MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium avium 104 chromosome

Total Repeats: 3674

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008595	CGGCCG	2	12	5154468	5154479	0 %	0 %	50 %	50 %	118466643
3502	NC_008595	GCCGGC	2	12	5154931	5154942	0 %	0 %	50 %	50 %	118466643
3503	NC_008595	TGGTGT	2	12	5155889	5155900	0 %	50 %	50 %	0 %	118465948
3504	NC_008595	CCGCGG	2	12	5157492	5157503	0 %	0 %	50 %	50 %	118463532
3505	NC_008595	CAGCAC	2	12	5158434	5158445	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118462976
3506	NC_008595	CCAGGT	2	12	5159878	5159889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118466982
3507	NC_008595	CGAGCA	2	12	5160139	5160150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118466982
3508	NC_008595	CCCGGT	2	12	5160342	5160353	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118466982
3509	NC_008595	CAGCGT	2	12	5161095	5161106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118466982
3510	NC_008595	CCGGCG	2	12	5161501	5161512	0 %	0 %	50 %	50 %	118466487
3511	NC_008595	CTTGCC	2	12	5162492	5162503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118466487
3512	NC_008595	GTCGAG	2	12	5165229	5165240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118463171
3513	NC_008595	CAGCCC	2	12	5165951	5165962	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118465982
3514	NC_008595	CAGGGC	2	12	5166860	5166871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118465982
3515	NC_008595	GGCGCC	2	12	5167411	5167422	0 %	0 %	50 %	50 %	118463838
3516	NC_008595	CGCCGG	2	12	5168347	5168358	0 %	0 %	50 %	50 %	118464753
3517	NC_008595	GCGTCA	2	12	5170856	5170867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118466214
3518	NC_008595	CACCGA	2	12	5171034	5171045	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118466214
3519	NC_008595	GGTGTC	2	12	5193667	5193678	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118465472
3520	NC_008595	CAGGGT	2	12	5201484	5201495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118467026
3521	NC_008595	GGTACC	2	12	5203090	5203101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118462607
3522	NC_008595	CGGATG	2	12	5204273	5204284	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118463320
3523	NC_008595	ACCGAG	2	12	5204767	5204778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463320
3524	NC_008595	TGCAGC	2	12	5207555	5207566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118463958
3525	NC_008595	AGGTCG	2	12	5213383	5213394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118466709
3526	NC_008595	CTACCG	2	12	5219485	5219496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118462334
3527	NC_008595	ACCACG	2	12	5225764	5225775	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118465153
3528	NC_008595	CGGGCG	2	12	5226299	5226310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465153
3529	NC_008595	TTCGGC	2	12	5226774	5226785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465153
3530	NC_008595	CATCGA	2	12	5231249	5231260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118467034
3531	NC_008595	CGTTGA	2	12	5232613	5232624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118465045
3532	NC_008595	TTGTCG	2	12	5233957	5233968	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118462651
3533	NC_008595	GTCGCG	2	12	5235499	5235510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118462394
3534	NC_008595	ACGCCC	2	12	5236641	5236652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118463524
3535	NC_008595	CCAGGC	2	12	5236954	5236965	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463524
3536	NC_008595	CAGCGC	2	12	5237605	5237616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463105
3537	NC_008595	TGAGCT	2	12	5242062	5242073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118465389
3538	NC_008595	GTCGGC	2	12	5245272	5245283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118463155
3539	NC_008595	GCTGTG	2	12	5250171	5250182	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118466512
3540	NC_008595	GATGTT	2	12	5250634	5250645	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118466512
3541	NC_008595	TCGACG	2	12	5256270	5256281	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465799
3542	NC_008595	GTCGAG	2	12	5257902	5257913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118463527
3543	NC_008595	GTTCGA	2	12	5261805	5261816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118463072
3544	NC_008595	GGCGAT	2	12	5262723	5262734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118462524
3545	NC_008595	GGGCCA	2	12	5262788	5262799	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118462524
3546	NC_008595	GGTGCG	2	12	5263539	5263550	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118462524
3547	NC_008595	CGATGA	2	12	5263769	5263780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118462524
3548	NC_008595	GCGGCC	2	12	5265719	5265730	0 %	0 %	50 %	50 %	118464570
3549	NC_008595	GCCACC	2	12	5266175	5266186	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118464570
3550	NC_008595	TCGACA	2	12	5267665	5267676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118463973
3551	NC_008595	GGCCGG	2	12	5271728	5271739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118466274
3552	NC_008595	GGGCCT	2	12	5272003	5272014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118466274
3553	NC_008595	GTAGGC	2	12	5272106	5272117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118466274
3554	NC_008595	ACGAGT	2	12	5273017	5273028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118466274
3555	NC_008595	CGCGGC	2	12	5273332	5273343	0 %	0 %	50 %	50 %	118467330
3556	NC_008595	GTGCCT	2	12	5273990	5274001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466608
3557	NC_008595	CCGCGG	2	12	5274380	5274391	0 %	0 %	50 %	50 %	118466608
3558	NC_008595	GCGATC	2	12	5274716	5274727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465989
