MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 7626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAAA	2	8	24	31	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	ACCA	2	8	348	355	50 %	0 %	0 %	50 %	118444385
3	NC_008593	GATT	2	8	714	721	25 %	50 %	25 %	0 %	118443844
4	NC_008593	AAAT	2	8	787	794	75 %	25 %	0 %	0 %	118443844
5	NC_008593	CAAT	2	8	1139	1146	50 %	25 %	0 %	25 %	118442981
6	NC_008593	ATGA	2	8	1315	1322	50 %	25 %	25 %	0 %	118442981
7	NC_008593	TTAT	2	8	1620	1627	25 %	75 %	0 %	0 %	118442981
8	NC_008593	GATT	2	8	2201	2208	25 %	50 %	25 %	0 %	118444639
9	NC_008593	TAGT	2	8	2249	2256	25 %	50 %	25 %	0 %	118444639
10	NC_008593	ATTC	2	8	2434	2441	25 %	50 %	0 %	25 %	118444639
11	NC_008593	CTTT	2	8	2540	2547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008593	AGAT	2	8	3624	3631	50 %	25 %	25 %	0 %	118444248
13	NC_008593	AACA	2	8	3769	3776	75 %	0 %	0 %	25 %	118444248
14	NC_008593	AAAG	2	8	3806	3813	75 %	0 %	25 %	0 %	118444248
15	NC_008593	AGTA	2	8	4075	4082	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
16	NC_008593	AATA	2	8	4600	4607	75 %	25 %	0 %	0 %	118443722
17	NC_008593	ATAG	2	8	4760	4767	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
18	NC_008593	CTTT	2	8	5048	5055	0 %	75 %	0 %	25 %	118443722
19	NC_008593	AATG	2	8	5095	5102	50 %	25 %	25 %	0 %	118443722
20	NC_008593	TAAA	2	8	6237	6244	75 %	25 %	0 %	0 %	118444066
21	NC_008593	AGGT	2	8	6390	6397	25 %	25 %	50 %	0 %	118444066
22	NC_008593	AAAG	2	8	7230	7237	75 %	0 %	25 %	0 %	118443812
23	NC_008593	TAAA	2	8	7292	7299	75 %	25 %	0 %	0 %	118443812
24	NC_008593	GAAA	2	8	7340	7347	75 %	0 %	25 %	0 %	118443812
25	NC_008593	GTAT	2	8	8244	8251	25 %	50 %	25 %	0 %	118443230
26	NC_008593	TAAA	2	8	9139	9146	75 %	25 %	0 %	0 %	118443024
27	NC_008593	AAAT	2	8	9191	9198	75 %	25 %	0 %	0 %	118443024
28	NC_008593	GAAT	2	8	9511	9518	50 %	25 %	25 %	0 %	118443471
29	NC_008593	ATAA	2	8	9875	9882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	GTAT	2	8	10244	10251	25 %	50 %	25 %	0 %	118444149
31	NC_008593	ATCT	2	8	10393	10400	25 %	50 %	0 %	25 %	118444149
32	NC_008593	ATAG	2	8	10458	10465	50 %	25 %	25 %	0 %	118444149
33	NC_008593	TACA	2	8	10482	10489	50 %	25 %	0 %	25 %	118444149
34	NC_008593	AAAG	2	8	10563	10570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008593	TTAT	2	8	10836	10843	25 %	75 %	0 %	0 %	118444555
36	NC_008593	TTTA	2	8	11027	11034	25 %	75 %	0 %	0 %	118444555
37	NC_008593	TAAA	2	8	11047	11054	75 %	25 %	0 %	0 %	118444555
38	NC_008593	TCCT	2	8	11117	11124	0 %	50 %	0 %	50 %	118444555
39	NC_008593	AAGT	2	8	11588	11595	50 %	25 %	25 %	0 %	118444134
40	NC_008593	TTTA	2	8	11804	11811	25 %	75 %	0 %	0 %	118444568
41	NC_008593	GCTT	2	8	11927	11934	0 %	50 %	25 %	25 %	118444568
42	NC_008593	GAGT	2	8	12297	12304	25 %	25 %	50 %	0 %	118443896
43	NC_008593	ATAC	2	8	12311	12318	50 %	25 %	0 %	25 %	118443896
44	NC_008593	GAAT	2	8	12435	12442	50 %	25 %	25 %	0 %	118443896
45	NC_008593	TAAA	2	8	12580	12587	75 %	25 %	0 %	0 %	118444188
46	NC_008593	TATT	2	8	13128	13135	25 %	75 %	0 %	0 %	118443030
47	NC_008593	AGTA	2	8	13688	13695	50 %	25 %	25 %	0 %	118443356
48	NC_008593	TTTA	2	8	14203	14210	25 %	75 %	0 %	0 %	118443356
