MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 5476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	GGCTG	2	10	513	522	0 %	20 %	60 %	20 %	118468117
2	NC_008596	CGTGT	2	10	1874	1883	0 %	40 %	40 %	20 %	118471954
3	NC_008596	CGGCG	2	10	3202	3211	0 %	0 %	60 %	40 %	118467917
4	NC_008596	CGCGG	2	10	3892	3901	0 %	0 %	60 %	40 %	118470893
5	NC_008596	CGGCC	2	10	3939	3948	0 %	0 %	40 %	60 %	118470893
6	NC_008596	TGGTC	2	10	5355	5364	0 %	40 %	40 %	20 %	118470567
7	NC_008596	AGGCG	2	10	6674	6683	20 %	0 %	60 %	20 %	118467811
8	NC_008596	GCAGC	2	10	6722	6731	20 %	0 %	40 %	40 %	118467811
9	NC_008596	CCAGT	2	10	7562	7571	20 %	20 %	20 %	40 %	118467811
10	NC_008596	TGGTC	2	10	7826	7835	0 %	40 %	40 %	20 %	118467811
11	NC_008596	CGGTG	2	10	8630	8639	0 %	20 %	60 %	20 %	118467811
12	NC_008596	GGTCC	2	10	9544	9553	0 %	20 %	40 %	40 %	118470742
13	NC_008596	CCCGG	2	10	10658	10667	0 %	0 %	40 %	60 %	118470556
14	NC_008596	CGCGC	2	10	11245	11254	0 %	0 %	40 %	60 %	118467909
15	NC_008596	CGCGC	2	10	14928	14937	0 %	0 %	40 %	60 %	118470693
16	NC_008596	GTCGA	2	10	15831	15840	20 %	20 %	40 %	20 %	118472346
17	NC_008596	CGCAA	2	10	16557	16566	40 %	0 %	20 %	40 %	118472346
18	NC_008596	CGCGG	2	10	16837	16846	0 %	0 %	60 %	40 %	118472346
19	NC_008596	GTCGA	2	10	17894	17903	20 %	20 %	40 %	20 %	118472884
20	NC_008596	CCCGG	2	10	18251	18260	0 %	0 %	40 %	60 %	118472884
21	NC_008596	CGGCC	2	10	20023	20032	0 %	0 %	40 %	60 %	118470215
22	NC_008596	GGCCG	2	10	21386	21395	0 %	0 %	60 %	40 %	118470215
23	NC_008596	GCCGC	2	10	22001	22010	0 %	0 %	40 %	60 %	118470215
24	NC_008596	CCGCA	2	10	23628	23637	20 %	0 %	20 %	60 %	118470215
25	NC_008596	CGCAC	2	10	25960	25969	20 %	0 %	20 %	60 %	118470215
26	NC_008596	GGCGC	2	10	26972	26981	0 %	0 %	60 %	40 %	118470215
27	NC_008596	CTGGC	2	10	29912	29921	0 %	20 %	40 %	40 %	118470215
28	NC_008596	CCGCA	2	10	30561	30570	20 %	0 %	20 %	60 %	118470215
29	NC_008596	CGGCA	2	10	30630	30639	20 %	0 %	40 %	40 %	118470215
30	NC_008596	CGCTG	2	10	31894	31903	0 %	20 %	40 %	40 %	118470215
31	NC_008596	CCGCG	2	10	32866	32875	0 %	0 %	40 %	60 %	118470215
32	NC_008596	CGGGG	2	10	35087	35096	0 %	0 %	80 %	20 %	118470215
33	NC_008596	CCGAC	2	10	35247	35256	20 %	0 %	20 %	60 %	118470215
34	NC_008596	CGCAC	3	15	35503	35517	20 %	0 %	20 %	60 %	118470215
35	NC_008596	CGGCG	2	10	36190	36199	0 %	0 %	60 %	40 %	118470215
36	NC_008596	CGGGC	2	10	37497	37506	0 %	0 %	60 %	40 %	118470215
