MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TAA	2	6	32	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008598	CCA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008598	AAC	2	6	195	200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008598	CCA	2	6	308	313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008598	ACG	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008598	AAT	2	6	559	564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008598	CCA	2	6	598	603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008598	GCT	2	6	618	623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008598	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
10	NC_008598	CTT	2	6	724	729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445180
11	NC_008598	CGT	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
12	NC_008598	ATC	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445180
13	NC_008598	CAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445180
14	NC_008598	GAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445180
15	NC_008598	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445180
16	NC_008598	TAT	2	6	1651	1656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008598	CAT	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008598	ATT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008598	TAT	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008598	TTA	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008598	GAA	2	6	2083	2088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008598	ATT	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
23	NC_008598	TGC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445181
24	NC_008598	GTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445181
25	NC_008598	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
26	NC_008598	TCA	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
27	NC_008598	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
28	NC_008598	CTT	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
29	NC_008598	TTA	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
30	NC_008598	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445181
31	NC_008598	ATT	2	6	2934	2939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
32	NC_008598	TCA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
33	NC_008598	CCT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445182
34	NC_008598	TCT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
35	NC_008598	TTC	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
36	NC_008598	CTT	2	6	3138	3143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
37	NC_008598	GTT	2	6	3167	3172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445182
38	NC_008598	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
39	NC_008598	TAC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445182
40	NC_008598	TTC	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
41	NC_008598	ATA	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
42	NC_008598	ATA	2	6	3623	3628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008598	CAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008598	AGG	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008598	AAC	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008598	CAG	2	6	4206	4211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445183
47	NC_008598	TCA	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445183
48	NC_008598	CTT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445183
49	NC_008598	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445183
50	NC_008598	TCC	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008598	CTT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
52	NC_008598	TCT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
53	NC_008598	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445184
54	NC_008598	TGT	2	6	4668	4673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445184
55	NC_008598	TTC	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
56	NC_008598	CCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008598	TCT	2	6	5004	5009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008598	ACG	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008598	TTC	2	6	5206	5211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008598	TAA	2	6	5313	5318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008598	ACC	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008598	ATA	3	9	5721	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008598	ATA	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
64	NC_008598	GTT	2	6	5859	5864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445185
65	NC_008598	CAT	3	9	5868	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
66	NC_008598	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
67	NC_008598	ATT	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445185
68	NC_008598	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
69	NC_008598	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445185
70	NC_008598	ACT	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
71	NC_008598	GCA	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445185
72	NC_008598	CTC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445185
73	NC_008598	AAT	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
74	NC_008598	TTG	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008598	CCA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008598	TAA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
77	NC_008598	TCT	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
78	NC_008598	CTA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
79	NC_008598	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
80	NC_008598	TGC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
81	NC_008598	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445186
82	NC_008598	TCT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
83	NC_008598	TGC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
84	NC_008598	CAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
85	NC_008598	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
86	NC_008598	TCC	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008598	ATC	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008598	ATT	2	6	7155	7160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008598	TTG	2	6	7161	7166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008598	ATC	3	9	7300	7308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008598	TCC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445187
92	NC_008598	AAT	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008598	GCT	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008598	TTC	2	6	7732	7737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008598	ATC	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008598	GTT	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008598	CTT	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008598	AAG	2	6	8312	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008598	CTT	2	6	8340	8345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008598	TAA	2	6	8387	8392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008598	GAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008598	TAC	3	9	8538	8546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008598	TGT	2	6	8624	8629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008598	TAA	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008598	ATT	2	6	8746	8751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008598	CAA	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008598	CTG	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445188
108	NC_008598	TAT	2	6	9087	9092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445188
109	NC_008598	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445188
110	NC_008598	TTC	2	6	9226	9231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
111	NC_008598	TTC	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
112	NC_008598	CTT	2	6	9459	9464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
113	NC_008598	AGA	2	6	9622	9627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445189
114	NC_008598	ATG	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445190
115	NC_008598	AAT	2	6	9947	9952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445190
116	NC_008598	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445190
117	NC_008598	TTA	2	6	10144	10149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445190
118	NC_008598	TTC	3	9	10156	10164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445190
119	NC_008598	ACC	2	6	10270	10275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445190
120	NC_008598	TTC	2	6	10400	10405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008598	CCT	2	6	10513	10518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445191
122	NC_008598	ATC	3	9	10779	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445191
123	NC_008598	TGT	2	6	10887	10892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
124	NC_008598	GTT	2	6	10957	10962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
125	NC_008598	TCT	2	6	11026	11031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
126	NC_008598	CTT	2	6	11051	11056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
127	NC_008598	CTG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445192
128	NC_008598	TTG	2	6	11216	11221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008598	CCT	2	6	11246	11251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445193
130	NC_008598	TGC	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445193
131	NC_008598	GTG	2	6	11423	11428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445193
132	NC_008598	TTC	2	6	11444	11449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
133	NC_008598	TAA	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445193
134	NC_008598	TCT	3	9	11632	11640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
135	NC_008598	AGG	2	6	11685	11690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445193
136	NC_008598	CTT	2	6	11702	11707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
137	NC_008598	CTT	2	6	11891	11896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
138	NC_008598	TTC	3	9	11928	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
139	NC_008598	CCT	2	6	11971	11976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445194
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142	NC_008598	TTG	2	6	12184	12189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445194
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145	NC_008598	ATG	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445195
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147	NC_008598	TCA	2	6	12395	12400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445195
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168	NC_008598	GTA	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445198
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255	NC_008598	ATA	2	6	19944	19949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008598	GTT	2	6	19976	19981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_008598	ACA	2	6	20021	20026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008598	ATT	2	6	20206	20211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008598	CGT	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445241
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261	NC_008598	AGA	2	6	20432	20437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445241
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391	NC_008598	TTA	2	6	29926	29931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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