MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	A	6	6	4108	4113	100 %	0 %	0 %	0 %	118445183
2	NC_008598	T	6	6	5792	5797	0 %	100 %	0 %	0 %	118445185
3	NC_008598	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	118445187
4	NC_008598	T	6	6	9911	9916	0 %	100 %	0 %	0 %	118445190
5	NC_008598	T	6	6	11593	11598	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
6	NC_008598	T	6	6	11622	11627	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
7	NC_008598	T	7	7	11678	11684	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
8	NC_008598	T	6	6	11729	11734	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
9	NC_008598	T	6	6	11805	11810	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
10	NC_008598	T	6	6	11908	11913	0 %	100 %	0 %	0 %	118445193
11	NC_008598	T	6	6	12106	12111	0 %	100 %	0 %	0 %	118445194
12	NC_008598	T	7	7	13090	13096	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
13	NC_008598	T	7	7	13390	13396	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
14	NC_008598	T	6	6	13611	13616	0 %	100 %	0 %	0 %	118445197
15	NC_008598	T	7	7	14079	14085	0 %	100 %	0 %	0 %	118445198
16	NC_008598	T	6	6	15036	15041	0 %	100 %	0 %	0 %	118445200
17	NC_008598	T	7	7	17122	17128	0 %	100 %	0 %	0 %	118445202
18	NC_008598	A	6	6	17304	17309	100 %	0 %	0 %	0 %	118445202
19	NC_008598	A	8	8	17374	17381	100 %	0 %	0 %	0 %	118445203
20	NC_008598	T	6	6	17445	17450	0 %	100 %	0 %	0 %	118445203
21	NC_008598	A	6	6	18053	18058	100 %	0 %	0 %	0 %	118445204
22	NC_008598	T	6	6	18573	18578	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
23	NC_008598	A	6	6	18616	18621	100 %	0 %	0 %	0 %	118445205
24	NC_008598	A	6	6	18964	18969	100 %	0 %	0 %	0 %	118445205
25	NC_008598	T	6	6	19152	19157	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
26	NC_008598	T	6	6	19289	19294	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
27	NC_008598	T	6	6	19389	19394	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
28	NC_008598	T	6	6	19770	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	118445205
29	NC_008598	T	6	6	20385	20390	0 %	100 %	0 %	0 %	118445241
30	NC_008598	A	6	6	20757	20762	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
31	NC_008598	A	6	6	20850	20855	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
32	NC_008598	A	7	7	20993	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
33	NC_008598	A	6	6	21057	21062	100 %	0 %	0 %	0 %	118445206
34	NC_008598	T	7	7	22053	22059	0 %	100 %	0 %	0 %	118445207
35	NC_008598	A	7	7	22157	22163	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
36	NC_008598	A	6	6	22224	22229	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
37	NC_008598	A	7	7	22518	22524	100 %	0 %	0 %	0 %	118445207
38	NC_008598	A	7	7	23174	23180	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
39	NC_008598	A	7	7	23413	23419	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
40	NC_008598	A	6	6	23441	23446	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
41	NC_008598	A	6	6	23529	23534	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
42	NC_008598	A	6	6	23955	23960	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
43	NC_008598	A	10	10	24129	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	118445208
44	NC_008598	T	6	6	24991	24996	0 %	100 %	0 %	0 %	118445209
45	NC_008598	T	6	6	25744	25749	0 %	100 %	0 %	0 %	118445210
46	NC_008598	A	6	6	25787	25792	100 %	0 %	0 %	0 %	118445210
47	NC_008598	T	6	6	26796	26801	0 %	100 %	0 %	0 %	118445210
48	NC_008598	A	6	6	29011	29016	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
49	NC_008598	A	6	6	29231	29236	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
50	NC_008598	A	6	6	29443	29448	100 %	0 %	0 %	0 %	118445211
51	NC_008598	A	6	6	29624	29629	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
52	NC_008598	A	6	6	29636	29641	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
53	NC_008598	A	6	6	29649	29654	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
54	NC_008598	A	9	9	29840	29848	100 %	0 %	0 %	0 %	118445212
55	NC_008598	A	6	6	30056	30061	100 %	0 %	0 %	0 %	118445213
56	NC_008598	A	6	6	30348	30353	100 %	0 %	0 %	0 %	118445214
57	NC_008598	A	6	6	30428	30433	100 %	0 %	0 %	0 %	118445214
58	NC_008598	A	6	6	32096	32101	100 %	0 %	0 %	0 %	118445216
59	NC_008598	A	7	7	32441	32447	100 %	0 %	0 %	0 %	118445216
60	NC_008598	T	6	6	32527	32532	0 %	100 %	0 %	0 %	118445216
61	NC_008598	T	6	6	35897	35902	0 %	100 %	0 %	0 %	118445219
62	NC_008598	T	6	6	36367	36372	0 %	100 %	0 %	0 %	118445220
63	NC_008598	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
64	NC_008598	A	6	6	37446	37451	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
65	NC_008598	T	6	6	39672	39677	0 %	100 %	0 %	0 %	118445225
66	NC_008598	T	6	6	43144	43149	0 %	100 %	0 %	0 %	118445227
67	NC_008598	A	6	6	44022	44027	100 %	0 %	0 %	0 %	118445228
68	NC_008598	A	6	6	45798	45803	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
69	NC_008598	A	7	7	46217	46223	100 %	0 %	0 %	0 %	118445229
70	NC_008598	T	6	6	47586	47591	0 %	100 %	0 %	0 %	118445230
71	NC_008598	T	6	6	47980	47985	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
72	NC_008598	T	6	6	48213	48218	0 %	100 %	0 %	0 %	118445231
73	NC_008598	A	6	6	49039	49044	100 %	0 %	0 %	0 %	118445233
74	NC_008598	T	6	6	51012	51017	0 %	100 %	0 %	0 %	118445237
75	NC_008598	T	6	6	51721	51726	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
76	NC_008598	T	6	6	51786	51791	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
77	NC_008598	A	6	6	52276	52281	100 %	0 %	0 %	0 %	118445238
78	NC_008598	T	6	6	52810	52815	0 %	100 %	0 %	0 %	118445238
79	NC_008598	T	6	6	53585	53590	0 %	100 %	0 %	0 %	118445239

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.