MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 35242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
2	NC_008593	CAT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118444385
3	NC_008593	AGA	3	9	431	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
4	NC_008593	GAA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
5	NC_008593	AAT	3	9	632	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443844
6	NC_008593	GTA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443844
7	NC_008593	TTG	2	6	777	782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443844
8	NC_008593	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443844
9	NC_008593	ATA	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
10	NC_008593	ATA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
11	NC_008593	TTG	2	6	936	941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443513
12	NC_008593	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
13	NC_008593	GTA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443513
14	NC_008593	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
15	NC_008593	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
16	NC_008593	ATA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
17	NC_008593	ACA	3	9	1377	1385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118442981
18	NC_008593	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
19	NC_008593	AGG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118442981
20	NC_008593	ACT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118442981
21	NC_008593	TAT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118442981
22	NC_008593	TAA	2	6	1488	1493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
23	NC_008593	AAT	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
24	NC_008593	ATG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
25	NC_008593	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118442981
26	NC_008593	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
27	NC_008593	AGA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
28	NC_008593	AGA	3	9	2154	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
29	NC_008593	AAT	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444639
30	NC_008593	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
31	NC_008593	GAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
32	NC_008593	AGA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
33	NC_008593	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118444248
34	NC_008593	CAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
35	NC_008593	GAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
36	NC_008593	TAT	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
37	NC_008593	CAG	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118444248
38	NC_008593	TGT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
39	NC_008593	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118444248
40	NC_008593	GTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
41	NC_008593	GAA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
42	NC_008593	TAA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
43	NC_008593	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
44	NC_008593	AGA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
45	NC_008593	AGA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
46	NC_008593	TGA	2	6	3205	3210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
47	NC_008593	TTA	2	6	3221	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
48	NC_008593	AAC	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
49	NC_008593	ATA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
50	NC_008593	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
51	NC_008593	TGT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
52	NC_008593	AAC	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
53	NC_008593	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
54	NC_008593	TAT	2	6	3594	3599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
55	NC_008593	AAG	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
56	NC_008593	AAG	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
57	NC_008593	ATT	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
58	NC_008593	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
59	NC_008593	ACA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
60	NC_008593	GAA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
61	NC_008593	ATA	2	6	3932	3937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
62	NC_008593	TGT	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443722
63	NC_008593	ATG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
64	NC_008593	AGG	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
65	NC_008593	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
66	NC_008593	AAT	3	9	4474	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443722
67	NC_008593	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
68	NC_008593	GAT	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
69	NC_008593	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
70	NC_008593	CAC	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118443722
71	NC_008593	CTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118443722
72	NC_008593	AGA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
73	NC_008593	GGA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
74	NC_008593	AAG	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
75	NC_008593	ATG	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
76	NC_008593	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443722
77	NC_008593	GAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
78	NC_008593	TGC	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443722
79	NC_008593	TGA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
80	NC_008593	ATG	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
81	NC_008593	ATT	3	9	5293	5301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443722
82	NC_008593	AGA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
83	NC_008593	AGA	2	6	5404	5409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
84	NC_008593	AAG	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
85	NC_008593	CAG	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443722
86	NC_008593	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
87	NC_008593	CTG	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443722
88	NC_008593	ACA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443722
89	NC_008593	AGG	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
90	NC_008593	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118444066
91	NC_008593	AAG	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
92	NC_008593	TTA	2	6	5990	5995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444066
93	NC_008593	ATA	2	6	6047	6052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444066
94	NC_008593	GGA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118444066
95	NC_008593	AAT	2	6	6163	6168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444066
96	NC_008593	GAT	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
97	NC_008593	ATG	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
98	NC_008593	AGA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
99	NC_008593	AGT	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
100	NC_008593	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
101	NC_008593	AGA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
102	NC_008593	AGA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
103	NC_008593	TTA	3	9	6537	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444066
104	NC_008593	ATT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443812
105	NC_008593	TGA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443812
106	NC_008593	AGA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
107	NC_008593	AGA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
108	NC_008593	AGC	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443812
109	NC_008593	AAG	2	6	6926	6931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
110	NC_008593	AGA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
111	NC_008593	CTA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443812
112	NC_008593	ACA	2	6	7155	7160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443812
113	NC_008593	AAT	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443812
114	NC_008593	AGA	2	6	7281	7286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
115	NC_008593	TAA	2	6	7466	7471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443812
116	NC_008593	ACT	3	9	7739	7747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443230
117	NC_008593	TAT	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443230
118	NC_008593	ACA	2	6	7823	7828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443230
119	NC_008593	ATG	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443230
120	NC_008593	AGA	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443230
121	NC_008593	TCC	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118443230
122	NC_008593	TGC	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443230
123	NC_008593	AAG	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443230
124	NC_008593	TAC	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443230
125	NC_008593	ATG	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443230
126	NC_008593	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443230
127	NC_008593	AGA	2	6	8519	8524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
128	NC_008593	TGA	2	6	8606	8611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443024
129	NC_008593	AAT	2	6	8618	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
130	NC_008593	AAT	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
131	NC_008593	AGA	2	6	8715	8720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
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