MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium avium 104 chromosome

Total Repeats: 5206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008595	CGGGC	2	10	1301	1310	0 %	0 %	60 %	40 %	118466558
2	NC_008595	ACCAC	2	10	1411	1420	40 %	0 %	0 %	60 %	118466558
3	NC_008595	CCCGG	2	10	1580	1589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008595	GGCCG	2	10	3044	3053	0 %	0 %	60 %	40 %	118465865
5	NC_008595	GACCG	2	10	3494	3503	20 %	0 %	40 %	40 %	118465169
6	NC_008595	GCACC	2	10	6003	6012	20 %	0 %	20 %	60 %	118463778
7	NC_008595	GCAGC	2	10	6981	6990	20 %	0 %	40 %	40 %	118463778
8	NC_008595	GCAGC	2	10	7376	7385	20 %	0 %	40 %	40 %	118462773
9	NC_008595	GGGCA	2	10	7638	7647	20 %	0 %	60 %	20 %	118462773
10	NC_008595	GCGAA	2	10	12262	12271	40 %	0 %	40 %	20 %	118465807
11	NC_008595	CGGCT	2	10	12436	12445	0 %	20 %	40 %	40 %	118465807
12	NC_008595	CGGGC	2	10	15528	15537	0 %	0 %	60 %	40 %	118462237
13	NC_008595	GCCCA	2	10	15940	15949	20 %	0 %	20 %	60 %	118462237
14	NC_008595	CGGGC	2	10	16179	16188	0 %	0 %	60 %	40 %	118464054
15	NC_008595	TCCCG	2	10	16708	16717	0 %	20 %	20 %	60 %	118466937
16	NC_008595	CCAGC	2	10	16814	16823	20 %	0 %	20 %	60 %	118466937
17	NC_008595	GCCGG	2	10	18846	18855	0 %	0 %	60 %	40 %	118462951
18	NC_008595	CGGCG	2	10	18895	18904	0 %	0 %	60 %	40 %	118462951
19	NC_008595	CGGCG	2	10	19333	19342	0 %	0 %	60 %	40 %	118462951
20	NC_008595	CGGCG	2	10	19884	19893	0 %	0 %	60 %	40 %	118465786
21	NC_008595	TTAGC	2	10	20117	20126	20 %	40 %	20 %	20 %	118465786
22	NC_008595	GGTCG	2	10	20502	20511	0 %	20 %	60 %	20 %	118465786
23	NC_008595	CGGCG	2	10	20574	20583	0 %	0 %	60 %	40 %	118465786
24	NC_008595	GCTGA	2	10	22403	22412	20 %	20 %	40 %	20 %	118465232
25	NC_008595	GCCGG	2	10	22820	22829	0 %	0 %	60 %	40 %	118466385
26	NC_008595	GACGG	2	10	24586	24595	20 %	0 %	60 %	20 %	118466929
27	NC_008595	GGCGG	2	10	25853	25862	0 %	0 %	80 %	20 %	118465219
28	NC_008595	CGAAC	2	10	26189	26198	40 %	0 %	20 %	40 %	118465219
29	NC_008595	ATCGC	2	10	27060	27069	20 %	20 %	20 %	40 %	118465816
30	NC_008595	CAGCG	2	10	27944	27953	20 %	0 %	40 %	40 %	118463612
31	NC_008595	GCTCG	2	10	28101	28110	0 %	20 %	40 %	40 %	118463612
32	NC_008595	ACGGG	2	10	31548	31557	20 %	0 %	60 %	20 %	118463081
33	NC_008595	CCCGG	2	10	32066	32075	0 %	0 %	40 %	60 %	118463081
34	NC_008595	GGCCG	2	10	35418	35427	0 %	0 %	60 %	40 %	118463202
35	NC_008595	TGCGC	2	10	35873	35882	0 %	20 %	40 %	40 %	118463202
36	NC_008595	ATCAG	2	10	35980	35989	40 %	20 %	20 %	20 %	118463202
37	NC_008595	GATGC	2	10	41936	41945	20 %	20 %	40 %	20 %	118462762
38	NC_008595	CGGCG	2	10	42630	42639	0 %	0 %	60 %	40 %	118463481
39	NC_008595	ACCGG	2	10	42641	42650	20 %	0 %	40 %	40 %	118463481
40	NC_008595	CGGGC	2	10	43626	43635	0 %	0 %	60 %	40 %	118463920
41	NC_008595	CGGCG	2	10	44091	44100	0 %	0 %	60 %	40 %	118465006
42	NC_008595	GGCCG	2	10	45553	45562	0 %	0 %	60 %	40 %	118462713
43	NC_008595	CCGTC	2	10	46085	46094	0 %	20 %	20 %	60 %	118464594
44	NC_008595	GTGCG	2	10	47189	47198	0 %	20 %	60 %	20 %	118467122
45	NC_008595	GTCGG	2	10	49766	49775	0 %	20 %	60 %	20 %	118466337
46	NC_008595	TTGTC	2	10	51816	51825	0 %	60 %	20 %	20 %	118463947
47	NC_008595	GCCTT	2	10	51827	51836	0 %	40 %	20 %	40 %	118463947
48	NC_008595	CGGCG	2	10	52007	52016	0 %	0 %	60 %	40 %	118462500
49	NC_008595	TGACG	2	10	52760	52769	20 %	20 %	40 %	20 %	118462540
50	NC_008595	TCGGG	2	10	53024	53033	0 %	20 %	60 %	20 %	118462540
51	NC_008595	GCAAC	2	10	53579	53588	40 %	0 %	20 %	40 %	118467113