49	NC_008593	ATAA	2	8	14656	14663	75 %	25 %	0 %	0 %	118444184
50	NC_008593	GAAA	2	8	14679	14686	75 %	0 %	25 %	0 %	118444184
51	NC_008593	AGAA	2	8	14934	14941	75 %	0 %	25 %	0 %	118444184
52	NC_008593	ATAG	2	8	15472	15479	50 %	25 %	25 %	0 %	118444184
53	NC_008593	ATAG	2	8	15619	15626	50 %	25 %	25 %	0 %	118444184
54	NC_008593	ATAA	2	8	16093	16100	75 %	25 %	0 %	0 %	118444184
55	NC_008593	AGAA	3	12	16438	16449	75 %	0 %	25 %	0 %	118444702
56	NC_008593	AACA	2	8	16558	16565	75 %	0 %	0 %	25 %	118444702
57	NC_008593	CTAT	2	8	17283	17290	25 %	50 %	0 %	25 %	118443553
58	NC_008593	AAGA	2	8	17326	17333	75 %	0 %	25 %	0 %	118443553
59	NC_008593	TATT	2	8	17656	17663	25 %	75 %	0 %	0 %	118443553
60	NC_008593	TAAA	2	8	18463	18470	75 %	25 %	0 %	0 %	118443553
61	NC_008593	AACA	2	8	18766	18773	75 %	0 %	0 %	25 %	118443592
62	NC_008593	CATA	2	8	19027	19034	50 %	25 %	0 %	25 %	118443592
63	NC_008593	CTTG	2	8	19998	20005	0 %	50 %	25 %	25 %	118443592
64	NC_008593	TAAG	2	8	20373	20380	50 %	25 %	25 %	0 %	118443885
65	NC_008593	AAAT	2	8	20460	20467	75 %	25 %	0 %	0 %	118443885
66	NC_008593	TTTA	2	8	20562	20569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008593	AAAG	2	8	20632	20639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008593	ATCA	2	8	21410	21417	50 %	25 %	0 %	25 %	118444302
69	NC_008593	GGAA	2	8	21540	21547	50 %	0 %	50 %	0 %	118444302
70	NC_008593	GGAA	2	8	21597	21604	50 %	0 %	50 %	0 %	118444302
71	NC_008593	AGTA	2	8	21648	21655	50 %	25 %	25 %	0 %	118444302
72	NC_008593	TAAG	2	8	21982	21989	50 %	25 %	25 %	0 %	118444302
73	NC_008593	ATTT	2	8	22301	22308	25 %	75 %	0 %	0 %	118444706
74	NC_008593	ATTC	2	8	22329	22336	25 %	50 %	0 %	25 %	118444706
75	NC_008593	AAAT	2	8	22388	22395	75 %	25 %	0 %	0 %	118444706
76	NC_008593	TTTA	2	8	22892	22899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008593	TTTG	2	8	23012	23019	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008593	ATAA	2	8	23060	23067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008593	GTAG	2	8	23120	23127	25 %	25 %	50 %	0 %	118443218
80	NC_008593	TTAG	2	8	23207	23214	25 %	50 %	25 %	0 %	118443218
81	NC_008593	ATAA	2	8	24287	24294	75 %	25 %	0 %	0 %	118443218
82	NC_008593	TCAA	2	8	25075	25082	50 %	25 %	0 %	25 %	118443625
83	NC_008593	GAAG	2	8	25983	25990	50 %	0 %	50 %	0 %	118444008
84	NC_008593	GAAA	2	8	26007	26014	75 %	0 %	25 %	0 %	118444008
85	NC_008593	ACTT	3	12	26165	26176	25 %	50 %	0 %	25 %	118444008
86	NC_008593	ATAG	2	8	26992	26999	50 %	25 %	25 %	0 %	118444249
87	NC_008593	ATTT	2	8	27179	27186	25 %	75 %	0 %	0 %	118444249
88	NC_008593	AATA	2	8	27188	27195	75 %	25 %	0 %	0 %	118444249
89	NC_008593	TAAA	2	8	27709	27716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008593	GGAA	2	8	28191	28198	50 %	0 %	50 %	0 %	118443392
91	NC_008593	TCAA	2	8	28893	28900	50 %	25 %	0 %	25 %	118443392
92	NC_008593	ATTT	2	8	29489	29496	25 %	75 %	0 %	0 %	118442930
93	NC_008593	CATA	2	8	29884	29891	50 %	25 %	0 %	25 %	118442930
94	NC_008593	ATTT	2	8	30205	30212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008593	ATTT	2	8	30765	30772	25 %	75 %	0 %	0 %	118444610
