MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 chromosome

Total Repeats: 997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008599	TATAAA	2	12	921	932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474813
2	NC_008599	CAAAAG	2	12	1083	1094	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118474813
3	NC_008599	TAAAAA	2	12	1409	1420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008599	TGCTCT	2	12	4887	4898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118475336
5	NC_008599	ATTTAT	2	12	9477	9488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118474252
6	NC_008599	TTTATT	2	12	11078	11089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118474297
7	NC_008599	TGAGCG	2	12	14154	14165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118474951
8	NC_008599	GTATCC	2	12	15755	15766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118474951
9	NC_008599	TTTAAA	2	12	15993	16004	50 %	50 %	0 %	0 %	118475627
10	NC_008599	TTTAAA	2	12	16452	16463	50 %	50 %	0 %	0 %	118475627
11	NC_008599	TTTTTA	2	12	18193	18204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118475138
12	NC_008599	TAAAAA	2	12	19505	19516	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118474259
13	NC_008599	GCTTTT	2	12	19742	19753	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118474259
14	NC_008599	TTTAAT	2	12	21968	21979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008599	AATTTA	2	12	22028	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008599	TCATAC	2	12	22498	22509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118474565
17	NC_008599	TTTAAA	2	12	23134	23145	50 %	50 %	0 %	0 %	118474565
18	NC_008599	AAACGA	2	12	26571	26582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475730
19	NC_008599	TTTATA	2	12	27233	27244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118474544
20	NC_008599	TTTAAA	2	12	33298	33309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008599	ATTTAT	2	12	34542	34553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118474924
22	NC_008599	CTTGCA	2	12	36565	36576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118475310
23	NC_008599	TATCAA	2	12	37111	37122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118474301
24	NC_008599	GTAAAG	2	12	37763	37774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475204
25	NC_008599	AAGTAA	2	12	38780	38791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475687
26	NC_008599	TAAAGG	2	12	40706	40717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475079
27	NC_008599	GGTTTT	2	12	41288	41299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118475155
28	NC_008599	CAAGAA	2	12	45095	45106	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475454
29	NC_008599	AATTTA	2	12	46978	46989	50 %	50 %	0 %	0 %	118475267
30	NC_008599	CAAAAG	2	12	47345	47356	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118474282
31	NC_008599	GAGATA	2	12	49566	49577	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118475066
32	NC_008599	ATTTAA	2	12	50321	50332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008599	AAATGA	2	12	50967	50978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118474988
34	NC_008599	GATTTT	2	12	52461	52472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118474266
35	NC_008599	TTAAAT	2	12	56129	56140	50 %	50 %	0 %	0 %	118475100
36	NC_008599	TTTAAA	2	12	56574	56585	50 %	50 %	0 %	0 %	118475100
37	NC_008599	ATATAG	2	12	57973	57984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118474863
38	NC_008599	TTAAAT	2	12	58200	58211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008599	ATAGAT	2	12	60768	60779	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118474422
40	NC_008599	ATGATA	2	12	61217	61228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475169
41	NC_008599	AAATTA	2	12	63816	63827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474071
42	NC_008599	TAAATT	2	12	64502	64513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008599	CTTCTA	2	12	67299	67310	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118475197
44	NC_008599	CTATAT	2	12	69454	69465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118474058
45	NC_008599	ATCTTT	2	12	70122	70133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118475704
46	NC_008599	AAAGAT	2	12	71778	71789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475568
47	NC_008599	TAAAGA	2	12	72984	72995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118474715
48	NC_008599	CTTAAA	2	12	73174	73185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118474715
49	NC_008599	AATATA	2	12	73763	73774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474715
50	NC_008599	TATAGT	2	12	77223	77234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008599	AAATGA	2	12	77956	77967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475452