52	NC_008595	CGGCG	2	10	54615	54624	0 %	0 %	60 %	40 %	118467113
53	NC_008595	GCACC	2	10	56106	56115	20 %	0 %	20 %	60 %	118467113
54	NC_008595	CGGTG	2	10	58303	58312	0 %	20 %	60 %	20 %	118465112
55	NC_008595	CGCGG	2	10	58657	58666	0 %	0 %	60 %	40 %	118464237
56	NC_008595	GGGCG	2	10	60100	60109	0 %	0 %	80 %	20 %	118464237
57	NC_008595	GTGGG	2	10	60893	60902	0 %	20 %	80 %	0 %	118464635
58	NC_008595	CAGCG	2	10	62880	62889	20 %	0 %	40 %	40 %	118463370
59	NC_008595	GCAGC	2	10	65000	65009	20 %	0 %	40 %	40 %	118467333
60	NC_008595	GACGG	2	10	66960	66969	20 %	0 %	60 %	20 %	118463701
61	NC_008595	ATCGT	2	10	69266	69275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008595	CCGCG	2	10	71187	71196	0 %	0 %	40 %	60 %	118467310
63	NC_008595	GCGCC	2	10	71288	71297	0 %	0 %	40 %	60 %	118467310
64	NC_008595	CCGGA	2	10	74287	74296	20 %	0 %	40 %	40 %	118467279
65	NC_008595	GCCTG	2	10	75203	75212	0 %	20 %	40 %	40 %	118465152
66	NC_008595	GCCGC	2	10	76130	76139	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_008595	GCGTC	2	10	76937	76946	0 %	20 %	40 %	40 %	118466677
68	NC_008595	TGTCG	2	10	80768	80777	0 %	40 %	40 %	20 %	118466020
69	NC_008595	TGGGA	2	10	82070	82079	20 %	20 %	60 %	0 %	118465316
70	NC_008595	CCGGG	2	10	84606	84615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008595	CGCAC	2	10	84970	84979	20 %	0 %	20 %	60 %	118465633
72	NC_008595	GCTGG	2	10	85040	85049	0 %	20 %	60 %	20 %	118465633
73	NC_008595	TCAGC	2	10	86423	86432	20 %	20 %	20 %	40 %	118465633
74	NC_008595	GCCGC	2	10	88587	88596	0 %	0 %	40 %	60 %	118465091
75	NC_008595	CCGTC	2	10	88927	88936	0 %	20 %	20 %	60 %	118465091
76	NC_008595	CTGCA	2	10	89568	89577	20 %	20 %	20 %	40 %	118462980
77	NC_008595	GCTGC	2	10	91006	91015	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_008595	CGTCG	2	10	91128	91137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_008595	GCATG	2	10	92756	92765	20 %	20 %	40 %	20 %	118464391
80	NC_008595	TCACC	2	10	93537	93546	20 %	20 %	0 %	60 %	118464475
81	NC_008595	GCGCC	2	10	93902	93911	0 %	0 %	40 %	60 %	118465858
82	NC_008595	GGCCG	2	10	95300	95309	0 %	0 %	60 %	40 %	118466614
83	NC_008595	CGGCG	2	10	96896	96905	0 %	0 %	60 %	40 %	118465826
84	NC_008595	CAGGT	2	10	97637	97646	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008595	CGGCG	2	10	98554	98563	0 %	0 %	60 %	40 %	118462494
86	NC_008595	GCACC	2	10	99878	99887	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008595	CGCAG	2	10	99941	99950	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_008595	GCGCG	2	10	100674	100683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008595	ATGCG	2	10	101697	101706	20 %	20 %	40 %	20 %	118467326
90	NC_008595	GGCAA	2	10	107088	107097	40 %	0 %	40 %	20 %	118464466
91	NC_008595	AGCCA	2	10	107511	107520	40 %	0 %	20 %	40 %	118464466
92	NC_008595	GTCCG	2	10	107738	107747	0 %	20 %	40 %	40 %	118464466
93	NC_008595	CGCGG	2	10	109199	109208	0 %	0 %	60 %	40 %	118464842
94	NC_008595	ACGGT	2	10	109217	109226	20 %	20 %	40 %	20 %	118464842
95	NC_008595	CGCGC	2	10	109227	109236	0 %	0 %	40 %	60 %	118464842
96	NC_008595	GCACG	2	10	109502	109511	20 %	0 %	40 %	40 %	118464842
97	NC_008595	CGGCC	2	10	110025	110034	0 %	0 %	40 %	60 %	118462906
98	NC_008595	CGCGG	2	10	110748	110757	0 %	0 %	60 %	40 %	118464655
99	NC_008595	ACCGC	2	10	110948	110957	20 %	0 %	20 %	60 %	118464655
100	NC_008595	GGCGC	3	15	113431	113445	0 %	0 %	60 %	40 %	118462222
101	NC_008595	GCCAG	2	10	113575	113584	20 %	0 %	40 %	40 %	118462222