3559	NC_008595	CGTCGC	2	12	5275344	5275355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465989
3560	NC_008595	GCGGGC	2	12	5278666	5278677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118466435
3561	NC_008595	CCAGCC	2	12	5279190	5279201	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118466435
3562	NC_008595	GAGCCG	2	12	5279852	5279863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118466085
3563	NC_008595	GAAGCC	2	12	5282279	5282290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118463504
3564	NC_008595	CATCGG	2	12	5282848	5282859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118462770
3565	NC_008595	CCGACA	2	12	5285721	5285732	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118466492
3566	NC_008595	TGGTCG	2	12	5286754	5286765	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118466279
3567	NC_008595	CCTCGG	2	12	5290841	5290852	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465117
3568	NC_008595	CGCGGC	2	12	5291238	5291249	0 %	0 %	50 %	50 %	118465117
3569	NC_008595	GGCCGA	2	12	5294157	5294168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118462393
3570	NC_008595	TCAAGG	2	12	5294234	5294245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118462393
3571	NC_008595	TGGTGC	2	12	5294669	5294680	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118462393
3572	NC_008595	GCGCTG	2	12	5294893	5294904	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118462393
3573	NC_008595	CCGCGC	2	12	5295888	5295899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462955
3574	NC_008595	CGTCGG	2	12	5297772	5297783	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118464085
3575	NC_008595	GCCGGT	2	12	5298685	5298696	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118465380
3576	NC_008595	ACAGCG	2	12	5299185	5299196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465380
3577	NC_008595	CGCCGG	2	12	5301023	5301034	0 %	0 %	50 %	50 %	118465946
3578	NC_008595	CCCCCG	2	12	5303543	5303554	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	118466869
3579	NC_008595	CGGCGT	2	12	5304825	5304836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118467038
3580	NC_008595	CCGGCG	2	12	5305083	5305094	0 %	0 %	50 %	50 %	118467038
3581	NC_008595	GCGCCT	2	12	5307679	5307690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118464206
3582	NC_008595	GAGCCG	2	12	5309822	5309833	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118465972
3583	NC_008595	CCAGCT	2	12	5311327	5311338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118464795
3584	NC_008595	GTCGCG	2	12	5312416	5312427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118464848
3585	NC_008595	GCACCG	2	12	5312484	5312495	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464848
3586	NC_008595	CACCGG	2	12	5312548	5312559	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464848
3587	NC_008595	ACCGCG	2	12	5312876	5312887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464848
3588	NC_008595	GGTGTG	2	12	5315908	5315919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118466892
3589	NC_008595	AGCCTG	2	12	5317610	5317621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118464175
3590	NC_008595	CCGACA	2	12	5320621	5320632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118465470
3591	NC_008595	CTGCAC	2	12	5322273	5322284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118466973
3592	NC_008595	CCCCGG	2	12	5327278	5327289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118464908
3593	NC_008595	CGTCGC	2	12	5328083	5328094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465788
3594	NC_008595	GCCGTC	2	12	5328161	5328172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465788
3595	NC_008595	CCCGGG	2	12	5330037	5330048	0 %	0 %	50 %	50 %	118467284
3596	NC_008595	CCTCGG	2	12	5332933	5332944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465148
3597	NC_008595	CGCGGC	2	12	5333322	5333333	0 %	0 %	50 %	50 %	118465668
3598	NC_008595	CCGTTG	2	12	5333368	5333379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465668
3599	NC_008595	GATCGC	2	12	5334796	5334807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118463811
3600	NC_008595	CTACGC	2	12	5335568	5335579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118464431
3601	NC_008595	GGCCTC	2	12	5345360	5345371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118464226
3602	NC_008595	CGACAG	2	12	5348332	5348343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465335
3603	NC_008595	CCACCG	2	12	5349263	5349274	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118464611
3604	NC_008595	GCCAGC	2	12	5349850	5349861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464611
3605	NC_008595	CACCTG	2	12	5351122	5351133	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118466438
3606	NC_008595	CGACGT	2	12	5351907	5351918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118466438
3607	NC_008595	ACCTCC	2	12	5354330	5354341	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	118465244
3608	NC_008595	AGCCGA	2	12	5354598	5354609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465244
3609	NC_008595	GTTGAC	2	12	5354731	5354742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118465244
3610	NC_008595	GTAGTC	2	12	5357123	5357134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118466689
3611	NC_008595	GTCGAT	2	12	5357762	5357773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118466689
3612	NC_008595	GCGCCA	2	12	5365379	5365390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118467051
3613	NC_008595	GATCCG	2	12	5366419	5366430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465422
3614	NC_008595	ACCTGG	2	12	5368217	5368228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118463660
3615	NC_008595	AGGCGG	2	12	5368436	5368447	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118463660
3616	NC_008595	GCCGCG	2	12	5368594	5368605	0 %	0 %	50 %	50 %	118463660
3617	NC_008595	GCGGCC	2	12	5368894	5368905	0 %	0 %	50 %	50 %	118463660