52	NC_008599	TTAAAT	2	12	78190	78201	50 %	50 %	0 %	0 %	118475452
53	NC_008599	CAAATA	2	12	78910	78921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118475075
54	NC_008599	GAACTG	2	12	78997	79008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475075
55	NC_008599	TGTAGG	2	12	79672	79683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118475047
56	NC_008599	TTAAGC	2	12	82394	82405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475628
57	NC_008599	TTTAAA	2	12	82858	82869	50 %	50 %	0 %	0 %	118475628
58	NC_008599	AAAAGC	2	12	85617	85628	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475437
59	NC_008599	TTTAAA	2	12	88446	88457	50 %	50 %	0 %	0 %	118475611
60	NC_008599	AAGATA	2	12	88968	88979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475611
61	NC_008599	ATTAGC	2	12	89237	89248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475611
62	NC_008599	GCTTAT	2	12	89463	89474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118475611
63	NC_008599	TTTGAT	2	12	91522	91533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118474976
64	NC_008599	TTTGCT	2	12	92676	92687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118475295
65	NC_008599	TAAAAG	2	12	94184	94195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118474194
66	NC_008599	TAAATT	2	12	96705	96716	50 %	50 %	0 %	0 %	118475170
67	NC_008599	GCTCCT	2	12	98249	98260	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118474846
68	NC_008599	TTTGCT	2	12	99116	99127	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118474846
69	NC_008599	TCTAAA	2	12	103570	103581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118474306
70	NC_008599	AAGCTC	2	12	107603	107614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118474557
71	NC_008599	ATTTAA	2	12	109011	109022	50 %	50 %	0 %	0 %	118475333
72	NC_008599	AAATAT	2	12	109705	109716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475333
73	NC_008599	TTTAAA	2	12	110048	110059	50 %	50 %	0 %	0 %	118475333
74	NC_008599	AAAAAC	2	12	110870	110881	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118474335
75	NC_008599	CAACTC	2	12	112939	112950	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	118475492
76	NC_008599	AGAATA	2	12	113253	113264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118475492
77	NC_008599	ATATTT	2	12	114894	114905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008599	AAATTT	2	12	121019	121030	50 %	50 %	0 %	0 %	118475688
79	NC_008599	CAAACT	2	12	121749	121760	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118475688
80	NC_008599	AATATA	2	12	123321	123332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118475586
81	NC_008599	AAAAAC	2	12	128608	128619	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118474575
82	NC_008599	TTAAAT	2	12	128812	128823	50 %	50 %	0 %	0 %	118474575
83	NC_008599	TTTAAA	2	12	131093	131104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008599	AAATTT	2	12	132713	132724	50 %	50 %	0 %	0 %	118474365
85	NC_008599	GATATA	2	12	141539	141550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118474354
86	NC_008599	GTTATA	2	12	145478	145489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475236
87	NC_008599	TACTTG	2	12	149004	149015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118475000
88	NC_008599	TTAGTT	2	12	149583	149594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118475000
89	NC_008599	GCTTTT	2	12	152988	152999	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	118474895
90	NC_008599	GGTTGA	2	12	154066	154077	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118475653
91	NC_008599	TTTAAA	2	12	156136	156147	50 %	50 %	0 %	0 %	118474444
92	NC_008599	TTTAAA	2	12	162884	162895	50 %	50 %	0 %	0 %	118475184
93	NC_008599	TTATTC	2	12	163856	163867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118474415
94	NC_008599	ATAAAA	2	12	164040	164051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008599	TGTTTT	2	12	165075	165086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	118475259
96	NC_008599	TCCGGC	2	12	170024	170035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118475682
97	NC_008599	CCGACC	2	12	170556	170567	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118475682
98	NC_008599	TTGTAT	2	12	170966	170977	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008599	AAAATC	2	12	173011	173022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118474458
100	NC_008599	TTAAAT	2	12	173094	173105	50 %	50 %	0 %	0 %	118474458
101	NC_008599	CTAAAA	2	12	175803	175814	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118475178
102	NC_008599	CTAAAT	2	12	176079	176090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008599	ATTTAT	2	12	176601	176612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118474170
104	NC_008599	ATTTAA	2	12	180414	180425	50 %	50 %	0 %	0 %	118475117
