MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	GATCGG	2	12	12374	12385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008596	TGGCAA	2	12	74344	74355	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008596	ATCACG	2	12	107471	107482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008596	TGAGCG	2	12	273010	273021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008596	GGCCGC	2	12	330738	330749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008596	CGGCGA	2	12	381073	381084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008596	GCCAGT	2	12	425217	425228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008596	ACGTCG	2	12	574305	574316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008596	CGGCGA	2	12	574489	574500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008596	ACCTCA	2	12	647939	647950	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008596	CTGTGC	2	12	679131	679142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008596	CGGCGA	2	12	712852	712863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008596	CGGCGT	2	12	712933	712944	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008596	GCTCGC	2	12	735036	735047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008596	TGGTGA	2	12	735421	735432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008596	GATCGG	2	12	782895	782906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008596	TGCCGG	2	12	1038631	1038642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008596	CTGTTC	2	12	1109356	1109367	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008596	GATCGC	2	12	1109376	1109387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008596	GTGCGC	2	12	1112016	1112027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008596	GATCGC	2	12	1151715	1151726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008596	CCAGCG	2	12	1152574	1152585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008596	CGCGGT	2	12	1227440	1227451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008596	CCCAAT	2	12	1307881	1307892	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008596	CCTGTT	2	12	1348516	1348527	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008596	AGCTTC	2	12	1352071	1352082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008596	CGGATT	2	12	1356439	1356450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008596	CGAGAC	2	12	1357047	1357058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008596	TCCACA	2	12	1394665	1394676	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008596	AAGAGC	2	12	1458469	1458480	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008596	CCGGCG	2	12	1481713	1481724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008596	GCAGGA	2	12	1499387	1499398	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008596	ATCACC	2	12	1499406	1499417	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008596	CCAAGA	2	12	1500473	1500484	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008596	GTGTTC	2	12	1510105	1510116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008596	CGCGGG	2	12	1640365	1640376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008596	CTCGTG	2	12	1654546	1654557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008596	GCCGGC	2	12	1680226	1680237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008596	CGCGGC	2	12	1697845	1697856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008596	GGCCTG	2	12	1861337	1861348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008596	CCATCG	2	12	1891185	1891196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008596	TCGATG	2	12	1891615	1891626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008596	GTGGAC	2	12	1892059	1892070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008596	GATCGA	2	12	1902413	1902424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008596	ACCGAG	2	12	1902432	1902443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008596	CACCGC	2	12	1911694	1911705	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008596	TCAACG	2	12	1917963	1917974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008596	CGTCGA	2	12	1918683	1918694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008596	GGAACA	2	12	1923328	1923339	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008596	GTCGGC	2	12	1925102	1925113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008596	GGCGGA	2	12	1928429	1928440	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008596	GCCCGC	2	12	1930806	1930817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008596	CGTGGC	2	12	2011458	2011469	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008596	CGGGCA	2	12	2042551	2042562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008596	CGCGGT	2	12	2056059	2056070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008596	GCGAAG	2	12	2056582	2056593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008596	ATGGTC	2	12	2090010	2090021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008596	AACTGA	2	12	2153177	2153188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008596	ACGTCG	2	12	2162305	2162316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008596	CGTTGC	2	12	2162510	2162521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008596	ACCGAA	2	12	2234514	2234525	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008596	ATCTAC	2	12	2235667	2235678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008596	ATCTGG	2	12	2236568	2236579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008596	GAAGCC	2	12	2236782	2236793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008596	CGCTGA	2	12	2290838	2290849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008596	CGATCT	2	12	2294932	2294943	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008596	CTGTTC	2	12	2402618	2402629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008596	GATCGC	2	12	2402638	2402649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008596	GTGCGC	2	12	2405278	2405289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008596	CGAACT	2	12	2429676	2429687	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008596	GTGGGG	2	12	2430014	2430025	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008596	CAGGTG	2	12	2482880	2482891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008596	GGCCAG	2	12	2599959	2599970	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008596	GCGTCG	2	12	2599972	2599983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008596	ACCTAT	2	12	2632209	2632220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008596	TTCGAG	2	12	2771518	2771529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008596	CCGCAC	2	12	2777035	2777046	