MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	ACTTA	2	10	9058	9067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008577	AGCTT	2	10	15884	15893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008577	ATTTT	2	10	31878	31887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008577	ATTCA	2	10	46470	46479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008577	ACTGC	2	10	48475	48484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008577	CACAA	2	10	49833	49842	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008577	AGTCG	2	10	53899	53908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008577	AGGCT	2	10	54228	54237	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008577	AATTT	2	10	55773	55782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008577	ATCCC	2	10	55857	55866	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008577	TCCGC	2	10	56037	56046	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008577	GATAG	2	10	62711	62720	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008577	AATAA	2	10	64260	64269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008577	TTTTA	2	10	66087	66096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008577	AGTTG	2	10	109048	109057	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008577	TTTCG	2	10	115237	115246	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008577	CTGAA	2	10	117715	117724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008577	TGTGA	2	10	117894	117903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008577	TGCCA	2	10	118286	118295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_008577	ATCCC	2	10	139366	139375	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008577	ATCTA	2	10	151842	151851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008577	TTTGG	2	10	164588	164597	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008577	GCCAA	2	10	167065	167074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008577	TATCC	2	10	172415	172424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008577	AGTCG	2	10	219057	219066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008577	AGGCT	2	10	219386	219395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008577	ATCCC	2	10	221063	221072	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008577	CGAAT	2	10	266985	266994	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008577	TAGTG	2	10	269324	269333	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008577	AGTCG	2	10	270255	270264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008577	AGGCT	2	10	270584	270593	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008577	ATCCC	2	10	272261	272270	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_008577	TCCGC	2	10	272456	272465	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_008577	TTTGC	2	10	273207	273216	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008577	TTTAA	2	10	288278	288287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008577	CGCGG	2	10	299335	299344	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008577	CCATT	2	10	301285	301294	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008577	AAATA	2	10	302773	302782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008577	TAAAA	2	10	357701	357710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008577	CTTAT	2	10	383017	383026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008577	TAAGC	2	10	400023	400032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008577	ATCCC	2	10	411525	411534	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008577	CATTT	2	10	416656	416665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008577	GACGC	2	10	443009	443018	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008577	AAAGC	2	10	464719	464728	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008577	ACTGT	2	10	478688	478697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008577	AAATA	2	10	527768	527777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008577	GGTAA	2	10	533527	533536	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008577	AAACG	2	10	534195	534204	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008577	CACCC	2	10	539109	539118	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_008577	TGAAA	2	10	541062	541071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008577	CTCGG	2	10	550891	550900	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008577	TTTTA	2	10	571709	571718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008577	GAGGG	2	10	594292	594301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008577	AAAAC	2	10	596332	596341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008577	TTAAC	2	10	602702	602711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008577	CTAGG	2	10	610786	610795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008577	AAAAC	2	10	611177	611186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008577	AAATG	2	10	611674	611683	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008577	TCAGC	2	10	611815	611824	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008577	TGAAA	2	10	622405	622414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008577	TTCCT	2	10	690783	690792	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008577	GTGTA	2	10	709415	709424	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008577	CTTGT	2	10	724084	724093	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008577	TTGTG	2	10	730587	730596	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008577	CGCTC	2	10	736611	736620	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_008577	ATTTT	2	10	758607	758616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008577	TTCAA	2	10	760795	760804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008577	ATGCA	2	10	760815	760824	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_008577	GTTAG	2	10	761661	761670	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008577	GAGGG	2	10	761952	761961	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008577	AAATG	2	10	770350	770359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008577	GACTA	2	10	770511	770520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008577	CAAAA	2	10	774000	774009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008577	TTTTA	2	10	779780	779789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008577	CCTAG	2	10	785345	785354	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008577	GAGAT	2	10	790069	790078	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008577	CTTAT	2	10	797207	797216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008577	TAAAA	2	10	827101	827110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008577	TGTAA	2	10	833200	833209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008577	AATTA	2	10	837610	837619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008577	ATTTT	2	10	843012	843021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008577	GATAA	2	10	855039	855048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008577	GCAAC	2	10	881967	881976	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008577	AATCC	2	10	893576	893585	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_008577	GCGAG	2	10	900542	900551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008577	CTTTT	2	10	910814	910823	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008577	GTTTT	2	10	914352	914361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008577	TTGTT	2	10	914528	914537	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008577	CTCGC	2	10	922682	922691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_008577	TGCAA	2	10	951693	951702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008577	AAACA	2	10	985287	985296	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008577	AGCTG	2	10	989823	989832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_008577	AAGTT	2	10	998060	998069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008577	TCATT	2	10	1004225	1004234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008577	AGTTA	2	10	1005263	1005272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008577	ACTGG	2	10	1026427	1026436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008577	TAATC	2	10	1029225	1029234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008577	TAAAT	2	10	1032439	1032448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008577	TTTTG	2	10	1036625	1036634	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008577	TGGAT	2	10	1052046	1052055	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008577	ATTTC	2	10	1054660	1054669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008577	GAGAA	2	10	1057524	1057533	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008577	GTTAG	2	10	1061613	1061622	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008577	GTCAC	2	10	1062882	1062891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008577	GGCAG	2	10	1075822	1075831	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008577	CCATA	2	10	1082776	1082785	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_008577	AGCCG	2	10	1083040	1083049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008577	AGTGC	2	10	1087183	1087192	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008577	TAGTT	2	10	1111159	1111168	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008577	AAAAG	2	10	1118005	1118014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008577	TGTTA	2	10	1127394	1127403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008577	CACAT	2	10	1127736	1127745	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_008577	TGGCT	2	10	1134202	1134211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008577	GAGTG	2	10	1143334	1143343	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008577	ACAAA	2	10	1178431	1178440	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008577	AGCAC	2	10	1184199	1184208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008577	AGCAC	2	10	1184635	1184644	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008577	AAAAC	2	10	1192988	1192997	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008577	GCGTG	2	10	1214031	1214040	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_008577	GTTAA	2	10	1216566	1216575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008577	CAAAA	2	10	1229672	1229681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008577	ATCTC	2	10	1246068	1246077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_008577	AAATA	2	10	1249062	1249071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008577	ATGAT	2	10	1278151	1278160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008577	AACTG	2	10	1283114	1283123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008577	AACTC	2	10	1288284	1288293	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008577	ATAGC	2	10	1300213	1300222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008577	AAAGC	2	10	1337605	1337614	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008577	CTTTA	2	10	1339166	1339175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008577	TGATG	2	10	1342280	1342289	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008577	TAGCT	2	10	1353802	1353811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008577	ACTAA	2	10	1360958	1360967	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008577	CGAAT	2	10	1362884	1362893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008577	TTAGC	2	10	1366985	1366994	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008577	ATGCA	2	10	1372571	1372580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008577	AACTA	2	10	1386013	1386022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008577	AACTA	2	10	1386649	1386658	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008577	ACGAG	2	10	1389823	1389832	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008577	ATTTT	2	10	1390568	1390577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008577	ATTGG	2	10	1398608	1398617	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008577	TTGTC	2	10	1421235	1421244	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008577	TCTGT	2	10	1421245	1421254	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008577	CGCCT	2	10	1422700	1422709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_008577	CTTTA	2	10	1428183	1428192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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