MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TAGT	2	8	1101	1108	25 %	50 %	25 %	0 %	118445180
2	NC_008598	ACAA	2	8	1315	1322	75 %	0 %	0 %	25 %	118445180
3	NC_008598	TTTC	2	8	1375	1382	0 %	75 %	0 %	25 %	118445180
4	NC_008598	CATT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	118445180
5	NC_008598	TTTA	2	8	1734	1741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008598	TTTC	2	8	2466	2473	0 %	75 %	0 %	25 %	118445181
7	NC_008598	TTCG	2	8	2638	2645	0 %	50 %	25 %	25 %	118445181
8	NC_008598	TAAA	2	8	2783	2790	75 %	25 %	0 %	0 %	118445181
9	NC_008598	AGCA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	118445182
10	NC_008598	AGTA	2	8	3246	3253	50 %	25 %	25 %	0 %	118445182
11	NC_008598	AAAT	2	8	3351	3358	75 %	25 %	0 %	0 %	118445182
12	NC_008598	TGTT	2	8	3449	3456	0 %	75 %	25 %	0 %	118445182
13	NC_008598	AATT	2	8	3607	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008598	ATTT	2	8	3631	3638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008598	TAAT	2	8	3670	3677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008598	GTTT	2	8	3990	3997	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008598	TACT	2	8	4537	4544	25 %	50 %	0 %	25 %	118445184
18	NC_008598	CTTT	2	8	4822	4829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008598	ATTC	2	8	5053	5060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008598	CATA	3	12	5104	5115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008598	CAAA	2	8	5274	5281	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008598	TATT	2	8	5454	5461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008598	TGAT	2	8	5488	5495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008598	CATT	2	8	5570	5577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008598	GCCC	2	8	5613	5620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_008598	TGAC	2	8	6580	6587	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
27	NC_008598	ACTG	2	8	6603	6610	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
28	NC_008598	TTTC	2	8	6963	6970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008598	TTTC	2	8	7169	7176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008598	ATAG	2	8	7590	7597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008598	AAAC	2	8	7953	7960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008598	TAAA	2	8	8350	8357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008598	TTTA	2	8	8496	8503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008598	TGGA	2	8	8734	8741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008598	TTTC	2	8	8770	8777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008598	TATT	2	8	8825	8832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008598	ACCC	2	8	9103	9110	25 %	0 %	0 %	75 %	118445188
38	NC_008598	AAAC	2	8	9375	9382	75 %	0 %	0 %	25 %	118445188
39	NC_008598	AATA	2	8	9441	9448	75 %	25 %	0 %	0 %	118445188
40	NC_008598	TATT	2	8	10078	10085	25 %	75 %	0 %	0 %	118445190
41	NC_008598	ACTT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	0 %	25 %	118445190
42	NC_008598	TTTC	2	8	10494	10501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008598	GTAG	2	8	10608	10615	25 %	25 %	50 %	0 %	118445191
44	NC_008598	TTTC	2	8	10674	10681	0 %	75 %	0 %	25 %	118445191
45	NC_008598	TCTT	2	8	11512	11519	0 %	75 %	0 %	25 %	118445193
46	NC_008598	TTTC	2	8	11773	11780	0 %	75 %	0 %	25 %	118445193
47	NC_008598	CCTT	2	8	12356	12363	0 %	50 %	0 %	50 %	118445195
48	NC_008598	TTTA	2	8	12773	12780	25 %	75 %	0 %	0 %	118445197
