MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TACCT	2	10	707	716	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
2	NC_008598	CTTCA	2	10	953	962	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
3	NC_008598	CCTTT	2	10	1328	1337	0 %	60 %	0 %	40 %	118445180
4	NC_008598	TAAAA	2	10	2122	2131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008598	TCTTT	2	10	2430	2439	0 %	80 %	0 %	20 %	118445181
6	NC_008598	ATTAT	2	10	2875	2884	40 %	60 %	0 %	0 %	118445181
7	NC_008598	TAAAC	2	10	3853	3862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008598	TTACA	2	10	4615	4624	40 %	40 %	0 %	20 %	118445184
9	NC_008598	CCGTT	2	10	5255	5264	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008598	AAATC	2	10	6702	6711	60 %	20 %	0 %	20 %	118445186
11	NC_008598	ACATC	2	10	7224	7233	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_008598	TTCAT	2	10	7316	7325	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008598	AGATA	2	10	10947	10956	60 %	20 %	20 %	0 %	118445192
14	NC_008598	TTCCA	2	10	13974	13983	20 %	40 %	0 %	40 %	118445198
15	NC_008598	GAATC	2	10	14018	14027	40 %	20 %	20 %	20 %	118445198
16	NC_008598	TCTTT	2	10	14200	14209	0 %	80 %	0 %	20 %	118445198
17	NC_008598	TTAAC	2	10	14270	14279	40 %	40 %	0 %	20 %	118445198
18	NC_008598	TCCTT	2	10	14428	14437	0 %	60 %	0 %	40 %	118445199
19	NC_008598	TCCCA	2	10	14807	14816	20 %	20 %	0 %	60 %	118445200
20	NC_008598	GTAAT	2	10	15482	15491	40 %	40 %	20 %	0 %	118445201
21	NC_008598	TTTTG	2	10	16207	16216	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008598	ATCCA	2	10	16469	16478	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008598	CTTTT	2	10	16660	16669	0 %	80 %	0 %	20 %	118445202
24	NC_008598	TTTAT	2	10	19927	19936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008598	TGATT	2	10	20568	20577	20 %	60 %	20 %	0 %	118445241
26	NC_008598	AAATT	2	10	21457	21466	60 %	40 %	0 %	0 %	118445206
27	NC_008598	TCTTT	2	10	22628	22637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008598	ATTTA	2	10	23647	23656	40 %	60 %	0 %	0 %	118445208
29	NC_008598	AAAAT	2	10	24369	24378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008598	TAAAT	2	10	25132	25141	60 %	40 %	0 %	0 %	118445209
31	NC_008598	TCTTT	2	10	25552	25561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008598	CAAAA	2	10	27778	27787	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008598	TTTTG	2	10	28100	28109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008598	TGTTT	2	10	28183	28192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008598	GAAAA	2	10	29618	29627	80 %	0 %	20 %	0 %	118445212
36	NC_008598	GAAAA	2	10	29969	29978	80 %	0 %	20 %	0 %	118445213
37	NC_008598	AGTAA	2	10	30459	30468	60 %	20 %	20 %	0 %	118445214
38	NC_008598	ATTTT	2	10	32970	32979	20 %	80 %	0 %	0 %	118445216
39	NC_008598	TGAAA	2	10	33187	33196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008598	TGATT	2	10	34751	34760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008598	ATTTT	2	10	34799	34808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008598	AAAGA	2	10	36245	36254	80 %	0 %	20 %	0 %	118445220
43	NC_008598	TCAAT	2	10	36856	36865	40 %	40 %	0 %	20 %	118445221
44	NC_008598	GAAAA	2	10	37555	37564	80 %	0 %	20 %	0 %	118445221
45	NC_008598	TCCAA	2	10	43015	43024	40 %	20 %	0 %	40 %	118445227
46	NC_008598	TAAAA	2	10	44602	44611	80 %	20 %	0 %	0 %	118445228
47	NC_008598	ATTTT	2	10	45464	45473	20 %	80 %	0 %	0 %	118445229
48	NC_008598	ATGAT	2	10	46266	46275	40 %	40 %	20 %	0 %	118445229
49	NC_008598	TTTCT	2	10	48613	48622	0 %	80 %	0 %	20 %	118445232
50	NC_008598	AATGA	2	10	49579	49588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008598	ACTTC	2	10	50316	50325	20 %	40 %	0 %	40 %	118445235
52	NC_008598	TAGCA	2	10	50872	50881	40 %	20 %	20 %	20 %	118445237
53	NC_008598	AGACG	2	10	52656	52665	40 %	0 %	40 %	20 %	118445238
54	NC_008598	CTTCT	2	10	52910	52919	0 %	60 %	0 %	40 %	118445239
55	NC_008598	TCAAT	2	10	54353	54362	40 %	40 %	0 %	20 %	118445240
56	NC_008598	TCTTT	2	10	54789	54798	0 %	80 %	0 %	20 %	118445240
57	NC_008598	TTCAT	2	10	55087	55096	20 %	60 %	0 %	20 %	118445240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.