MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 2991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	TGCAG	2	10	1486	1495	20 %	20 %	40 %	20 %	117918461
2	NC_008577	GAACT	2	10	3293	3302	40 %	20 %	20 %	20 %	117918462
3	NC_008577	TTACT	2	10	4001	4010	20 %	60 %	0 %	20 %	117918463
4	NC_008577	CTGCG	2	10	4836	4845	0 %	20 %	40 %	40 %	117918463
5	NC_008577	CAGTA	2	10	6917	6926	40 %	20 %	20 %	20 %	117918465
6	NC_008577	CATAA	2	10	7109	7118	60 %	20 %	0 %	20 %	117918465
7	NC_008577	ATAGG	2	10	7188	7197	40 %	20 %	40 %	0 %	117918465
8	NC_008577	ACTTA	2	10	9058	9067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008577	AGTGA	2	10	14445	14454	40 %	20 %	40 %	0 %	117918471
10	NC_008577	AGCTT	2	10	15884	15893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008577	GCAAA	2	10	17506	17515	60 %	0 %	20 %	20 %	117918473
12	NC_008577	GCTGA	2	10	20641	20650	20 %	20 %	40 %	20 %	117918475
13	NC_008577	TGGCG	2	10	21002	21011	0 %	20 %	60 %	20 %	117918476
14	NC_008577	ATTGC	2	10	22451	22460	20 %	40 %	20 %	20 %	117918477
15	NC_008577	AGATT	2	10	22571	22580	40 %	40 %	20 %	0 %	117918478
16	NC_008577	GGTTA	2	10	23219	23228	20 %	40 %	40 %	0 %	117918478
17	NC_008577	AGAGT	2	10	23561	23570	40 %	20 %	40 %	0 %	117918478
18	NC_008577	CCAAT	2	10	27708	27717	40 %	20 %	0 %	40 %	117918481
19	NC_008577	ATTTT	2	10	31878	31887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008577	CGGCG	2	10	32734	32743	0 %	0 %	60 %	40 %	117918484
21	NC_008577	CGAAA	2	10	33312	33321	60 %	0 %	20 %	20 %	117918484
22	NC_008577	GGACT	2	10	34412	34421	20 %	20 %	40 %	20 %	117918486
23	NC_008577	TCGCG	2	10	34838	34847	0 %	20 %	40 %	40 %	117918486
24	NC_008577	TGCTG	2	10	35738	35747	0 %	40 %	40 %	20 %	117918487
25	NC_008577	TGTGA	2	10	42247	42256	20 %	40 %	40 %	0 %	117918493
26	NC_008577	ATTTA	2	10	43190	43199	40 %	60 %	0 %	0 %	117918495
27	NC_008577	CGAAA	2	10	44731	44740	60 %	0 %	20 %	20 %	117918496
28	NC_008577	GGTTG	2	10	45150	45159	0 %	40 %	60 %	0 %	117918496
29	NC_008577	ATTCA	2	10	46470	46479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008577	TGGCC	2	10	46747	46756	0 %	20 %	40 %	40 %	117918499
31	NC_008577	ACTGC	2	10	48475	48484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008577	TGGCG	2	10	49442	49451	0 %	20 %	60 %	20 %	117918502
33	NC_008577	GAAGA	2	10	49528	49537	60 %	0 %	40 %	0 %	117918503
34	NC_008577	CACAA	2	10	49833	49842	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008577	AGTCG	2	10	53899	53908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008577	AGGCT	2	10	54228	54237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008577	AATTT	2	10	55773	55782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008577	ATCCC	2	10	55857	55866	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008577	TCCGC	2	10	56037	56046	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008577	ATTTG	2	10	56734	56743	20 %	60 %	20 %	0 %	117918506
41	NC_008577	TTGAT	2	10	58576	58585	20 %	60 %	20 %	0 %	117918508
42	NC_008577	GCCTT	2	10	61136	61145	0 %	40 %	20 %	40 %	117918510
43	NC_008577	GATAG	2	10	62711	62720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008577	AAGTT	2	10	62855	62864	40 %	40 %	20 %	0 %	117918512
45	NC_008577	AGAAA	2	10	64207	64216	80 %	0 %	20 %	0 %	117918513
46	NC_008577	AATAA	2	10	64260	64269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008577	TGGCG	2	10	65633	65642	0 %	20 %	60 %	20 %	117918514
