MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	A	7	7	250	256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008598	T	6	6	2111	2116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008598	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008598	A	6	6	4108	4113	100 %	0 %	0 %	0 %	118445183
5	NC_008598	A	6	6	4360	4365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008598	A	6	6	4797	4802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008598	T	6	6	5358	5363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008598	C	6	6	5405	5410	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_008598	T	6	6	5792	5797	0 %	100 %	0 %	0 %	118445185
10	NC_008598	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	118445187
11	NC_008598	T	6	6	7683	7688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008598	T	7	7	8197	8203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008598	T	6	6	8479	8484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008598	T	6	6	8486	8491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008598	A	6	6	8861	8866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008598	T	6	6	9911	9916	0 %	100 %	0 %	0 %	118445190
17	NC_008598	T	6	6	11593	11598	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
18	NC_008598	T	6	6	11622	11627	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
19	NC_008598	T	7	7	11678	11684	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
20	NC_008598	T	6	6	11729	11734	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
21	NC_008598	T	6	6	11805	11810	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
22	NC_008598	T	6	6	11908	11913	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
23	NC_008598	T	6	6	12106	12111	0 %	100 %	0 %	0 %	118445194
24	NC_008598	T	7	7	13090	13096	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
25	NC_008598	T	7	7	13390	13396	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
26	NC_008598	T	6	6	13611	13616	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
27	NC_008598	T	7	7	14079	14085	0 %	100 %	0 %	0 %	118445198
28	NC_008598	T	6	6	15036	15041	0 %	100 %	0 %	0 %	118445200
29	NC_008598	T	7	7	17122	17128	0 %	100 %	0 %	0 %	118445202
30	NC_008598	A	6	6	17304	17309	100 %	0 %	0 %	0 %	118445202
31	NC_008598	A	8	8	17374	17381	100 %	0 %	0 %	0 %	118445203
32	NC_008598	T	6	6	17445	17450	0 %	100 %	0 %	0 %	118445203
33	NC_008598	T	6	6	17618	17623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008598	A	7	7	17625	17631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008598	A	6	6	18053	18058	100 %	0 %	0 %	0 %	118445204
36	NC_008598	T	7	7	18102	18108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008598	T	7	7	18464	18470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008598	T	6	6	18573	18578	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
39	NC_008598	A	6	6	18616	18621	100 %	0 %	0 %	0 %	118445205
40	NC_008598	A	6	6	18964	18969	100 %	0 %	0 %	0 %	118445205
41	NC_008598	T	6	6	19152	19157	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
42	NC_008598	T	6	6	19289	19294	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
43	NC_008598	T	6	6	19389	19394	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
44	NC_008598	T	6	6	19770	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
45	NC_008598	T	6	6	19914	19919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008598	T	6	6	19955	19960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008598	A	6	6	20042	20047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008598	T	6	6	20385	20390	0 %	100 %	0 %	0 %	118445241
49	NC_008598	T	7	7	20663	20669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008598	A	6	6	20757	20762	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
51	NC_008598	A	6	6	20850	20855	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
52	NC_008598	A	7	7	20993	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
53	NC_008598	A	6	6	21057	21062	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
54	NC_008598	T	7	7	21884	21890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008598	T	7	7	22053	22059	0 %	100 %	0 %	0 %	118445207
56	NC_008598	A	7	7	22157	22163	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
57	NC_008598	A	6	6	22224	22229	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
58	NC_008598	A	7	7	22518	22524	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
59	NC_008598	A	7	7	22545	22551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008598	T	6	6	22712	22717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008598	T	7	7	22903	22909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008598	T	6	6	23165	23170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008598	A	7	7	23174	23180	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
64	NC_008598	A	7	7	23413	23419	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
65	NC_008598	A	6	6	23441	23446	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
66	NC_008598	A	6	6	23529	23534	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
67	NC_008598	A	6	6	23955	23960	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
