MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Magnetococcus marinus MC-1 chromosome

Total Repeats: 501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008576	AGCTT	2	10	9605	9614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008576	ACCCC	2	10	13290	13299	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_008576	AGAAT	2	10	17070	17079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008576	GCGGG	2	10	20881	20890	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008576	GTGGG	2	10	32606	32615	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008576	TTGTT	2	10	54327	54336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008576	CCTGA	2	10	68246	68255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008576	AAGGA	2	10	68705	68714	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008576	CCCTT	2	10	73342	73351	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_008576	CCCTT	2	10	74689	74698	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_008576	AGCAT	2	10	84154	84163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008576	AAAAT	2	10	96101	96110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008576	GGTGA	2	10	123618	123627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008576	CAACT	2	10	127737	127746	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008576	ATTTT	2	10	127836	127845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008576	GGTGC	2	10	128560	128569	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008576	ATAGA	2	10	132252	132261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008576	AAAGC	2	10	145811	145820	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008576	AGATT	2	10	147164	147173	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008576	GCTCT	2	10	149484	149493	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008576	GAGCG	2	10	151193	151202	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008576	TGATA	2	10	163112	163121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008576	TTAAA	2	10	165926	165935	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008576	ACACG	2	10	188806	188815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008576	TAATG	2	10	191210	191219	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008576	CAACC	2	10	206536	206545	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_008576	CAAAG	2	10	215666	215675	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008576	CCCTC	2	10	216394	216403	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_008576	CGACC	2	10	221928	221937	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_008576	TTAAG	2	10	245459	245468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008576	TTGGT	2	10	245479	245488	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008576	GGGTT	2	10	258492	258501	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008576	CACCC	2	10	262380	262389	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_008576	GCCTA	2	10	264347	264356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008576	ATTGG	2	10	270025	270034	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008576	AATGA	2	10	275184	275193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008576	TCGTG	2	10	276280	276289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008576	GCGAA	2	10	277572	277581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008576	ATCCC	2	10	279960	279969	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_008576	CCGGG	2	10	280210	280219	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008576	TCGGT	2	10	282773	282782	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008576	AAAAC	2	10	292981	292990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008576	GCAAT	2	10	294743	294752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008576	TTGGG	2	10	316337	316346	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008576	TAATA	2	10	327677	327686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008576	GGTTG	2	10	338661	338670	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008576	TAACC	2	10	344327	344336	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008576	TGCCA	2	10	364988	364997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_008576	CCTTT	2	10	388677	388686	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008576	TACAC	2	10	397711	397720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008576	TAAAA	2	10	398316	398325	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008576	GGTAA	2	10	400632	400641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008576	AAGAG	2	10	419928	419937	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008576	GTTGA	2	10	437847	437856	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008576	GTGCC	2	10	467010	467019	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_008576	GTTTT	2	10	482316	482325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008576	CTAAC	2	10	482345	482354	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008576	CTAGG	2	10	494278	494287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008576	CCCTC	2	10	497907	497916	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
60	NC_008576	CTTTA	2	10	516699	516708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_008576	TGGCT	2	10	517289	517298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_008576	CATTC	2	10	517368	517377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008576	GGCAA	2	10	521012	521021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008576	CTCTG	2	10	528527	528536	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_008576	AACTT	2	10	535341	535350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008576	GTTTT	2	10	536733	536742	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008576	GTTTT	2	10	536859	536868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008576	GTTTT	2	10	536985	536994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008576	ACGGC	2	10	541038	541047	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_008576	ATGGC	2	10	572661	572670	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008576	TGGAA	2	10	572896	572905	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008576	AGCAT	2	10	613150	613159	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008576	CGTTT	2	10	622043	622052	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008576	AGGGC	2	10	643313	643322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008576	TGCCA	2	10	657955	657964	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008576	GCCAA	2	10	659543	659552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008576	AGGCA	2	10	661533	661542	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008576	GAATT	2	10	667119	667128	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008576	TGTTT	2	10	671529	671538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008576	TGGCA	2	10	671621	671630	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008576	GTTAA	2	10	689421	689430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008576	