37	NC_008596	CGCGG	2	10	39913	39922	0 %	0 %	60 %	40 %	118470215
38	NC_008596	CCGGT	2	10	41066	41075	0 %	20 %	40 %	40 %	118470215
39	NC_008596	CGACG	2	10	41434	41443	20 %	0 %	40 %	40 %	118470215
40	NC_008596	CAACC	2	10	43611	43620	40 %	0 %	0 %	60 %	118471393
41	NC_008596	GTCAG	2	10	46411	46420	20 %	20 %	40 %	20 %	118471515
42	NC_008596	CCAGC	2	10	46802	46811	20 %	0 %	20 %	60 %	118469202
43	NC_008596	CGGGC	2	10	47734	47743	0 %	0 %	60 %	40 %	118467576
44	NC_008596	GGCGT	2	10	47840	47849	0 %	20 %	60 %	20 %	118467576
45	NC_008596	CCAGC	2	10	48348	48357	20 %	0 %	20 %	60 %	118471844
46	NC_008596	GCCTG	2	10	48773	48782	0 %	20 %	40 %	40 %	118471844
47	NC_008596	CGGCG	2	10	50840	50849	0 %	0 %	60 %	40 %	118472918
48	NC_008596	AAGTG	2	10	53516	53525	40 %	20 %	40 %	0 %	118468873
49	NC_008596	GGGGC	2	10	53597	53606	0 %	0 %	80 %	20 %	118468873
50	NC_008596	CAGCC	2	10	54737	54746	20 %	0 %	20 %	60 %	118470123
51	NC_008596	TGGCG	2	10	55978	55987	0 %	20 %	60 %	20 %	118472708
52	NC_008596	AGGTC	2	10	57643	57652	20 %	20 %	40 %	20 %	118471786
53	NC_008596	GGTCG	2	10	59062	59071	0 %	20 %	60 %	20 %	118469688
54	NC_008596	GAGCT	2	10	61944	61953	20 %	20 %	40 %	20 %	118470024
55	NC_008596	ACCGC	2	10	62271	62280	20 %	0 %	20 %	60 %	118470024
56	NC_008596	TGCGC	2	10	63218	63227	0 %	20 %	40 %	40 %	118470024
57	NC_008596	ACCGC	3	15	64345	64359	20 %	0 %	20 %	60 %	118469427
58	NC_008596	CGGCG	2	10	64428	64437	0 %	0 %	60 %	40 %	118469427
59	NC_008596	GGCGC	2	10	65953	65962	0 %	0 %	60 %	40 %	118469427
60	NC_008596	CCGTT	2	10	66622	66631	0 %	40 %	20 %	40 %	118468267
61	NC_008596	ATCGC	2	10	68655	68664	20 %	20 %	20 %	40 %	118471734
62	NC_008596	GGGGC	2	10	68813	68822	0 %	0 %	80 %	20 %	118468908
63	NC_008596	CCGCG	2	10	69089	69098	0 %	0 %	40 %	60 %	118468908
64	NC_008596	CGTCG	2	10	69123	69132	0 %	20 %	40 %	40 %	118468908
65	NC_008596	GGTCC	2	10	69594	69603	0 %	20 %	40 %	40 %	118468908
66	NC_008596	GCCCC	2	10	71193	71202	0 %	0 %	20 %	80 %	118467671
67	NC_008596	CGCTG	2	10	71680	71689	0 %	20 %	40 %	40 %	118467671
68	NC_008596	GCGCC	2	10	73297	73306	0 %	0 %	40 %	60 %	118471679
69	NC_008596	GGCAG	2	10	74839	74848	20 %	0 %	60 %	20 %	118469229
70	NC_008596	GCCGC	2	10	75192	75201	0 %	0 %	40 %	60 %	118469229
71	NC_008596	GCTCG	2	10	75646	75655	0 %	20 %	40 %	40 %	118469229
72	NC_008596	GCACC	2	10	75891	75900	20 %	0 %	20 %	60 %	118469229
73	NC_008596	CCGCG	2	10	77237	77246	0 %	0 %	40 %	60 %	118472873
74	NC_008596	GGCGC	2	10	78562	78571	0 %	0 %	60 %	40 %	118472323