102	NC_008595	CGGCC	2	10	113779	113788	0 %	0 %	40 %	60 %	118462222
103	NC_008595	ACGGC	2	10	114456	114465	20 %	0 %	40 %	40 %	118463621
104	NC_008595	CTTCC	2	10	114586	114595	0 %	40 %	0 %	60 %	118463621
105	NC_008595	GCCCG	2	10	115234	115243	0 %	0 %	40 %	60 %	118465587
106	NC_008595	CGGCG	2	10	117122	117131	0 %	0 %	60 %	40 %	118465195
107	NC_008595	CCGGT	2	10	118153	118162	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008595	CCCGG	2	10	118925	118934	0 %	0 %	40 %	60 %	118463772
109	NC_008595	GTCGA	2	10	120598	120607	20 %	20 %	40 %	20 %	118462735
110	NC_008595	TCCGA	2	10	120733	120742	20 %	20 %	20 %	40 %	118462735
111	NC_008595	CGGGC	2	10	121228	121237	0 %	0 %	60 %	40 %	118462333
112	NC_008595	TCGGC	2	10	121316	121325	0 %	20 %	40 %	40 %	118462333
113	NC_008595	GCCGC	2	10	121794	121803	0 %	0 %	40 %	60 %	118462333
114	NC_008595	GCGCC	2	10	121972	121981	0 %	0 %	40 %	60 %	118466457
115	NC_008595	GCGCC	2	10	122674	122683	0 %	0 %	40 %	60 %	118462304
116	NC_008595	GGCGC	2	10	123323	123332	0 %	0 %	60 %	40 %	118462304
117	NC_008595	CCAGG	2	10	123624	123633	20 %	0 %	40 %	40 %	118462304
118	NC_008595	CGCGC	2	10	123986	123995	0 %	0 %	40 %	60 %	118462780
119	NC_008595	TGCTG	2	10	124442	124451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008595	CCGGC	2	10	126907	126916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_008595	GACCC	2	10	127171	127180	20 %	0 %	20 %	60 %	118465186
122	NC_008595	CGAAG	2	10	128170	128179	40 %	0 %	40 %	20 %	118465754
123	NC_008595	GCACC	2	10	129536	129545	20 %	0 %	20 %	60 %	118462954
124	NC_008595	CGGAT	2	10	130883	130892	20 %	20 %	40 %	20 %	118462392
125	NC_008595	CAGCG	2	10	132318	132327	20 %	0 %	40 %	40 %	118465645
126	NC_008595	GCACC	2	10	133264	133273	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_008595	ACGCA	2	10	135397	135406	40 %	0 %	20 %	40 %	118465370
128	NC_008595	GTGGC	2	10	135514	135523	0 %	20 %	60 %	20 %	118463383
129	NC_008595	CACCG	2	10	136703	136712	20 %	0 %	20 %	60 %	118463657
130	NC_008595	ACGTC	2	10	139644	139653	20 %	20 %	20 %	40 %	118465842
131	NC_008595	GTCCC	2	10	140274	140283	0 %	20 %	20 %	60 %	118464449
132	NC_008595	CGACT	2	10	143243	143252	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008595	CCGGG	2	10	143819	143828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008595	CACTA	2	10	143871	143880	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_008595	AGGGC	2	10	146292	146301	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008595	CGAGC	2	10	146568	146577	20 %	0 %	40 %	40 %	118466894
137	NC_008595	GCCGC	2	10	147383	147392	0 %	0 %	40 %	60 %	118465993
138	NC_008595	CGATG	2	10	149610	149619	20 %	20 %	40 %	20 %	118464269
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262	NC_008595	GCGCG	2	10	279217	279226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
263	NC_008595	GGCGC	2	10	281816	281825	0 %	0 %	60 %	40 %	118462462
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270	NC_008595	GCCGA	2	10	287547	287556	20 %	0 %	40 %	40 %	118465086
271	NC_008595	GGTCA	2	10	287577	287586	20 %	20 %	40 %	20 %	118465086
272	NC_008595	GCCGA	2	10	288924	288933	20 %	0 %	40 %	40 %	118465086
273	NC_008595	GAGCA	2	10	289125	289134	40 %	0 %	40 %	20 %	118465086
274	NC_008595	AACCC	2	10	290072	290081	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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277	NC_008595	ACGGG	2	10	291964	291973	20 %	0 %	60 %	20 %	118465246
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