49	NC_008598	AGTT	2	8	12835	12842	25 %	50 %	25 %	0 %	118445197
50	NC_008598	TTGC	2	8	12906	12913	0 %	50 %	25 %	25 %	118445197
51	NC_008598	AATA	2	8	13211	13218	75 %	25 %	0 %	0 %	118445197
52	NC_008598	TTAA	2	8	13774	13781	50 %	50 %	0 %	0 %	118445198
53	NC_008598	TTGA	2	8	14235	14242	25 %	50 %	25 %	0 %	118445198
54	NC_008598	TTTC	2	8	14543	14550	0 %	75 %	0 %	25 %	118445199
55	NC_008598	TTGT	2	8	14749	14756	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008598	GTTT	2	8	15009	15016	0 %	75 %	25 %	0 %	118445200
57	NC_008598	AAAG	2	8	15358	15365	75 %	0 %	25 %	0 %	118445200
58	NC_008598	AAGT	2	8	15914	15921	50 %	25 %	25 %	0 %	118445201
59	NC_008598	ATCC	2	8	16434	16441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008598	TTCT	2	8	16576	16583	0 %	75 %	0 %	25 %	118445202
61	NC_008598	CTCA	2	8	16819	16826	25 %	25 %	0 %	50 %	118445202
62	NC_008598	GAAG	2	8	17024	17031	50 %	0 %	50 %	0 %	118445202
63	NC_008598	TTCA	2	8	17317	17324	25 %	50 %	0 %	25 %	118445202
64	NC_008598	AAAT	2	8	17635	17642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008598	GAAA	2	8	18004	18011	75 %	0 %	25 %	0 %	118445204
66	NC_008598	ATGT	2	8	18030	18037	25 %	50 %	25 %	0 %	118445204
67	NC_008598	CAAA	2	8	18048	18055	75 %	0 %	0 %	25 %	118445204
68	NC_008598	TAAA	2	8	18689	18696	75 %	25 %	0 %	0 %	118445205
69	NC_008598	TTTG	2	8	19168	19175	0 %	75 %	25 %	0 %	118445205
70	NC_008598	AAAT	2	8	19688	19695	75 %	25 %	0 %	0 %	118445205
71	NC_008598	AAAC	2	8	20105	20112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008598	TATT	2	8	20869	20876	25 %	75 %	0 %	0 %	118445206
73	NC_008598	GAAG	2	8	21029	21036	50 %	0 %	50 %	0 %	118445206
74	NC_008598	AAGA	2	8	21042	21049	75 %	0 %	25 %	0 %	118445206
75	NC_008598	ATTT	2	8	21741	21748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008598	TTCT	2	8	22043	22050	0 %	75 %	0 %	25 %	118445207
77	NC_008598	ATTC	2	8	22725	22732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008598	TAAA	2	8	22772	22779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008598	AAAC	2	8	23285	23292	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
80	NC_008598	CAAA	2	8	23559	23566	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
81	NC_008598	AATC	2	8	23573	23580	50 %	25 %	0 %	25 %	118445208
82	NC_008598	AATA	2	8	23929	23936	75 %	25 %	0 %	0 %	118445208
83	NC_008598	ATAA	2	8	24340	24347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008598	TACA	2	8	25220	25227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008598	ATTC	2	8	25376	25383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008598	ACTA	2	8	25565	25572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008598	ATTT	2	8	25699	25706	25 %	75 %	0 %	0 %	118445210
88	NC_008598	ATGT	2	8	25769	25776	25 %	50 %	25 %	0 %	118445210
89	NC_008598	ATAA	2	8	25812	25819	75 %	25 %	0 %	0 %	118445210
90	NC_008598	TTTG	2	8	26141	26148	0 %	75 %	25 %	0 %	118445210
91	NC_008598	CTTC	2	8	26588	26595	0 %	50 %	0 %	50 %	118445210
92	NC_008598	TTCC	2	8	26730	26737	0 %	50 %	0 %	50 %	118445210
93	NC_008598	TTTA	2	8	27182	27189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008598	AATC	2	8	27364	27371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008598	GTAT	2	8	27426	27433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008598	CCCT	2	8	27595	27602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_008598	CACG	2	8	27684	27691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008598	TTTA	2	8	27743	27750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008598	ATTT	2	8	28398	28405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008598	GGTA	2	8	28661	28668	25 %	25 %	50 %	0 %	118445211
