MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 16645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	TGCC	2	8	33	40	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008596	CGAT	2	8	345	352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008596	CTGC	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	118468117
4	NC_008596	GACC	2	8	1032	1039	25 %	0 %	25 %	50 %	118468117
5	NC_008596	ACGG	2	8	1147	1154	25 %	0 %	50 %	25 %	118468117
6	NC_008596	GTCG	2	8	1188	1195	0 %	25 %	50 %	25 %	118468117
7	NC_008596	CGGC	2	8	1588	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	118468117
8	NC_008596	CGCA	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	118471954
9	NC_008596	GGTG	2	8	2194	2201	0 %	25 %	75 %	0 %	118471954
10	NC_008596	GCCA	2	8	3497	3504	25 %	0 %	25 %	50 %	118467917
11	NC_008596	CGAC	2	8	5135	5142	25 %	0 %	25 %	50 %	118470567
12	NC_008596	TCGT	2	8	5734	5741	0 %	50 %	25 %	25 %	118470567
13	NC_008596	CGAC	2	8	5885	5892	25 %	0 %	25 %	50 %	118470567
14	NC_008596	GATT	2	8	6639	6646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008596	TCCG	2	8	6841	6848	0 %	25 %	25 %	50 %	118467811
16	NC_008596	ACTC	2	8	7049	7056	25 %	25 %	0 %	50 %	118467811
17	NC_008596	GGAC	2	8	7443	7450	25 %	0 %	50 %	25 %	118467811
18	NC_008596	AACG	2	8	7803	7810	50 %	0 %	25 %	25 %	118467811
19	NC_008596	CGTG	2	8	8084	8091	0 %	25 %	50 %	25 %	118467811
20	NC_008596	GACC	2	8	8240	8247	25 %	0 %	25 %	50 %	118467811
21	NC_008596	CGAC	2	8	8704	8711	25 %	0 %	25 %	50 %	118467811
22	NC_008596	TCGA	2	8	8856	8863	25 %	25 %	25 %	25 %	118467811
23	NC_008596	CCGG	2	8	9270	9277	0 %	0 %	50 %	50 %	118470742
24	NC_008596	CGAG	2	8	9521	9528	25 %	0 %	50 %	25 %	118470742
25	NC_008596	CGTC	2	8	10427	10434	0 %	25 %	25 %	50 %	118470556
26	NC_008596	CACG	2	8	10687	10694	25 %	0 %	25 %	50 %	118470556
27	NC_008596	GAAC	2	8	11034	11041	50 %	0 %	25 %	25 %	118470556
28	NC_008596	GCGA	2	8	11192	11199	25 %	0 %	50 %	25 %	118470556
29	NC_008596	CGCT	2	8	11881	11888	0 %	25 %	25 %	50 %	118467909
30	NC_008596	GGCG	2	8	12665	12672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008596	TGCC	2	8	13413	13420	0 %	25 %	25 %	50 %	118471554
32	NC_008596	CGGG	2	8	13507	13514	0 %	0 %	75 %	25 %	118471554
33	NC_008596	CGGG	2	8	13758	13765	0 %	0 %	75 %	25 %	118471554
34	NC_008596	CGTT	2	8	14499	14506	0 %	50 %	25 %	25 %	118470693
35	NC_008596	GGAA	2	8	15274	15281	50 %	0 %	50 %	0 %	118469728
36	NC_008596	CATC	2	8	16007	16014	25 %	25 %	0 %	50 %	118472346
37	NC_008596	TCGC	2	8	16474	16481	0 %	25 %	25 %	50 %	118472346
38	NC_008596	ATCT	2	8	17405	17412	25 %	50 %	0 %	25 %	118472884
39	NC_008596	GCTG	2	8	17488	17495	0 %	25 %	50 %	25 %	118472884
40	NC_008596	ACCT	2	8	17528	17535	25 %	25 %	0 %	50 %	118472884
41	NC_008596	GGTC	2	8	17653	17660	0 %	25 %	50 %	25 %	118472884
42	NC_008596	CCGG	2	8	18374	18381	0 %	0 %	50 %	50 %	118472884
43	NC_008596	GTGC	2	8	19324	19331	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
44	NC_008596	ACCG	2	8	20621	20628	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
45	NC_008596	CGAT	2	8	21549	21556	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
46	NC_008596	GGCA	2	8	21864	21871	25 %	0 %	50 %	25 %	118470215
47	NC_008596	TCGG	2	8	21928	21935	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
48	NC_008596	GCCC	2	8	22192	22199	0 %	0 %	25 %	75 %	118470215