TGTGG	2	10	692132	692141	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008576	CGGTG	2	10	703474	703483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008576	GGGTG	2	10	707421	707430	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008576	ATGGG	2	10	710327	710336	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008576	AGAGG	2	10	720630	720639	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008576	GAAAG	2	10	723380	723389	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008576	ATCTT	2	10	737056	737065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008576	TATTG	2	10	738516	738525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008576	ATTGT	2	10	777809	777818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008576	ATGGA	2	10	806421	806430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008576	TGCGG	2	10	837542	837551	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008576	GGGTT	2	10	840499	840508	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008576	GGGCT	2	10	852199	852208	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008576	GCTGA	2	10	853931	853940	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008576	GTGTG	2	10	861490	861499	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008576	TTGTT	2	10	870977	870986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008576	GTTTC	2	10	875002	875011	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008576	TAGGT	2	10	876544	876553	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008576	GGTTG	2	10	909939	909948	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008576	CCTGC	2	10	929491	929500	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_008576	CAGGG	2	10	949714	949723	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008576	ATGGT	2	10	957822	957831	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008576	TTGGG	2	10	978688	978697	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008576	TGCTG	2	10	990383	990392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_008576	TGGTT	2	10	997383	997392	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008576	CGGAT	2	10	1004368	1004377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008576	CTGCA	2	10	1004801	1004810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008576	AGGGG	2	10	1004945	1004954	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008576	CCTTG	2	10	1019443	1019452	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008576	GGTCG	2	10	1027687	1027696	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008576	TCCTG	2	10	1038588	1038597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_008576	GGGTT	2	10	1041945	1041954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008576	CAACC	2	10	1041971	1041980	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_008576	AGCAG	2	10	1051948	1051957	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008576	GATGG	2	10	1069441	1069450	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008576	AAAGC	2	10	1072839	1072848	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008576	TTTTC	2	10	1083126	1083135	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008576	GAGTC	2	10	1101632	1101641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008576	TGTGG	2	10	1108543	1108552	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008576	GTGGC	2	10	1114824	1114833	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_008576	GTGTA	2	10	1120276	1120285	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008576	TGGGG	2	10	1125184	1125193	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008576	CGGTG	2	10	1126812	1126821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008576	TGGAT	2	10	1146077	1146086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008576	CCAAG	2	10	1149100	1149109	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008576	GAGAG	2	10	1168116	1168125	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008576	TGCAA	2	10	1168204	1168213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008576	TAGGC	2	10	1173029	1173038	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_008576	TGTGG	2	10	1180940	1180949	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008576	CCGCC	2	10	1182409	1182418	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_008576	GAAAA	2	10	1210194	1210203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008576	CATAA	2	10	1212670	1212679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008576	AGGGA	2	10	1212695	1212704	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008576	GCTGG	2	10	1212947	1212956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008576	GCCAT	2	10	1218916	1218925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_008576	TTGGT	2	10	1221738	1221747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008576	TGGCT	2	10	1261032	1261041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008576	TGGGG	2	10	1277649	1277658	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008576	GTGGG	2	10	1279649	1279658	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008576	TTATC	2	10	1294291	1294300	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008576	CATTC	2	10	1307810	1307819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_008576	CATAA	2	10	1320551	1320560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008576	GTGTG	2	10	1322919	1322928	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008576	AAAAC	2	10	1322977	1322986	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_008576	GCGTG	2	10	1388052	1388061	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_008576	GGTAG	2	10	1389611	1389620	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_008576	TCTGT	2	10	1457025	1457034	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_008576	CATAG	2	10	1518381	1518390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_008576	CAACA	2	10	1664995	1665004	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_008576	AATCC	2	10	1672333	1672342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_008576	TCTCT	2	10	1672696	1672705	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_008576	GTGTT	2	10	1777768	1777777	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_008576	AGCCA	2	10	2609708	2609717	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
280	NC_008576	TCAAG	2	10	2609726	2609735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_008576	GGTTT	2	10	2609858	2609867	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
282	NC_008576	GCCAC	2	10	2610150	2610159	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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284	NC_008576	ATCCC	2	10	2611398	2611407	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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399	NC_008576	ATTGG	2	10	3816376	3816385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
400	NC_008576	ATTGG	2	10	3816469	3816478	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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