MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Magnetococcus marinus MC-1 chromosome

Total Repeats: 3081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008576	ACCAC	2	10	1418	1427	40 %	0 %	0 %	60 %	117923319
2	NC_008576	CACGG	2	10	2932	2941	20 %	0 %	40 %	40 %	117923321
3	NC_008576	GGGGT	2	10	4338	4347	0 %	20 %	80 %	0 %	117923322
4	NC_008576	TGGTC	2	10	4692	4701	0 %	40 %	40 %	20 %	117923322
5	NC_008576	GGCAA	2	10	5084	5093	40 %	0 %	40 %	20 %	117923322
6	NC_008576	TTCTC	2	10	6939	6948	0 %	60 %	0 %	40 %	117923324
7	NC_008576	GCATG	2	10	7943	7952	20 %	20 %	40 %	20 %	117923324
8	NC_008576	GTCGC	2	10	8089	8098	0 %	20 %	40 %	40 %	117923324
9	NC_008576	AGCTT	2	10	9605	9614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008576	CCCTG	2	10	10646	10655	0 %	20 %	20 %	60 %	117923327
11	NC_008576	GATGA	2	10	12248	12257	40 %	20 %	40 %	0 %	117923329
12	NC_008576	ACCCC	2	10	13290	13299	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
13	NC_008576	AGAAT	2	10	17070	17079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008576	CCCCG	2	10	17811	17820	0 %	0 %	20 %	80 %	117923333
15	NC_008576	GCAAT	2	10	18582	18591	40 %	20 %	20 %	20 %	117923333
16	NC_008576	GCGGG	2	10	20881	20890	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008576	CAGCG	2	10	21237	21246	20 %	0 %	40 %	40 %	117923337
18	NC_008576	CCAAC	2	10	22905	22914	40 %	0 %	0 %	60 %	117923339
19	NC_008576	CAAGC	2	10	23486	23495	40 %	0 %	20 %	40 %	117923339
20	NC_008576	CGGTG	2	10	24776	24785	0 %	20 %	60 %	20 %	117923341
21	NC_008576	CCCAA	2	10	26520	26529	40 %	0 %	0 %	60 %	117923342
22	NC_008576	TTTGG	2	10	27583	27592	0 %	60 %	40 %	0 %	117923343
23	NC_008576	TGGGG	2	10	27721	27730	0 %	20 %	80 %	0 %	117923343
24	NC_008576	GCATG	2	10	28074	28083	20 %	20 %	40 %	20 %	117923343
25	NC_008576	GAATC	2	10	28691	28700	40 %	20 %	20 %	20 %	117923344
26	NC_008576	GATTT	2	10	28824	28833	20 %	60 %	20 %	0 %	117923344
27	NC_008576	GCAGA	2	10	29541	29550	40 %	0 %	40 %	20 %	117923344
28	NC_008576	AGTTT	2	10	31744	31753	20 %	60 %	20 %	0 %	117923346
29	NC_008576	CTGCC	2	10	32092	32101	0 %	20 %	20 %	60 %	117923347
30	NC_008576	GTGGG	2	10	32606	32615	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008576	AGCCA	2	10	33266	33275	40 %	0 %	20 %	40 %	117923348
32	NC_008576	TTTGG	2	10	34085	34094	0 %	60 %	40 %	0 %	117923349
33	NC_008576	GCGCT	2	10	37254	37263	0 %	20 %	40 %	40 %	117923353
34	NC_008576	GGGGC	2	10	38325	38334	0 %	0 %	80 %	20 %	117923354
35	NC_008576	CAACG	2	10	41370	41379	40 %	0 %	20 %	40 %	117923356
36	NC_008576	GATGG	2	10	41916	41925	20 %	20 %	60 %	0 %	117923357
37	NC_008576	TTGGG	2	10	42593	42602	0 %	40 %	60 %	0 %	117923357
38	NC_008576	TGGGG	2	10	42799	42808	0 %	20 %	80 %	0 %	117923358
39	NC_008576	CACCC	2	10	42953	42962	20 %	0 %	0 %	80 %	117923358
40	NC_008576	AGGTG	2	10	47720	47729	20 %	20 %	60 %	0 %	117923363
41	NC_008576	TGGTG	2	10	48023	48032	0 %	40 %	60 %	0 %	117923363
42	NC_008576	CAAGC	2	10	52137	52146	40 %	0 %	20 %	40 %	117923368
