MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 2168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	AGTAG	2	10	650	659	40 %	20 %	40 %	0 %	118443844
2	NC_008593	ACAAA	2	10	1347	1356	80 %	0 %	0 %	20 %	118442981
3	NC_008593	AAGAT	2	10	4827	4836	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
4	NC_008593	AGAGC	2	10	5573	5582	40 %	0 %	40 %	20 %	118443722
5	NC_008593	AGATA	2	10	5752	5761	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
6	NC_008593	TGGAA	2	10	6002	6011	40 %	20 %	40 %	0 %	118444066
7	NC_008593	AAAGA	2	10	6205	6214	80 %	0 %	20 %	0 %	118444066
8	NC_008593	AAATA	2	10	7116	7125	80 %	20 %	0 %	0 %	118443812
9	NC_008593	CAATT	2	10	8184	8193	40 %	40 %	0 %	20 %	118443230
10	NC_008593	ATATA	2	10	11210	11219	60 %	40 %	0 %	0 %	118444555
11	NC_008593	TGTTA	2	10	11573	11582	20 %	60 %	20 %	0 %	118444134
12	NC_008593	ATACT	2	10	11960	11969	40 %	40 %	0 %	20 %	118444568
13	NC_008593	TAAGG	2	10	15276	15285	40 %	20 %	40 %	0 %	118444184
14	NC_008593	TTTTA	2	10	15826	15835	20 %	80 %	0 %	0 %	118444184
15	NC_008593	ATACT	2	10	17683	17692	40 %	40 %	0 %	20 %	118443553
16	NC_008593	AGAGT	2	10	17727	17736	40 %	20 %	40 %	0 %	118443553
17	NC_008593	TGATA	2	10	19325	19334	40 %	40 %	20 %	0 %	118443592
18	NC_008593	ACAGT	2	10	20012	20021	40 %	20 %	20 %	20 %	118443592
19	NC_008593	TAGAT	2	10	20030	20039	40 %	40 %	20 %	0 %	118443592
20	NC_008593	TGAAA	2	10	22458	22467	60 %	20 %	20 %	0 %	118444706
21	NC_008593	GCATT	2	10	23094	23103	20 %	40 %	20 %	20 %	118443218
22	NC_008593	TTATG	2	10	23456	23465	20 %	60 %	20 %	0 %	118443218
23	NC_008593	AAATA	2	10	25880	25889	80 %	20 %	0 %	0 %	118443625
24	NC_008593	TATTT	2	10	30062	30071	20 %	80 %	0 %	0 %	118442930
25	NC_008593	GGAAC	2	10	31901	31910	40 %	0 %	40 %	20 %	118444065
26	NC_008593	ATAAA	2	10	33150	33159	80 %	20 %	0 %	0 %	118444000
27	NC_008593	TAAGG	2	10	35082	35091	40 %	20 %	40 %	0 %	118442902
28	NC_008593	TTCTT	2	10	35706	35715	0 %	80 %	0 %	20 %	118443206
29	NC_008593	CTTTA	2	10	36305	36314	20 %	60 %	0 %	20 %	118443206
30	NC_008593	TTTAT	2	10	40344	40353	20 %	80 %	0 %	0 %	118443542
31	NC_008593	AAAAT	2	10	41500	41509	80 %	20 %	0 %	0 %	118443542
32	NC_008593	ATGAA	2	10	43377	43386	60 %	20 %	20 %	0 %	118443447
33	NC_008593	AAAAT	2	10	43506	43515	80 %	20 %	0 %	0 %	118442905
34	NC_008593	GAAAT	2	10	46989	46998	60 %	20 %	20 %	0 %	118443407
35	NC_008593	ATTAT	2	10	50704	50713	40 %	60 %	0 %	0 %	118443895
36	NC_008593	TTTGT	2	10	51268	51277	0 %	80 %	20 %	0 %	118444723
37	NC_008593	TATAA	2	10	51576	51585	60 %	40 %	0 %	0 %	118444723
38	NC_008593	ACTTC	2	10	52445	52454	20 %	40 %	0 %	40 %	118444146
39	NC_008593	AAACA	2	10	52696	52705	80 %	0 %	0 %	20 %	118444146
40	NC_008593	ATAAC	2	10	53795	53804	60 %	20 %	0 %	20 %	118443320
41	NC_008593	CCATA	2	10	54899	54908	40 %	20 %	0 %	40 %	118443506
42	NC_008593	TTAAA	2	10	56161	56170	60 %	40 %	0 %	0 %	118443798
43	NC_008593	TTTTA	2	10	56793	56802	20 %	80 %	0 %	0 %	118443798
44	NC_008593	GAATG	2	10	57633	57642	40 %	20 %	40 %	0 %	118443798
45	NC_008593	TAAAT	2	10	58278	58287	60 %	40 %	0 %	0 %	118443604