101	NC_008598	AGAA	2	8	29494	29501	75 %	0 %	25 %	0 %	118445212
102	NC_008598	AATC	2	8	29692	29699	50 %	25 %	0 %	25 %	118445212
103	NC_008598	TAGA	2	8	29771	29778	50 %	25 %	25 %	0 %	118445212
104	NC_008598	GTTG	2	8	30217	30224	0 %	50 %	50 %	0 %	118445213
105	NC_008598	AATA	2	8	30308	30315	75 %	25 %	0 %	0 %	118445213
106	NC_008598	ACAG	2	8	30420	30427	50 %	0 %	25 %	25 %	118445214
107	NC_008598	ATAA	2	8	30905	30912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008598	ATAC	2	8	31998	32005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008598	ATAA	2	8	32029	32036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008598	TTTA	2	8	32190	32197	25 %	75 %	0 %	0 %	118445216
111	NC_008598	GCCA	2	8	32770	32777	25 %	0 %	25 %	50 %	118445216
112	NC_008598	AGGT	2	8	32889	32896	25 %	25 %	50 %	0 %	118445216
113	NC_008598	ATAA	2	8	33169	33176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008598	CGCT	2	8	33591	33598	0 %	25 %	25 %	50 %	118445217
115	NC_008598	CTGT	2	8	33869	33876	0 %	50 %	25 %	25 %	118445217
116	NC_008598	CGTC	2	8	34008	34015	0 %	25 %	25 %	50 %	118445217
117	NC_008598	TGTC	2	8	34280	34287	0 %	50 %	25 %	25 %	118445218
118	NC_008598	ACAA	2	8	34447	34454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008598	CTAC	2	8	34690	34697	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008598	ACAT	2	8	34833	34840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008598	TTCG	2	8	34936	34943	0 %	50 %	25 %	25 %	118445219
122	NC_008598	ATTT	2	8	35260	35267	25 %	75 %	0 %	0 %	118445219
123	NC_008598	AAAC	2	8	35768	35775	75 %	0 %	0 %	25 %	118445219
124	NC_008598	TAAC	2	8	35950	35957	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
125	NC_008598	ACTA	2	8	36026	36033	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
126	NC_008598	ACTA	2	8	36377	36384	50 %	25 %	0 %	25 %	118445220
127	NC_008598	TACA	2	8	36526	36533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008598	TTTA	2	8	36541	36548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008598	CATA	2	8	36740	36747	50 %	25 %	0 %	25 %	118445221
130	NC_008598	GATT	2	8	37391	37398	25 %	50 %	25 %	0 %	118445221
131	NC_008598	TTTA	2	8	38130	38137	25 %	75 %	0 %	0 %	118445223
132	NC_008598	TCCA	2	8	38544	38551	25 %	25 %	0 %	50 %	118445223
133	NC_008598	AAAT	2	8	38964	38971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008598	TTAA	2	8	39438	39445	50 %	50 %	0 %	0 %	118445225
135	NC_008598	TTTC	2	8	39993	40000	0 %	75 %	0 %	25 %	118445225
136	NC_008598	TGTT	2	8	40018	40025	0 %	75 %	25 %	0 %	118445225
137	NC_008598	TAGT	2	8	40126	40133	25 %	50 %	25 %	0 %	118445226
138	NC_008598	AACA	2	8	40221	40228	75 %	0 %	0 %	25 %	118445226
139	NC_008598	TTTC	2	8	40329	40336	0 %	75 %	0 %	25 %	118445226
140	NC_008598	CGTC	2	8	40435	40442	0 %	25 %	25 %	50 %	118445226
141	NC_008598	AGTT	2	8	41807	41814	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008598	ATTG	2	8	42840	42847	25 %	50 %	25 %	0 %	118445227
143	NC_008598	TTCA	2	8	43131	43138	25 %	50 %	0 %	25 %	118445227
144	NC_008598	CCAT	2	8	43275	43282	25 %	25 %	0 %	50 %	118445227
145	NC_008598	AGCA	2	8	43580	43587	50 %	0 %	25 %	25 %	118445227
146	NC_008598	TACA	2	8	43890	43897	50 %	25 %	0 %	25 %	118445227
147	NC_008598	CCTA	2	8	44039	44046	25 %	25 %	0 %	50 %	118445228
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.