43	NC_008576	TGTGA	2	10	53901	53910	20 %	40 %	40 %	0 %	117923369
44	NC_008576	TTGTT	2	10	54327	54336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008576	GGGTG	2	10	58761	58770	0 %	20 %	80 %	0 %	117923372
46	NC_008576	GTGCC	2	10	60428	60437	0 %	20 %	40 %	40 %	117923373
47	NC_008576	GGTGT	2	10	62243	62252	0 %	40 %	60 %	0 %	117923375
48	NC_008576	TCGCT	2	10	63713	63722	0 %	40 %	20 %	40 %	117923377
49	NC_008576	GCGCA	2	10	63727	63736	20 %	0 %	40 %	40 %	117923377
50	NC_008576	AGCCG	2	10	65286	65295	20 %	0 %	40 %	40 %	117923379
51	NC_008576	AGCGT	2	10	65572	65581	20 %	20 %	40 %	20 %	117923379
52	NC_008576	GCACC	2	10	67457	67466	20 %	0 %	20 %	60 %	117923381
53	NC_008576	CCTGA	2	10	68246	68255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008576	AAGGA	2	10	68705	68714	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008576	AGCGC	2	10	72439	72448	20 %	0 %	40 %	40 %	117923386
56	NC_008576	CCCTT	2	10	73342	73351	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_008576	AGCGC	2	10	73786	73795	20 %	0 %	40 %	40 %	117923387
58	NC_008576	CCCTT	2	10	74689	74698	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_008576	CGGTG	2	10	76887	76896	0 %	20 %	60 %	20 %	117923389
60	NC_008576	CGTGC	2	10	77083	77092	0 %	20 %	40 %	40 %	117923389
61	NC_008576	GCCGC	2	10	80432	80441	0 %	0 %	40 %	60 %	117923392
62	NC_008576	GGATG	2	10	80939	80948	20 %	20 %	60 %	0 %	117923393
63	NC_008576	CGGCG	2	10	83548	83557	0 %	0 %	60 %	40 %	117923396
64	NC_008576	AGCAT	2	10	84154	84163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008576	TGCGT	2	10	84693	84702	0 %	40 %	40 %	20 %	117923397
66	NC_008576	GATGA	2	10	85162	85171	40 %	20 %	40 %	0 %	117923397
67	NC_008576	GACCA	2	10	85912	85921	40 %	0 %	20 %	40 %	117923397
68	NC_008576	AGACG	2	10	90743	90752	40 %	0 %	40 %	20 %	117923402
69	NC_008576	AGTGA	2	10	91898	91907	40 %	20 %	40 %	0 %	117923404
70	NC_008576	GATGG	2	10	92219	92228	20 %	20 %	60 %	0 %	117923405
71	NC_008576	TGTGG	2	10	94169	94178	0 %	40 %	60 %	0 %	117923408
72	NC_008576	GTTGA	2	10	94365	94374	20 %	40 %	40 %	0 %	117923408
73	NC_008576	AAAAT	2	10	96101	96110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008576	GGCGG	2	10	99927	99936	0 %	0 %	80 %	20 %	117923413
75	NC_008576	CCAAC	2	10	102786	102795	40 %	0 %	0 %	60 %	117923416
76	NC_008576	ACCGG	2	10	105583	105592	20 %	0 %	40 %	40 %	117923419
77	NC_008576	TCACC	2	10	105965	105974	20 %	20 %	0 %	60 %	117923419
78	NC_008576	GGTGG	2	10	109122	109131	0 %	20 %	80 %	0 %	117923422
79	NC_008576	GGTCA	2	10	112319	112328	20 %	20 %	40 %	20 %	117923426
80	NC_008576	GCCCG	2	10	115343	115352	0 %	0 %	40 %	60 %	117923429
81	NC_008576	TGGTT	2	10	118943	118952	0 %	60 %	40 %	0 %	117923432
82	NC_008576	CCAAA	2	10	121358	121367	60 %	0 %	0 %	40 %	117923433
83	NC_008576	CACGC	2	10	121494	121503	20 %	0 %	20 %	60 %	117923433
84	NC_008576	CGTGC	2	10	122144	122153	0 %	20 %	40 %	40 %	117923434
85	NC_008576	GCGCT	2	10	122947	122956	0 %	20 %	40 %	40 %	117923435