96	NC_008593	TAAT	2	8	31170	31177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008593	TTAT	2	8	31314	31321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008593	AAGA	2	8	31606	31613	75 %	0 %	25 %	0 %	118444065
99	NC_008593	CTAA	2	8	32207	32214	50 %	25 %	0 %	25 %	118444065
100	NC_008593	ATAA	2	8	32762	32769	75 %	25 %	0 %	0 %	118444065
101	NC_008593	AAGT	2	8	33258	33265	50 %	25 %	25 %	0 %	118444000
102	NC_008593	CAGA	2	8	33543	33550	50 %	0 %	25 %	25 %	118444000
103	NC_008593	TAAA	2	8	34287	34294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008593	TATT	2	8	34573	34580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	AATT	2	8	34746	34753	50 %	50 %	0 %	0 %	118442902
106	NC_008593	TAAT	2	8	35440	35447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008593	AAGT	2	8	35719	35726	50 %	25 %	25 %	0 %	118443206
108	NC_008593	AATT	2	8	35864	35871	50 %	50 %	0 %	0 %	118443206
109	NC_008593	TATC	2	8	36519	36526	25 %	50 %	0 %	25 %	118443206
110	NC_008593	ATTA	2	8	36867	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008593	TTAA	3	12	37830	37841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008593	ATTT	2	8	37976	37983	25 %	75 %	0 %	0 %	118444581
113	NC_008593	TAAG	2	8	38197	38204	50 %	25 %	25 %	0 %	118444581
114	NC_008593	TTCT	2	8	38448	38455	0 %	75 %	0 %	25 %	118444581
115	NC_008593	TTAA	2	8	38568	38575	50 %	50 %	0 %	0 %	118444581
116	NC_008593	TTTA	2	8	38798	38805	25 %	75 %	0 %	0 %	118444581
117	NC_008593	TCTT	2	8	39076	39083	0 %	75 %	0 %	25 %	118444142
118	NC_008593	TTTA	2	8	39159	39166	25 %	75 %	0 %	0 %	118444142
119	NC_008593	TTTC	2	8	39548	39555	0 %	75 %	0 %	25 %	118444142
120	NC_008593	TTAC	2	8	39871	39878	25 %	50 %	0 %	25 %	118444142
121	NC_008593	AATT	2	8	40001	40008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008593	ATAA	2	8	40360	40367	75 %	25 %	0 %	0 %	118443542
123	NC_008593	TAGA	2	8	40439	40446	50 %	25 %	25 %	0 %	118443542
124	NC_008593	AAAT	2	8	40656	40663	75 %	25 %	0 %	0 %	118443542
125	NC_008593	AAAT	2	8	40790	40797	75 %	25 %	0 %	0 %	118443542
126	NC_008593	ATAA	2	8	41422	41429	75 %	25 %	0 %	0 %	118443542
127	NC_008593	AAGG	2	8	41479	41486	50 %	0 %	50 %	0 %	118443542
128	NC_008593	AAAT	2	8	41546	41553	75 %	25 %	0 %	0 %	118443542
129	NC_008593	ATAA	2	8	41817	41824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008593	AAAG	2	8	41848	41855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008593	AAAT	2	8	41859	41866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008593	TAGT	2	8	42067	42074	25 %	50 %	25 %	0 %	118443025
133	NC_008593	ATAC	2	8	42150	42157	50 %	25 %	0 %	25 %	118443025
134	NC_008593	TTCA	2	8	42364	42371	25 %	50 %	0 %	25 %	118443025
135	NC_008593	AATA	2	8	42496	42503	75 %	25 %	0 %	0 %	118443025
136	NC_008593	AAAG	2	8	42626	42633	75 %	0 %	25 %	0 %	118443447
137	NC_008593	TGAT	2	8	43182	43189	25 %	50 %	25 %	0 %	118443447
138	NC_008593	AGTA	2	8	43740	43747	50 %	25 %	25 %	0 %	118442905
139	NC_008593	ATTT	2	8	43817	43824	25 %	75 %	0 %	0 %	118443289
140	NC_008593	TAAA	2	8	44913	44920	75 %	25 %	0 %	0 %	118444515
141	NC_008593	AAGG	2	8	45197	45204	50 %	0 %	50 %	0 %	118444515
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143	NC_008593	GTAA	2	8	45889	45896	50 %	25 %	25 %	0 %	118444212
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