68	NC_008598	A	10	10	24129	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
69	NC_008598	T	6	6	24165	24170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008598	T	6	6	24457	24462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008598	T	6	6	24824	24829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008598	T	6	6	24859	24864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008598	T	6	6	24991	24996	0 %	100 %	0 %	0 %	118445209
74	NC_008598	T	6	6	25363	25368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008598	A	6	6	25572	25577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008598	T	6	6	25744	25749	0 %	100 %	0 %	0 %	118445210
77	NC_008598	A	6	6	25787	25792	100 %	0 %	0 %	0 %	118445210
78	NC_008598	T	6	6	26796	26801	0 %	100 %	0 %	0 %	118445210
79	NC_008598	C	6	6	26986	26991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_008598	A	7	7	27355	27361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008598	A	6	6	27869	27874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008598	T	7	7	28016	28022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008598	A	7	7	28431	28437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008598	A	6	6	29011	29016	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
85	NC_008598	A	6	6	29231	29236	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
86	NC_008598	A	6	6	29443	29448	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
87	NC_008598	A	6	6	29624	29629	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
88	NC_008598	A	6	6	29636	29641	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
89	NC_008598	A	6	6	29649	29654	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
90	NC_008598	A	9	9	29840	29848	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
91	NC_008598	A	6	6	30056	30061	100 %	0 %	0 %	0 %	118445213
92	NC_008598	A	6	6	30348	30353	100 %	0 %	0 %	0 %	118445214
93	NC_008598	A	6	6	30428	30433	100 %	0 %	0 %	0 %	118445214
94	NC_008598	A	7	7	30736	30742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008598	A	6	6	30761	30766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008598	A	6	6	30927	30932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008598	A	7	7	32051	32057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008598	A	6	6	32096	32101	100 %	0 %	0 %	0 %	118445216
99	NC_008598	A	7	7	32441	32447	100 %	0 %	0 %	0 %	118445216
100	NC_008598	T	6	6	32527	32532	0 %	100 %	0 %	0 %	118445216
101	NC_008598	G	6	6	33284	33289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008598	T	6	6	33373	33378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008598	A	7	7	34076	34082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008598	T	7	7	34101	34107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008598	A	6	6	34392	34397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008598	T	6	6	34404	34409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008598	T	6	6	34470	34475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008598	T	6	6	34805	34810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008598	A	7	7	34811	34817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008598	T	6	6	35897	35902	0 %	100 %	0 %	0 %	118445219
111	NC_008598	T	6	6	36367	36372	0 %	100 %	0 %	0 %	118445220
112	NC_008598	T	7	7	36612	36618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008598	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
114	NC_008598	A	6	6	37446	37451	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
115	NC_008598	A	6	6	37947	37952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008598	T	7	7	37972	37978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008598	A	7	7	38077	38083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008598	T	6	6	38102	38107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008598	A	6	6	39419	39424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008598	A	6	6	39426	39431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008598	T	6	6	39672	39677	0 %	100 %	0 %	0 %	118445225
122	NC_008598	T	6	6	43144	43149	0 %	100 %	0 %	0 %	118445227
123	NC_008598	A	6	6	44022	44027	100 %	0 %	0 %	0 %	118445228
124	NC_008598	A	6	6	45798	45803	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
125	NC_008598	A	7	7	46217	46223	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
126	NC_008598	T	6	6	47586	47591	0 %	100 %	0 %	0 %	118445230
127	NC_008598	T	6	6	47980	47985	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
128	NC_008598	T	6	6	48213	48218	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
129	NC_008598	A	6	6	49039	49044	100 %	0 %	0 %	0 %	118445233
130	NC_008598	T	6	6	51012	51017	0 %	100 %	0 %	0 %	118445237
131	NC_008598	T	6	6	51721	51726	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
132	NC_008598	T	6	6	51786	51791	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
133	NC_008598	A	6	6	52276	52281	100 %	0 %	0 %	0 %	118445238
134	NC_008598	T	6	6	52810	52815	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
135	NC_008598	T	6	6	53585	53590	0 %	100 %	0 %	0 %	118445239

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.