MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TACCT	2	10	707	716	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
2	NC_008598	CTTCA	2	10	953	962	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
3	NC_008598	CCTTT	2	10	1328	1337	0 %	60 %	0 %	40 %	118445180
4	NC_008598	TCTTT	2	10	2430	2439	0 %	80 %	0 %	20 %	118445181
5	NC_008598	ATTAT	2	10	2875	2884	40 %	60 %	0 %	0 %	118445181
6	NC_008598	TTACA	2	10	4615	4624	40 %	40 %	0 %	20 %	118445184
7	NC_008598	AAATC	2	10	6702	6711	60 %	20 %	0 %	20 %	118445186
8	NC_008598	AGATA	2	10	10947	10956	60 %	20 %	20 %	0 %	118445192
9	NC_008598	TTCCA	2	10	13974	13983	20 %	40 %	0 %	40 %	118445198
10	NC_008598	GAATC	2	10	14018	14027	40 %	20 %	20 %	20 %	118445198
11	NC_008598	TCTTT	2	10	14200	14209	0 %	80 %	0 %	20 %	118445198
12	NC_008598	TTAAC	2	10	14270	14279	40 %	40 %	0 %	20 %	118445198
13	NC_008598	TCCTT	2	10	14428	14437	0 %	60 %	0 %	40 %	118445199
14	NC_008598	TCCCA	2	10	14807	14816	20 %	20 %	0 %	60 %	118445200
15	NC_008598	GTAAT	2	10	15482	15491	40 %	40 %	20 %	0 %	118445201
16	NC_008598	CTTTT	2	10	16660	16669	0 %	80 %	0 %	20 %	118445202
17	NC_008598	TGATT	2	10	20568	20577	20 %	60 %	20 %	0 %	118445241
18	NC_008598	AAATT	2	10	21457	21466	60 %	40 %	0 %	0 %	118445206
19	NC_008598	ATTTA	2	10	23647	23656	40 %	60 %	0 %	0 %	118445208
20	NC_008598	TAAAT	2	10	25132	25141	60 %	40 %	0 %	0 %	118445209
21	NC_008598	GAAAA	2	10	29618	29627	80 %	0 %	20 %	0 %	118445212
22	NC_008598	GAAAA	2	10	29969	29978	80 %	0 %	20 %	0 %	118445213
23	NC_008598	AGTAA	2	10	30459	30468	60 %	20 %	20 %	0 %	118445214
24	NC_008598	ATTTT	2	10	32970	32979	20 %	80 %	0 %	0 %	118445216
25	NC_008598	AAAGA	2	10	36245	36254	80 %	0 %	20 %	0 %	118445220
26	NC_008598	TCAAT	2	10	36856	36865	40 %	40 %	0 %	20 %	118445221
27	NC_008598	GAAAA	2	10	37555	37564	80 %	0 %	20 %	0 %	118445221
28	NC_008598	TCCAA	2	10	43015	43024	40 %	20 %	0 %	40 %	118445227
29	NC_008598	TAAAA	2	10	44602	44611	80 %	20 %	0 %	0 %	118445228
30	NC_008598	ATTTT	2	10	45464	45473	20 %	80 %	0 %	0 %	118445229
31	NC_008598	ATGAT	2	10	46266	46275	40 %	40 %	20 %	0 %	118445229
32	NC_008598	TTTCT	2	10	48613	48622	0 %	80 %	0 %	20 %	118445232
33	NC_008598	ACTTC	2	10	50316	50325	20 %	40 %	0 %	40 %	118445235
34	NC_008598	TAGCA	2	10	50872	50881	40 %	20 %	20 %	20 %	118445237
35	NC_008598	AGACG	2	10	52656	52665	40 %	0 %	40 %	20 %	118445238
36	NC_008598	CTTCT	2	10	52910	52919	0 %	60 %	0 %	40 %	118445239
37	NC_008598	TCAAT	2	10	54353	54362	40 %	40 %	0 %	20 %	118445240
38	NC_008598	TCTTT	2	10	54789	54798	0 %	80 %	0 %	20 %	118445240
39	NC_008598	TTCAT	2	10	55087	55096	20 %	60 %	0 %	20 %	118445240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.