75	NC_008596	ACCTC	2	10	79948	79957	20 %	20 %	0 %	60 %	118470512
76	NC_008596	TCGGT	2	10	80446	80455	0 %	40 %	40 %	20 %	118470512
77	NC_008596	ATCCG	2	10	80474	80483	20 %	20 %	20 %	40 %	118470512
78	NC_008596	GTGCT	2	10	80682	80691	0 %	40 %	40 %	20 %	118470512
79	NC_008596	ACCCC	2	10	83421	83430	20 %	0 %	0 %	80 %	118469179
80	NC_008596	GCCGC	2	10	83500	83509	0 %	0 %	40 %	60 %	118469179
81	NC_008596	CCGGT	2	10	84547	84556	0 %	20 %	40 %	40 %	118469179
82	NC_008596	CCGGC	2	10	85668	85677	0 %	0 %	40 %	60 %	118468579
83	NC_008596	CCGCG	2	10	86664	86673	0 %	0 %	40 %	60 %	118468579
84	NC_008596	GCCCG	2	10	88109	88118	0 %	0 %	40 %	60 %	118472342
85	NC_008596	CTCGG	2	10	88470	88479	0 %	20 %	40 %	40 %	118472342
86	NC_008596	TTGTG	2	10	91864	91873	0 %	60 %	40 %	0 %	118468706
87	NC_008596	CCCAC	2	10	94434	94443	20 %	0 %	0 %	80 %	118467650
88	NC_008596	GCCGC	2	10	94479	94488	0 %	0 %	40 %	60 %	118467650
89	NC_008596	GCGAC	2	10	99880	99889	20 %	0 %	40 %	40 %	118474029
90	NC_008596	CCGCG	2	10	100010	100019	0 %	0 %	40 %	60 %	118474029
91	NC_008596	CCATC	2	10	100150	100159	20 %	20 %	0 %	60 %	118474029
92	NC_008596	GCGGA	2	10	104841	104850	20 %	0 %	60 %	20 %	118468438
93	NC_008596	GCCGA	2	10	104961	104970	20 %	0 %	40 %	40 %	118468438
94	NC_008596	GTGAG	2	10	106404	106413	20 %	20 %	60 %	0 %	118467898
95	NC_008596	GCTGG	2	10	106465	106474	0 %	20 %	60 %	20 %	118467898
96	NC_008596	CAGCG	2	10	108422	108431	20 %	0 %	40 %	40 %	118468259
97	NC_008596	CACGC	2	10	109230	109239	20 %	0 %	20 %	60 %	118468259
98	NC_008596	TCGGC	2	10	109351	109360	0 %	20 %	40 %	40 %	118468259
99	NC_008596	CGGCG	2	10	109535	109544	0 %	0 %	60 %	40 %	118468259
100	NC_008596	GGCCG	2	10	109562	109571	0 %	0 %	60 %	40 %	118468259
101	NC_008596	GCACC	2	10	110112	110121	20 %	0 %	20 %	60 %	118472636
102	NC_008596	CGGCA	2	10	110354	110363	20 %	0 %	40 %	40 %	118472636
103	NC_008596	CGCTG	2	10	113345	113354	0 %	20 %	40 %	40 %	118473073
104	NC_008596	ATCCG	2	10	114145	114154	20 %	20 %	20 %	40 %	118472785
105	NC_008596	GCGCT	2	10	115750	115759	0 %	20 %	40 %	40 %	118471193
106	NC_008596	TCGGA	2	10	116623	116632	20 %	20 %	40 %	20 %	118471952
107	NC_008596	TGCTC	2	10	116716	116725	0 %	40 %	20 %	40 %	118471952
108	NC_008596	CCGCG	2	10	119855	119864	0 %	0 %	40 %	60 %	118467600
109	NC_008596	GCTCA	2	10	124530	124539	20 %	20 %	20 %	40 %	118470992
110	NC_008596	GCCGG	2	10	124557	124566	0 %	0 %	60 %	40 %	118470992
