MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TAGT	2	8	1101	1108	25 %	50 %	25 %	0 %	118445180
2	NC_008598	ACAA	2	8	1315	1322	75 %	0 %	0 %	25 %	118445180
3	NC_008598	TTTC	2	8	1375	1382	0 %	75 %	0 %	25 %	118445180
4	NC_008598	CATT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	118445180
5	NC_008598	TTTC	2	8	2466	2473	0 %	75 %	0 %	25 %	118445181
6	NC_008598	TTCG	2	8	2638	2645	0 %	50 %	25 %	25 %	118445181
7	NC_008598	TAAA	2	8	2783	2790	75 %	25 %	0 %	0 %	118445181
8	NC_008598	AGCA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	118445182
9	NC_008598	AGTA	2	8	3246	3253	50 %	25 %	25 %	0 %	118445182
10	NC_008598	AAAT	2	8	3351	3358	75 %	25 %	0 %	0 %	118445182
11	NC_008598	TGTT	2	8	3449	3456	0 %	75 %	25 %	0 %	118445182
12	NC_008598	TACT	2	8	4537	4544	25 %	50 %	0 %	25 %	118445184
13	NC_008598	TGAC	2	8	6580	6587	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
14	NC_008598	ACTG	2	8	6603	6610	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
15	NC_008598	ACCC	2	8	9103	9110	25 %	0 %	0 %	75 %	118445188
16	NC_008598	AAAC	2	8	9375	9382	75 %	0 %	0 %	25 %	118445188
17	NC_008598	AATA	2	8	9441	9448	75 %	25 %	0 %	0 %	118445188
18	NC_008598	TATT	2	8	10078	10085	25 %	75 %	0 %	0 %	118445190
19	NC_008598	ACTT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	0 %	25 %	118445190
20	NC_008598	GTAG	2	8	10608	10615	25 %	25 %	50 %	0 %	118445191
21	NC_008598	TTTC	2	8	10674	10681	0 %	75 %	0 %	25 %	118445191
22	NC_008598	TCTT	2	8	11512	11519	0 %	75 %	0 %	25 %	118445193
23	NC_008598	TTTC	2	8	11773	11780	0 %	75 %	0 %	25 %	118445193
24	NC_008598	CCTT	2	8	12356	12363	0 %	50 %	0 %	50 %	118445195
25	NC_008598	TTTA	2	8	12773	12780	25 %	75 %	0 %	0 %	118445197
26	NC_008598	AGTT	2	8	12835	12842	25 %	50 %	25 %	0 %	118445197
27	NC_008598	TTGC	2	8	12906	12913	0 %	50 %	25 %	25 %	118445197
28	NC_008598	AATA	2	8	13211	13218	75 %	25 %	0 %	0 %	118445197
29	NC_008598	TTAA	2	8	13774	13781	50 %	50 %	0 %	0 %	118445198
30	NC_008598	TTGA	2	8	14235	14242	25 %	50 %	25 %	0 %	118445198
31	NC_008598	TTTC	2	8	14543	14550	0 %	75 %	0 %	25 %	118445199
32	NC_008598	GTTT	2	8	15009	15016	0 %	75 %	25 %	0 %	118445200
33	NC_008598	AAAG	2	8	15358	15365	75 %	0 %	25 %	0 %	118445200
34	NC_008598	AAGT	2	8	15914	15921	50 %	25 %	25 %	0 %	118445201
35	NC_008598	TTCT	2	8	16576	16583	0 %	75 %	0 %	25 %	118445202
36	NC_008598	CTCA	2	8	16819	16826	25 %	25 %	0 %	50 %	118445202
37	NC_008598	GAAG	2	8	17024	17031	50 %	0 %	50 %	0 %	118445202
38	NC_008598	TTCA	2	8	17317	17324	25 %	50 %	0 %	25 %	118445202
39	NC_008598	GAAA	2	8	18004	18011	75 %	0 %	25 %	0 %	118445204
40	NC_008598	ATGT	2	8	18030	18037	25 %	50 %	25 %	0 %	118445204
41	NC_008598	CAAA	2	8	18048	18055	75 %	0 %	0 %	25 %	118445204
