MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 13347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008600	AAAG	2	8	515	522	75 %	0 %	25 %	0 %	118475779
2	NC_008600	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	118475779
3	NC_008600	ATGC	2	8	888	895	25 %	25 %	25 %	25 %	118475779
4	NC_008600	TTAA	2	8	1389	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	118475779
5	NC_008600	GAAA	2	8	2196	2203	75 %	0 %	25 %	0 %	118475780
6	NC_008600	AACT	2	8	2444	2451	50 %	25 %	0 %	25 %	118475780
7	NC_008600	GATG	2	8	2934	2941	25 %	25 %	50 %	0 %	118475780
8	NC_008600	AATT	2	8	3038	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	118475780
9	NC_008600	TACT	2	8	3057	3064	25 %	50 %	0 %	25 %	118475780
10	NC_008600	ACGA	2	8	4282	4289	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
11	NC_008600	AACG	2	8	4507	4514	50 %	0 %	25 %	25 %	118475782
12	NC_008600	ATAG	2	8	4532	4539	50 %	25 %	25 %	0 %	118475782
13	NC_008600	GTAT	2	8	4673	4680	25 %	50 %	25 %	0 %	118475783
14	NC_008600	ATGA	2	8	6755	6762	50 %	25 %	25 %	0 %	118475784
15	NC_008600	GATT	2	8	7413	7420	25 %	50 %	25 %	0 %	118475784
16	NC_008600	ATAA	2	8	14443	14450	75 %	25 %	0 %	0 %	118475785
17	NC_008600	AATA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	118475785
18	NC_008600	GTAA	2	8	14601	14608	50 %	25 %	25 %	0 %	118475785
19	NC_008600	AAGT	2	8	15558	15565	50 %	25 %	25 %	0 %	118475786
20	NC_008600	AACA	2	8	17565	17572	75 %	0 %	0 %	25 %	118475787
21	NC_008600	CAAA	2	8	18052	18059	75 %	0 %	0 %	25 %	118475787
22	NC_008600	TTCT	2	8	18303	18310	0 %	75 %	0 %	25 %	118475787
23	NC_008600	GGTT	2	8	18349	18356	0 %	50 %	50 %	0 %	118475787
24	NC_008600	TAAA	2	8	18870	18877	75 %	25 %	0 %	0 %	118475788
25	NC_008600	TATT	2	8	19821	19828	25 %	75 %	0 %	0 %	118475789
26	NC_008600	TCCA	2	8	19932	19939	25 %	25 %	0 %	50 %	118475789
27	NC_008600	AAAG	2	8	20539	20546	75 %	0 %	25 %	0 %	118475790
28	NC_008600	CTAT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	118475790
29	NC_008600	TAAA	2	8	21078	21085	75 %	25 %	0 %	0 %	118475790
30	NC_008600	CTGT	2	8	22096	22103	0 %	50 %	25 %	25 %	118475791
31	NC_008600	AAAG	2	8	22250	22257	75 %	0 %	25 %	0 %	118475791
32	NC_008600	GAAA	2	8	22307	22314	75 %	0 %	25 %	0 %	118475791
33	NC_008600	GTTT	2	8	22482	22489	0 %	75 %	25 %	0 %	118475792
34	NC_008600	ATAG	2	8	22850	22857	50 %	25 %	25 %	0 %	118475792
35	NC_008600	AGCT	2	8	23376	23383	25 %	25 %	25 %	25 %	118475793
36	NC_008600	TAAA	2	8	23386	23393	75 %	25 %	0 %	0 %	118475793
37	NC_008600	TTGT	2	8	23566	23573	0 %	75 %	25 %	0 %	118475793
38	NC_008600	AAAG	2	8	23583	23590	75 %	0 %	25 %	0 %	118475793
39	NC_008600	ATTA	2	8	23894	23901	50 %	50 %	0 %	0 %	118475794
40	NC_008600	TACA	2	8	24009	24016	50 %	25 %	0 %	25 %	118475794
41	NC_008600	ATGA	2	8	24198	24205	50 %	25 %	25 %	0 %	118475794
42	NC_008600	TAAT	2	8	24236	24243	50 %	50 %	0 %	0 %	118475794
43	NC_008600	ATTT	2	8	24560	24567	25 %	75 %	0 %	0 %	118475795
44	NC_008600	ATTT	2	8	25640	25647	25 %	75 %	0 %	0 %	118475796
45	NC_008600	AATG	2	8	25738	25745	50 %	25 %	25 %	0 %	118475796
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47	NC_008600	ATCA	2	8	27806	27813	50 %	25 %	0 %	25 %	118475798
48	NC_008600	AAAT	2	8	28584	28591	75 %	25 %	0 %	0 %	118475800