111	NC_008596	CAGCT	2	10	128002	128011	20 %	20 %	20 %	40 %	118467624
112	NC_008596	CGTGA	2	10	128468	128477	20 %	20 %	40 %	20 %	118471878
113	NC_008596	CCGCA	2	10	131465	131474	20 %	0 %	20 %	60 %	118473313
114	NC_008596	GCGTC	2	10	131787	131796	0 %	20 %	40 %	40 %	118468177
115	NC_008596	GCGCG	2	10	134913	134922	0 %	0 %	60 %	40 %	118472776
116	NC_008596	GCCGA	2	10	135535	135544	20 %	0 %	40 %	40 %	118472776
117	NC_008596	GCCGC	2	10	138777	138786	0 %	0 %	40 %	60 %	118472450
118	NC_008596	GGCCG	2	10	138846	138855	0 %	0 %	60 %	40 %	118468961
119	NC_008596	CGACG	2	10	139811	139820	20 %	0 %	40 %	40 %	118469225
120	NC_008596	GATCG	2	10	140431	140440	20 %	20 %	40 %	20 %	118472845
121	NC_008596	ACACC	2	10	141287	141296	40 %	0 %	0 %	60 %	118473955
122	NC_008596	TCCCG	2	10	143211	143220	0 %	20 %	20 %	60 %	118469452
123	NC_008596	CGGCC	2	10	145180	145189	0 %	0 %	40 %	60 %	118468057
124	NC_008596	GCAGG	2	10	145369	145378	20 %	0 %	60 %	20 %	118468057
125	NC_008596	CGCAC	2	10	148409	148418	20 %	0 %	20 %	60 %	118467830
126	NC_008596	CGGAC	2	10	150274	150283	20 %	0 %	40 %	40 %	118473269
127	NC_008596	CGCGG	2	10	151084	151093	0 %	0 %	60 %	40 %	118468175
128	NC_008596	GACGC	2	10	151675	151684	20 %	0 %	40 %	40 %	118470372
129	NC_008596	CCGCT	2	10	154798	154807	0 %	20 %	20 %	60 %	118472305
130	NC_008596	GCGCG	2	10	155612	155621	0 %	0 %	60 %	40 %	118472305
131	NC_008596	CCGAT	2	10	156699	156708	20 %	20 %	20 %	40 %	118468987
132	NC_008596	CGGTG	2	10	159012	159021	0 %	20 %	60 %	20 %	118471615
133	NC_008596	GCCCG	2	10	160068	160077	0 %	0 %	40 %	60 %	118471615
134	NC_008596	CGACG	2	10	161718	161727	20 %	0 %	40 %	40 %	118473635
135	NC_008596	ACCTC	2	10	161771	161780	20 %	20 %	0 %	60 %	118473635
136	NC_008596	ACCGC	2	10	162796	162805	20 %	0 %	20 %	60 %	118473635
137	NC_008596	CAACC	2	10	162835	162844	40 %	0 %	0 %	60 %	118473635
138	NC_008596	TGCGC	2	10	163107	163116	0 %	20 %	40 %	40 %	118473174
139	NC_008596	GCGTT	2	10	163158	163167	0 %	40 %	40 %	20 %	118473174
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144	NC_008596	GCCGG	2	10	172473	172482	0 %	0 %	60 %	40 %	118470952
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150	NC_008596	TCGCG	2	10	176288	176297	0 %	20 %	40 %	40 %	118472907
151	NC_008596	TCGAT	2	10	177417	177426	20 %	40 %	20 %	20 %	118467787
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262	NC_008596	GTCGG	2	10	323132	323141	0 %	20 %	60 %	20 %	118473602
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