46	NC_008593	TCATA	2	10	58546	58555	40 %	40 %	0 %	20 %	118443604
47	NC_008593	TCTTT	2	10	59600	59609	0 %	80 %	0 %	20 %	118443931
48	NC_008593	ATAAA	2	10	61002	61011	80 %	20 %	0 %	0 %	118444655
49	NC_008593	GTTTT	2	10	61166	61175	0 %	80 %	20 %	0 %	118444655
50	NC_008593	TGAAA	2	10	61877	61886	60 %	20 %	20 %	0 %	118443193
51	NC_008593	ATTTT	2	10	63510	63519	20 %	80 %	0 %	0 %	118443302
52	NC_008593	AGTAG	2	10	64618	64627	40 %	20 %	40 %	0 %	118443747
53	NC_008593	AAATA	2	10	67272	67281	80 %	20 %	0 %	0 %	118444018
54	NC_008593	ATGGA	2	10	67712	67721	40 %	20 %	40 %	0 %	118444018
55	NC_008593	AAAAT	2	10	72708	72717	80 %	20 %	0 %	0 %	118443765
56	NC_008593	AAATT	2	10	73013	73022	60 %	40 %	0 %	0 %	118443016
57	NC_008593	AGAAA	2	10	73123	73132	80 %	0 %	20 %	0 %	118443016
58	NC_008593	TATAA	2	10	73454	73463	60 %	40 %	0 %	0 %	118444357
59	NC_008593	AAATA	2	10	74083	74092	80 %	20 %	0 %	0 %	118444357
60	NC_008593	AAGAT	2	10	74214	74223	60 %	20 %	20 %	0 %	118444357
61	NC_008593	AAAAG	2	10	75029	75038	80 %	0 %	20 %	0 %	118443992
62	NC_008593	ATTAC	2	10	77211	77220	40 %	40 %	0 %	20 %	118443720
63	NC_008593	TAAAA	2	10	78655	78664	80 %	20 %	0 %	0 %	118444677
64	NC_008593	GTAGA	2	10	79161	79170	40 %	20 %	40 %	0 %	118444677
65	NC_008593	TAAAT	2	10	79312	79321	60 %	40 %	0 %	0 %	118444677
66	NC_008593	AAATA	2	10	80338	80347	80 %	20 %	0 %	0 %	118444270
67	NC_008593	CTTTA	2	10	81164	81173	20 %	60 %	0 %	20 %	118443339
68	NC_008593	CAAAT	2	10	81373	81382	60 %	20 %	0 %	20 %	118443339
69	NC_008593	TGCCA	2	10	81673	81682	20 %	20 %	20 %	40 %	118443004
70	NC_008593	TTTTA	2	10	82024	82033	20 %	80 %	0 %	0 %	118443004
71	NC_008593	TAAAA	2	10	83280	83289	80 %	20 %	0 %	0 %	118443149
72	NC_008593	AAACT	2	10	84677	84686	60 %	20 %	0 %	20 %	118443686
73	NC_008593	ATTAA	2	10	85509	85518	60 %	40 %	0 %	0 %	118443270
74	NC_008593	GGTTT	2	10	85568	85577	0 %	60 %	40 %	0 %	118443270
75	NC_008593	GATAA	2	10	85752	85761	60 %	20 %	20 %	0 %	118443270
76	NC_008593	GCTAG	2	10	86199	86208	20 %	20 %	40 %	20 %	118444556
77	NC_008593	AAGGA	2	10	86932	86941	60 %	0 %	40 %	0 %	118444556
78	NC_008593	TGGAA	2	10	87368	87377	40 %	20 %	40 %	0 %	118444102
79	NC_008593	CAATA	2	10	87643	87652	60 %	20 %	0 %	20 %	118444102
80	NC_008593	AAATT	2	10	88516	88525	60 %	40 %	0 %	0 %	118443400
81	NC_008593	AAAAT	2	10	89552	89561	80 %	20 %	0 %	0 %	118443002
82	NC_008593	AAATT	2	10	91058	91067	60 %	40 %	0 %	0 %	118443002
83	NC_008593	AAAAT	2	10	91454	91463	80 %	20 %	0 %	0 %	118444261
84	NC_008593	TTAAA	2	10	94248	94257	60 %	40 %	0 %	0 %	118443848
85	NC_008593	TCTTT	2	10	95318	95327	0 %	80 %	0 %	20 %	118443187
86	NC_008593	TTTAT	2	10	96690	96699	20 %	80 %	0 %	0 %	118444097
87	NC_008593	TATAT	2	10	98528	98537	40 %	60 %	0 %	0 %	118443234
88	NC_008593	ATTTA	2	10	98624	98633	40 %	60 %	0 %	0 %	118443234
89	NC_008593	ATAAA	2	10	101433	101442	80 %	20 %	0 %	0 %	118444220
90	NC_008593	TGTAT	2	10	101699	101708	20 %	60 %	20 %	0 %	118444220
91	NC_008593	TTATT	2	10	103731	103740	20 %	80 %	0 %	0 %	118443394
92	NC_008593	GTAAT	2	10	103915	103924	40 %	40 %	20 %	0 %	118443394