42	NC_008598	TAAA	2	8	18689	18696	75 %	25 %	0 %	0 %	118445205
43	NC_008598	TTTG	2	8	19168	19175	0 %	75 %	25 %	0 %	118445205
44	NC_008598	AAAT	2	8	19688	19695	75 %	25 %	0 %	0 %	118445205
45	NC_008598	TATT	2	8	20869	20876	25 %	75 %	0 %	0 %	118445206
46	NC_008598	GAAG	2	8	21029	21036	50 %	0 %	50 %	0 %	118445206
47	NC_008598	AAGA	2	8	21042	21049	75 %	0 %	25 %	0 %	118445206
48	NC_008598	TTCT	2	8	22043	22050	0 %	75 %	0 %	25 %	118445207
49	NC_008598	AAAC	2	8	23285	23292	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
50	NC_008598	CAAA	2	8	23559	23566	75 %	0 %	0 %	25 %	118445208
51	NC_008598	AATC	2	8	23573	23580	50 %	25 %	0 %	25 %	118445208
52	NC_008598	AATA	2	8	23929	23936	75 %	25 %	0 %	0 %	118445208
53	NC_008598	ATTT	2	8	25699	25706	25 %	75 %	0 %	0 %	118445210
54	NC_008598	ATGT	2	8	25769	25776	25 %	50 %	25 %	0 %	118445210
55	NC_008598	ATAA	2	8	25812	25819	75 %	25 %	0 %	0 %	118445210
56	NC_008598	TTTG	2	8	26141	26148	0 %	75 %	25 %	0 %	118445210
57	NC_008598	CTTC	2	8	26588	26595	0 %	50 %	0 %	50 %	118445210
58	NC_008598	TTCC	2	8	26730	26737	0 %	50 %	0 %	50 %	118445210
59	NC_008598	GGTA	2	8	28661	28668	25 %	25 %	50 %	0 %	118445211
60	NC_008598	AGAA	2	8	29494	29501	75 %	0 %	25 %	0 %	118445212
61	NC_008598	AATC	2	8	29692	29699	50 %	25 %	0 %	25 %	118445212
62	NC_008598	TAGA	2	8	29771	29778	50 %	25 %	25 %	0 %	118445212
63	NC_008598	GTTG	2	8	30217	30224	0 %	50 %	50 %	0 %	118445213
64	NC_008598	AATA	2	8	30308	30315	75 %	25 %	0 %	0 %	118445213
65	NC_008598	ACAG	2	8	30420	30427	50 %	0 %	25 %	25 %	118445214
66	NC_008598	TTTA	2	8	32190	32197	25 %	75 %	0 %	0 %	118445216
67	NC_008598	GCCA	2	8	32770	32777	25 %	0 %	25 %	50 %	118445216
68	NC_008598	AGGT	2	8	32889	32896	25 %	25 %	50 %	0 %	118445216
69	NC_008598	CGCT	2	8	33591	33598	0 %	25 %	25 %	50 %	118445217
70	NC_008598	CTGT	2	8	33869	33876	0 %	50 %	25 %	25 %	118445217
71	NC_008598	CGTC	2	8	34008	34015	0 %	25 %	25 %	50 %	118445217
72	NC_008598	TGTC	2	8	34280	34287	0 %	50 %	25 %	25 %	118445218
73	NC_008598	TTCG	2	8	34936	34943	0 %	50 %	25 %	25 %	118445219
74	NC_008598	ATTT	2	8	35260	35267	25 %	75 %	0 %	0 %	118445219
75	NC_008598	AAAC	2	8	35768	35775	75 %	0 %	0 %	25 %	118445219
76	NC_008598	TAAC	2	8	35950	35957	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
77	NC_008598	ACTA	2	8	36026	36033	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
78	NC_008598	ACTA	2	8	36377	36384	50 %	25 %	0 %	25 %	118445220
79	NC_008598	CATA	2	8	36740	36747	50 %	25 %	0 %	25 %	118445221
80	NC_008598	GATT	2	8	37391	37398	25 %	50 %	25 %	0 %	118445221
81	NC_008598	TTTA	2	8	38130	38137	25 %	75 %	0 %	0 %	118445223
82	NC_008598	TCCA	2	8	38544	38551	25 %	25 %	0 %	50 %	118445223
