MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	GGTTA	2	10	10390	10399	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008596	GCCCC	2	10	45181	45190	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_008596	TGGCG	2	10	58608	58617	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008596	TCGGC	2	10	96375	96384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008596	GCCGA	2	10	99145	99154	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008596	CGGCG	2	10	114414	114423	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008596	CCATT	2	10	120079	120088	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008596	GTCAG	2	10	125888	125897	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008596	TGTGT	2	10	224792	224801	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008596	CGCAG	2	10	253508	253517	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008596	CCGGC	2	10	261337	261346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008596	CGTGG	2	10	269408	269417	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008596	GCAAG	2	10	273919	273928	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008596	CTGAA	2	10	287663	287672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008596	CCGGT	2	10	355904	355913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_008596	GATCG	2	10	377347	377356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008596	TGGGC	2	10	381833	381842	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008596	CTGAC	2	10	385135	385144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008596	CGCAA	2	10	444942	444951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008596	CCAAC	2	10	470406	470415	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008596	TGTCG	2	10	504989	504998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008596	CCGGT	2	10	551182	551191	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008596	CGCTG	2	10	572915	572924	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008596	GGCGT	2	10	600766	600775	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008596	GTAAC	2	10	619673	619682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008596	AACCG	2	10	623618	623627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008596	CCGGA	2	10	636370	636379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008596	CCTGG	2	10	655284	655293	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008596	TGCAC	2	10	657610	657619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008596	CGGCG	2	10	678609	678618	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008596	CGTGA	2	10	681642	681651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008596	TCGCC	2	10	712309	712318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_008596	CTGCG	2	10	727532	727541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_008596	CGGCG	2	10	734808	734817	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008596	TTGCG	2	10	735538	735547	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008596	ACGGC	2	10	747601	747610	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008596	CCGCA	2	10	756657	756666	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_008596	GATGC	2	10	781987	781996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008596	TCGCC	2	10	782438	782447	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008596	ACGAC	2	10	783209	783218	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008596	CGTCG	2	10	783234	783243	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_008596	GGCAG	2	10	815619	815628	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008596	GCGTT	2	10	855543	855552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008596	CAGAC	2	10	864539	864548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008596	GGTGT	2	10	882900	882909	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008596	CGACG	2	10	885021	885030	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008596	CCGCT	2	10	926004	926013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_008596	ACCGT	2	10	926111	926120	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008596	GACGG	2	10	933738	933747	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008596	GCGTC	2	10	975573	975582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008596	CGCGG	2	10	979973	979982	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008596	ACGCG	2	10	1003877	1003886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008596	CGGCC	2	10	1005334	1005343	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_008596	CGGCC	2	10	1019310	1019319	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_008596	GGTAA	2	10	1024538	1024547	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008596	CGGAC	2	10	1036300	1036309	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008596	GCCAC	2	10	1037451	1037460	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_008596	TCCGA	2	10	1040080	1040089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_008596	GCGCG	2	10	1040525	1040534	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_008596	CGCTA	2	10	1059905	1059914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008596	CGGCG	2	10	1074770	1074779	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008596	CCGAA	2	10	1074799	1074808	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008596	GACAC	2	10	1086792	1086801	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008596	CTCGT	2	10	1097228	1097237	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008596	GCACG	2	10	1109229	1109238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008596	CTTTT	2	10	1111999	1112008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008596	CGTCA	2	10	1151367	1151376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_008596	AGAAA	2	10	1197475	1197484	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008596	TCCCG	2	10	1213963	1213972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_008596	GGGCC	2	10	1227124	1227133	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008596	GGCGT	2	10	1227544	1227553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008596	CCTCT	2	10	1228291	1228300	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_008596	CGATC	2	10	1229994	1230003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008596	GCTGC	2	10	1238537	1238546	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008596	AATGG	2	10	1259314	1259323	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008596	GCGCT	2	10	1259493	1259502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008596	CCGAG	2	10	1275919	1275928	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008596	GCCAC	2	10	1281954	1281963	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_008596	GAACG	2	10	1290395	1290404	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008596	GAGCC	2	10	1299245	1299254	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008596	GGTCG	2	10	1307437	1307446	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008596	CCGCG	2	10	1307846	1307855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_008596	CGACA	2	10	1311619	1311628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_008596	AGGAG	2	10	1350132	1350141	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008596	GAATC	2	10	1351761	1351770	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008596	CCACG	2	10	1351990	1351999	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008596	ATGGC	2	10	1353243	1353252	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008596	CGACG	2	10	1353393	1353402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008596	AGCGC	2	10	1353450	1353459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008596	CGACA	2	10	1419568	1419577	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008596	TTCCG	2	10	1437874	1437883	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_008596	GACTC	2	10	1443757	1443766	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_008596	GCCGT	2	10	1447527	