48	NC_008577	TTTTA	2	10	66087	66096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008577	CCAGC	2	10	68688	68697	20 %	0 %	20 %	60 %	117918516
50	NC_008577	TATGG	2	10	69565	69574	20 %	40 %	40 %	0 %	117918517
51	NC_008577	AGCAA	2	10	71578	71587	60 %	0 %	20 %	20 %	117918519
52	NC_008577	AAGAT	2	10	73605	73614	60 %	20 %	20 %	0 %	117918521
53	NC_008577	TCGTG	2	10	76691	76700	0 %	40 %	40 %	20 %	117918524
54	NC_008577	TTGAT	2	10	77372	77381	20 %	60 %	20 %	0 %	117918525
55	NC_008577	TTAGC	2	10	79524	79533	20 %	40 %	20 %	20 %	117918526
56	NC_008577	TTGAA	2	10	79879	79888	40 %	40 %	20 %	0 %	117918526
57	NC_008577	AGCAA	2	10	83800	83809	60 %	0 %	20 %	20 %	117918529
58	NC_008577	AACCG	2	10	85453	85462	40 %	0 %	20 %	40 %	117918531
59	NC_008577	TGCGC	2	10	90347	90356	0 %	20 %	40 %	40 %	117918537
60	NC_008577	TTCTG	2	10	90942	90951	0 %	60 %	20 %	20 %	117918537
61	NC_008577	GCAGC	2	10	90990	90999	20 %	0 %	40 %	40 %	117918537
62	NC_008577	TTGGC	2	10	91174	91183	0 %	40 %	40 %	20 %	117918538
63	NC_008577	TGGCA	2	10	91270	91279	20 %	20 %	40 %	20 %	117918538
64	NC_008577	TGACC	2	10	91406	91415	20 %	20 %	20 %	40 %	117918538
65	NC_008577	GCCGT	2	10	92730	92739	0 %	20 %	40 %	40 %	117918539
66	NC_008577	TGAGT	2	10	96036	96045	20 %	40 %	40 %	0 %	117918540
67	NC_008577	TCGAT	2	10	96255	96264	20 %	40 %	20 %	20 %	117918540
68	NC_008577	AAGCA	2	10	100107	100116	60 %	0 %	20 %	20 %	117918547
69	NC_008577	GATTT	2	10	100471	100480	20 %	60 %	20 %	0 %	117918547
70	NC_008577	GAAAG	2	10	102409	102418	60 %	0 %	40 %	0 %	117918550
71	NC_008577	AGCTC	2	10	104106	104115	20 %	20 %	20 %	40 %	117918551
72	NC_008577	CCCGC	2	10	108021	108030	0 %	0 %	20 %	80 %	117918556
73	NC_008577	AGTTG	2	10	109048	109057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008577	TCCGT	2	10	112790	112799	0 %	40 %	20 %	40 %	117918559
75	NC_008577	AAAAC	2	10	114629	114638	80 %	0 %	0 %	20 %	117918560
76	NC_008577	AAGCA	2	10	114819	114828	60 %	0 %	20 %	20 %	117918560
77	NC_008577	TTTCG	2	10	115237	115246	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008577	CTGAA	2	10	117715	117724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008577	TGTGA	2	10	117894	117903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008577	TGCCA	2	10	118286	118295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008577	GAATG	2	10	118751	118760	40 %	20 %	40 %	0 %	117918561
82	NC_008577	ATGAC	2	10	125625	125634	40 %	20 %	20 %	20 %	117918567
83	NC_008577	AAGCG	2	10	126804	126813	40 %	0 %	40 %	20 %	117918567
84	NC_008577	GTCGA	2	10	129913	129922	20 %	20 %	40 %	20 %	117918571
85	NC_008577	CGGTG	2	10	133462	133471	0 %	20 %	60 %	20 %	117918575
86	NC_008577	CTAAT	2	10	134062	134071	40 %	40 %	0 %	20 %	117918575
87	NC_008577	GTGAA	2	10	135909	135918	40 %	20 %	40 %	0 %	117918579
88	NC_008577	CGCAG	2	10	137568	137577	20 %	0 %	40 %	40 %	117918580
89	NC_008577	ATCCC	2	10	139366	139375	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_008577	AGCCC	2	10	139766	139775	20 %	0 %	20 %	60 %	117918582
91	NC_008577	TTATC	2	10	141353	141362	20 %	60 %	0 %	20 %	117918582
92	NC_008577	ACAGC	2	10	141727	141736	40 %	0 %	20 %	40 %	117918582
93	NC_008577	TAGCC	2	10	142190	142199	20 %	20 %	20 %	40 %	117918583
94	NC_008577	ATCCA	2	10	144938	144947	40 %	20 %	0 %	40 %	117918587