49	NC_008600	TCAT	2	8	28601	28608	25 %	50 %	0 %	25 %	118475800
50	NC_008600	AAAG	2	8	34608	34615	75 %	0 %	25 %	0 %	118475801
51	NC_008600	CTAT	2	8	34698	34705	25 %	50 %	0 %	25 %	118475801
52	NC_008600	GGAT	2	8	35083	35090	25 %	25 %	50 %	0 %	118475801
53	NC_008600	TTAT	2	8	35607	35614	25 %	75 %	0 %	0 %	118475801
54	NC_008600	TATG	2	8	35861	35868	25 %	50 %	25 %	0 %	118475801
55	NC_008600	AAAT	2	8	36338	36345	75 %	25 %	0 %	0 %	118475802
56	NC_008600	ATGT	2	8	36841	36848	25 %	50 %	25 %	0 %	118475803
57	NC_008600	TACT	2	8	37084	37091	25 %	50 %	0 %	25 %	118475803
58	NC_008600	TTAT	2	8	37420	37427	25 %	75 %	0 %	0 %	118475803
59	NC_008600	AACA	2	8	37868	37875	75 %	0 %	0 %	25 %	118475804
60	NC_008600	GATT	2	8	38005	38012	25 %	50 %	25 %	0 %	118475804
61	NC_008600	GGTG	2	8	38468	38475	0 %	25 %	75 %	0 %	118475805
62	NC_008600	TAAA	2	8	38816	38823	75 %	25 %	0 %	0 %	118475805
63	NC_008600	ATGA	2	8	39352	39359	50 %	25 %	25 %	0 %	118475806
64	NC_008600	GAAA	2	8	40159	40166	75 %	0 %	25 %	0 %	118475808
65	NC_008600	CAAA	2	8	40341	40348	75 %	0 %	0 %	25 %	118475808
66	NC_008600	GAAA	2	8	40389	40396	75 %	0 %	25 %	0 %	118475808
67	NC_008600	TTCA	2	8	42183	42190	25 %	50 %	0 %	25 %	118475810
68	NC_008600	TCGT	2	8	42430	42437	0 %	50 %	25 %	25 %	118475810
69	NC_008600	ATCG	2	8	42579	42586	25 %	25 %	25 %	25 %	118475810
70	NC_008600	TGAT	2	8	42733	42740	25 %	50 %	25 %	0 %	118475810
71	NC_008600	AATA	2	8	42906	42913	75 %	25 %	0 %	0 %	118475810
72	NC_008600	TTTA	2	8	43917	43924	25 %	75 %	0 %	0 %	118475811
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107	NC_008600	TCAT	2	8	59361	59368	25 %	50 %	0 %	25 %	118475826
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110	NC_008600	AATT	2	8	60997	61004	50 %	50 %	0 %	0 %	118475827
111	NC_008600	GGTT	2	8	61494	61501	0 %	50 %	50 %	0 %	118475827
112	NC_008600	GGTT	2	8	61724	61731	0 %	50 %	50 %	0 %	118475827
113	NC_008600	ACAG	2	8	62027	62034	50 %	0 %	25 %	25 %	118475827
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116	NC_008600	TATT	2	8	63075	63082	25 %	75 %	0 %	0 %	118475830
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118	NC_008600	AGGA	2	8	64865	64872	50 %	0 %	50 %	0 %	118475833
119	NC_008600	AATG	2	8	64898	64905	50 %	25 %	25 %	0 %	118475833
120	NC_008600	AACA	2	8	65027	65034	75 %	0 %	0 %	25 %	118475833
121	NC_008600	GATA	2	8	65138	65145	50 %	25 %	25 %	0 %	118475833
122	NC_008600	TTGT	2	8	65434	65441	0 %	75 %	25 %	0 %	118475833
123	NC_008600	TGCT	2	8	65641	65648	0 %	50 %	25 %	25 %	118475833
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125	NC_008600	AGTT	2	8	66160	66167	25 %	50 %	25 %	0 %	118475833
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128	NC_008600	TAGA	2	8	66442	66449	50 %	25 %	25 %	0 %	118475833
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130	NC_008600	TTCT	2	8	66856	66863	0 %	75 %	0 %	25 %	118475833
131	NC_008600	GAAG	2	8	68083	68090	50 %	0 %	50 %	0 %	118475834
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135	NC_008600	TTTA	2	8	69642	69649	25 %	75 %	0 %	0 %	118475836
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137	NC_008600	ATGG	2	8	70487	70494	25 %	25 %	50 %	0 %	118475836
138	NC_008600	ATCA	2	8	71405	71412	50 %	25 %	0 %	25 %	118475836
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