3618	NC_008595	CCCGAC	2	12	5369353	5369364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118463660
3619	NC_008595	CCGACG	2	12	5371607	5371618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463660
3620	NC_008595	GCGGTC	2	12	5372278	5372289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118463660
3621	NC_008595	AGCCGT	2	12	5373378	5373389	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118464228
3622	NC_008595	GGTCCG	2	12	5375173	5375184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118464006
3623	NC_008595	CGGCAG	2	12	5376693	5376704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118462552
3624	NC_008595	CAGCGC	2	12	5377149	5377160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118462552
3625	NC_008595	CGAGGT	2	12	5382667	5382678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118462861
3626	NC_008595	GGCCCG	2	12	5383858	5383869	0 %	0 %	50 %	50 %	118467275
3627	NC_008595	CGCCGT	2	12	5388265	5388276	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118463916
3628	NC_008595	GTCGGG	2	12	5389291	5389302	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118466493
3629	NC_008595	TCAACG	2	12	5392001	5392012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118466805
3630	NC_008595	CGACGC	2	12	5392128	5392139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118466805
3631	NC_008595	CGCCGG	2	12	5392335	5392346	0 %	0 %	50 %	50 %	118466805
3632	NC_008595	CAGGTC	2	12	5393563	5393574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118464250
3633	NC_008595	ACGCCG	2	12	5394555	5394566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463417
3634	NC_008595	CGACGC	2	12	5396460	5396471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463247
3635	NC_008595	GCACTG	2	12	5396900	5396911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118463890
3636	NC_008595	CCCACC	2	12	5398044	5398055	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	118463890
3637	NC_008595	GCACCG	2	12	5398528	5398539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463890
3638	NC_008595	GGGCGA	2	12	5400810	5400821	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	118465639
3639	NC_008595	GGCCGG	2	12	5402748	5402759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118464656
3640	NC_008595	CAGGGC	2	12	5403305	5403316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118462549
3641	NC_008595	ACGCCG	2	12	5406678	5406689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118466839
3642	NC_008595	CCGGGT	2	12	5407194	5407205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118466839
3643	NC_008595	GCACCC	2	12	5409645	5409656	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	118463463
3644	NC_008595	ACGTCG	2	12	5410339	5410350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118463855
3645	NC_008595	TCGCGG	2	12	5412126	5412137	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118466158
3646	NC_008595	GTCGCG	2	12	5413939	5413950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118466842
3647	NC_008595	ACGTCG	2	12	5413982	5413993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118466842
3648	NC_008595	GGTGAA	2	12	5414449	5414460	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118466842
3649	NC_008595	GATCAG	2	12	5415157	5415168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118466842
3650	NC_008595	CGGACG	2	12	5422103	5422114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118462894
3651	NC_008595	GGCCTT	2	12	5424851	5424862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118466616
3652	NC_008595	GCCGCA	2	12	5427195	5427206	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464559
3653	NC_008595	TACGCC	2	12	5430368	5430379	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118466811
3654	NC_008595	ATGCTG	2	12	5431942	5431953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118462826
3655	NC_008595	ACGGCG	2	12	5438738	5438749	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	118466652
3656	NC_008595	CCAGGC	2	12	5444516	5444527	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118464400
3657	NC_008595	CGCAGC	2	12	5445603	5445614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118463689
3658	NC_008595	GCATCT	2	12	5446928	5446939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118465693
3659	NC_008595	CGGCAT	2	12	5449035	5449046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465266
3660	NC_008595	ACCGTC	2	12	5453388	5453399	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118465581
3661	NC_008595	GGCCGT	2	12	5453534	5453545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118465581
3662	NC_008595	CCGTCC	2	12	5453713	5453724	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	118465581
3663	NC_008595	GCCGTC	2	12	5453790	5453801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118465581
3664	NC_008595	AGGTCG	2	12	5453803	5453814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118465581
3665	NC_008595	GCCGAC	2	12	5455059	5455070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118465833
3666	NC_008595	GAAGCC	2	12	5455619	5455630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118464187
3667	NC_008595	TCGCCT	2	12	5460939	5460950	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	118465424
3668	NC_008595	GCGCCC	2	12	5464633	5464644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118463700
3669	NC_008595	GCGGGC	2	12	5465967	5465978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465167
3670	NC_008595	TCGACG	2	12	5466850	5466861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118465727
3671	NC_008595	TCGAGC	2	12	5468510	5468521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118464843
3672	NC_008595	TCGGCG	2	12	5469005	5469016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118464843
3673	NC_008595	GGTCGA	2	12	5471070	5471081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118463688
3674	NC_008595	GCCCGC	2	12	5473099	5473110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118466815

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.