AGGA	2	8	127671	127678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008600	AACG	2	8	133718	133725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008600	GGAA	2	8	144806	144813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008600	TATT	2	8	146065	146072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008600	AGGA	2	8	146267	146274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008600	ATTT	2	8	147167	147174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008600	TTAA	2	8	147196	147203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008600	TGTA	2	8	149760	149767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008600	TGAA	2	8	149801	149808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008600	ATGG	2	8	150698	150705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008600	AAAC	2	8	151162	151169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008600	AACT	2	8	151207	151214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008600	ATGG	2	8	151446	151453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008600	GTGA	2	8	151626	151633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008600	AGCC	2	8	152680	152687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008600	ATGT	2	8	152855	152862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008600	GTAA	2	8	153000	153007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008600	AGAC	2	8	153090	153097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008600	CACG	2	8	153696	153703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008600	GAAA	2	8	155895	155902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008600	GCCT	2	8	156812	156819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008600	ATAC	2	8	159399	159406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008600	TGTT	2	8	163200	163207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008600	TAAA	2	8	163519	163526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008600	TTAA	2	8	165977	165984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008600	TGAT	2	8	170703	170710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008600	ACAT	2	8	170869	170876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008600	TTTA	2	8	172540	172547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008600	TTAT	2	8	176660	176667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008600	CTAT	2	8	177360	177367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008600	TAGA	2	8	180541	180548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008600	GATA	2	8	180638	180645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008600	TTCT	2	8	186177	186184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008600	GTAT	2	8	190107	190114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008600	TTGT	2	8	192231	192238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008600	TTGA	2	8	192472	192479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008600	AGCA	2	8	192625	192632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008600	TATG	2	8	198629	198636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008600	TGTA	2	8	198702	198709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008600	TTAG	2	8	199730	199737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008600	TATT	2	8	200500	200507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008600	TAGA	2	8	203739	203746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008600	TTAA	2	8	205760	205767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008600	AAAT	2	8	208253	208260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008600	TAAA	2	8	209387	209394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008600	TAAT	2	8	210984	210991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008600	TTTG	2	8	212443	212450	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008600	AGAA	2	8	214720	214727	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008600	TAAA	2	8	214815	214822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008600	GCTA	2	8	214844	214851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008600	TTTC	2	8	214911	214918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008600	TAAA	2	8	215801	215808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008600	CTAG	2	8	215831	215838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008600	TGTA	2	8	215953	215960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008600	ATGA	2	8	217311	217318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008600	ATAG	2	8	217512	217519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008600	TGAG	2	8	219232	219239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008600	TTTC	2	8	225955	225962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008600	TAAA	2	8	228414	228421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008600	ATTA	2	8	228517	228524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008600	AGAA	2	8	229030	229037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008600	CATA	2	8	229182	229189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_008600	AGTA	2	8	237039	237046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008600	CTAA	2	8	237211	237218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008600	ATCC	2	8	242237	242244	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_008600	CTTG	2	8	253017	253024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008600	CATT	2	8	256159	256166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_008600	TGCC	2	8	257409	257416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_008600	AAAC	2	8	258151	258158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_008600	AACT	2	8	258196	258203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_008600	ATGG	2	8	258435	258442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008600	GTGA	2	8	258615	258622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008600	AGCC	2	8	259668	259675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_008600	ATGT	2	8	259843	259850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008600	GTAA	2	8	259988	259995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_008600	AGAC	2	8	260078	260085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_008600	CACG	2	8	260684	260691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_008600	TGCC	2	8	263104	263111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_008600	GTAA	2	8	263308	263315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008600	AATC	2	8	269192	269199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_008600	GAAG	2	8	269288	269295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008600	CTAC	2	8	270139	270146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_008600	CTTA	2	8	270156	270163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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178	NC_008600	TCTT	2	8	274766	274773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_008600	TAAT	2	8	276554	276561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008600	TAAT	2	8	282002	282009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008600	AATT	2	8	283362	283369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008600	ACGA	2	8	283469	283476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_008600	AAAC	2	8	287691	287698	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_008600	ATGG	2	8	287976	287983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008600	GTGA	2	8	288156	288163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008600	AGCC	2	8	289210	289217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
189	NC_008600	ATGT	2	8	289385	289392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_008600	GTAA	2	8	289531	289538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_008600	AGAC	2	8	289621	289628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_008600	CACG	2	8	290227	290234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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233	NC_008600	AGAC	2	8	314182	314189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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250	NC_008600	ATGT	2	8	339102	339109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
251	NC_008600	ATTA	2	8	347007	347014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_008600	ATAA	2	8	354492	354499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_008600	ATGA	2	8	354720	354727	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008600	AAAT	2	8	356246	356253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008600	AAAT	2	8	356825	356832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_008600	AAAG	2	8	357246	357253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008600	CTTT	2	8	357262	357269	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
266	NC_008600	CTTG	2	8	357305	357312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_008600	TAGA	2	8	381539	381546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_008600	AGTC	2	8	391511	391518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_008600	TCTT	2	8	397701	397708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_008600	CTAG	2	8	397756	397763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_008600	TTAT	2	8	398763	398770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_008600	CTAA	2	8	399876	399883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_008600	GAAT	2	8	401503	401510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008600	TCCT	2	8	406825	406832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_008600	TTTA	2	8	408524	408531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_008600	AAAG	2	8	408532	408539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008600	AATC	2	8	408947	408954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
297	NC_008600	AAGC	2	8	410125	410132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
298	NC_008600	GCTT	2	8	410141	410148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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