86	NC_008576	GGTGA	2	10	123618	123627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008576	ATGGC	2	10	123925	123934	20 %	20 %	40 %	20 %	117923436
88	NC_008576	CAACT	2	10	127737	127746	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008576	ATTTT	2	10	127836	127845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008576	TGGGC	2	10	128105	128114	0 %	20 %	60 %	20 %	117923439
91	NC_008576	GGTGC	2	10	128560	128569	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_008576	GTTTT	2	10	130523	130532	0 %	80 %	20 %	0 %	117923440
93	NC_008576	GCGGT	2	10	130748	130757	0 %	20 %	60 %	20 %	117923440
94	NC_008576	ATAGA	2	10	132252	132261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008576	CCATG	2	10	133418	133427	20 %	20 %	20 %	40 %	117923443
96	NC_008576	CAAGC	2	10	135339	135348	40 %	0 %	20 %	40 %	117923445
97	NC_008576	AAAGC	2	10	145811	145820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008576	AGATT	2	10	147164	147173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008576	CGGTA	2	10	148835	148844	20 %	20 %	40 %	20 %	117923455
100	NC_008576	CGTTG	2	10	149219	149228	0 %	40 %	40 %	20 %	117923455
101	NC_008576	GCTCT	2	10	149484	149493	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008576	GAGCG	2	10	151193	151202	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008576	GGCAA	2	10	152737	152746	40 %	0 %	40 %	20 %	117923459
104	NC_008576	AGGTG	2	10	152795	152804	20 %	20 %	60 %	0 %	117923459
105	NC_008576	CGGCG	2	10	154565	154574	0 %	0 %	60 %	40 %	117923461
106	NC_008576	ATTTA	2	10	156385	156394	40 %	60 %	0 %	0 %	117923463
107	NC_008576	GGGTG	2	10	160076	160085	0 %	20 %	80 %	0 %	117923465
108	NC_008576	TGGTG	2	10	160428	160437	0 %	40 %	60 %	0 %	117923466
109	NC_008576	GTGGG	2	10	162055	162064	0 %	20 %	80 %	0 %	117923467
110	NC_008576	TGGCG	2	10	162088	162097	0 %	20 %	60 %	20 %	117923467
111	NC_008576	GGCGG	2	10	162158	162167	0 %	0 %	80 %	20 %	117923467
112	NC_008576	TGTGG	2	10	162207	162216	0 %	40 %	60 %	0 %	117923467
113	NC_008576	TGATA	2	10	163112	163121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008576	TTCAG	2	10	163534	163543	20 %	40 %	20 %	20 %	117923468
115	NC_008576	GTGGA	2	10	163867	163876	20 %	20 %	60 %	0 %	117923469
116	NC_008576	TTAAA	2	10	165926	165935	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008576	AGGGC	2	10	176059	176068	20 %	0 %	60 %	20 %	117923478
118	NC_008576	CCAAA	2	10	178454	178463	60 %	0 %	0 %	40 %	117923479
119	NC_008576	CATGC	2	10	185574	185583	20 %	20 %	20 %	40 %	117923487
120	NC_008576	ACACG	2	10	188806	188815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008576	GGGTT	2	10	190171	190180	0 %	40 %	60 %	0 %	117923490
122	NC_008576	TAATG	2	10	191210	191219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008576	CCCGC	2	10	193011	193020	0 %	0 %	20 %	80 %	117923491
124	NC_008576	CAACC	2	10	193351	193360	40 %	0 %	0 %	60 %	117923491
125	NC_008576	ACCCC	2	10	193946	193955	20 %	0 %	0 %	80 %	117923492
