MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	ATGACG	2	12	1757	1768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008578	CGGCTT	2	12	24558	24569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008578	GCCGGC	2	12	40941	40952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008578	CGTACA	2	12	45622	45633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008578	CACACC	2	12	57198	57209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008578	GAGCTG	2	12	71353	71364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008578	CGCGGG	2	12	154727	154738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008578	CTCGAT	2	12	183124	183135	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008578	CGGCCG	2	12	190382	190393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008578	CGGCCG	2	12	193009	193020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008578	GGTGCC	2	12	216272	216283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008578	AGCCGG	2	12	263614	263625	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008578	CGCGTG	2	12	367403	367414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008578	CGGCCG	2	12	375025	375036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008578	GACCGA	2	12	393166	393177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008578	GACGGG	2	12	430674	430685	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008578	GCGGCC	2	12	438350	438361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008578	AGGGTC	2	12	490062	490073	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008578	CCGCGG	2	12	502363	502374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008578	CGTGTG	2	12	511599	511610	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008578	AGCGGT	2	12	545106	545117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_008578	GGCTCG	2	12	718420	718431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008578	CGGGCG	2	12	718469	718480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008578	GGGGAA	2	12	754569	754580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008578	TTGACG	2	12	761764	761775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008578	CGGTGC	2	12	771312	771323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008578	TCGCGA	2	12	779144	779155	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008578	CGCCGA	2	12	829423	829434	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008578	CGTCCT	2	12	829467	829478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008578	CGACGG	2	12	874818	874829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008578	CGCGGG	2	12	921089	921100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008578	TGACCT	2	12	922329	922340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008578	CCGCAC	2	12	958925	958936	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008578	CGTCGC	2	12	991216	991227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008578	GGGAAG	2	12	1027662	1027673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008578	GCGGCT	2	12	1046995	1047006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008578	CGCGGG	2	12	1063448	1063459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008578	TCCGCG	2	12	1069238	1069249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008578	TGAGGG	2	12	1119049	1119060	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008578	TCCGGC	2	12	1176121	1176132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008578	GCGCCG	2	12	1176441	1176452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008578	ACCCTG	2	12	1198048	1198059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008578	GCGGCC	2	12	1273048	1273059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008578	CCGAAG	2	12	1280564	1280575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008578	CCGCGA	2	12	1313836	1313847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008578	GACACG	2	12	1387494	1387505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008578	TGCACT	2	12	1394814	1394825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008578	GCCGAC	2	12	1520734	1520745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008578	CGCCTC	2	12	1524944	1524955	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008578	GCACCC	2	12	1627166	1627177	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008578	CAGCAC	2	12	1649393	1649404	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008578	GCCGGA	2	12	1681463	1681474	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008578	CCGATC	2	12	1714610	1714621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008578	TCTGCC	2	12	1744543	1744554	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008578	TGTGGC	2	12	1766042	1766053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008578	CCGCTC	2	12	1782495	1782506	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008578	GTCGGC	2	12	1814380	1814391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008578	TGGCGC	2	12	1825928	1825939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008578	TGACAA	2	12	1834704	1834715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008578	GCCCGA	2	12	1861240	1861251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008578	GCCGAC	2	12	1916394	1916405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008578	GCTACT	2	12	1935339	1935350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008578	CGCCCG	2	12	1935964	1935975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008578	GCCAAG	2	12	1946974	1946985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008578	CGCAGG	2	12	1954284	1954295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008578	GCACGG	2	12	1998171	1998182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008578	CGACCG	2	12	1999969	1999980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008578	CGGGAG	2	12	2024626	2024637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008578	GCAGCG	2	12	2025975	2025986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008578	ACCACA	2	12	2061293	2061304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008578	GTGGCG	2	12	2065906	2065917	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008578	GCCTGC	2	12	2098264	2098275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008578	CCTGCA	2	12	2203732	2203743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008578	GACGCC	2	12	2220987	2220998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008578	CATCGT	2	12	2231825	2231836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008578	GGAACC	2	12	2237278	2237289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008578	CGCCGG	2	12	2265292	2265303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008578	CTGCAC	2	12	2277302	2277313	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008578	ATCGGC	2	12	2302146	2302157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008578	GGCGCC	2	12	2317346	2317357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008578	GCGACG	2	12	2321769	2321780	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008578	GCGAGC	2	12	2321781	2321792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008578	GGCACG	2	12	2353196	2353207	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008578	GGACCG	2	12	2383915	2383926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008578	GGCACG	2	12	2386129	2386140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008578	GGACGC	2	12	2389521	2389532	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008578	CCGAGC	2	12	2425997	2426008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008578	CGAGCC	2	12	2426016	2426027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.