49	NC_008596	GGAC	2	8	22242	22249	25 %	0 %	50 %	25 %	118470215
50	NC_008596	CGCC	2	8	22621	22628	0 %	0 %	25 %	75 %	118470215
51	NC_008596	CTGC	2	8	24011	24018	0 %	25 %	25 %	50 %	118470215
52	NC_008596	GCAC	2	8	24475	24482	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
53	NC_008596	GGCA	2	8	24604	24611	25 %	0 %	50 %	25 %	118470215
54	NC_008596	ACCG	2	8	25772	25779	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
55	NC_008596	CGAC	2	8	26004	26011	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
56	NC_008596	TCGA	3	12	27010	27021	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
57	NC_008596	ACCG	2	8	27149	27156	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
58	NC_008596	GCAC	2	8	27172	27179	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
59	NC_008596	CACC	2	8	27420	27427	25 %	0 %	0 %	75 %	118470215
60	NC_008596	CTGG	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
61	NC_008596	CCGG	2	8	28419	28426	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
62	NC_008596	ACCG	2	8	28436	28443	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
63	NC_008596	GCCG	2	8	28771	28778	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
64	NC_008596	CGGG	2	8	28988	28995	0 %	0 %	75 %	25 %	118470215
65	NC_008596	CGAC	2	8	30159	30166	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
66	NC_008596	TGCG	2	8	30264	30271	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
67	NC_008596	ACCG	2	8	30611	30618	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
68	NC_008596	ACCG	2	8	30670	30677	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
69	NC_008596	CGGT	2	8	30705	30712	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
70	NC_008596	TCGT	2	8	31196	31203	0 %	50 %	25 %	25 %	118470215
71	NC_008596	CGGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
72	NC_008596	AGGC	2	8	31629	31636	25 %	0 %	50 %	25 %	118470215
73	NC_008596	CACC	2	8	31879	31886	25 %	0 %	0 %	75 %	118470215
74	NC_008596	CCGG	2	8	33275	33282	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
75	NC_008596	CACG	2	8	34206	34213	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
76	NC_008596	TGGC	2	8	35147	35154	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
77	NC_008596	CGGC	2	8	35325	35332	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
78	NC_008596	GGCC	3	12	35422	35433	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
79	NC_008596	TCGA	2	8	35717	35724	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
80	NC_008596	CGGC	2	8	35761	35768	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
81	NC_008596	TCGA	2	8	36149	36156	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
82	NC_008596	GGCC	2	8	36766	36773	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
83	NC_008596	CCCG	2	8	36775	36782	0 %	0 %	25 %	75 %	118470215
84	NC_008596	CCGA	2	8	36875	36882	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
85	NC_008596	CACC	2	8	36927	36934	25 %	0 %	0 %	75 %	118470215
86	NC_008596	GCAT	2	8	37359	37366	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
87	NC_008596	GGCC	2	8	38590	38597	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
88	NC_008596	GGAC	2	8	38838	38845	25 %	0 %	50 %	25 %	118470215
89	NC_008596	CGCC	2	8	39007	39014	0 %	0 %	25 %	75 %	118470215
90	NC_008596	CGGT	2	8	39323	39330	0 %	25 %	50 %	25 %	118470215