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008596	CCCGAC	2	12	2817945	2817956	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008596	GCACCG	2	12	2818069	2818080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008596	TGGGCA	2	12	2827656	2827667	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008596	GCTCTG	2	12	2866613	2866624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008596	TGTCGG	2	12	2870991	2871002	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008596	GGCGCC	2	12	2877173	2877184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008596	AGCGGC	2	12	2879285	2879296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008596	GGCGAG	2	12	2959207	2959218	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008596	CCGCAC	2	12	2966284	2966295	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008596	GACAAG	2	12	2967682	2967693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008596	GGCCGG	2	12	3030950	3030961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008596	TTCCGC	2	12	3048957	3048968	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008596	AGACCG	2	12	3053783	3053794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008596	CGCGGT	2	12	3155382	3155393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008596	GGGAGG	2	12	3169889	3169900	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008596	ACTTGC	2	12	3179648	3179659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008596	GTGATT	2	12	3189399	3189410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008596	ACGCGA	2	12	3252952	3252963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008596	TCGGTG	2	12	3312287	3312298	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008596	GATCCG	2	12	3378241	3378252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008596	GGTGGG	2	12	3411003	3411014	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008596	TCGGGT	2	12	3416025	3416036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008596	CGAACT	2	12	3470864	3470875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008596	CATCCA	2	12	3485740	3485751	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008596	ACGTTC	2	12	3495557	3495568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008596	ATGTCG	2	12	3565258	3565269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008596	CGGGCG	2	12	3578153	3578164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008596	CCTTGA	2	12	3691277	3691288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008596	CGCAAC	2	12	3741036	3741047	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008596	GCCTCC	2	12	3745845	3745856	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008596	CGGTTG	2	12	3766661	3766672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008596	GTCCTC	2	12	3814200	3814211	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008596	CACGGC	2	12	3814992	3815003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008596	TGCCGG	2	12	3815749	3815760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008596	CGCCGA	2	12	3828309	3828320	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008596	GTCGCG	2	12	3849013	3849024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008596	CGGCGA	2	12	3849276	3849287	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008596	TGGCAA	2	12	3929190	3929201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008596	TCGCGG	2	12	3961848	3961859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008596	TGCCCT	2	12	3981559	3981570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008596	CGGGCC	2	12	3986919	3986930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008596	CCGGGC	2	12	4001301	4001312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008596	GCCCCG	2	12	4041715	4041726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008596	GTTGGC	2	12	4041801	4041812	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008596	GTCGAG	2	12	4041846	4041857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008596	CGACGT	2	12	4042740	4042751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008596	TCAATA	2	12	4054857	4054868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008596	GGGTGG	2	12	4132865	4132876	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008596	CCCAGA	2	12	4154664	4154675	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008596	GCGCCG	2	12	4214031	4214042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008596	TGCAGA	2	12	4219652	4219663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008596	TCCATA	2	12	4254006	4254017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008596	AGATCG	2	12	4256162	4256173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008596	CGTCCT	2	12	4256349	4256360	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008596	CGTCGA	2	12	4256604	4256615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008596	CGCCCG	2	12	4265179	4265190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008596	CCGGCC	2	12	4368969	4368980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008596	CCCCGG	2	12	4454692	4454703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008596	GGTCCG	2	12	4528055	4528066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008596	TGGACC	2	12	4528157	4528168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008596	GCTCCG	2	12	4657733	4657744	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008596	ACTGCT	2	12	4692653	4692664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008596	GCGATC	2	12	4697813	4697824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008596	TGCCGC	2	12	4700642	4700653	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008596	TGTCGG	2	12	4729346	4729357	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_008596	GTGCTG	2	12	4764477	4764488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_008596	CAACCG	2	12	4825558	4825569	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008596	AATACC	2	12	4877831	4877842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008596	AACAGC	2	12	5046626	5046637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008596	CGATCC	2	12	5058900	5058911	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_008596	ACGATG	2	12	5211744	5211755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_008596	CGGCGC	2	12	5388754	5388765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008596	AAATGT	2	12	5415910	5415921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008596	GGCATC	2	12	5417775	5417786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008596	TCGGCC	2	12	5418773	5418784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_008596	TCGCAG	2	12	5459324	5459335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.