MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 chromosome

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008599	TAAAT	2	10	1423	1432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008599	ATTTA	2	10	16516	16525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008599	TTTTA	2	10	20981	20990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008599	TTTTA	2	10	22068	22077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008599	ATATA	2	10	29165	29174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008599	ATCTA	2	10	29974	29983	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008599	CTAAA	2	10	58237	58246	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008599	CAATA	2	10	67915	67924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008599	CAAAA	2	10	71494	71503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008599	ATATT	2	10	77239	77248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008599	TTCTA	2	10	83015	83024	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008599	ATTAA	2	10	122936	122945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008599	CTATC	2	10	123008	123017	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008599	TTTTA	2	10	129250	129259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008599	ATTAT	2	10	133403	133412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008599	TAAGT	2	10	133791	133800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008599	GGTAA	2	10	133849	133858	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008599	TCGTG	2	10	134645	134654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008599	TAATT	2	10	137107	137116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008599	TAAAT	2	10	137126	137135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008599	CCGTA	2	10	137613	137622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008599	CAAAG	2	10	137748	137757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008599	AGCTA	2	10	138731	138740	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008599	TGCCT	2	10	139019	139028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008599	ATTTT	2	10	140190	140199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008599	TTTGA	2	10	140429	140438	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008599	TTTTG	2	10	162943	162952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008599	AAAAT	2	10	168209	168218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008599	ATTTA	2	10	176029	176038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008599	ATTAT	2	10	176207	176216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008599	TTATC	2	10	201799	201808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008599	ATATA	2	10	209432	209441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008599	ATCAA	2	10	232660	232669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008599	TAACT	2	10	248918	248927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008599	AAATC	2	10	251113	251122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008599	TATAA	2	10	258677	258686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008599	AAATT	2	10	258694	258703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008599	GTAAA	2	10	258781	258790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008599	GCAAA	2	10	262166	262175	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008599	TTTAA	2	10	266693	266702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008599	TTTGG	2	10	282437	282446	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008599	TATAA	2	10	291651	291660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008599	TATTT	2	10	305418	305427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008599	AAATT	2	10	312389	312398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008599	TTATT	2	10	331194	331203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008599	TTAGT	2	10	335598	335607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008599	GGCGG	2	10	335766	335775	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008599	TATTT	2	10	347499	347508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008599	CTTTA	2	10	368113	368122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008599	TTTAG	2	10	371593	371602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008599	TAAAT	2	10	371696	371705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008599	ATTTT	2	10	385001	385010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008599	TAATA	2	10	391719	391728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008599	TTTAA	2	10	396545	396554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008599	ATTAA	2	10	397368	397377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008599	GTTTT	2	10	397579	397588	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008599	ATTTA	2	10	412717	412726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008599	TAAAT	2	10	414732	414741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008599	ACTTA	2	10	418684	418693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008599	ATATA	2	10	418765	418774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008599	CGTTC	2	10	427680	427689	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008599	TAAAT	2	10	433415	433424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008599	TTTTA	2	10	433425	433434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008599	AATAA	3	15	437208	437222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008599	GTAAG	2	10	443335	443344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008599	ATTTT	3	15	443394	443408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008599	CAAAC	2	10	446425	446434	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008599	CAAAT	2	10	446703	446712	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008599	GGTTT	2	10	446961	446970	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008599	AATAA	3	15	450319	450333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008599	AATAA	3	15	456015	456029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008599	ATTCA	2	10	457704	457713	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008599	ATTAT	2	10	457884	457893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008599	ATAGA	2	10	458160	458169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008599	AAGCA	2	10	459761	459770	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008599	AGCTA	2	10	460326	460335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008599	ATTTT	2	10	460492	460501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008599	ATTTA	2	10	460598	460607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008599	ACTTT	2	10	464350	464359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008599	AATAA	3	15	471751	471765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008599	AATAA	3	15	475508	475522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008599	CTAAG	2	10	477495	477504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008599	AATAA	3	15	480401	480415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008599	GGTTT	2	10	482103	482112	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008599	AATAA	3	15	485461	485475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008599	CAAAC	2	10	488192	488201	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_008599	ATTTG	2	10	488417	488426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008599	GGTTT	2	10	488672	488681	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008599	AATAA	3	15	492588	492602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008599	ATTAT	2	10	503787	503796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008599	TCCCC	2	10	508411	508420	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
92	NC_008599	ATTAT	2	10	508666	508675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008599	TAAGT	2	10	509054	509063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008599	GGTAA	2	10	509112	509121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008599	TCGTG	2	10	509908	509917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008599	TAATT	2	10	512370	512379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008599	TAAAT	2	10	512389	512398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008599	CCGTA	2	10	512876	512885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008599	CAAAG	2	10	513011	513020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_008599	AGCTA	2	10	513994	514003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008599	TGCCT	2	10	514282	514291	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008599	TATAT	2	10	514810	514819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008599	ATTTT	2	10	516636	516645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008599	ATATA	2	10	518717	518726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008599	ATTTT	2	10	518737	518746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008599	AGGCA	2	10	553103	553112	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008599	AAATT	2	10	557327	557336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008599	ATATA	2	10	571371	571380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008599	AATTT	2	10	575798	575807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008599	ATCTG	2	10	588855	588864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008599	TTTTA	2	10	603149	603158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008599	ATTAT	2	10	603490	603499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008599	TAAGT	2	10	603878	603887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008599	GGTAA	2	10	603936	603945	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008599	TCGTG	2	10	604732	604741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008599	ATTTA	2	10	605397	605406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008599	TAATT	2	10	607201	607210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008599	TAAAT	2	10	607220	607229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008599	CCGTA	2	10	607707	607716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008599	CAAAG	2	10	607842	607851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008599	AGCTA	2	10	608825	608834	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008599	TGCCT	2	10	609113	609122	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_008599	TATAT	2	10	609641	609650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008599	TATAA	2	10	631835	631844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008599	TATAT	2	10	655237	655246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008599	GATAA	2	10	655589	655598	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008599	AAACT	2	10	656033	656042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008599	ATTTA	2	10	665793	665802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008599	CAAAT	2	10	670071	670080	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008599	TATAT	2	10	674329	674338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008599	TAATA	2	10	675091	675100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008599	ATTTT	2	10	701504	701513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008599	TAATT	2	10	722649	722658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008599	TTTGA	2	10	727221	727230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008599	AAATT	2	10	727268	727277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008599	AAATT	2	10	727343	727352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008599	ATATT	2	10	728649	728658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008599	ATAAA	2	10	767098	767107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008599	TATTT	2	10	767182	767191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008599	CTTGT	2	10	768692	768701	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008599	TAAAA	2	10	804236	804245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008599	GATAA	2	10	806252	806261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008599	AATTT	2	10	817077	817086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008599	ACTAA	2	10	827526	827535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_008599	CTTAT	2	10	838746	838755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_008599	ATTTT	2	10	848447	848456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008599	ATTTT	2	10	858145	858154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008599	AAATT	2	10	875009	875018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.