93	NC_008593	TTAAT	2	10	104772	104781	40 %	60 %	0 %	0 %	118443806
94	NC_008593	CAAGT	2	10	106785	106794	40 %	20 %	20 %	20 %	118443155
95	NC_008593	AAAAT	2	10	108736	108745	80 %	20 %	0 %	0 %	118443995
96	NC_008593	ATATT	2	10	108842	108851	40 %	60 %	0 %	0 %	118443995
97	NC_008593	ATTAG	2	10	108978	108987	40 %	40 %	20 %	0 %	118443995
98	NC_008593	AAAAT	2	10	109654	109663	80 %	20 %	0 %	0 %	118443995
99	NC_008593	ATACA	2	10	110110	110119	60 %	20 %	0 %	20 %	118443995
100	NC_008593	TTCTG	2	10	110433	110442	0 %	60 %	20 %	20 %	118443852
101	NC_008593	TCTTT	2	10	110793	110802	0 %	80 %	0 %	20 %	118443852
102	NC_008593	TAAAG	2	10	112279	112288	60 %	20 %	20 %	0 %	118444265
103	NC_008593	CAATA	2	10	112989	112998	60 %	20 %	0 %	20 %	118444265
104	NC_008593	AATTA	2	10	113633	113642	60 %	40 %	0 %	0 %	118443721
105	NC_008593	TTTGC	2	10	115413	115422	0 %	60 %	20 %	20 %	118444006
106	NC_008593	TATGG	2	10	116814	116823	20 %	40 %	40 %	0 %	118443984
107	NC_008593	TAAAA	2	10	117084	117093	80 %	20 %	0 %	0 %	118444072
108	NC_008593	ACTAT	2	10	118145	118154	40 %	40 %	0 %	20 %	118444591
109	NC_008593	AAAGA	2	10	118360	118369	80 %	0 %	20 %	0 %	118444591
110	NC_008593	ATTAT	2	10	120007	120016	40 %	60 %	0 %	0 %	118443707
111	NC_008593	AATGG	2	10	121811	121820	40 %	20 %	40 %	0 %	118443264
112	NC_008593	AACAG	2	10	122359	122368	60 %	0 %	20 %	20 %	118443264
113	NC_008593	AGAAA	2	10	124989	124998	80 %	0 %	20 %	0 %	118443393
114	NC_008593	ATACA	2	10	126840	126849	60 %	20 %	0 %	20 %	118444558
115	NC_008593	TAAAT	2	10	127147	127156	60 %	40 %	0 %	0 %	118444558
116	NC_008593	CTTTT	2	10	127929	127938	0 %	80 %	0 %	20 %	118442897
117	NC_008593	GTTAT	2	10	131194	131203	20 %	60 %	20 %	0 %	118444695
118	NC_008593	TATTC	2	10	134548	134557	20 %	60 %	0 %	20 %	118444629
119	NC_008593	TAAAT	2	10	134898	134907	60 %	40 %	0 %	0 %	118444629
120	NC_008593	ACTTA	2	10	135425	135434	40 %	40 %	0 %	20 %	118444629
121	NC_008593	CAAGA	2	10	136052	136061	60 %	0 %	20 %	20 %	118444224
122	NC_008593	ATGTT	2	10	137067	137076	20 %	60 %	20 %	0 %	118443576
123	NC_008593	AAGAA	2	10	137113	137122	80 %	0 %	20 %	0 %	118443576
124	NC_008593	AAAGA	2	10	137706	137715	80 %	0 %	20 %	0 %	118443619
125	NC_008593	AGATA	2	10	138667	138676	60 %	20 %	20 %	0 %	118443619
126	NC_008593	TTATT	2	10	140489	140498	20 %	80 %	0 %	0 %	118444703
127	NC_008593	ATAGA	2	10	141487	141496	60 %	20 %	20 %	0 %	118444361
128	NC_008593	AAAGA	2	10	143199	143208	80 %	0 %	20 %	0 %	118444361
129	NC_008593	ATGTT	2	10	144298	144307	20 %	60 %	20 %	0 %	118444361
130	NC_008593	TACAA	2	10	144336	144345	60 %	20 %	0 %	20 %	118444361
131	NC_008593	AATAT	2	10	144954	144963	60 %	40 %	0 %	0 %	118443543
132	NC_008593	AATTT	2	10	147609	147618	40 %	60 %	0 %	0 %	118444612
133	NC_008593	AATTT	2	10	150774	150783	40 %	60 %	0 %	0 %	118443675
134	NC_008593	TAAAG	2	10	151711	151720	60 %	20 %	20 %	0 %	118444683
135	NC_008593	ATCTT	2	10	153340	153349	20 %	60 %	0 %	20 %	118443535
136	NC_008593	ATTAT	2	10	154359	154368	40 %	60 %	0 %	0 %	118443535
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