1447536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_008596	TGGTG	2	10	1447929	1447938	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008596	GCCCG	2	10	1448208	1448217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_008596	GGCCG	2	10	1460945	1460954	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008596	CGGCC	2	10	1460958	1460967	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_008596	CACCT	2	10	1461468	1461477	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_008596	CACCT	2	10	1480488	1480497	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_008596	CACCT	2	10	1480520	1480529	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008596	CCCGA	2	10	1493991	1494000	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_008596	CCAGA	2	10	1496011	1496020	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008596	CCGGG	2	10	1496101	1496110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_008596	ACGCG	2	10	1502707	1502716	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008596	TGCGG	2	10	1508364	1508373	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008596	CGCGG	2	10	1561701	1561710	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008596	CCGGT	2	10	1561738	1561747	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008596	GCGCG	2	10	1563383	1563392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008596	AGCGG	2	10	1577315	1577324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008596	TCCTG	2	10	1588528	1588537	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008596	ACGAA	2	10	1611567	1611576	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008596	GAACC	2	10	1629517	1629526	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008596	CGGCG	2	10	1639121	1639130	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008596	TGAGC	2	10	1639834	1639843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008596	CGGCT	2	10	1645771	1645780	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008596	ACCGG	2	10	1649540	1649549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008596	TCGGC	2	10	1650922	1650931	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008596	CCGAG	2	10	1706329	1706338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008596	CCCAG	2	10	1720453	1720462	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008596	GACGG	2	10	1726650	1726659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008596	CTTGC	2	10	1748272	1748281	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008596	TGTGG	2	10	1760932	1760941	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008596	TGCCG	2	10	1768702	1768711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_008596	GCGCA	2	10	1813015	1813024	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_008596	ACCCG	2	10	1813279	1813288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_008596	GCCGT	2	10	1815399	1815408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008596	CCTTC	2	10	1817818	1817827	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_008596	TGAGT	2	10	1819173	1819182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008596	TGCCG	2	10	1822604	1822613	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_008596	TCACG	2	10	1822826	1822835	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008596	TCGAC	2	10	1822962	1822971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008596	GCCGC	2	10	1823144	1823153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_008596	CCGGC	2	10	1829011	1829020	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_008596	GGTGC	2	10	1857082	1857091	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008596	GAAAG	2	10	1858479	1858488	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008596	CCCTT	2	10	1862048	1862057	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_008596	CGATG	2	10	1862068	1862077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008596	GTCAC	2	10	1870808	1870817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_008596	CAGCC	2	10	1874501	1874510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_008596	GGCTT	2	10	1895855	1895864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008596	AGTCA	2	10	1914763	1914772	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008596	CGGTT	2	10	1919321	1919330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008596	CCGGC	2	10	1922095	1922104	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_008596	ACTCA	2	10	1940062	1940071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008596	TCGGC	2	10	1940403	1940412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_008596	ACTCA	2	10	1942107	1942116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_008596	CGGCG	2	10	1943029	1943038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_008596	GGTGA	2	10	2162149	2162158	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_008596	CGTCG	2	10	2222351	2222360	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_008596	CTGAT	2	10	2234713	2234722	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_008596	CGGCA	2	10	2522722	2522731	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_008596	GCGCA	2	10	2593169	2593178	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_008596	CGGTT	2	10	2740556	2740565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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204	NC_008596	TGCGC	2	10	2815553	2815562	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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254	NC_008596	CGCAT	2	10	3411530	3411539	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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257	NC_008596	CTCGC	2	10	3442052	3442061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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260	NC_008596	GCCGC	2	10	3471237	3471246	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
261	NC_008596	TCTCT	2	10	3499972	3499981	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_008596	TCGGC	2	10	3502210	3502219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_008596	CGAAC	2	10	3506135	3506144	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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265	NC_008596	CAGGT	2	10	3511306	3511315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_008596	AACAC	2	10	3515502	3515511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
267	NC_008596	CGGTT	2	10	3530988	3530997	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_008596	CACTG	2	10	3565938	3565947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_008596	GCCGC	2	10	3623282	3623291	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
271	NC_008596	AGGTG	2	10	3623928	3623937	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
272	NC_008596	TGCCT	2	10	3626855	3626864	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_008596	CCGCG	2	10	3629353	3629362	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_008596	TTTGC	2	10	3641690	3641699	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_008596	CTTCG	2	10	3668705	3668714	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
276	NC_008596	TTTCC	2	10	3669764	3669773	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
277	NC_008596	GGCTC	2	10	3680091	3680100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
278	NC_008596	GTTAG	2	10	3691197	3691206	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
279	NC_008596	GCTGT	2	10	3712406	3712415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_008596	TCGCG	2	10	3747275	3747284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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417	NC_008596	GACCG	2	10	5411312	5411321	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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472	NC_008596	CTGGT	2	10	6086053	6086062	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_008596	CCGGC	2	10	6529611	6529620	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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