91	NC_008596	CCGA	2	8	39436	39443	25 %	0 %	25 %	50 %	118470215
92	NC_008596	GGCC	2	8	39560	39567	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
93	NC_008596	GCCG	2	8	40084	40091	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
94	NC_008596	ATCG	2	8	41005	41012	25 %	25 %	25 %	25 %	118470215
95	NC_008596	CGGC	2	8	41500	41507	0 %	0 %	50 %	50 %	118470215
96	NC_008596	GATG	2	8	41545	41552	25 %	25 %	50 %	0 %	118470215
97	NC_008596	CACC	2	8	41958	41965	25 %	0 %	0 %	75 %	118469059
98	NC_008596	TCGA	2	8	42338	42345	25 %	25 %	25 %	25 %	118469059
99	NC_008596	GGTC	2	8	42471	42478	0 %	25 %	50 %	25 %	118469059
100	NC_008596	GCAA	2	8	42962	42969	50 %	0 %	25 %	25 %	118473676
101	NC_008596	TCGT	2	8	43208	43215	0 %	50 %	25 %	25 %	118473676
102	NC_008596	CGTG	2	8	44286	44293	0 %	25 %	50 %	25 %	118471393
103	NC_008596	CGGG	2	8	44528	44535	0 %	0 %	75 %	25 %	118471393
104	NC_008596	CACG	2	8	44562	44569	25 %	0 %	25 %	50 %	118471393
105	NC_008596	CACC	2	8	44652	44659	25 %	0 %	0 %	75 %	118471393
106	NC_008596	ACCG	2	8	45691	45698	25 %	0 %	25 %	50 %	118468422
107	NC_008596	CCGA	2	8	45709	45716	25 %	0 %	25 %	50 %	118468422
108	NC_008596	CGCC	2	8	45785	45792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_008596	CGGG	2	8	46156	46163	0 %	0 %	75 %	25 %	118469885
110	NC_008596	GTTG	2	8	46531	46538	0 %	50 %	50 %	0 %	118471515
111	NC_008596	CTGC	2	8	46844	46851	0 %	25 %	25 %	50 %	118469202
112	NC_008596	CACG	2	8	46874	46881	25 %	0 %	25 %	50 %	118469202
113	NC_008596	CCGC	2	8	48550	48557	0 %	0 %	25 %	75 %	118471844
114	NC_008596	CCGG	2	8	49138	49145	0 %	0 %	50 %	50 %	118471844
115	NC_008596	TCGG	2	8	50064	50071	0 %	25 %	50 %	25 %	118471844
116	NC_008596	CGCA	2	8	50132	50139	25 %	0 %	25 %	50 %	118472918
117	NC_008596	GCCG	2	8	51013	51020	0 %	0 %	50 %	50 %	118472918
118	NC_008596	TTGC	2	8	51349	51356	0 %	50 %	25 %	25 %	118472918
119	NC_008596	TCGC	2	8	51363	51370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008596	GTCC	2	8	51558	51565	0 %	25 %	25 %	50 %	118469030
121	NC_008596	GGCG	2	8	51918	51925	0 %	0 %	75 %	25 %	118469030
122	NC_008596	GTGG	2	8	52290	52297	0 %	25 %	75 %	0 %	118469030
123	NC_008596	CCGC	2	8	52681	52688	0 %	0 %	25 %	75 %	118469030
124	NC_008596	GACC	2	8	53194	53201	25 %	0 %	25 %	50 %	118468873
125	NC_008596	AGGA	2	8	54773	54780	50 %	0 %	50 %	0 %	118470123
126	NC_008596	AGCG	2	8	55331	55338	25 %	0 %	50 %	25 %	118470123
127	NC_008596	CCGG	2	8	56718	56725	0 %	0 %	50 %	50 %	118471786
128	NC_008596	CCGG	2	8	56763	56770	0 %	0 %	50 %	50 %	118471786
129	NC_008596	GCCT	2	8	57006	57013	0 %	25 %	25 %	50 %	118471786
130	NC_008596	CCGG	2	8	57066	57073	0 %	0 %	50 %	50 %	118471786
131	NC_008596	GCGG	2	8	57081	57088	0 %	0 %	75 %	25 %	118471786
132	NC_008596	CGGG	2	8	57157	57164	0 %	0 %	75 %	25 %	118471786
133	NC_008596	GTGC	2	8	57738	57745	0 %	25 %	50 %	25 %	118471786
134	NC_008596	CGCC	2	8	57880	57887	0 %	0 %	25 %	75 %	118471786
135	NC_008596	TTCG	2	8	57902	57909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008596	GGCC	2	8	58426	58433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008596	GCCG	2	8	58931	58938	0 %	0 %	50 %	50 %	118469105
138	NC_008596	GCCA	2	8	59523	59530	25 %	0 %	25 %	50 %	118468567
139	NC_008596	CACG	2	8	59603	59610	25 %	0 %	25 %	50 %	118468567
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