83	NC_008598	TTAA	2	8	39438	39445	50 %	50 %	0 %	0 %	118445225
84	NC_008598	TTTC	2	8	39993	40000	0 %	75 %	0 %	25 %	118445225
85	NC_008598	TGTT	2	8	40018	40025	0 %	75 %	25 %	0 %	118445225
86	NC_008598	TAGT	2	8	40126	40133	25 %	50 %	25 %	0 %	118445226
87	NC_008598	AACA	2	8	40221	40228	75 %	0 %	0 %	25 %	118445226
88	NC_008598	TTTC	2	8	40329	40336	0 %	75 %	0 %	25 %	118445226
89	NC_008598	CGTC	2	8	40435	40442	0 %	25 %	25 %	50 %	118445226
90	NC_008598	ATTG	2	8	42840	42847	25 %	50 %	25 %	0 %	118445227
91	NC_008598	TTCA	2	8	43131	43138	25 %	50 %	0 %	25 %	118445227
92	NC_008598	CCAT	2	8	43275	43282	25 %	25 %	0 %	50 %	118445227
93	NC_008598	AGCA	2	8	43580	43587	50 %	0 %	25 %	25 %	118445227
94	NC_008598	TACA	2	8	43890	43897	50 %	25 %	0 %	25 %	118445227
95	NC_008598	CCTA	2	8	44039	44046	25 %	25 %	0 %	50 %	118445228
96	NC_008598	CATT	2	8	44764	44771	25 %	50 %	0 %	25 %	118445228
97	NC_008598	ATAC	2	8	45021	45028	50 %	25 %	0 %	25 %	118445229
98	NC_008598	ACCC	2	8	45434	45441	25 %	0 %	0 %	75 %	118445229
99	NC_008598	GCTT	2	8	46076	46083	0 %	50 %	25 %	25 %	118445229
100	NC_008598	TTTG	2	8	47717	47724	0 %	75 %	25 %	0 %	118445230
101	NC_008598	AAGT	2	8	48242	48249	50 %	25 %	25 %	0 %	118445231
102	NC_008598	GAAC	2	8	48602	48609	50 %	0 %	25 %	25 %	118445232
103	NC_008598	ATCT	2	8	48643	48650	25 %	50 %	0 %	25 %	118445232
104	NC_008598	CTAA	2	8	48714	48721	50 %	25 %	0 %	25 %	118445232
105	NC_008598	AAAT	2	8	48917	48924	75 %	25 %	0 %	0 %	118445233
106	NC_008598	CATA	2	8	49227	49234	50 %	25 %	0 %	25 %	118445233
107	NC_008598	ATAA	2	8	49875	49882	75 %	25 %	0 %	0 %	118445234
108	NC_008598	TAAA	2	8	50003	50010	75 %	25 %	0 %	0 %	118445234
109	NC_008598	CTTT	2	8	50533	50540	0 %	75 %	0 %	25 %	118445236
110	NC_008598	TAAG	2	8	50755	50762	50 %	25 %	25 %	0 %	118445237
111	NC_008598	ATTG	2	8	51505	51512	25 %	50 %	25 %	0 %	118445237
112	NC_008598	TCAT	2	8	51764	51771	25 %	50 %	0 %	25 %	118445238
113	NC_008598	GTTT	2	8	52038	52045	0 %	75 %	25 %	0 %	118445238
114	NC_008598	TGTT	2	8	52220	52227	0 %	75 %	25 %	0 %	118445238
115	NC_008598	CTTT	2	8	52452	52459	0 %	75 %	0 %	25 %	118445238
116	NC_008598	GGTT	2	8	53100	53107	0 %	50 %	50 %	0 %	118445239
117	NC_008598	ACTT	2	8	53904	53911	25 %	50 %	0 %	25 %	118445240
118	NC_008598	TTTA	2	8	53979	53986	25 %	75 %	0 %	0 %	118445240
119	NC_008598	ACCA	2	8	54585	54592	50 %	0 %	0 %	50 %	118445240
120	NC_008598	TTTA	2	8	54711	54718	25 %	75 %	0 %	0 %	118445240
121	NC_008598	AGTA	2	8	54746	54753	50 %	25 %	25 %	0 %	118445240
122	NC_008598	TTAA	2	8	54817	54824	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
123	NC_008598	TAAA	2	8	55004	55011	75 %	25 %	0 %	0 %	118445240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.