105	NC_008599	TTTAAA	2	12	180604	180615	50 %	50 %	0 %	0 %	118475117
106	NC_008599	AAAACC	2	12	186435	186446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118474935
107	NC_008599	GCGGAT	2	12	186838	186849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118474935
108	NC_008599	TGTTTT	2	12	186994	187005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008599	ATTTGT	2	12	188542	188553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118475404
110	NC_008599	ATAAAA	2	12	190057	190068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118474760
111	NC_008599	GAATTT	2	12	192649	192660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118474570
112	NC_008599	AAAGAT	2	12	193367	193378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118474570
113	NC_008599	TAAATA	2	12	196906	196917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474734
114	NC_008599	TATCTT	2	12	197724	197735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118474756
115	NC_008599	AATATA	2	12	203773	203784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118474828
116	NC_008599	CGCCAG	2	12	203798	203809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118474828
117	NC_008599	GTTATA	2	12	204358	204369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475053
118	NC_008599	AAGATC	2	12	205551	205562	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118474622
119	NC_008599	TAAAAG	2	12	207621	207632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118474622
120	NC_008599	TTATAT	2	12	209412	209423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008599	TTCAAA	2	12	219214	219225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118474097
122	NC_008599	CAAATT	2	12	219804	219815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118475133
123	NC_008599	TAAATT	2	12	225343	225354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008599	AAATTA	2	12	225355	225366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_008599	ATTTAA	2	12	232602	232613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008599	AATTTA	2	12	234122	234133	50 %	50 %	0 %	0 %	118474316
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231	NC_008599	CGTAAG	2	12	408281	408292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118474399
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475	NC_008599	TGCAAA	2	12	829706	829717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118475062
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477	NC_008599	TATGGA	2	12	834617	834628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118475423
478	NC_008599	ATTGCA	2	12	840033	840044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118474106
479	NC_008599	AAATTT	2	12	841070	841081	50 %	50 %	0 %	0 %	118475026
480	NC_008599	AGCCAT	2	12	842002	842013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118475026
481	NC_008599	TGAGCT	2	12	842382	842393	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118475026
482	NC_008599	ACTCTA	2	12	844749	844760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118475457
483	NC_008599	AATTAG	2	12	845030	845041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118474490
484	NC_008599	GCACTT	2	12	846022	846033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118475717
485	NC_008599	ATGGGC	2	12	846530	846541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118474788
486	NC_008599	TTTAAA	2	12	847919	847930	50 %	50 %	0 %	0 %	118475195
487	NC_008599	AAATTT	3	18	848365	848382	50 %	50 %	0 %	0 %	118475195
488	NC_008599	AGGCAA	2	12	850496	850507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118474094
489	NC_008599	TAGCGA	2	12	851769	851780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118475699
490	NC_008599	TTAAAT	2	12	852355	852366	50 %	50 %	0 %	0 %	118474728
491	NC_008599	TTTAAA	2	12	852776	852787	50 %	50 %	0 %	0 %	118474728
492	NC_008599	ACAATA	2	12	853208	853219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118474728
493	NC_008599	CAAAAG	2	12	862753	862764	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118475540
494	NC_008599	TTATAG	2	12	862903	862914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118475540
495	NC_008599	TAGATA	2	12	863056	863067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118475540
496	NC_008599	CGGAAG	2	12	865260	865271	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118475534
497	NC_008599	GCTATC	2	12	865896	865907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118475534
498	NC_008599	TTTAAA	2	12	868782	868793	50 %	50 %	0 %	0 %	118475742
499	NC_008599	TACTTG	2	12	870918	870929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118475408
500	NC_008599	CTTGAA	2	12	873491	873502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118475355

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