95	NC_008577	CGAAG	2	10	145249	145258	40 %	0 %	40 %	20 %	117918587
96	NC_008577	CGGCG	2	10	149250	149259	0 %	0 %	60 %	40 %	117918591
97	NC_008577	ATCTA	2	10	151842	151851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008577	GCTAT	2	10	153430	153439	20 %	40 %	20 %	20 %	117918593
99	NC_008577	CTCCA	2	10	153450	153459	20 %	20 %	0 %	60 %	117918593
100	NC_008577	AGAGT	2	10	159964	159973	40 %	20 %	40 %	0 %	117918598
101	NC_008577	TTGCT	2	10	161245	161254	0 %	60 %	20 %	20 %	117918598
102	NC_008577	TTTGG	2	10	164588	164597	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008577	GGGCA	2	10	166555	166564	20 %	0 %	60 %	20 %	117918602
104	NC_008577	TGACC	2	10	166821	166830	20 %	20 %	20 %	40 %	117918602
105	NC_008577	GCCAA	2	10	167065	167074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008577	GCCGA	2	10	169276	169285	20 %	0 %	40 %	40 %	117918604
107	NC_008577	TATCC	2	10	172415	172424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008577	GCTGC	2	10	172665	172674	0 %	20 %	40 %	40 %	117918606
109	NC_008577	GGCTA	2	10	173054	173063	20 %	20 %	40 %	20 %	117918606
110	NC_008577	TGGTT	2	10	174124	174133	0 %	60 %	40 %	0 %	117918608
111	NC_008577	GCCGC	2	10	175517	175526	0 %	0 %	40 %	60 %	117918609
112	NC_008577	TTACT	2	10	176273	176282	20 %	60 %	0 %	20 %	117918609
113	NC_008577	GATGC	2	10	183404	183413	20 %	20 %	40 %	20 %	117918617
114	NC_008577	TTGTC	2	10	183891	183900	0 %	60 %	20 %	20 %	117918617
115	NC_008577	CAGTA	2	10	186260	186269	40 %	20 %	20 %	20 %	117918620
116	NC_008577	ACGCT	2	10	187501	187510	20 %	20 %	20 %	40 %	117918622
117	NC_008577	CATCC	2	10	188529	188538	20 %	20 %	0 %	60 %	117918622
118	NC_008577	TGCCT	2	10	194350	194359	0 %	40 %	20 %	40 %	117918626
119	NC_008577	GGCAT	2	10	200273	200282	20 %	20 %	40 %	20 %	117918626
120	NC_008577	GTGGC	2	10	200991	201000	0 %	20 %	60 %	20 %	117918626
121	NC_008577	AATCA	2	10	204866	204875	60 %	20 %	0 %	20 %	117918630
122	NC_008577	AGTCA	2	10	205321	205330	40 %	20 %	20 %	20 %	117918631
123	NC_008577	GCCTT	2	10	205748	205757	0 %	40 %	20 %	40 %	117918631
124	NC_008577	GCCGA	2	10	206191	206200	20 %	0 %	40 %	40 %	117918631
125	NC_008577	TTCGT	2	10	206639	206648	0 %	60 %	20 %	20 %	117918631
126	NC_008577	AGAAA	2	10	207307	207316	80 %	0 %	20 %	0 %	117918632
127	NC_008577	CTGAG	2	10	208371	208380	20 %	20 %	40 %	20 %	117918632
128	NC_008577	GGTTT	2	10	208664	208673	0 %	60 %	40 %	0 %	117918633
129	NC_008577	GTTTT	2	10	210166	210175	0 %	80 %	20 %	0 %	117918634
130	NC_008577	CATCG	2	10	212988	212997	20 %	20 %	20 %	40 %	117918637
131	NC_008577	CTTCA	2	10	215003	215012	20 %	40 %	0 %	40 %	117918639
132	NC_008577	AGTCG	2	10	219057	219066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008577	AGGCT	2	10	219386	219395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008577	ATCCC	2	10	221063	221072	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_008577	GTTCA	2	10	221630	221639	20 %	40 %	20 %	20 %	117918640
136	NC_008577	GTCAG	2	10	222938	222947	20 %	20 %	40 %	20 %	117918641
137	NC_008577	TCTAT	2	10	223172	223181	20 %	60 %	0 %	20 %	117918641
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159	NC_008577	AGTCG	2	10	270255	270264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_008577	CATTT	2	10	416656	416665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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