MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TA	3	6	1199	1204	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
2	NC_008598	TA	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
3	NC_008598	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
4	NC_008598	TA	3	6	2766	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
5	NC_008598	CT	3	6	3011	3016	0 %	50 %	0 %	50 %	118445182
6	NC_008598	TA	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	118445182
7	NC_008598	TC	3	6	4231	4236	0 %	50 %	0 %	50 %	118445183
8	NC_008598	AT	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
9	NC_008598	AT	3	6	4528	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
10	NC_008598	CT	3	6	5972	5977	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
11	NC_008598	TC	3	6	6121	6126	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
12	NC_008598	TC	3	6	9501	9506	0 %	50 %	0 %	50 %	118445188
13	NC_008598	GT	3	6	10221	10226	0 %	50 %	50 %	0 %	118445190
14	NC_008598	TA	3	6	11382	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	118445193
15	NC_008598	CT	3	6	12078	12083	0 %	50 %	0 %	50 %	118445194
16	NC_008598	TC	3	6	12553	12558	0 %	50 %	0 %	50 %	118445196
17	NC_008598	AC	3	6	12627	12632	50 %	0 %	0 %	50 %	118445196
18	NC_008598	CA	3	6	12694	12699	50 %	0 %	0 %	50 %	118445196
19	NC_008598	CA	3	6	12992	12997	50 %	0 %	0 %	50 %	118445197
20	NC_008598	TC	3	6	14514	14519	0 %	50 %	0 %	50 %	118445199
21	NC_008598	AT	3	6	15565	15570	50 %	50 %	0 %	0 %	118445201
22	NC_008598	CT	3	6	15900	15905	0 %	50 %	0 %	50 %	118445201
23	NC_008598	TG	3	6	17202	17207	0 %	50 %	50 %	0 %	118445202
24	NC_008598	AG	3	6	17981	17986	50 %	0 %	50 %	0 %	118445204
25	NC_008598	AT	3	6	18745	18750	50 %	50 %	0 %	0 %	118445205
26	NC_008598	AT	3	6	18839	18844	50 %	50 %	0 %	0 %	118445205
27	NC_008598	CT	3	6	19003	19008	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
28	NC_008598	CT	3	6	19061	19066	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
29	NC_008598	CA	3	6	19258	19263	50 %	0 %	0 %	50 %	118445205
30	NC_008598	CA	3	6	19564	19569	50 %	0 %	0 %	50 %	118445205
31	NC_008598	TC	3	6	19602	19607	0 %	50 %	0 %	50 %	118445205
32	NC_008598	GA	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	118445241
33	NC_008598	AT	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	118445241
34	NC_008598	AT	3	6	22010	22015	50 %	50 %	0 %	0 %	118445207
35	NC_008598	TC	3	6	25167	25172	0 %	50 %	0 %	50 %	118445209
36	NC_008598	AT	3	6	29255	29260	50 %	50 %	0 %	0 %	118445211
37	NC_008598	GT	3	6	29458	29463	0 %	50 %	50 %	0 %	118445211
38	NC_008598	AT	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	118445215
39	NC_008598	TA	3	6	31730	31735	50 %	50 %	0 %	0 %	118445215
40	NC_008598	TC	3	6	32139	32144	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
41	NC_008598	CT	3	6	32950	32955	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
42	NC_008598	CT	3	6	33051	33056	0 %	50 %	0 %	50 %	118445216
43	NC_008598	AT	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	118445219
44	NC_008598	AT	3	6	37761	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	118445222
45	NC_008598	CT	3	6	39171	39176	0 %	50 %	0 %	50 %	118445224
46	NC_008598	AC	3	6	40459	40464	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
47	NC_008598	AT	3	6	40712	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	118445226
48	NC_008598	CA	3	6	40762	40767	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
49	NC_008598	AC	3	6	43619	43624	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
50	NC_008598	AC	3	6	43814	43819	50 %	0 %	0 %	50 %	118445227
51	NC_008598	TG	3	6	43858	43863	0 %	50 %	50 %	0 %	118445227
52	NC_008598	AT	3	6	44079	44084	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
53	NC_008598	TA	3	6	44257	44262	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
54	NC_008598	TA	3	6	44681	44686	50 %	50 %	0 %	0 %	118445228
55	NC_008598	TC	3	6	45233	45238	0 %	50 %	0 %	50 %	118445229
56	NC_008598	TG	3	6	47507	47512	0 %	50 %	50 %	0 %	118445229
57	NC_008598	TG	3	6	48120	48125	0 %	50 %	50 %	0 %	118445231
58	NC_008598	AT	3	6	48531	48536	50 %	50 %	0 %	0 %	118445232
59	NC_008598	TA	3	6	49808	49813	50 %	50 %	0 %	0 %	118445234
60	NC_008598	AG	3	6	50371	50376	50 %	0 %	50 %	0 %	118445235
61	NC_008598	AT	3	6	51614	51619	50 %	50 %	0 %	0 %	118445237
62	NC_008598	AG	3	6	52025	52030	50 %	0 %	50 %	0 %	118445238
63	NC_008598	AT	3	6	52496	52501	50 %	50 %	0 %	0 %	118445238
64	NC_008598	AT	3	6	52933	52938	50 %	50 %	0 %	0 %	118445239
65	NC_008598	CT	3	6	52978	52983	0 %	50 %	0 %	50 %	118445239
66	NC_008598	CG	3	6	53005	53010	0 %	0 %	50 %	50 %	118445239
67	NC_008598	CT	3	6	53224	53229	0 %	50 %	0 %	50 %	118445239
68	NC_008598	TC	3	6	54674	54679	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240
69	NC_008598	TA	3	6	54930	54935	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
70	NC_008598	CT	3	6	55234	55239	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.