126	NC_008576	TAACC	2	10	195530	195539	40 %	20 %	0 %	40 %	117923493
127	NC_008576	CCGCT	2	10	195940	195949	0 %	20 %	20 %	60 %	117923493
128	NC_008576	TGGCT	2	10	195962	195971	0 %	40 %	40 %	20 %	117923493
129	NC_008576	CGTGC	2	10	196846	196855	0 %	20 %	40 %	40 %	117923494
130	NC_008576	GGGCT	2	10	196935	196944	0 %	20 %	60 %	20 %	117923494
131	NC_008576	GTGTG	2	10	197464	197473	0 %	40 %	60 %	0 %	117923495
132	NC_008576	CCACC	2	10	198509	198518	20 %	0 %	0 %	80 %	117923496
133	NC_008576	GTTTG	2	10	199390	199399	0 %	60 %	40 %	0 %	117923498
134	NC_008576	CATCT	2	10	199894	199903	20 %	40 %	0 %	40 %	117923499
135	NC_008576	CTAAG	2	10	201367	201376	40 %	20 %	20 %	20 %	117923500
136	NC_008576	GGTGT	2	10	203115	203124	0 %	40 %	60 %	0 %	117923502
137	NC_008576	CTAAT	2	10	205699	205708	40 %	40 %	0 %	20 %	117923505
138	NC_008576	CAACC	2	10	206536	206545	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_008576	ATCAC	2	10	206892	206901	40 %	20 %	0 %	40 %	117923507
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145	NC_008576	GGGGT	2	10	215277	215286	0 %	20 %	80 %	0 %	117923511
146	NC_008576	CAAAG	2	10	215666	215675	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008576	CCCTC	2	10	216394	216403	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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156	NC_008576	GGGTG	2	10	223553	223562	0 %	20 %	80 %	0 %	117923519
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168	NC_008576	TTGGT	2	10	245479	245488	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008576	GGGTT	2	10	258492	258501	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008576	AAAAT	2	10	261136	261145	80 %	20 %	0 %	0 %	117923548
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176	NC_008576	GCCTA	2	10	264347	264356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_008576	TGGAT	2	10	390745	390754	20 %	40 %	40 %	0 %	117923653
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254	NC_008576	TACAC	2	10	397711	397720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
255	NC_008576	TAAAA	2	10	398316	398325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008576	AGGAA	2	10	399762	399771	60 %	0 %	40 %	0 %	117923661
257	NC_008576	GAACC	2	10	399901	399910	40 %	0 %	20 %	40 %	117923661
258	NC_008576	GGTAA	2	10	400632	400641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008576	GCAAG	2	10	402335	402344	40 %	0 %	40 %	20 %	117923663
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261	NC_008576	ATGGT	2	10	404381	404390	20 %	40 %	40 %	0 %	117923665
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264	NC_008576	GCAAA	2	10	406656	406665	60 %	0 %	20 %	20 %	117923668
265	NC_008576	GCGAG	2	10	406877	406886	20 %	0 %	60 %	20 %	117923668
266	NC_008576	ATCCG	2	10	409233	409242	20 %	20 %	20 %	40 %	117923672
267	NC_008576	CCCAG	2	10	409258	409267	20 %	0 %	20 %	60 %	117923672
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